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非小细胞肺癌间充质干细胞差异性模块筛选和功能分析
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作者 陈婧 李恒 +6 位作者 张小平 赵玉凤 刘学春 李文 刘骏 王忠 顾浩 《现代肿瘤医学》 CAS 2024年第18期3459-3467,共9页
目的:通过筛选间充质干细胞特异共表达的基因簇分析非小细胞肺癌(NSCLC)间充质干细胞(MSCs)在NSCLC发生、发展的分子机制和潜在的治疗靶标。方法:基于GEO高通量基因表达谱数据,采用模块药理学平台构建NSCLC-MSCs基因共表达网络,通过Z_(s... 目的:通过筛选间充质干细胞特异共表达的基因簇分析非小细胞肺癌(NSCLC)间充质干细胞(MSCs)在NSCLC发生、发展的分子机制和潜在的治疗靶标。方法:基于GEO高通量基因表达谱数据,采用模块药理学平台构建NSCLC-MSCs基因共表达网络,通过Z_(summary)、ME特征参数精细化筛选NSCLC-MSCs差异模块。对差异性模块的基因簇进行GO功能分析和KEGG通路富集分析,并通过生存分析、药物靶标筛选等方法分析差异性模块中不同功能基因对肺癌的治疗和预后价值。结果:研究共得到46个NSCLC-MSCs共表达模块,与正常肺组织(NLT)-MSCs相比共得到3个差异模块分别为29号、33号、35号,共计492个基因。功能富集分析表明,29号模块主要与细胞调控和适应性响应有关,33号模块与细胞免疫调节相关,35号模块主要与细胞代谢调控相关。通过分析发现差异模块中有79(16.1%)个药物靶标相关的调控基因,有372个(70.5%)是预后显著性(P<0.01)的预后相关基因,说明差异模块中的基因簇在疾病治疗和预后方面具有重要价值。结论:模块药理学平台可以筛选识别出NSCLC-MSCs特异性相关差异模块,为精细化筛选药物靶标和预后标志物提供方法和手段。 展开更多
关键词 模块药理 间充质干细胞 非小细胞肺癌 预后标志物 细胞特异性表达 药物靶标
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骨折愈合过程成骨细胞特异性表达补体受体c5ar1的表达 被引量:2
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作者 党胜利 王航辉 崔玉婷 《中国矫形外科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第14期1297-1301,共5页
[目的]探讨股骨粗隆间骨折动力髋螺钉(DHS)内固定术后骨折愈合过程中成骨细胞特异性表达补体受体c5ar1的表达。[方法]选取2010年1月~2014年12月本院收治的股骨粗隆间骨折并经DHS内固定治疗的患者86例。应用酶联免疫吸附法检测患者入院... [目的]探讨股骨粗隆间骨折动力髋螺钉(DHS)内固定术后骨折愈合过程中成骨细胞特异性表达补体受体c5ar1的表达。[方法]选取2010年1月~2014年12月本院收治的股骨粗隆间骨折并经DHS内固定治疗的患者86例。应用酶联免疫吸附法检测患者入院及术后6周血清c5ar1表达水平。术后6个月影像评价骨折是否愈合。术后6周应用血清c5ar1预测骨折愈合ROC曲线下面积、诊断界值以及对应的敏感度及特异度。并应用Cox回归分析分析影响骨折愈合的因素。[结果]术后6个月X线片检查示68例骨折愈合,18例骨折未愈合。入院时愈合组患者中血清c5ar1表达水平为(41.26±11.25)ng/ml,与未愈合组的(40.65±11.52)ng/ml差异无统计学意义(P>0.05)。术后6周愈合组患者中血清c5ar1表达水平为(56.32±12.54)ng/ml,显著高于未愈合组的(34.23±8.98)ng/ml(P<0.05)。术后6周血清c5ar1的ROC曲线下面积为0.80,预测骨折愈合最佳诊断界值为46.50 ng/ml,敏感度和特异度分别为81%、54%。Cox回归分析结果提示,年龄>60岁、吸烟史、糖尿病史、术后6周血清c5ar1水平≤46.50 ng/ml不利于术后骨折愈合(P<0.05)。[结论]血清c5ar1水平可作为预测股骨粗隆间骨折DHS内固定治疗患者骨折愈合的血清学标志物。 展开更多
关键词 成骨细胞特异性表达补体受体 骨折愈合 动力髋螺钉 股骨粗隆间骨折
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拟南芥静止中心细胞特异性基因表达系统的构建及功能验证 被引量:2
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作者 陈月琴 严欢欢 +3 位作者 陈玉洁 陈丽华 王甜 张汉马 《植物学研究》 2019年第3期181-189,共9页
静止中心是高等植物根尖分生组织中一群重要细胞,在根尖生长点功能和干细胞调控中起关键作用。但由于缺少静止中心细胞特异性的基因表达工具,对该细胞群中基因功能的了解非常有限。本研究利用拟南芥WOX5基因的启动子片段和GAL4-VP16-UA... 静止中心是高等植物根尖分生组织中一群重要细胞,在根尖生长点功能和干细胞调控中起关键作用。但由于缺少静止中心细胞特异性的基因表达工具,对该细胞群中基因功能的了解非常有限。本研究利用拟南芥WOX5基因的启动子片段和GAL4-VP16-UAS人工合成基因转录激活系统构建了一个可在拟南芥根尖静止中心细胞中特异性地驱动目的基因表达的转基因系统。通过绿色荧光蛋白基因证实了该表达系统的静止中心细胞特异性,并用两个已知根干细胞调控基因WOX5和FEZ检测了该表达系统用于研究静止中心基因功能的可行性及功效。研究结果表明所构建的表达系统具静止中心细胞特异性,可用来研究不同调控基因在该细胞群中的功能。 展开更多
关键词 拟南芥 静止中心 细胞特异性表达 WOX5 启动子
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心肌特异性表达腺病毒载体的构建及鉴定 被引量:2
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作者 高文谦 李小鹰 +1 位作者 李梁 裴雪涛 《军医进修学院学报》 CAS 2000年第4期279-281,共3页
