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基于生物信息学研究细胞周期蛋白依赖性激酶抑制因子2A基因与宫颈癌的关系及调控机制 被引量:1
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作者 刘珍 罗永金 胡晓霞 《广西医学》 CAS 2022年第12期1378-1383,共6页
目的采用生物信息学方法分析细胞周期蛋白依赖性激酶抑制因子2A(CDKN2A)基因与宫颈癌的关系,并探讨其对宫颈癌潜在的调控机制。方法从GEO数据库中下载数据集GSE7803、GSE64217和GSE63514,并使用GEO2R软件筛选宫颈癌组织和正常组织之间... 目的采用生物信息学方法分析细胞周期蛋白依赖性激酶抑制因子2A(CDKN2A)基因与宫颈癌的关系,并探讨其对宫颈癌潜在的调控机制。方法从GEO数据库中下载数据集GSE7803、GSE64217和GSE63514,并使用GEO2R软件筛选宫颈癌组织和正常组织之间的差异性表达基因,得到CDKN2A基因在宫颈鳞状细胞癌组织中的表达情况,并利用GEPIA数据库验证CDKN2A基因在宫颈鳞状细胞癌组织中的表达水平。通过DAVID在线工具针对差异性表达基因进行通路富集分析;利用STRING数据库和Cytoscape软件筛选与CDKN2A基因编码蛋白相互作用密切的蛋白。利用UALCAN在线工具分析CDKN2A基因表达与宫颈癌患者临床病理特征及预后的关系,以及宫颈癌组织中CDKN2A基因启动子甲基化水平。利用TIMER数据库分析CDKN2A基因表达水平与肿瘤免疫细胞浸润的相关性。利用ENCORI和mirDIP软件分析与CDKN2A基因有结合靶点的miRNA。结果共获得347个差异性表达基因,其中CDKN2A基因为上调基因;GEPIA数据库验证结果提示CDKN2A基因在宫颈鳞状细胞癌组织组织中呈高表达水平(P<0.05)。CDKN2A基因参与了细胞周期、p53信号通路及膀胱癌信号通路;共有22个蛋白与CDKN2A基因编码蛋白相互作用密切。淋巴结转移阳性宫颈癌患者中的CDKN2A基因表达水平高于淋巴结转移阴性者,CDKN2A基因高表达的宫颈癌患者的生存期短于低表达者(均P<0.05)。宫颈癌组织中CDKN2A基因启动子的甲基化水平较正常宫颈组织升高(P<0.05)。CDKN2A基因表达水平与巨噬细胞浸润水平呈负相关,与中性粒细胞、树突状细胞浸润水平呈正相关(均P<0.05)。共有9个miRNA可能与CDKN2A基因有结合靶点。结论CDKN2A基因与宫颈癌发生、发展密切相关,或可作为宫颈癌诊断及预后评估的潜在新分子标志物,并可为研究宫颈癌的免疫治疗提供新线索;该基因可能通过启动子区域甲基化或上游miRNA靶向调控在宫颈癌的发生、发展中发挥作用。 展开更多
关键词 宫颈癌 细胞周期蛋白依赖性激酶抑制因子2A 临床病理特征 预后 启动子区域甲基化 微小rna 生物信息学
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细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂2B反义RNA1靶向微小RNA-339-5p对乳腺癌细胞增殖、迁移、侵袭的影响 被引量:2
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作者 陈倩倩 张英丽 +1 位作者 李阳 唐音 《安徽医药》 CAS 2022年第7期1390-1394,共5页
目的 探讨长链非编码RNA细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂2B反义RNA1(lncRNA CDKN2B-AS1)对乳腺癌细胞增殖、迁移、侵袭的影响及分子机制。方法 收集南阳市中心医院2017年1月2019年1月收治的37例乳腺癌患者的癌组织及癌旁组织。将MDA-MB-45... 目的 探讨长链非编码RNA细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂2B反义RNA1(lncRNA CDKN2B-AS1)对乳腺癌细胞增殖、迁移、侵袭的影响及分子机制。方法 收集南阳市中心医院2017年1月2019年1月收治的37例乳腺癌患者的癌组织及癌旁组织。将MDA-MB-453细胞分为CDKN2B-AS1阴性对照(si-NC组)、CDKN2B-AS1小分子干扰RNA(si-CDKN2B-AS1组)、CDKN2B-AS1小分子干扰RNA+miR-339-5p阴性对照(si-CDKN2B-AS1+anti-miR-NC组)以及CDKN2B-AS1小分子干扰RNA+miR-339-5p特异性寡核苷酸抑制剂(si-CDKN2B-AS1+anti-miR-339-5p组)。采用RT-qPCR法对CDKN2B-AS1及微小RNA-339-5p(miR-339-5p)表达水平进行检测;细胞周期及增殖活性检测分别采用流式细胞术及MTT实验;采用Transwell小室技术对细胞迁移和侵袭进行检测;采用Western blotting法对增殖标记蛋白细胞增殖核抗原-67(Ki67)、细胞周期依赖性蛋白激酶抑制因子1A(P21)、上皮型钙黏蛋白(E-cadherin)、神经型钙黏蛋白(N-cadherin)蛋白表达进行检测;荧光素酶报告实验检测CDKN2BAS1对miR-339-5p的靶向调控。