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细胞周期蛋白依赖性激酶1(CDK1)和极光激酶A(AURKA)在HBV相关肝细胞癌患者血清中的表达及意义
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作者 何燕芳 谢娇娇 +2 位作者 郑兰兰 郭才 马燕花 《临床肝胆病杂志》 CAS 北大核心 2024年第7期1390-1396,共7页
目的 探讨血清细胞周期蛋白依赖性激酶1(CDK1)和极光激酶A(AURKA)在HBV相关肝细胞癌(HBV-HCC)患者中的诊断价值。方法 收集2022年6月—2023年12月在甘肃省人民医院消化内科住院部的HBV-HCC患者、HBV相关肝硬化患者(HBV-LC)及慢性乙型肝... 目的 探讨血清细胞周期蛋白依赖性激酶1(CDK1)和极光激酶A(AURKA)在HBV相关肝细胞癌(HBV-HCC)患者中的诊断价值。方法 收集2022年6月—2023年12月在甘肃省人民医院消化内科住院部的HBV-HCC患者、HBV相关肝硬化患者(HBV-LC)及慢性乙型肝炎患者(CHB)各50例,收集同期体检中心与病例组年龄、性别相匹配的健康人群50例,记录患者的年龄、性别、并发症以及入院后首次的血常规、肝功能、凝血等检验指标。ELISA法检测各组血清中CDK1和AURKA水平。符合正态分布的计量资料多组间比较采用单因素方差分析,进一步两两比较采用LSD-t检验;非正态分布的计量资料多组间比较采用Kruskal-Wallis H检验,进一步两两比较采用Bonferroni检验。计数资料组间比较采用χ^(2)检验或Fisher确切概率法。CDK1与AURKA表达的关系采用Spearman相关分析;受试者工作特征曲线(ROC曲线)下面积(AUC)分析CDK1与AURKA对HBV-HCC的诊断价值。结果 与对照组相比,HBV-HCC患者肝功能各项指标差异均有统计学意义(P值均<0.05);CHB组与HBV-HCC组Alb、Glb、DBil、AST、GGT、ALP水平比较差异均有统计学意义(P值均<0.05);HBV-LC组与HBV-HCC组Glb、AST、GGT水平比较差异均有统计学意义(P值均<0.05)。HBV-HCC组患者血清中CDK1及AURKA水平明显高于HBV-LC组、CHB组和对照组(P值均<0.05)。CDK1水平与AURKA在总研究人群和HBV-HCC患者中均存在显著的正相关性(r值分别为0.526 6、0.815 2,P值均<0.001)。以对照组为参照,CDK1诊断HBV-HCC的AUC为0.832 3,敏感度为92.86%,特异度为75%;AURKA诊断HCC的AUC为0.886 6,敏感度为95.80%,特异度为74%。以CHB组为参照,CDK1诊断HBV-HCC的AUC为0.833 3,敏感度为93.75%,特异度为75%;AURKA诊断HBV-HCC的AUC为0.972 7,敏感度为95.83%,特异度为91.67%。以HBV-LC组为参照,CDK1诊断HBV-HCC的AUC为0.608 5,敏感度为66.67%,特异度为54.17%;AURKA诊断HBV-HCC的AUC为0.762 2,敏感度为95.83%,特异度为47.92%。结论 血清CDK1与AURKA水平随着HBV相关慢性肝病的进展而升高,二者对HBV相关HCC有一定的诊断价值。 展开更多
关键词 细胞 细胞周期蛋白质依赖激酶 极光激酶A
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细胞周期蛋白B2基因在胰腺癌中表达的生物信息学分析
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作者 邹晶晶 郭敬强 《浙江医学》 CAS 2023年第18期1927-1931,I0004,I0005,共7页
目的利用生物信息学分析细胞周期蛋白B2(CCNB2)基因在胰腺癌中的表达和意义。方法基于GEPIA数据库、Ualcan数据库、cBbioPortal数据库和Timer数据,探究胰腺癌组织和正常胰腺组织CCNB2基因表达差异,进一步分析胰腺癌组织中CCNB2基因甲基... 目的利用生物信息学分析细胞周期蛋白B2(CCNB2)基因在胰腺癌中的表达和意义。方法基于GEPIA数据库、Ualcan数据库、cBbioPortal数据库和Timer数据,探究胰腺癌组织和正常胰腺组织CCNB2基因表达差异,进一步分析胰腺癌组织中CCNB2基因甲基化、突变情况,并探讨影响胰腺癌预后的因素。通过STRING数据库、GeneMANIA数据库分析与CCNB2基因相互作用的蛋白,同时进行功能富集分析,预测CCNB2基因在胰腺癌中调控的可能途径。结果与正常胰腺组织比较,胰腺癌组织中CCNB2基因具有高表达水平和高甲基化水平。胰腺癌中CCNB2基因表达与免疫细胞浸润呈正相关,CCNB2基因高表达的患者预后差。蛋白网络分析显示,CDK1、CDK2、CKS2等蛋白与CCNB2蛋白相互作用。基因本体论(GO)富集分析显示,CCNB2表达样本富集到有丝分裂细胞周期过程、细胞蛋白质代谢过程的调节等相关功能基因集;京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析显示,CCNB2基因可能通过p53信号通路、FoxO信号通路等方式在胰腺癌中发挥作用。结论胰腺癌中CCNB2基因高表达,与肿瘤预后呈负相关。胰腺癌发病和预后可能与CCNB2基因甲基化及免疫细胞浸润有关用。CCNB2基因可能通过能调节CDC20、CDK1等相互作用蛋白、影响细胞周期及激活p53、FoxO信号通路等途径促进胰腺癌的发生、发展。 展开更多