目的 :构建心肌特异性表达的腺病毒载体 ,使外源基因在心肌细胞中特异性表达。方法 :将心肌特异性肌凝蛋白轻链蛋白 2 (mlc 2v)启动子克隆至腺病毒穿梭质粒 ,并将绿色荧光蛋白 (GFP)基因克隆至此质粒中 ,同源重组含GFP基因的缺陷型腺病... 目的 :构建心肌特异性表达的腺病毒载体 ,使外源基因在心肌细胞中特异性表达。方法 :将心肌特异性肌凝蛋白轻链蛋白 2 (mlc 2v)启动子克隆至腺病毒穿梭质粒 ,并将绿色荧光蛋白 (GFP)基因克隆至此质粒中 ,同源重组含GFP基因的缺陷型腺病毒 (AdmlcGFP) ,转染心肌细胞及非心肌细胞。结果 :经RT PCR分析 ,转染的心肌细胞有GFPmRNA的表达 ,而转染的非心肌细胞无GFPmRNA的表达 ;荧光显微镜下观察 ,可见转染的心肌细胞表达GFP ,而转染的的非心肌细胞不表达GFP。结论 :构建的心肌特异性表达腺病毒载体可使外源基因在心肌细胞内特异性表达。 展开更多
关键词 腺病毒载体 mlc-2v GFP基因 心肌细胞特异性表达
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卡介苗接种效果与树突状细胞表达的特异性表面分子重复序列区基因多态性的关系 被引量:1
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作者 周晓光 劳卫民 +5 位作者 周平 郭芳 郭炽星 何超文 李丽妍 肖昕 《实用儿科临床杂志》 CAS CSCD 北大核心 2010年第22期1705-1707,共3页
目的分析汉族婴儿接种卡介苗(BCG)后的免疫效果,探讨树突状细胞表达的特异性表面分子(DC-SIGN)编码第4外显子多拷贝重复序列区(简称DC-SIGN重复序列区基因)多态性与BCG接种效果的关系。方法收集200例符合以下入选条件的汉族婴儿作为研... 目的分析汉族婴儿接种卡介苗(BCG)后的免疫效果,探讨树突状细胞表达的特异性表面分子(DC-SIGN)编码第4外显子多拷贝重复序列区(简称DC-SIGN重复序列区基因)多态性与BCG接种效果的关系。方法收集200例符合以下入选条件的汉族婴儿作为研究对象:1.出生24 h内在出生医院接种BCG;2.BCG接种后12周在指定医疗机构进行结核菌素纯蛋白衍生物(PPD)试验;3.排除早产儿接种、伴随感染和漏接种后补接种等情况;4.获得婴儿监护人的知情同意。采集150例BCG接种后PPD试验阳性婴儿(PPD阳性组)和50例BCG接种后PPD阴性婴儿(PPD阴性组)的外周静脉血,通过全血基因组DNA抽提、基因片断的PCR扩增和琼脂糖电泳分析DC-SIGN重复序列区基因多态性,探讨BCG接种效果与DC-SIGN编码基因多态性的关系。结果在200例BCG接种后PPD阳性和PPD阴性汉族婴儿中,存在6型和7型2种DC-SIGN序列区基因型,分别组成7/7野生型纯合子(197例,占98.5%)或6/7变异型(3例,占1.5%)。150例PPD阳性婴儿的DC-SIGN重复序列区基因均为7/7(100.0%),50例PPD阴性组的DC-SIGN重复序列区基因中,47例为7/7纯合子(94.0%),3例为6/7杂合子(6.0%)。二组比较差异有统计学意义(2χ=9.137 1,P<0.05)。结论汉族婴儿DC-SIGN重复序列区基因以7/7野生型纯合子为主,BCG接种失败(PPD阴性)汉族婴儿存在6/7变异型杂合子。DC-SIGN重复序列区基因变异可能是导致BCG接种失败的原因之一。 展开更多
关键词 卡介苗 细胞免疫 树突状细胞表达异性表面分子 基因多态性
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VEGF和Ki-67在复发性小脑血管母细胞瘤中的临床意义
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作者 滕宏伟 薛新潮 《交通医学》 2012年第1期36-38,共3页
目的:探讨VEGF和Ki-67在复发的小脑血管母细胞瘤中表达的意义。方法:采用免疫组化(SP法)检测VEGF和Ki-67在18例复发的小脑血管母细胞瘤组织中和43例未复发的小脑血管母细胞瘤中的表达,采用SPSS13.0统计软件分析其表达的差异。结果:VEGF... 目的:探讨VEGF和Ki-67在复发的小脑血管母细胞瘤中表达的意义。方法:采用免疫组化(SP法)检测VEGF和Ki-67在18例复发的小脑血管母细胞瘤组织中和43例未复发的小脑血管母细胞瘤中的表达,采用SPSS13.0统计软件分析其表达的差异。结果:VEGF、Ki-67在复发组的阳性表达率分别为88.9%(16/18)和83.1%(15/18);VEGF、Ki-67在未复发组的阳性表达率为74.4%(32/43)和62.7%(27/43),两者之间差异有统计学意义(P<0.05)。结论:VEGF促使肿瘤血管形成,对病变的复发产生影响;联合检测VGFR和Ki-67,对小脑血管母细胞瘤的预后判断有一定帮助。 展开更多
关键词 复发性小脑血管母细胞 血管通透性因子 细胞增殖期异性表达的核抗原
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Isolation of a 1 195 bp 5′-Flanking Region of Rice Cytosolic Fructose-1,6-bisphosphatase and Analysis of Its Expression in Transgenic Rice
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作者 司丽珍 曹守云 储成才 《Acta Botanica Sinica》 CSCD 2003年第3期359-364,共6页