结果 在乳腺癌组织中CDKN2B-AS1表达水平上调[(2.23±0.08)比(1.00±0.06)](P<0.05)。抑制CDKN2B-AS1可增加G0期细胞比例[(43.29±3.76)%比(30.25±3.01)%]、P21表达水平升高,S期细胞比例[(21.91±3.10)%比(34.19±3.32)%]、细胞存活率[(53.02±5.38)%比(100.00±7.12)%]、迁移、侵袭数以及Ki67、E-cadherin、N-cadherin蛋白表达水平降低(P<0.05)。CDKN2B-AS1靶向调控miR-339-5p,抑制miR-339-5p逆转抑制CDKN2B-AS1对MDA-MB-453细胞增殖、迁移、侵袭的作用。结论 抑制CDKN2B-AS可抑制乳腺癌MDA-MB-453细胞增殖、迁移、侵袭,且靶向调控miR-339-5p表达。 展开更多
关键词 乳腺肿瘤 细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂2B反义rna1 微小rna-339-5p(miR-339-5p) 增殖 迁移 侵袭
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细胞周期调控基因及Bcl-2、c-Jun基因在人肝细胞脂肪变性过程中的表达变化 被引量:2
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作者 包成 毕玉晶 +1 位作者 杨瑞馥 智发朝 《山东医药》 CAS 北大核心 2017年第37期12-14,共3页
目的观察细胞周期调控基因及Bcl-2、c-Jun基因在人肝细胞L02脂肪变性过程中的表达变化。方法以油酸和软脂酸(2∶1)混合液处理L02细胞0、5、10、20 h,建立人肝细胞脂肪变性模型。用油红O染色检测L02细胞内脂质含量;用荧光定量PCR技术检测... 目的观察细胞周期调控基因及Bcl-2、c-Jun基因在人肝细胞L02脂肪变性过程中的表达变化。方法以油酸和软脂酸(2∶1)混合液处理L02细胞0、5、10、20 h,建立人肝细胞脂肪变性模型。用油红O染色检测L02细胞内脂质含量;用荧光定量PCR技术检测L02细胞脂肪变性过程中CDK2、CDK4、Cyclin D1、Bcl-2、c-Jun mRNA表达。结果随造模时间延长,L02细胞内橘红色脂滴聚集越来越多,至造模20 h,肝细胞染成橘红色。L02细胞内CDK2 mRNA相对表达量逐渐升高,造模5 h达最高(P均<0.05),随后逐渐下降;CDK4 mRNA相对表达量逐渐升高,造模10 h达最高(P均>0.05),随后逐渐下降,造模20 h最低(P均>0.05);不同时间点Cyclin D1 mRNA相对表达量比较差异无统计学意义(P均>0.05);Bcl-2 mRNA相对表达量随造模时间延长而升高,造模10 h达最高(P<0.05),随后降低;造模5、10、20 h的c-Jun mRNA相对表达量均较造模0 h高(P均<0.05),但无变化规律。结论人肝细胞L02脂肪变性过程中癌症相关基因CDK2、CDK4、Bcl-2、c-Jun表达先升高后降低,Cyclin D1表达变化不明显。 展开更多
关键词 细胞脂肪变性 细胞周期 细胞周期蛋白 细胞周期蛋白依赖性激酶 细胞周期蛋白依赖性激酶抑制因子 B细胞白血病-淋巴瘤基因2 C-JUN基因
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长链非编码RNA LINC00996通过抑制CDKN2A促进胃癌进展
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作者 程国雄 刘明 +1 位作者 陈正伟 叶巧萍 《世界华人消化杂志》 CAS 2024年第4期302-312,共11页
背景长链非编码RNA长基因间非蛋白编码RNA 996(long intergenic non-protein coding RNA 996,LINC00996)在多种肿瘤中发挥促癌或抑癌作用,而其在胃癌中的表达和作用尚不清楚.目的探索LINC00996在胃癌组织和细胞系中的表达,并探讨其对胃... 背景长链非编码RNA长基因间非蛋白编码RNA 996(long intergenic non-protein coding RNA 996,LINC00996)在多种肿瘤中发挥促癌或抑癌作用,而其在胃癌中的表达和作用尚不清楚.目的探索LINC00996在胃癌组织和细胞系中的表达,并探讨其对胃癌细胞生物学行为的作用及机制.方法用生物信息学法分析胃癌中LINC00996的表达,及其对胃癌患者总生存期的影响.用RT-qPCR检测胃癌及癌旁组织、胃癌及正常胃上皮细胞系中LINC00996表达.