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基于区域生长的细胞生长汇合度计算
被引量:
1
1
作者
邵一波
许志磊
姚拓中
《计算机科学与应用》
2020年第2期236-244,共9页
细胞生长汇合度一般指细胞贴壁并且完全舒展之后,细胞所占的面积的占培养表面面积的百分比,它作为细胞体外培养环节中的主要参数,对后续的传代培养有着重要影响。传统计算细胞生长汇合度主要的方法通过人工观察,根据经验值判断,对结果...
细胞生长汇合度一般指细胞贴壁并且完全舒展之后,细胞所占的面积的占培养表面面积的百分比,它作为细胞体外培养环节中的主要参数,对后续的传代培养有着重要影响。传统计算细胞生长汇合度主要的方法通过人工观察,根据经验值判断,对结果有较大的误差,不适用于大规模批量生产。为此本文采用数字图像处理技术代替人工,提出了一种基于区域生长的细胞生长汇合度计算方法。首先,采用改进的高斯-拉普拉斯算子对图像预处理增强对比度;其次,应用均值漂移算法将细胞区域和非细胞区域分离;最后,使用数学形态学操作过滤面积较小的空白区域,进而实现细胞区域与背景的有效分离,得到准确细胞的生长汇合度。本文通过实验室采集的Hela细胞数据集与人工方式相比较,保证了准确性的同时提高了计算速度,在批量生产过程中有效替代传统的人工方法进行细胞生长汇合度计算。
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关键词
细胞
生长
汇合
度
均值漂移
高斯-拉普拉斯算子
区域生长
下载PDF
职称材料
间充质干细胞生长汇合度自动分析算法研究
被引量:
2
2
作者
白华
张凤凤
+4 位作者
张诚
赵军发
严淑琳
张建中
韩之波
《中国细胞生物学学报》
CAS
CSCD
2017年第11期1444-1451,共8页
细胞生长汇合度是细胞体外培养环节中的重要参数。目前的细胞汇合度评估方法主要依靠人工,其结果效率低、精度差,且主观性强。图像处理技术具有快速、准确、自动化程度高等优点,在生物医学领域应用日益广泛,用来分析细胞汇合度可以在很...
细胞生长汇合度是细胞体外培养环节中的重要参数。目前的细胞汇合度评估方法主要依靠人工,其结果效率低、精度差,且主观性强。图像处理技术具有快速、准确、自动化程度高等优点,在生物医学领域应用日益广泛,用来分析细胞汇合度可以在很大程度上提高检测效率和客观准确性。该文提出的贴壁细胞生长汇合度自动分析算法首先运用灰度形态学的高低帽变换组合与背景减除相结合的预处理增强图像对比度,然后运用改进的K-Means聚类算法将前景和背景进行粗略地区分,最后通过面积滤波和二值形态学的算法组合对图像进行后处理,实现前景和背景的良好区分并计算细胞汇合度。实验结果显示,该算法准确性较高,可有效替代传统人工方法对细胞汇合度进行自动检测。
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关键词
间充质干
细胞
细胞汇合度
数学形态学
改进的K-Means算法
图像处理
原文传递
题名
基于区域生长的细胞生长汇合度计算
被引量:
1
1
作者
邵一波
许志磊
姚拓中
机构
宁波工程学院电子与信息工程学院
出处
《计算机科学与应用》
2020年第2期236-244,共9页
文摘
细胞生长汇合度一般指细胞贴壁并且完全舒展之后,细胞所占的面积的占培养表面面积的百分比,它作为细胞体外培养环节中的主要参数,对后续的传代培养有着重要影响。传统计算细胞生长汇合度主要的方法通过人工观察,根据经验值判断,对结果有较大的误差,不适用于大规模批量生产。为此本文采用数字图像处理技术代替人工,提出了一种基于区域生长的细胞生长汇合度计算方法。首先,采用改进的高斯-拉普拉斯算子对图像预处理增强对比度;其次,应用均值漂移算法将细胞区域和非细胞区域分离;最后,使用数学形态学操作过滤面积较小的空白区域,进而实现细胞区域与背景的有效分离,得到准确细胞的生长汇合度。本文通过实验室采集的Hela细胞数据集与人工方式相比较,保证了准确性的同时提高了计算速度,在批量生产过程中有效替代传统的人工方法进行细胞生长汇合度计算。
关键词
细胞
生长
汇合
度
均值漂移
高斯-拉普拉斯算子
区域生长
分类号
TP3 [自动化与计算机技术—计算机科学与技术]
下载PDF
职称材料
题名
间充质干细胞生长汇合度自动分析算法研究
被引量:
2
2
作者
白华
张凤凤
张诚
赵军发
严淑琳
张建中
韩之波
机构
天津工业大学电子与信息工程学院
天津市光电检测技术与系统重点实验室
细胞产品国家工程研究中心
天津昂赛细胞基因工程有限公司
出处
《中国细胞生物学学报》
CAS
CSCD
2017年第11期1444-1451,共8页
基金
国家自然科学基金(批准号:61201106
61307094)
+1 种基金
天津市应用基础与前沿技术研究计划项目(批准号:14JCQNJC01800)
天津市光电传感器与传感网络技术重点实验室开放项目资助的课题~~
文摘
细胞生长汇合度是细胞体外培养环节中的重要参数。目前的细胞汇合度评估方法主要依靠人工,其结果效率低、精度差,且主观性强。图像处理技术具有快速、准确、自动化程度高等优点,在生物医学领域应用日益广泛,用来分析细胞汇合度可以在很大程度上提高检测效率和客观准确性。该文提出的贴壁细胞生长汇合度自动分析算法首先运用灰度形态学的高低帽变换组合与背景减除相结合的预处理增强图像对比度,然后运用改进的K-Means聚类算法将前景和背景进行粗略地区分,最后通过面积滤波和二值形态学的算法组合对图像进行后处理,实现前景和背景的良好区分并计算细胞汇合度。实验结果显示,该算法准确性较高,可有效替代传统人工方法对细胞汇合度进行自动检测。
关键词
间充质干
细胞
细胞汇合度
数学形态学
改进的K-Means算法
图像处理
Keywords
mesenchymal stem cells
cell confluence
morphology mathematics
improved K-Meansalgorithm
image processing
分类号
Q25 [生物学—细胞生物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于区域生长的细胞生长汇合度计算
邵一波
许志磊
姚拓中
《计算机科学与应用》
2020
1
下载PDF
职称材料
2
间充质干细胞生长汇合度自动分析算法研究
白华
张凤凤
张诚
赵军发
严淑琳
张建中
韩之波
《中国细胞生物学学报》
CAS
CSCD
2017
2
原文传递
已选择
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参考文献
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