关键词 细胞周期蛋白B2 胰腺癌 早期诊断 生物信息学分析
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大蒜类钙调蛋白基因AsCML15和AsCML42的分离及其在渗透胁迫中的功能分析
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作者 王广龙 许吴俊 +3 位作者 陈洋洋 胡珍珠 孙敏 熊爱生 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2024年第4期80-86,共7页
类钙调素蛋白(CMLs)是植物中的Ca 2+感受器之一,参与植物的生长发育和适应环境变化的过程。为了解大蒜CML的序列特征及其对渗透胁迫的响应,从大蒜品种苍山四六瓣中克隆得到AsCML15和AsCML42基因,并对其在干旱以及盐胁迫条件下的表达模... 类钙调素蛋白(CMLs)是植物中的Ca 2+感受器之一,参与植物的生长发育和适应环境变化的过程。为了解大蒜CML的序列特征及其对渗透胁迫的响应,从大蒜品种苍山四六瓣中克隆得到AsCML15和AsCML42基因,并对其在干旱以及盐胁迫条件下的表达模式进行了分析。结果表明,AsCML15和AsCML42基因开放阅读框长度分别为498,543 bp,编码165,180个氨基酸残基。AsCML15和AsCML42分别含有4,3个EF-hand结构域。AsCML42与拟南芥AtCML42和AtCML43在进化关系上更为接近,而AsCML15与拟南芥AtCML15、AtCML16亲缘关系较近。荧光定量PCR结果表明,AsCML15和AsCML42在鳞茎、叶片、根都有表达,且均能被200 mmol/L NaCl和15%PEG6000所诱导。AsCML15和AsCML42基因可能参与了大蒜抵御盐胁迫和干旱胁迫的过程,可进一步鉴定其生物学功能。 展开更多
关键词 大蒜 钙调蛋白 基因克隆 表达分析 渗透胁迫
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斑节对虾细胞周期蛋白E基因的克隆与表达分析 被引量:10
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作者 赵超 傅明骏 +4 位作者 江世贵 周发林 杨其彬 朱彩艳 邱丽华 《中国水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2014年第3期464-473,共10页
为了解细胞周期蛋白E(cyclin E)基因在斑节对虾(Penaeus monodon)发育过程中的作用,构建和测序了斑节对虾全组织cDNA文库,获得了斑节对虾细胞周期蛋白(Pmcyclin)E的部分表达序列。通过RACE技术克隆得到1条全长1 706 bp的cDNA序列。Pmcyc... 为了解细胞周期蛋白E(cyclin E)基因在斑节对虾(Penaeus monodon)发育过程中的作用,构建和测序了斑节对虾全组织cDNA文库,获得了斑节对虾细胞周期蛋白(Pmcyclin)E的部分表达序列。通过RACE技术克隆得到1条全长1 706 bp的cDNA序列。Pmcyclin E开放阅读框(ORF)为1 263 bp,编码420个氨基酸。生物信息学分析表明,该氨基酸序列含有周期蛋白家族特有的CYCLIN保守区并含有N-糖基化位点及磷酸化位点。经BLAST同源性分析表明,该基因编码蛋白与红火蚁(Solenopsis invicta)、切叶蜂(Megachile rotundata)等多种节肢动物细胞周期蛋白E有很高的同源性。组织分布分析表明,该基因在斑节对虾精巢、卵巢、肠、脑、肝胰腺、胃和心脏组织中均有表达,其中卵巢中表达量较高,而心脏、胃及肝胰腺中表达量相对较低。分别对蜕皮抑制激素(MIH)注射和眼柄切除的对虾进行表达分析,发现眼柄切除后,Pmcyclin E大量表达,而注射MIH后细胞Pmcyclin E的表达量相对降低。结果表明,细胞cyclin E基因在斑节对虾卵巢发育过程中起重要作用,且眼柄切除对细胞cyclin E的表达具有影响,该结果为进一步探究斑节对虾卵巢的发育机理提供了理论依据。 展开更多
