术前血清V-set和免疫球蛋白结构域4以及长链非编码核糖核酸SBF2反义RNA1与肾结石患者经皮肾镜取石术后急性肾损伤的关系

目的探讨术前血清V-set和免疫球蛋白结构域4(VSIG4)以及长链非编码核糖核酸(LncRNA)SBF2反义RNA1(SBF2-AS1)与肾结石患者经皮肾镜取石术后急性肾损伤(AKI)的关系。方法选择2020年1月—2022年12月本院收治的109例肾结石患者为研究对象。术前检测患者血清VSIG4水平以及LncRNA SBF2-AS1表达,术后记录AKI发生情况。采用多因素Logistic回归模型分析肾结石患者经皮肾镜取石术后发生AKI的影响因素;采用受试者工作特征(ROC)曲线分析VSIG4、LncRNA SBF2-AS1预测肾结石患者经皮肾镜取石术后发生AKI的价值。结果本研究中,术后发生AKI者16例。AKI组血清VSIG4水平低于非AKI组,LncRNA SBF2-AS1表达高于非AKI组,差异均有统计学意义(P<0.05)。多因素Logistic回归分析显示,术前高尿酸水平、术前高LncRNA SBF2-AS1表达、较长的手术时间、术中低血压是肾结石患者经皮肾镜取石术后发生AKI的危险因素(P<0.05),术前高VSIG4水平是保护因素(P<0.05)。术前血清VSIG4、LncRNA SBF2-AS1水平预测肾结石患者经皮肾镜术后发生AKI的曲线下面积分别为0.854、0.705,二者联合预测的曲线下面积为0.948,大于各指标单独预测(Z=1.995、2.958,P<0.05)。结论肾结石患者术前血清VSIG4水平降低、LncRNA SBF2-AS1表达增高与经皮肾镜取石术后AKI的发生有关,联合检测术前VSIG4、LncRNA SBF2-AS1可预测术后AKI的发生风险。

基于N6-甲基腺苷相关长链非编码核糖核酸表达的喉鳞状细胞癌预后分析

目的 探索N6-甲基腺苷(m6A)相关长链非编码核糖核酸(lncRNA)与喉鳞状细胞癌(LSCC)的预后关系及其临床意义。方法 获取癌症基因组图谱(TCGA)数据库LSCC的转录组数据和临床数据,共表达分析筛选m6A基因相关的lncRNA,单变量Cox分析m6A相关lncRNA与LSCC预后关系、套索回归及交叉验证法迭代分析构建LSCC预后模型。采用实时荧光定量聚合酶链式反应(qPCR)验证构建预后模型的lncRNA在LSCC中的转录水平。通过预后模型计算风险评分,将LSCC区分为高、低风险患者,高、低风险患者之间进行基因集富集分析(GSEA)。风险评分与浸润LSCC的免疫细胞进行免疫相关性分析。结果 m6A相关基因与lncRNA的共表达分析筛选出169个与m6A基因相关的lncRNA(相关系数>0.4,P<0.001),通过单变量Cox分析确定了LSCC预后相关lncRNA:ALOX12-AS1(P<0.05)、LINC00528(P<0.05)、STAG3L5P-PVRIG2P-PILRB(P<0.05)、MNX1-AS1(P<0.01)和LINC02043(P<0.05)。套索回归、交叉验证迭代分析结果:变量为4时模型的均方根误差最小,即5个预后相关lncRNA仅有ALOX12-AS1、LINC00528、STAG3L5P-PVRIG2P-PILRB与MNX1-AS1可作为模型变量。预后模型:风险评分=(0.176723096228585×MNX1-AS1表达量)+(-0.614916717648596×ALOX12-AS1表达量)+(-0.814201385798827×LINC00528表达量)+(-0.436537752110547×STAG3L5P-PVRIG2P-PILRB表达量)。qPCR结果ALOX12-AS1(P<0.0001)、LINC00528(P<0.01)、STAG3L5P-PVRIG2P-PILRB(P<0.0001)、MNX1-AS1(P<0.0001)较于癌旁组织,在LSCC组织表达水平上调。GSEA分析结果:高风险患者在细胞-基质粘附(KEGG_FOCAL_ADHESION)(P<0.05)与细胞外基质受体相互作用(KEGG_ECM_RECEPTOR_INTERACTION)(P<0.05)的通路下调,低风险患者在碱基切除修复(KEGG_SPLICEOSOME)(P<0.05)、剪接体(KEGG_SPLICEOSOME)(P<0.05)通路上调。风险评分与免疫浸润细胞相关性分析,风险评分与效应B细胞(R=-0.24,P=0.017)、细胞毒性T细胞(R=-0.26,P=0.0091)和T滤泡辅助细胞(R=-0.22,P=0.028)呈负相关。结论 基于m6A相关LncRNA表达量构建的LSCC预后模型可作为预测LSCC患者预后的有效工具。