胃癌细胞(SGC7901、NCI-N87)转染针对LINC00996的小干扰RNA(si-LINC00996)和细胞周期蛋白依赖性激酶抑制蛋白2A(cyclin-dependent kinase inhibitor 2A,CDKN2A)的小干扰RNA(si-CDKN2A)后,用细胞计数试剂盒-8法、EDU染色法、流式细胞术法、划痕法和Transwell法分别检测细胞增殖、细胞周期、凋亡、迁移与侵袭;Western blot法检测细胞中CDKN2A、周期蛋白D1、B淋巴细胞瘤-2(B-cell lymphoma-2,Bcl-2)、Bcl-2相关X蛋白(Bcl-2 associated X protein,Bax)和劈开的半胱胺酸蛋白酶-3(Cleaved cysteinyl aspartate-specific proteinase-3,Cleaved caspase-3)表达.结果LINC00996在胃癌组织和细胞中表达较癌旁组织和胃正常细胞系显著升高(P<0.05),Kaplan Meier Plotter数据库显示LINC00996高表达组的胃癌患者的总生存期较低表达组显著缩短(P<0.05).敲降LINC00996能抑制胃癌细胞增殖、细胞周期运行、迁移、侵袭(P<0.05),促进细胞凋亡(P<0.05);降低cyclin D1和Bcl-2表达(P<0.05);升高CDKN2A、Bax和Cleaved caspase-3表达(P<0.05).敲降CDKN2A能部分逆转敲降LINC00996对胃癌细胞的作用(P<0.05).结论敲降LINC00996能通过上调CDKN2A诱导胃癌细胞凋亡,抑制其增殖、迁移与侵袭. 展开更多
关键词 基因间非蛋白编码rna 996 细胞周期蛋白依赖性激酶抑制蛋白2A 胃癌 增殖 凋亡 迁移 侵袭
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RNA干扰INK4位点反义非编码RNA抑制人肺癌细胞系生长的分子机制 被引量:4
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作者 肖颖 王正晖 +1 位作者 牛秀珑 申去非 《新乡医学院学报》 CAS 2013年第4期259-261,共3页
目的探讨INK4位点反义非编码RNA(ANRIL)下调对CDKN2B-CDKN2A-ARF基因簇的调控及对人肺癌细胞生长的影响。方法通过RNA干扰下调人肺鳞状细胞癌细胞系H520中ANRIL的表达,实时荧光定量聚合酶链反应检测RNA干扰前后细胞中ANRIL mRNA的表达变... 目的探讨INK4位点反义非编码RNA(ANRIL)下调对CDKN2B-CDKN2A-ARF基因簇的调控及对人肺癌细胞生长的影响。方法通过RNA干扰下调人肺鳞状细胞癌细胞系H520中ANRIL的表达,实时荧光定量聚合酶链反应检测RNA干扰前后细胞中ANRIL mRNA的表达变化,绘制细胞生长曲线;实时荧光定量聚合酶链反应和蛋白质印迹法检测RNA干扰前后细胞中细胞同期蛋白依赖性激酶抑制剂2B(CDKN2B)、CDKN2A、ARF mRNA和蛋白的表达变化。结果 RNA干扰可显著下调ANRIL mRNA的表达(P<0.05),ANRIL下调能抑制人肺鳞状细胞癌细胞系H520的生长(P<0.05),引起CDKN2B、CDKN2A、ARF mRNA和蛋白的表达升高(P<0.05)。结论 RNA干扰AN-RIL能抑制人肺鳞状细胞癌细胞的生长,ANRIL可能通过调控CDKN2B-CDKN2A-ARF基因簇起作用。 展开更多
关键词 肺鳞状细胞 INK4位点反义非编码rna 细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂2B 细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂2A rna干扰
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CDKN3基因在肝癌中的表达及其对肝癌细胞生长、细胞周期的影响 被引量:2
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作者 李苗苗 王海啸 陶国全 《山西医科大学学报》 CAS 2016年第6期496-501,共6页
目的研究细胞周期蛋白依赖性激酶抑制因子3(cyclin dependent kinase inhibitor 3,CDKN3)基因在肝癌组织中的表达,以及被沉默后对肝癌细胞生长和细胞周期的影响。方法采用普通及定量RT-PCR、蛋白免疫印迹法检测36例手术切除的肝癌组织... 目的研究细胞周期蛋白依赖性激酶抑制因子3(cyclin dependent kinase inhibitor 3,CDKN3)基因在肝癌组织中的表达,以及被沉默后对肝癌细胞生长和细胞周期的影响。方法采用普通及定量RT-PCR、蛋白免疫印迹法检测36例手术切除的肝癌组织和匹配的癌旁组织以及人肝癌细胞株中CDKN3的表达;观察沉默CDKN3表达后肝癌细胞生长曲线、克隆形成能力和细胞周期的变化。结果与癌旁样本相比,CDKN3基因在63.9%(23/36)肝癌组织中的mRNA表达显著上调,差异具有统计学意义(P<0.000 1);RNA干扰技术沉默CDKN3表达后,MHCC-LM3和Huh-7细胞生长和克隆形成能力被明显抑制(P<0.05);应用流式细胞术发现沉默CDKN3的表达能够诱导肝癌细胞发生G0/G1期阻滞(P<0.05)。结论 CDKN3基因在肝癌中表达上调,其通过影响细胞周期分布从而促进肝癌细胞的增殖,在肝癌发生、发展过程中可能发挥重要作用。 展开更多