关键词 斑节对虾 细胞周期蛋白E 克隆 序列分析 基因表达 卵巢发育
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树鼩细胞周期蛋白T1 cDNA的克隆和序列分析 被引量:2
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作者 杨敏 张驰宇 贲昆龙 《Zoological Research》 CAS CSCD 北大核心 2003年第3期205-210,共6页
树细胞不能感染HIV 1,但支持HIV 1进入靶细胞后的转录 ,可能是因为树细胞周期蛋白T1(tsCycT1)能结合HIV 1的Tat蛋白。通过设计引物 ,用RT PCR技术 ,获得全长为 2 175bptsCycT1基因的cD NA。其核苷酸序列与人的CycT1(hCycT1)基因的c... 树细胞不能感染HIV 1,但支持HIV 1进入靶细胞后的转录 ,可能是因为树细胞周期蛋白T1(tsCycT1)能结合HIV 1的Tat蛋白。通过设计引物 ,用RT PCR技术 ,获得全长为 2 175bptsCycT1基因的cD NA。其核苷酸序列与人的CycT1(hCycT1)基因的cDNA有 92 6 %的相似性 ;由此推导出的氨基酸序列有94 1%相似性。其中 ,hCycT1和tsCycT1氨基端的 1~ 2 72个氨基酸的相似性高达 98 8% ,氨基酸第 2 6 1位点为半胱氨酸。这些结果提示 ,tsCycT1会和HIV 1的Tat结合 ,形成高亲和的、锌依赖的复合物 ,支持HIV 1转录。 展开更多
关键词 树鼩 细胞周期蛋白T1 CDNA 克隆 序列分析
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3D-QSAR和分子对接研究吲哚咔唑类细胞周期蛋白激酶抑制剂的选择性 被引量:3
6
作者 孙倪悦 陆涛 +3 位作者 陈亚东 郝兰虎 许岩 李瑞君 《物理化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2009年第4期645-654,共10页
细胞周期蛋白激酶(cyclin-dependent kinases,CDKs)是近年来治疗肿瘤的重要靶标.由于大多数激酶ATP结合位点的保守性,CDK选择性激酶抑制剂的开发成为当前的研发难点和热点.针对吲哚咔唑类CDK抑制剂,我们采用比较分子力场分析方法(CoMFA... 细胞周期蛋白激酶(cyclin-dependent kinases,CDKs)是近年来治疗肿瘤的重要靶标.由于大多数激酶ATP结合位点的保守性,CDK选择性激酶抑制剂的开发成为当前的研发难点和热点.针对吲哚咔唑类CDK抑制剂,我们采用比较分子力场分析方法(CoMFA)建立了CDK2-QSAR(quantitative structure-activity relationship)和CDK4-QSSR(quantitative structure-selectivity relationship)模型.所建模型的交叉验证系数q2分别为0.722和0.703;非交叉验证系数r2分别为0.977和0.946,表明其具有较好的预测能力.同时,用分子对接的方法分析了这类化合物与CDK4同源模建结构的作用模式,根据这两个模型发现,吲哚咔唑类化合物的R5和R6位长链取代对CDK4的选择性具有一定的影响,而且结合其作用模式比较合理地解释了这类抑制剂的选择性原因,这对CDKs的选择性研究具有一定的指导意义. 展开更多
关键词 细胞周期蛋白激酶 吲哚咔唑衍生物 3D-QSAR 3D-QSSR 比较分子力场分析方法 分子对接
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细胞周期蛋白A2在肝细胞癌中的表达及其意义
7
作者 马苗苗 黄海珍 +7 位作者 王雪轩 张义炜 张书铭 杨英 陈宁园 黄玲 彭均华 潘尚领 《广西医科大学学报》 CAS 2023年第5期814-821,共8页
目的:探讨细胞周期蛋白A2(CCNA2)在肝细胞癌(HCC)中的表达及其意义。方法:从TCGA、GEO、GETx数据库获得测序数据,通过STATA 15.0进行meta分析评估HCC患者肿瘤组织中CCNA2 mRNA的表达水平;通过数据库GEPIA绘制CCNA2在HCC中的生存曲线,探... 目的:探讨细胞周期蛋白A2(CCNA2)在肝细胞癌(HCC)中的表达及其意义。方法:从TCGA、GEO、GETx数据库获得测序数据,通过STATA 15.0进行meta分析评估HCC患者肿瘤组织中CCNA2 mRNA的表达水平;通过数据库GEPIA绘制CCNA2在HCC中的生存曲线,探究CCNA2对HCC预后的影响。在HCC细胞系(Huh7和SK-Hep1)沉默CCNA2(shCCNA2组),并设置空载体对照组(shNC组),通过细胞功能学实验检测沉默CCNA2对HCC细胞增殖、迁移与侵袭、细胞周期和细胞凋亡中的影响。