A genomic DNA fragment containing the 5'-upstream sequence and part of the open reading frame corresponding to the cytosolic fructose-1,6-bisphosphatase (cyFBPase) cDNA was isolated by Genome Walking. The 1 195 li... A genomic DNA fragment containing the 5'-upstream sequence and part of the open reading frame corresponding to the cytosolic fructose-1,6-bisphosphatase (cyFBPase) cDNA was isolated by Genome Walking. The 1 195 lip 5'-flanking region which started from the translation initiation ATG codon was fused to reporter gene encoding beta-glucuronidase (GUS) and stably transferred to rice via particle bombardment. Strong GUS activity was detected in leaves and leaf sheaths of transgenic rice, but not in culms and roots. Histochemical localization revealed that GUS expression was exclusively restricted to mesophyll cells in transgenic rice. Our results indicate that the 1 195 bp fragment contains all the cis-elements required for directing mesophyll-specific expression pattern in rice. 展开更多
关键词 rice (Oryza sativa) promoter cytosolic fructose-1 6-bisphosphatase gene mesophyll-specific expression
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Leukolysin/MMP25/MT6-MMP: a novel matrix metalloproteinase specifically expressed in the leukocyte lineage 被引量:6
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作者 PEI DUANQING(Department of Pharmacology, 6-120 Jackson Hall, 321Church St. S.E., University of Minnesota, Minneapolis,MN 55455, USA)Tel: 612-626-1468 Fax: 612-625-8408 E-mail: peixx003@tc. umn. edu 《Cell Research》 SCIE CAS CSCD 1999年第4期291-303,共13页
A novel matrix metalloproteinase (MMP) was identified from leukocytes and found to be specifically expressedby peripheral blood leukocytes among 29 different tissuesexamined. Named leukolysin, it encodes for 562 resid... A novel matrix metalloproteinase (MMP) was identified from leukocytes and found to be specifically expressedby peripheral blood leukocytes among 29 different tissuesexamined. Named leukolysin, it encodes for 562 residueswith a conserved MMP structure, i.e., pre-, pro-, catalytic , hinge- and hemopexin-like domains, but also a RXK/RRmotif, known for its role in MMP zymogen activation, anda C-terminal hydrophobic segment. Overall, leukolysindisplays the strongest homology to the newly identifiedMT-MMP subgroup with 45% and 39% identities to MT4and MT1-MMPs vs 30% and 31.5% to MMP1 and 3 respectively. Unlike MT4-MMP whose proteolytic activityremains undefined, a C-terminally truncated leukolysin isexpressed as a strong gelatinolytic species at 28 kDa whichis derived from a cell-associated 34 kDa proenzyme, presumably by furin or proprotein convertase mediated removal of the propeptide (-6 kDa). By green fluorescentprotein (GFP) tagging, the intracellular proenzyme is localized to granules throughout the cell, suggesting thatactivation occur immediately prior to secretion. Taken together, leukolysin may be part of the proteolytic arsenaldeployed by leukocytes during inflammatory responses. 展开更多
关键词 MT6-IMP MMP25 leukolysin MAP Matrix Remodeling Leukocytes.