关键词 原发性肝癌 细胞周期蛋白依赖性激酶抑制因子3 rna干扰 基因沉默 细胞周期
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急性冠脉综合征患者血清lncRNA CDKN2B-AS1、miR-184水平与介入治疗后冠状动脉再狭窄发生的相关性研究
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作者 王翔 王淼 +1 位作者 李宾 熊小雪 《国际检验医学杂志》 CAS 2024年第22期2752-2757,共6页
目的分析急性冠脉综合征(ACS)患者血清长链非编码RNA细胞周期蛋白依赖性激酶抑制因子2B基因反义RNA1(lncRNA CDKN2B-AS1)、微小RNA-184(miR-184)水平与经皮冠状动脉介入(PCI)治疗后冠状动脉再狭窄(RS)发生的相关性。方法选取2020年2月至... 目的分析急性冠脉综合征(ACS)患者血清长链非编码RNA细胞周期蛋白依赖性激酶抑制因子2B基因反义RNA1(lncRNA CDKN2B-AS1)、微小RNA-184(miR-184)水平与经皮冠状动脉介入(PCI)治疗后冠状动脉再狭窄(RS)发生的相关性。方法选取2020年2月至2023年3月在该院行PCI治疗的288例ACS患者,根据术后6个月复查造影结果分为RS发生组96例和RS未发生组192例。采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)法检测血清lncRNA CDKN2B-AS1、miR-184相对表达水平;采用Pearson相关性分析血清lncRNA CDKN2B-AS1与miR-184相关性;影响ACS患者PCI后RS发生的因素采用多因素Logistic回归分析;以受试者工作特征(ROC)曲线分析血清lncRNA CDKN2B-AS1、miR-184对ACS患者PCI后RS发生的评估价值。结果与RS未发生组相比,RS发生组血清lncRNA CDKN2B-AS1水平显著升高,miR-184水平显著降低,差异有统计学意义(P<0.05);两组超敏C反应蛋白(hs-CRP)、白细胞介素18(IL-18)、总胆红素(TBIL)及心肌肌钙蛋白I(cTnI)比较,差异有统计学意义(P<0.05);Pearson相关性分析显示,ACS患者血清lncRNA CDKN2B-AS1与miR-184水平呈显著负相关(r=-0.427,P<0.05);多因素Logistic回归分析结果显示,lncRNA CDKN2B-AS1、hs-CRP、IL-18、cTnI是影响ACS患者PCI后RS发生的危险因素,miR-184、TBIL是影响ACS患者PCI后RS发生的保护因素(P<0.05);ROC曲线结果显示,血清lncRNA CDKN2B-AS1、miR-184及二者联合对ACS患者PCI后RS发生评估的曲线下面积(AUC)分别为0.787、0.844、0.929,二者联合对ACS患者PCI后RS发生评估的AUC显著高于血清lncRNA CDKN2B-AS1、miR-184单独评估(Z_(二者联合-lncRNA CDKN2B-AS1)=4.490、Z_(二者联合-miR-184)=3.429,均P<0.05)。结论ACS患者血清lncRNA CDKN2B-AS1水平显著升高,miR-184水平显著降低,与ACS患者PCI后RS发生具有相关性,均是影响ACS患者PCI后RS发生的因素,且二者联合对ACS患者PCI后RS发生的评估效能更佳。 展开更多
关键词 急性冠脉综合征 经皮冠状动脉介入 冠状动脉再狭窄 长链非编码rna细胞周期蛋白依赖性激酶抑制因子2B基因反义rna1 微小rna-184
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CDKN2B-AS1基因多态性与子宫内膜异位症的相关性研究 被引量:1
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作者 郝娜 贾亚静 +1 位作者 田芸婕 路晓琳 《河北医学》 CAS 2020年第6期975-980,共6页
目的:研究细胞周期蛋白依赖性激酶抑制因子2B-反义RNA(CDKN2B-AS1)基因多态性与子宫内膜异位症(EM)的相关性。方法:选择2017年12月至2019年7月邯郸市中心医院和河北医科大学第四医院收治的子宫内膜异位症的患者112例为病例组,另取同期... 目的:研究细胞周期蛋白依赖性激酶抑制因子2B-反义RNA(CDKN2B-AS1)基因多态性与子宫内膜异位症(EM)的相关性。方法:选择2017年12月至2019年7月邯郸市中心医院和河北医科大学第四医院收治的子宫内膜异位症的患者112例为病例组,另取同期因宫外孕、输卵管黏连等手术患者112例为对照组,采用DNA PCR测序法检测所有受试者血液CDKN2B-AS1基因多态性,分析CDKN2B-AS1基因rs10965235位点多态性与EM临床分期的关系,采用Logistic回归分析CDKN2B-AS1基因多态性对EM易感性的影响。结果:病例组与对照组年龄、BMI、月经周期、CDKN2B-AS1 rs4977574位点等位基因A与G、AA与AG+GG基因型频率比较差异均无统计学意义(P>0.05)。