通过在鸡胚绒毛尿囊膜构建HCC细胞移植瘤模型,观察并分离瘤体,检测CCNA2在体内对HCC生长的影响。结果:CCNA2在HCC患者肿瘤组织中m RNA水平显著高于非癌肝组织(SMD=1.65,95%CI:1.46~1.85,I2=89%)。CCNA2高表达与肝癌患者的不良预后呈负相关关系。与shNC组相比,shCCNA2组细胞增殖、迁移和侵袭能力降低(P<0.05)。shCCNA2组Huh7和SK-Hep1细胞的G0/G1期、S期、G2/M期占比发生改变(P<0.05)。鸡胚绒毛尿囊膜移植成瘤实验中,与shNC组比较,shCCNA2组肿瘤体积明显减小(P<0.05)。结论:CCNA2可能通过影响HCC细胞的增殖、迁移和侵袭能力,抑制HCC的进展和转移,其有望成为HCC治疗靶点。 展开更多
关键词 细胞 细胞周期蛋白A2 细胞增殖 生物信息学分析
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香蕉枯萎病菌内源报告基因细胞周期蛋白C1基因FocFCC1的鉴定及分析
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作者 曾凡云 王艳玮 +3 位作者 漆艳香 谢艺贤 张欣 彭军 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2021年第11期3126-3133,共8页
本研究克隆鉴定了香蕉枯萎病菌4号生理小种(Foc4)的细胞周期蛋白C1(Fusarium Cyclin C1,FCC1)基因FocFCC1,采用Split-marker同源重组技术获得基因敲除突变体ΔFocFCC1,通过比较突变体和野生菌株在生长速度、产孢量和致病力等方面的差异... 本研究克隆鉴定了香蕉枯萎病菌4号生理小种(Foc4)的细胞周期蛋白C1(Fusarium Cyclin C1,FCC1)基因FocFCC1,采用Split-marker同源重组技术获得基因敲除突变体ΔFocFCC1,通过比较突变体和野生菌株在生长速度、产孢量和致病力等方面的差异,探索了FocFCC1基因缺失对香蕉枯萎病菌生物学功能的影响,并评估了FocFCC1作为枯萎菌内源报告基因的可行性。结果表明:与Foc4野生型菌株相比,ΔFocFCC1菌丝生长缓慢、菌丝畸形及产孢量减少,对巴西蕉苗的致病力明显减弱,推测FocFCC1基因在Foc4的生长发育、产孢及致病力等方面具有重要作用。以FocFCC1为靶标基因,评估了两种基因敲除重组方法介导的基因敲除效率,利用红色表型作为判断依据,挑取再生板上有红色表型的转化子进行PCR检测,Split-marker重组方法获得阳性转化子比例为91.7%,而多片段装配融合方法获得阳性转化子的比例为64%。ΔFocFCC1出现典型红色菌落,红色表型与PCR检测的FocFCC1阳性敲除转化子一一对应,FocFCC1基因敲除后红色表型肉眼容易分辨,可作为香蕉枯萎病菌内源报告基因探索新的遗传操作技术在该菌上应用的可行性。 展开更多
关键词 香蕉枯萎菌 细胞周期蛋白C1 基因敲除 表型分析 致病力
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D类细胞周期蛋白与膀胱肿瘤关系的研究现状
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作者 张云山 曲仕浩 柳建军 《国际医药卫生导报》 2006年第22期122-125,共4页
D类细胞周期蛋白是细胞周期G1期的主要调控因子,其表达异常与膀胱肿瘤的发生发展有重要关系,对判断肿瘤的生物学特性、预后及指导临床治疗有重要意义,对D类细胞周期蛋白的靶向调节有望为膀胱肿瘤的防治开辟新途径。
关键词 D细胞周期蛋白 细胞周期 膀胱肿瘤
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斑节对虾细胞周期蛋白T基因的克隆和表达分析 被引量:1
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作者 郭松 傅明骏 +5 位作者 赵超 李伟杰 江世贵 杨其彬 周发林 邱丽华 《南方水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2016年第1期59-66,共8页