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Myeloidcell-lineage and premylocytic-stage-specific-expression of the mouse myeloperoxidase gene is controlled at initiation as well as elongation levels of transcription 被引量:2
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作者 ZHU JING DE (Department of Medical Oncology, University of Glasgow,Glasgow G61 1BD, UK) 《Cell Research》 SCIE CAS CSCD 1999年第2期107-134,共28页
The myeloperoxidase (MPO) is an important microbicidal protein present at high concentration in the primary granule of mature granulocyte and its expression is regulated in both myeloidcell-lineage and premyelocytic-s... The myeloperoxidase (MPO) is an important microbicidal protein present at high concentration in the primary granule of mature granulocyte and its expression is regulated in both myeloidcell-lineage and premyelocytic-stagespecific manners. A better understanding of the underlying control mechanisms should provide insights into the temporal and co-ordinate regulation of the gene expression during granulopoiesis. We have identified its promoter by mapping the start(s) of transcription using various molecular approaches together with demonstrating the promoter function of the relevant DNA segment in a transient transfection reporter assay. Besides the major start of transcription mapped at G residue, 11 nucleotide upstream of the 3’ end of exon 0, the usage of that is specific to the MPO expressing cell lines, we have shown that irrespective of the MPO-expression status of the hematopoietic cells, transcription occurs broadly within a two kb region upstream of the 5’ proximity of the gene, and is largely terminated in nitron 2. These data support a model of the pre myelocytic-stage-specific MPO expression, the control of which is operated at initiation as well as elongation levels of transcription. 展开更多
关键词 Myeloid-cell-lineage premylocytic-stage-specific-expression myloperosidase gene gene controll
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The effect of baicalein on the expression of SATB1 in MDA-MB-231 cells
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作者 Xiaoyan Gao Xingcong Ma +2 位作者 Yinan Ma Xinghuan Xue Shuqun Zhang 《The Chinese-German Journal of Clinical Oncology》 CAS 2014年第11期503-508,共6页
Baicalein had been proved to have anti-cancer activity in vitro and in vivo, including the inhibition of malignant proliferation, migration, adhesion and invasion of many kinds of cancer cells. The special AT-rich seq... Baicalein had been proved to have anti-cancer activity in vitro and in vivo, including the inhibition of malignant proliferation, migration, adhesion and invasion of many kinds of cancer cells. The special AT-rich sequence binding protein 1 (SATB1) is