CDKN2B-AS1基因rs4977574位点与AA基因型比较,AG+GG基因型与EM易感性无关(OR=1.105,95%CI:0.819-1.491;P=0.124)。与对照组比较,病例组CDKN2B-AS1基因rs10965235位点等位基因C、CC基因型频率高,等位基因A、CA+AA基因型频率低(χ2=4.397、4.075,P=0.036、0.044),差异有统计学意义。与Ⅰ~Ⅱ期比较,III^IV期EM患者CDKN2B-AS1基因rs10965235位点CC基因型频率高、CA+AA基因型频率低,差异有统计学意义(χ2=5.168,P=0.023)。CDKN2B-AS1基因rs10965235位点,与CC基因型比较,携带CA+AA基因型可降低EM易感性(OR=0.564,95%CI:0.347-0.917,P=0.000)。结论:CDKN2B-AS1基因rs4977574位点与EM易感性无关,rs10965235位点基因多态性与中国北方女性EM易感性有关。 展开更多
关键词 细胞周期蛋白依赖性激酶抑制因子2b-反义rna基因 基因多态性 子宫内膜异位症
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沉默CDKN2B-AS1调控miR-98-5p、STAT3对高糖诱导的人脐静脉内皮细胞损伤的影响
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作者 张松闯 杨光辉 +1 位作者 张增辉 王传花 《中国动脉硬化杂志》 CAS 2022年第12期1025-1032,共8页
[目的]探讨细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂2B反义RNA 1(CDKN2B-AS1)是否通过靶向miR-98-5p影响高糖诱导的人脐静脉内皮细胞(HUVEC)损伤。[方法]将HUVEC分为对照组(含5 mmol/L葡萄糖的DMEM培养)、模型组(含33.5 mmol/L葡萄糖的DMEM培养)... [目的]探讨细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂2B反义RNA 1(CDKN2B-AS1)是否通过靶向miR-98-5p影响高糖诱导的人脐静脉内皮细胞(HUVEC)损伤。[方法]将HUVEC分为对照组(含5 mmol/L葡萄糖的DMEM培养)、模型组(含33.5 mmol/L葡萄糖的DMEM培养)、模型+si-NC组、模型+si-CDKN2B-AS1组、模型+miR-NC组、模型+miR-98-5p模拟物组、模型+si-CDKN2B-AS1+anti-miR-NC组、模型+si-CDKN2B-AS1+anti-miR-98-5p组。运用实时定量聚合酶链反应检测HUVEC的CDKN2B-AS1、miR-98-5p表达;Western blot检测信号转导及转录激活因子3(STAT3)蛋白表达;流式细胞术检测细胞凋亡;超氧化物歧化酶(SOD)、乳酸脱氢酶(LDH)、丙二醛(MDA)试剂盒检测SOD、LDH、MDA水平。双荧光素酶报告实验分析miR-98-5p与CDKN2B-AS1、STAT3的靶向结合。[结果]高糖使HUVEC中CDKN2B-AS1、STAT3表达、凋亡率、LDH、MDA水平升高,miR-98-5p表达、SOD水平降低(P<0.05)。沉默CDKN2B-AS1或过表达miR-98-5p后,高糖诱导的HUVEC中CDKN2B-AS1、STAT3表达、凋亡率、LDH、MDA水平降低,miR-98-5p表达、SOD水平升高(P<0.05)。双荧光素酶报告实验显示,CDKN2B-AS1靶向miR-98-5p,miR-98-5p靶向STAT3。抑制miR-98-5p逆转了沉默CDKN2B-AS1对高糖诱导的HUVEC凋亡、氧化应激、STAT3蛋白表达的抑制作用。[结论]沉默CDKN2B-AS1通过调节miR-98-5p/STAT3轴抑制高糖诱导的HUVEC氧化应激和凋亡,CDKN2B-AS1可作为糖尿病相关血管并发症的候选治疗靶标。 展开更多
关键词 细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂2B反义rna 1 miR-98-5p 信号转导及转录激活因子3 高糖 人脐静脉内皮细胞 氧化应激 细胞凋亡
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CDKN2A/2B基因单核苷酸多态性与妊娠期糖尿病的相关性 被引量:2
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作者 刘念 于祥远 +2 位作者 秦林原 张军 余红平 《广西医学》 CAS 2019年第13期1673-1677,共5页