真核生物的转录调控多发生在转录的延伸阶段,细胞周期蛋白T(cyclin T)是细胞转录的重要调控因子。文章利用RACE技术获得斑节对虾(Penaeus monodon)cyclin T(Pmcyclin T)c DNA全长,其全长为3 421 bp,其中开放阅读框(ORF)3 135 bp,编码1 ... 真核生物的转录调控多发生在转录的延伸阶段,细胞周期蛋白T(cyclin T)是细胞转录的重要调控因子。文章利用RACE技术获得斑节对虾(Penaeus monodon)cyclin T(Pmcyclin T)c DNA全长,其全长为3 421 bp,其中开放阅读框(ORF)3 135 bp,编码1 044个氨基酸;生物信息学分析显示,该氨基酸序列含有一个周期蛋白家族特有的CYCLIN保守区,并含有N-糖基化位点和磷酸化位点;经BLAST同源性分析显示,细胞周期蛋白T编码的蛋白与柑橘木虱(Diaphorina citri)、切叶蚁(Acromyrmex echinatior)等多种节肢动物有很高的同源性;利用qRTPCR技术对Pmcyclin T在不同组织及卵巢发育各时期的mRNA水平的表达谱进行了研究。结果表明,细胞周期蛋白T在斑节对虾的心、卵巢等7个组织中均有表达,其中卵巢中表达量显著高于其他组织(P<0.05);在卵巢发育各时期中,细胞周期蛋白T在Ⅲ期表达量最高。 展开更多
关键词 斑节对虾 细胞周期蛋白T 基因克隆 表达分析 卵巢发育
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细胞周期蛋白家族的生物信息学分析 被引量:3
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作者 万晶 冯沛春 王万军 《安徽农业科学》 CAS 2012年第30期14668-14672,共5页
[目的]对细胞周期蛋白家族的序列进行生物信息学分析,从而研究物种间细胞周期蛋白的分类体系。[方法]选取已完成基因组测序的10个物种的细胞周期蛋白,按细胞周期蛋白中周期蛋白框结构域的序列完整性及结构域的数目进行分类,并进行多次... [目的]对细胞周期蛋白家族的序列进行生物信息学分析,从而研究物种间细胞周期蛋白的分类体系。[方法]选取已完成基因组测序的10个物种的细胞周期蛋白,按细胞周期蛋白中周期蛋白框结构域的序列完整性及结构域的数目进行分类,并进行多次筛选比对,分别构建具完整单周期蛋白框结构域和完整双周期蛋白框结构域细胞周期蛋白的系统发育树。[结果]随物种进化,细胞周期蛋白的序列类型和序列数量显著增加。对完整单域和完整双域细胞周期蛋白的聚类分析结果显示,原核生物的细胞周期蛋白、单细胞真核生物的PHO80与PCL、植物的P和U、动物的Y组成原核型细胞周期蛋白,并进化形成真核型细胞周期蛋白,真核型细胞周期蛋白的进化趋势是增加类型和数量,动物以增加细胞周期蛋白的类型为主,而植物则是以增加细胞周期蛋白类型中的成员为主;另一进化趋势是由单域向双域发展,物种进化程度越高,所具有的双域细胞周期蛋白的类型就越多。[结论]为物种间细胞周期蛋白的分子进化研究提供了参考。 展开更多
关键词 细胞周期蛋白 结构域 进化分析
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大豆疫霉细胞周期蛋白依赖性蛋白激酶的生物信息分析 被引量:1
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作者 张蕾 艾嘉 +4 位作者 韩毅强 王彦杰 晏磊 高亚梅 王伟东 《江苏农业科学》 2018年第4期33-37,共5页
细胞周期蛋白依赖性蛋白激酶(cyclin-dependent kinases,CDK)是调控细胞周期蛋白、维持细胞周期有序进行的关键蛋白。利用生物信息学方法在大豆疫霉基因组内共发现11个CDK家族蛋白,其中大豆疫霉ps Cdc2与勃利霉素抑制作用靶标的酵母Cdc2... 细胞周期蛋白依赖性蛋白激酶(cyclin-dependent kinases,CDK)是调控细胞周期蛋白、维持细胞周期有序进行的关键蛋白。利用生物信息学方法在大豆疫霉基因组内共发现11个CDK家族蛋白,其中大豆疫霉ps Cdc2与勃利霉素抑制作用靶标的酵母Cdc28高度同源,位于进化树的同一分支,且两者蛋白的保守结构域高度相似。大豆疫霉的ps Cdc2为表达基因,其蛋白分子量为35 478 u,等电点为8.56的稳定存在的蛋白,无信号肽,为α/β型蛋白。与酵母Cdc28基因存在相互作用的10个蛋白在大豆疫霉基因组内全部找到其同源蛋白,说明大豆疫霉内可能存在类似的蛋白相互作用网络。 展开更多
关键词 细胞周期蛋白依赖性蛋白激酶 酵母Cdc28基因 大豆疫霉psCdc2 生物信息学分析
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鼻咽癌中细胞周期蛋白E与细胞周期蛋白依赖性激酶抑制因子p27^(kip1)的相关性分析 被引量:1
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作者 张国顺 高国芬 林尚泽 《贵阳医学院学报》 CAS 2007年第6期622-624,628,共4页