a tissue-specific expression of nuclear matrix-binding protein and is reported to be a breast cancer "gene group organizer". Previous studies have shown that SATB1 is involved in the growth, metastasis and prognosis of breast cancer. The present study was aimed to investigate whether baicalein inhibits the proliferation and migration of MDA-MB-231 human breast cancer cells through down-regulation of the SATB1 expression. Methods: MDA-MB-231 cells were treated for 24 h, 48 h and 72 h with various concentrations of baicalein (0, 5, 10, 20, 40 and 80 pM) respectively. Then, the proliferation and migration of MDA-MB-231 cells following treatment with baicalein were determined using colorimetric 3-(4, 5-dimethylthia- zol-2-yl) 2, 5-diphenyltetrazolium bromide (MTT) and wound healing assays. Thereafter, western blot analysis was performed to detect the changes of SATB1 protein expression in MDA-MB-231 cells. Results: Along with the prolongation of time and increase of drug concentration, inhibitory effect of baicalein on proliferation and migration of MDA-MB-231 cells gradually in- creased, in a time.- and dose- dependent manner (P 〈 0.05). Meanwhile, after treated with baicalein in different concentrations for 48 h, the level of SATB1 protein expression of MDA-MB-231 cells decreased obviously, in a dose-dependent manner (P 〈 0.05). Conclusion: Baicalein inhibits breast cancer cell proliferation and suppresses its invasion and metastasis by reducing cell migration possibly by down-regulation of the SATB1 protein expression, indicating that baicalein is a potential therapeutic agent for human breast cancer. 展开更多
关键词 BAICALEIN special AT-rich sequence binding protein 1 (SATB1) breast cancer PROLIFERATION MIGRATION
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玉米糖运载蛋白基因ZmSWEET10a的生物信息和表达分析 被引量:4
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作者 杨于天程 范会 +2 位作者 王姣姣 朱娜 刘征 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2018年第20期6537-6544,共8页
在植物体内,蔗糖转运蛋白(SWEET)在蔗糖转运过程中发挥重要作用。本研究运用一系列生物信息学方法对C4作物玉米ZmSWEET10a基因及其蛋白进行了结构及功能分析。结果分析表明,该蛋白具备跨膜运输蛋白的典型特征。另外,该基因在授粉后18 d... 在植物体内,蔗糖转运蛋白(SWEET)在蔗糖转运过程中发挥重要作用。本研究运用一系列生物信息学方法对C4作物玉米ZmSWEET10a基因及其蛋白进行了结构及功能分析。结果分析表明,该蛋白具备跨膜运输蛋白的典型特征。另外,该基因在授粉后18 d表达量达到峰值,暗示着该基因是促进糖运输的关键基因,对于源叶向籽粒库进行糖的输出发挥重要作用。进一步检查ZmSWEET10a基因及糖合成、运输相关基因在玉米叶片花环状结构中的表达量,结果显示蔗糖磷酸转运蛋白基因(ZmSPS)、果糖-1,6-二磷酸酶基因(ZmFBPase)、糖转运蛋白基因ZmSWEET10a、ZmGPT2及ZmSUT等参与蔗糖合成和运输的基因均在维管束鞘细胞中存在特异性高表达。可见,在C4玉米叶片中,不仅卡尔文循环的产物三碳糖在维管束鞘细胞中合成,其光合同化物的运输形式-蔗糖的合成及运出也是在维管束鞘细胞中发生,表明C4玉米维管束鞘细胞中同时存在光合同化物的高效合成与同化物的高效运出机制,构成一个统一的有机体。因此,ZmSWEET10a基因是玉米SWEET基因家族中具有C4特异性的关键糖输出基因。总之,深入探讨ZmSWEET10a基因的特性及其在授粉不同天数的表达变化、以及该基因在维管束鞘细胞的特异性表达,将加深对玉米高光效机制的了解,并为提高作物产量的分子育种提供了新的基因元件。 展开更多
关键词 玉米 糖运载蛋白基因 生物信息 维管束鞘细胞特异性表达
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