目的探讨细胞周期素依赖性蛋白激酶抑制因子2A/2B(CDKN2A/2B)基因单核苷酸多态性(SNP)与妊娠期糖尿病(GDM)发生风险的关系。方法选择459例GDM患者为病例组,571例正常妊娠者为对照组。通过相关数据库及文献筛选CDKN2A/2B基因的7个候选SN... 目的探讨细胞周期素依赖性蛋白激酶抑制因子2A/2B(CDKN2A/2B)基因单核苷酸多态性(SNP)与妊娠期糖尿病(GDM)发生风险的关系。方法选择459例GDM患者为病例组,571例正常妊娠者为对照组。通过相关数据库及文献筛选CDKN2A/2B基因的7个候选SNP位点,并对其进行基因分型。采用多因素Logistic回归模型评估候选SNP位点与GDM的相关性,采用多因子降维法评估候选SNP位点的单独或联合作用对妊娠期女性发生GDM的影响。结果多因素回归分析结果显示,与携带CDKN2A/2B基因rs10811661位点CC基因型的孕妇比较,携带TC或TT基因型的孕妇GDM患病风险升高(均P<0.05);在显性遗传模型下,与CC基因型携带者比较,携带TC/TT基因型的孕妇发生GDM的风险升高(P<0.05)。多因子降维分析结果显示,最优单位点模型为rs10811661位点(P<0.05);SNP-SNP联合作用与GDM发病存在关联,rs10811661-rs7036656-rs1063192-rs3217986位点的交互作用可增加GDM发病风险(P<0.05)。结论 CDKN2A/2B基因rs10811661位点多态性与GDM发生有关,SNP单独和联合作用均可影响妊娠期女性对GDM的易感性。 展开更多
关键词 妊娠期糖尿病 细胞周期依赖性蛋白激酶抑制因子2A/2B基因 单核苷酸多态性 rs10811661位点 发病风险
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TNFα诱导激活NF-κB上调抑癌基因CDKN2B表达 被引量:5
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作者 周飞 彭仲特 +2 位作者 郑锦玲 曾咏仪 周梦逸 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第9期972-981,共10页
NF-κB通过转录调控其靶基因,在肿瘤发生发展和精准治疗中起关键作用。过表达抑癌基因细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂2B(CDKN2B)可抑制肿瘤细胞增殖并诱导凋亡,但是否受NF-κB调节尚无报道。本文发现,NF-κB直接结合并上调CDKN2B基因:在... NF-κB通过转录调控其靶基因,在肿瘤发生发展和精准治疗中起关键作用。过表达抑癌基因细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂2B(CDKN2B)可抑制肿瘤细胞增殖并诱导凋亡,但是否受NF-κB调节尚无报道。本文发现,NF-κB直接结合并上调CDKN2B基因:在TNFα处理的He La细胞内,CDKN2B的基因区覆盖大量NF-κB结合峰,其中富集倍数大于20的结合峰有14个。TRANSFAC软件分析发现,NF-κB结合峰内包含大量经典的κB位点。Ch IP-q PCR证明,TNFα诱导NF-κB结合CDKN2B基因。将NF-κB结合峰中心区DNA片段插入荧光素酶报告基因载体中,发现该DNA片段的插入使荧光素酶相对活性上调至7.88倍,TNFα处理又使其相对活性提高到2.37倍,且NF-κB/p65 siRNA显著干扰其相对活性的升高。免疫荧光检测显示,TNFα诱导激活NF-κB进入细胞核,而NF-κB/p65 siRNA阻止它入核。此结果提示,我们成功构建了具有NF-κB转录活性差异的细胞模型,q PCR检测两个已知的NF-κB靶基因NFKB2和STAT5A的表达,进一步验证该细胞模型构建成功。利用此细胞模型,发现受TNFα诱导激活的NF-κB,能够上调CDKN2B基因。总之,本文发现抑癌基因CDKN2B是NF-κB新的靶基因,NF-κB直接结合并上调CDKN2B基因在转录水平的表达。本研究为抑癌基因CDKN2B的抗肿瘤应用奠定了基础。 展开更多
关键词 TNFΑ 因子ΚB 细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂2B 基因 肿瘤
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斑蝥酸钠维生素B6诱导人肝癌HepG2细胞凋亡及周期阻滞 被引量:10
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作者 张萌 李胜超 +2 位作者 乔治斌 何宏涛 彭利 《中国实验方剂学杂志》 CAS 北大核心 2013年第23期216-220,共5页