目的:研究鼻咽癌中细胞周期蛋白E(cyclin E)和细胞周期蛋白依赖性激酶抑制因子(p27kip1)的表达及相关性。方法:以抗cyclin E抗体、抗p27kip1抗体为标记物,采用免疫组织化学方法(Elivision法)对37例鼻咽癌、17例慢性鼻咽炎石蜡标本进行检... 目的:研究鼻咽癌中细胞周期蛋白E(cyclin E)和细胞周期蛋白依赖性激酶抑制因子(p27kip1)的表达及相关性。方法:以抗cyclin E抗体、抗p27kip1抗体为标记物,采用免疫组织化学方法(Elivision法)对37例鼻咽癌、17例慢性鼻咽炎石蜡标本进行检测,并结合临床资料进行分析。结果:37例鼻咽癌组织中cyclin E和p27kip1阳性表达率分别为51.4%和45.9%,17例慢性鼻咽炎中cyclin E和p27kip1阳性表达率分别为5.9%和88.2%,两者比较差异有显著性(P<0.01)。cyclin E阳性表达与病理分型、临床分期、淋巴结转移、颅神经侵犯无关(P>0.05),但与3年生存率有关(P<0.05);p27kip1阳性表达与病理分型、临床分期、淋巴结转移无关(P>0.05),但与颅神经侵犯及3年生存率有关(P<0.05)。cyclin E与p27kip1二者的表达有负相关性(r=-0.509,χ2=9.745,P=0.002)。结论:cyclin E和p27kip1表达可能是判断鼻咽癌生物学行为的指标。 展开更多
关键词 b细胞周期蛋白E 细胞周期蛋白质依赖激酶抑制因子 鼻咽肿瘤 免疫组织化学
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细胞周期S期激酶相关蛋白2预测乳腺癌预后价值的Meta分析 被引量:1
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作者 薛婷 张颖超 +1 位作者 尹光浩 王丹 《现代肿瘤医学》 CAS 2020年第18期3167-3172,共6页
目的:基于现有文献的Meta分析试阐述Skp2对乳腺癌(breast cancer,BC)预后的价值。方法:2015年10月之前在PubMed、EMBASE和Web of Science等数据库检索到的符合标准的研究。在95%可信区间(confidence interval,CI)内,以风险比(hazard rat... 目的:基于现有文献的Meta分析试阐述Skp2对乳腺癌(breast cancer,BC)预后的价值。方法:2015年10月之前在PubMed、EMBASE和Web of Science等数据库检索到的符合标准的研究。在95%可信区间(confidence interval,CI)内,以风险比(hazard ratio,HR)阐明Skp2表达和BC临床结果之间的相关性,包括总存活数(overall survival,OS)、无病生存数(disease-free survival,DFS)和BC带病生存数。结果:共计9个研究包括1820个病例。Meta分析结果表明:Skp2过表达与BC患者低OS(HR=2.58,95%CI:1.83~3.63,P=0.000)和低DFS(HR=2.12,95%CI:1.48~3.05,P=0.000)相关。结论:Skp2过表达是肿瘤低生存率的独立危险因素。 展开更多
关键词 乳腺癌 META分析 总生存数 预后 细胞周期S期激酶相关蛋白2
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基于oncomine数据库分析细胞周期蛋白B2在肝细胞癌中的表达及意义 被引量:1
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作者 朱云峰 孔伟浩 +1 位作者 王恒毅 吴雪生 《肝胆外科杂志》 2019年第6期470-473,共4页
目的探讨细胞周期蛋白B2(CCNB2)在肝细胞癌(肝癌)中的表达及意义。方法通过对Oncomine数据库挖掘肝癌中CCNB2的信息,并对肝癌中有关CCNB2的研究进行meta分析。肝癌组织与癌旁正常组织之间CCNB2的表达差异采用t检验,CCNB2的表达与肝癌预... 目的探讨细胞周期蛋白B2(CCNB2)在肝细胞癌(肝癌)中的表达及意义。方法通过对Oncomine数据库挖掘肝癌中CCNB2的信息,并对肝癌中有关CCNB2的研究进行meta分析。肝癌组织与癌旁正常组织之间CCNB2的表达差异采用t检验,CCNB2的表达与肝癌预后的关系采用Kaplan-Meier法和Log-rank检验。结果Oncomine数据库中共收集了415个不同类型的研究,其中关于CCNB2表达有统计学意义的研究结果有86个.CCNB2表达上调的研究有76个、表达下调的研究有10个。共有7项研究涉及CCNB2在肝癌组织和正常组织中的表达,与正常肝组织相比.CCNB2在肝癌中呈高表达(t=2.789,P=0.004)。oncomine数据库中共提取2项关于CCNB2与肝癌患者预后的相关数据的队列研究,研究显示CCNB2的表达量与预后均无关(X2=0.2737,2.894;P>0.05)。结论CCNB2在肝癌中呈高表达,为临床肝癌发病机制的探索及肝癌靶向药物的开发提供了一个新的思路。 展开更多
关键词 细胞 细胞周期蛋白B2 Oncomine meta分析