目的:研究斑蝥酸钠维生素B6(艾易舒)注射液对人肝癌HepG2细胞增殖、细胞周期与凋亡的影响,探讨其分子机制。方法:将不同浓度的斑蝥酸钠维生素B6注射液(0,1,5,10 mg·L-1)作用于人肝癌HepG2细胞12,24,48 h,MTT法检测细胞增殖抑制率,... 目的:研究斑蝥酸钠维生素B6(艾易舒)注射液对人肝癌HepG2细胞增殖、细胞周期与凋亡的影响,探讨其分子机制。方法:将不同浓度的斑蝥酸钠维生素B6注射液(0,1,5,10 mg·L-1)作用于人肝癌HepG2细胞12,24,48 h,MTT法检测细胞增殖抑制率,流式细胞学技术检测细胞凋亡率及细胞周期的变化,Western blot检测蛋白激酶B(Akt),磷酸化蛋白激酶B(pAkt),B细胞淋巴瘤-2基因相关X蛋白(Bax),B细胞淋巴瘤-2基因(Bcl-2)及细胞周期依赖性激酶抑制因子p21蛋白表达变化,RT-PCR检测Bax,Bcl-2及p21 mRNA表达变化。结果:斑蝥酸钠维生素B6可显著抑制HepG2细胞的增殖,诱导细胞凋亡,具有显著的时间和浓度效应(P<0.05);同时G0/G1期细胞比例显著升高,S期细胞比例显著降低(P<0.05)。Western blot结果显示斑蝥酸钠维生素B6可下调HepG2细胞中pAkt和Bcl-2蛋白的表达,上调Bax和p21蛋白的表达(P<0.05)。RT-PCR结果显示Bax,p21 mRNA的表达水平明显升高,而Bcl-2 mRNA的表达水平下降(P<0.05)。结论:斑蝥酸钠维生素B6可抑制人肝癌HepG2细胞的增殖,诱导其凋亡并引发G0/G1期阻滞,其机制可能与斑蝥酸钠维生素B6参与调控磷脂酰肌醇-3-激酶/蛋白激酶B(PI3K/Akt)通路有关。 展开更多
关键词 斑蝥酸钠维生素B6 磷脂酰肌醇-3-激酶 蛋白激酶B信号通路 细胞 凋亡 B细胞淋巴瘤-2基因 B细胞淋巴瘤-2基因相关X蛋白 细胞周期依赖性激酶抑制因子p21
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血清CHI3L1、ANRIL联合检测对慢性乙型肝炎的诊断价值
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作者 刘改 代坤 《海南医学》 CAS 2024年第19期2807-2811,共5页
目的探究血清壳多糖酶3样蛋白1(CHI3L1)、细胞周期激酶抑制因子4基因座中反义非编码RNA(ANRIL)联合检测诊断慢性乙型肝炎(CHB)的临床价值。方法前瞻性选取2022年10月至2024年4月西安市第八医院收治的172例CHB患者作为研究组,另选取同期... 目的探究血清壳多糖酶3样蛋白1(CHI3L1)、细胞周期激酶抑制因子4基因座中反义非编码RNA(ANRIL)联合检测诊断慢性乙型肝炎(CHB)的临床价值。方法前瞻性选取2022年10月至2024年4月西安市第八医院收治的172例CHB患者作为研究组,另选取同期在本院体检的健康者172例作为对照组。检测并比较两组受检者的血清CHI3L1、ANRIL水平和肝功能[总胆红素(TBIL)、谷草转氨酶(AST)、丙氨酸转氨酶(ALT)和白蛋白(ALB)]以及不同肝纤维化程度CHB患者的血清CHI3L1、ANRIL水平、肝功能和肝纤维化指标[层黏连蛋白(LN)、Ⅳ型胶原(Ⅳ-C)、透明质酸(HA)及Ⅲ型前胶原(PC-Ⅲ)];采用Pearson相关性分析CHB患者血清CHI3L1、ANRIL及两者与肝功能、肝纤维化指标的相关性;采用多因素Logistic回归分析CHB的影响因素;绘制受试者工作特征曲线(ROC)曲线分析血清CHI3L1、ANRIL对CHB的诊断价值。结果研究组患者的血清CHI3L1、ANRIL、TBIL、AST、ALT水平分别为(74.56±5.54)ng/m L、2.52±0.50、(42.03±4.52)mol/L、(56.45±4.65)U/L、(59.66±5.77)U/L,明显高于对照组的(46.37±3.42)ng/m L、1.01±0.24、(16.53±3.02)mol/L、(25.05±3.54)U/L、(30.54±4.38)U/L,ALB为(34.77±8.22)g/L,明显低于对照组的(50.42±12.21)g/L,差异均有统计学意义(P<0.05)。S0期、S1~S2期及S3~S4期患者的血清CHI3L1、ANRIL、TBIL、AST、ALT、LN、Ⅳ-C、HA和PC-Ⅲ水平依次升高,ALB依次降低,差异均有统计学意义(P<0.05)。Pearson相关性分析结果显示,血清CHI3L1与ANRIL呈正相关(P<0.05),且两者与TBIL、AST、ALT、LN、Ⅳ-C、HA和PC-Ⅲ均呈正相关(P<0.05),但与ALB均呈负相关(P<0.05)。多因素Logistic回归分析结果显示,CHI3L1、ANRIL、TBIL、AST、ALT、LN、Ⅳ-C、HA和PC-Ⅲ均是影响CHB的危险因素(P<0.05),ALB为保护因素(P<0.05)。ROC曲线分析结果显示,血清CHI3L1、ANRIL检测诊断CHB的AUC分别为0.830、0.779,两者联合检测诊断CHB的AUC为0.897,两者联合优于各自单独诊断(P<0.05)。结论CHB患者的血清CHI3L1、ANRIL水平显著升高,两者与肝功能以及肝纤维化指标有关,两者联合检测可提高对CHB的诊断价值。 展开更多
关键词 慢性乙型肝炎 壳多糖酶3样蛋白1 细胞周期激酶抑制因子4基因座中反义非编码rna 诊断
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CDKN2A基因多态性与妊娠期人乳头状瘤病毒感染的关联性 被引量:1
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作者 付红艺 马智 +2 位作者 王薇 邓煜 王炼炼 《中华医院感染学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第4期574-577,共4页
目的 研究细胞周期素依赖性蛋白激酶抑制因子2A(CDKN2A)基因多态性与妊娠期女性人乳头状瘤病毒(HPV)感染的相关性。方法 选取2018年2月-2021年2月在重庆医科大学附属第一医院体检的78名妊娠非HPV感染志愿者为对照组;同时期在医院产检的... 目的 研究细胞周期素依赖性蛋白激酶抑制因子2A(CDKN2A)基因多态性与妊娠期女性人乳头状瘤病毒(HPV)感染的相关性。方法 选取2018年2月-2021年2月在重庆医科大学附属第一医院体检的78名妊娠非HPV感染志愿者为对照组;同时期在医院产检的521例妊娠HPV感染患者,根据妊娠时间分为早期组258例,中期组158例,晚期组105例。限制性片段长度多态性聚合酶链反应技术检测CDKN2A基因多态性。结果妊娠晚期组、中期组、早期组HPV感染者和对照组CDKN2A rs7036656在TT、CC、TC/CC基因型者的分布中有统计学差异,HPV感染者呈TT基因型分布的最多,CC、TC/CC基因型分布的较少,差异有统计学意义(P<0.05);在妊娠期HPV感染中,感染者孕周越长,呈TT基因型分布的最多(P<0.05)。经过Logistic回归分析,CDKN2A基因单核苷酸多态性位点在TT、CC、TC/CC与HPV感染有关(P<0.05)。结论 CDKN2A基因多态性会增加妊娠期女性HPV感染风险,其基因位点突变发生HPV感染的可能性与患者孕周有关。 展开更多
关键词 细胞周期依赖性蛋白激酶抑制因子2A 基因多态性 妊娠期 人乳头状瘤病毒
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p57^(Kip2)在完全性和部分性葡萄胎与流产伴绒毛水肿中的表达及意义 被引量:13
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作者 何英 杨开选 +3 位作者 王红静 徐炼 黄芹 吴秀丽 《中华病理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2007年第3期197-199,共3页
p57^Kip2是细胞周期抑制因子和肿瘤抑制基因,定位于染色体11p15.5。其所编码产物是一种广泛的细胞周期蛋白依赖性激酶(CDK)的抑制蛋白。p57^Kip2显示极强的父本基因组烙印,在母本等位基因中为优势,即该基因的表达是由母系来源的... p57^Kip2是细胞周期抑制因子和肿瘤抑制基因,定位于染色体11p15.5。其所编码产物是一种广泛的细胞周期蛋白依赖性激酶(CDK)的抑制蛋白。p57^Kip2显示极强的父本基因组烙印,在母本等位基因中为优势,即该基因的表达是由母系来源的基因开放所致。我们利用免疫组织化学法检测p57^Kip2蛋白在由组织学所诊断的完全性葡萄胎、部分性葡萄胎及流产伴绒毛水肿中的表达情况,试图探讨p57^Kip2基因在完全性、部分性葡萄胎和流产伴绒毛水肿鉴别诊断中的临床意义。 展开更多
关键词 P57^KIP2 部分性葡萄胎 完全性葡萄胎 绒毛水肿 流产 细胞周期抑制因子 肿瘤抑制基因 周期蛋白依赖性激酶
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肝癌组织LncRNA TINCR和ANRIL表达水平及其与患者预后的关系 被引量:11
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作者 张帅 朱佳 +4 位作者 吴相柏 陈巧 魏亚元 张晓平 许海 《热带医学杂志》 CAS 2019年第1期55-59,共5页
目的探讨肝癌组织长链非编码RNA(LncRNA)组织分化诱导非蛋白质编码RNA(TINCR)和细胞周期激酶抑制因子4基因座中反义非编码RNA(ANRIL)表达水平及其与患者预后的关系。方法选取2010年7月至2012年11月本院进行手术切除的68例肝癌患者的肿... 目的探讨肝癌组织长链非编码RNA(LncRNA)组织分化诱导非蛋白质编码RNA(TINCR)和细胞周期激酶抑制因子4基因座中反义非编码RNA(ANRIL)表达水平及其与患者预后的关系。方法选取2010年7月至2012年11月本院进行手术切除的68例肝癌患者的肿瘤组织及癌旁组织,采用RT-PCR方法检测肝癌组织和癌旁组组中LncRNA TINCR和ANRIL相对表达量,分析LncRNA TINCR和ANRIL表达与患者临床病理特征及生存率的关系。结果肝癌组织中TINCR和ANRIL相对表达量均显著高于癌旁组织(P<0.05);TINCR表达量与患者肿瘤大小、肿瘤分化程度及TNM分期有关,ANRIL表达量与患者肿瘤大小和TNM分期有关;TINCR高表达患者无瘤生存率及5年总生存率均显著低于TINCR低表达患者(P<0.05);ANRIL高表达患者无瘤生存率及5年总生存率均显著低于ANRIL低表达患者(P<0.05);肿瘤大小、TINCR高表达和ANRIL高表达是影响肝癌患者预后的危险因素。结论肝癌组织中TINCR和ANRIL表达显著上调,可能参与肿瘤进展过程,与患者预后密切相关。 展开更多
关键词 肝癌 长链非编码rna 组织分化诱导非蛋白质编码rna 细胞周期激酶抑制因子4基因座中反义非编码rna
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