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‘741杨’D2类细胞周期蛋白基因的克隆及功能鉴定 被引量:1
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作者 刘孝晨 关超男 +2 位作者 许楠 诸葛祥林 杨海灵 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第4期547-556,共10页
D类细胞周期蛋白(D-type cyclin,CYCD)调控细胞周期G1/S期转变。CYCD与细胞周期蛋白依赖性激酶(cyclin-dependent kinase,CDK)结合形成CYCD/CDK复合物,被激活的CYCD/CDK复合物通过磷酸化下游细胞周期响应因子调控细胞周期有序进行,进而... D类细胞周期蛋白(D-type cyclin,CYCD)调控细胞周期G1/S期转变。CYCD与细胞周期蛋白依赖性激酶(cyclin-dependent kinase,CDK)结合形成CYCD/CDK复合物,被激活的CYCD/CDK复合物通过磷酸化下游细胞周期响应因子调控细胞周期有序进行,进而影响植物的生长发育。该研究以‘741杨’为实验材料,成功鉴定得到1个D2类细胞周期蛋白基因(PtoCYCD2;1)。研究表明:(1)实时定量PCR(qRT-PCR)显示,PtoCYCD2;1基因在根、茎、叶、叶柄、树皮和木质部中均有表达,在叶中的相对表达水平最高。(2)亚细胞定位表明PtoCYCD2;1蛋白定位于细胞核。(3)与野生型(Wild-Type poplar,WT)相比,过表达PtoCYCD2;1基因的‘741杨’出现株高降低,茎直径减小,叶片明显下卷的表型。(4)扫描电镜分析(SEM)显示,转基因杨树叶片的上表皮细胞平均面积变小,细胞数量增多;树脂切片结果显示与WT相比,转基因杨树叶片的栅栏组织和海绵组织的细胞间隙疏松。(5)qRT-PCR结果显示,转基因杨树中细胞周期调控基因CDKA;1、CDKB1;1和CDKB2;1的表达水平显著上调,植物成视网膜细胞瘤相关蛋白1(retinoblastoma-related protein1,RBR1)基因、细胞周期蛋白依赖性激酶抑制因子(kip-related protein,KRP)基因的表达水平显著下调。该研究结果为进一步研究木本植物CYCD2基因的功能奠定了基础。 展开更多
关键词 ‘741杨’ 细胞周期蛋白 PtoCYCD2 1基因 基因表达 细胞定位 功能分析
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小麦木瓜类半胱氨酸蛋白酶基因TaRD21的克隆及赤霉病菌诱导下的表达分析
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作者 蒋正宁 高致富 +5 位作者 寿露露 江伟 王玲 陈甜甜 张勇 高德荣 《麦类作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第7期819-826,共8页
木瓜类半胱氨酸蛋白酶(PLCPs)作为一类重要的蛋白水解酶,在植物生长发育以及胁迫应答过程中都发挥着重要作用。本研究从抗、感赤霉病小麦品种差异表达基因谱中获得1个注释为RD21 Cysteine proteases的EST(表达序列标签),以此序列检索小... 木瓜类半胱氨酸蛋白酶(PLCPs)作为一类重要的蛋白水解酶,在植物生长发育以及胁迫应答过程中都发挥着重要作用。本研究从抗、感赤霉病小麦品种差异表达基因谱中获得1个注释为RD21 Cysteine proteases的EST(表达序列标签),以此序列检索小麦最新基因组数据库并设计引物,从小麦中克隆到3个基因,分别命名为TaRD21-2A、TaRD21-2B和TaRD21-2D,属于PLCPs RD21家族。序列分析表明,3个基因的开放阅读框长度分别为1410、1428和1419 bp,分别编码469、475和472个氨基酸。序列比对发现,3个基因的序列相似性为89.3%,所编码蛋白的氨基酸序列相似性为95.6%。系统进化分析表明,TaRD21-2A、TaRD21-2B和TaRD21-2D蛋白的同源性较高,且与乌拉尔图小麦TuRD21A蛋白聚为一类。qRT-PCR分析表明,3个TaRD21基因均受水杨酸(SA)、乙烯利(ETH)以及赤霉病菌诱导表达;感病品种中,TaRD21-2A对SA和赤霉病菌的响应更迅速,且表达量较高;抗病品种中,TaRD21-2B和TaRD21-2D基因对ETH的响应更迅速。 展开更多
关键词 小麦 木瓜半胱氨酸蛋白 TaRD21 赤霉病菌 表达分析
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D类细胞周期蛋白与肿瘤研究进展 被引量:7
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作者 卢筱洪 《国外医学(内科学分册)》 1997年第10期432-435,439,共5页
细胞周期失控在肿瘤发生中的作用愈来愈受到重视。D类细胞周期蛋白作用于决定细胞分化的关键时期—G1期,在此期与一些抑癌基因及其产物组成一个负反馈调节圈,在调控细胞周期及肿瘤发生中起重要作用。
关键词 肿瘤 细胞周期 D细胞 细胞周期蛋白
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水稻类病变突变体lms1的表型鉴定与抗病分子机制分析
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作者 余瑶 王紫瑶 +5 位作者 周思睿 刘鹏程 叶亚峰 马伯军 刘斌美 陈析丰 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期857-870,共14页
类病变突变体是研究植物细胞死亡和抗病分子机制的重要遗传材料。通过辐射诱变粳稻品种武运粳7号,获得一个少见的抗病性下降的类病变突变体lms1(lesion mimic and disease susceptible mutant 1)。与野生型相比,该突变体叶片自发出现红... 类病变突变体是研究植物细胞死亡和抗病分子机制的重要遗传材料。通过辐射诱变粳稻品种武运粳7号,获得一个少见的抗病性下降的类病变突变体lms1(lesion mimic and disease susceptible mutant 1)。与野生型相比,该突变体叶片自发出现红褐色斑点,其株高、穗长、每穗粒数以及单株产量降低,但千粒重增加;对水稻白叶枯病的抗性显著下降,组织染色表明突变体的叶片中存在明显的细胞死亡以及活性氧的过量积累。遗传分析表明,lms1突变体的表型受单隐性核基因控制,利用图位克隆技术将lms1基因精细定位于水稻9号染色体Indel7和Indel8两个分子标记间,物理距离为62 kb。定位区间内候选基因的PCR扩增测序结果表明,其中一个编码泛素羧基末端水解酶的OsLMP1(Lesion Mimic Phenotype 1)基因第1个外显子中插入了一段长度为654 bp的序列,导致其蛋白翻译提前终止。利用蛋白组学技术分析了lms1突变体与野生型对照的蛋白积累水平,共鉴定到19个差异蛋白(7个上调、12个下调),主要参与氧化还原、叶绿素合成、光合作用等代谢途径。上述结果为进一步研究OsLMP1基因的功能及其调控细胞程序性死亡与抗病性的分子机制提供借鉴。 展开更多
关键词 水稻 病变 lms1 基因定位 蛋白组学分析
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miR-449b和miR-34c对卵巢癌细胞SKOV3-ipl周期相关蛋白的下调及细胞周期阻滞作用 被引量:7
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作者 马丽萍 李娜 +1 位作者 何湘君 张旗 《北京大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2011年第1期129-133,共5页
目的:基于miR-449和miR-34在p53突变的卵巢癌细胞系SKOV3和SKOV3-ipl的表达差异,研究探讨这些miRNA对肿瘤细胞生长、细胞周期的影响及靶基因的表达变化。方法:通过反转录实时定量PCR方法测定miR-449a/b和miR-34b,c在SKOV3和SKOV3-ipl... 目的:基于miR-449和miR-34在p53突变的卵巢癌细胞系SKOV3和SKOV3-ipl的表达差异,研究探讨这些miRNA对肿瘤细胞生长、细胞周期的影响及靶基因的表达变化。方法:通过反转录实时定量PCR方法测定miR-449a/b和miR-34b,c在SKOV3和SKOV3-ipl的表达,通过转染使它们在极低表达的SKOV3-ipl中获得表达。用MTS方法测定细胞生长率变化、流式细胞术检测细胞周期改变、Western blot检测细胞周期相关蛋白表达。结果:miR-449b和miR-34c使SKOV3-ipl黏附性下降28%~34%,细胞周期阻滞:G1期细胞数量分别增加15.62%和15.71%;S期细胞数量分别减少15.96%和16.56%。细胞周期相关蛋白CDK6和CDC25A均表达下调,miR-449b使CDK6减少39%、CDC25A减少22%;miR-34c使CDK6减少49%、CDC25A减少32%;而miR-449b与miR-34c共同作用后,下调作用更明显,CDK6减少69%,CDC25A减少86%,CyclinA减少59%。结论:miR-449b和miR-34c使高恶性卵巢癌细胞系SKOV3-ipl发生细胞周期阻滞,CDK6、CDC25A和CyclinA表达均下调。 展开更多
关键词 卵巢肿瘤 细胞周期蛋白 微RNAS
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