转录因子ETS1激活长链非编码RNA XIST促进胶质瘤细胞增殖

目的探讨ETS原癌基因1(ETS1)在胶质瘤中的生物学功能及其下游机制。方法生物信息学和免疫组织化学分析ETS1在胶质瘤组织中的表达;实时定量PCR(qRT-PCR)检测ETS1 mRNA和长链非编码RNA(lncRNA)X染色体失活特异转录本(XIST)的表达水平。CCK-8和5-乙炔基-2'-脱氧尿苷摄入实验检测细胞增殖。Western blot检测凋亡相关蛋白(Bax、Bak、Bcl-2)的表达。PROMO数据库预测ETS1与XIST启动子的结合位点。双荧光素酶报告基因实验和染色质免疫共沉淀-PCR用于验证ETS1与XIST启动子区域的结合关系。cBioPortal数据库分析ETS1 mRNA与lncRNA XIST在胶质瘤组织中表达的相关性。结果ETS1 mRNA和蛋白的表达水平在胶质瘤中显著上调(P<0.05)。敲低ETS1可显著抑制胶质瘤细胞增殖(P<0.05)并促进细胞凋亡(P<0.05)。ETS1可靶向结合XIST并促进XIST的表达(P<0.05),过表达XIST可逆转敲低ETS1对胶质瘤细胞增殖的抑制作用(P<0.05)以及对细胞凋亡的促进作用(P<0.05)。结论ETS1在胶质瘤组织中高表达,其可能通过促进lncRNA XIST高表达而减少细胞凋亡和促进胶质瘤细胞增殖。

神经母细胞瘤中MYCN相关长链非编码核糖核酸的功能研究

目的:筛选神经母细胞瘤(NB)中MYCN相关的长链非编码核糖核酸(lncRNA),分析其功能及对患者预后的影响,寻找潜在治疗靶点和分子标志物。方法:分别从TARGET及GEO数据库下载基因表达数据,并将两组数据分成MYCN高表达组和低表达组,R语言筛选出两组差异表达lncRNA,取共同差异表达lncRNA;通过ENCORI数据库预测与lncRNA互作的核糖核酸(RNA),DAVID数据库分析相关基因的功能与信号通路的富集情况;TARGET数据库进行相关生存分析。结果:TARGET数据库中共筛选出差异倍数在两倍以上的lncRNA 1104个,GEO数据库筛选出差异基因2849个,两个数据库中共同差异表达lncRNA 59个,ENCORI数据库预测与这些基因互作mRNA 547个,功能分析发现这些基因主要富集在调控神经系统疾病的相关通路,并通过调控转录、蛋白绑定等发挥相关生物学功能。利用TARGET数据库进行生存分析发现其中VPS9D1-AS1、LINC00649、LINC01234的异常表达可以影响患者生存。结论:运用生物信息学通过对MYCN相关差异表达lncRNA的分析发现VPS9D1-AS1、LINC00649、LINC01234可能与NB的发生发展密切相关,可为后续的研究提供方向与思路。

长链非编码核糖核酸KCNQ1重叠转录物1、Runt相关转录因子3与急性心肌梗死的关系

目的 探讨急性心肌梗死(acute myocardial infarction,AMI)患者血清长链非编码RNA KCNQ1重叠转录物1(long non-coding RNA KCNQ1 overlapping transcript 1,lncRNA KCNQ1OT1)、Runt相关转录因子3(Runt-related transcription factor 3,Runx3)表达水平及意义。方法 选取2019年1月至2020年4月在德阳市人民医院住院治疗的231例AMI患者为研究对象(AMI组),AMI患者按美国纽约心脏病协会心功能分级标准分为Ⅱ级组72例、Ⅲ级组81例、Ⅳ级组78例;同期选取229例健康体检者作为对照组。采用实时荧光定量聚合酶链反应(realtime fluorescence quantitative polymerase chain reaction,fqRT-PCR)法检测血清lncRNA KCNQ1OT1、Runx3表达水平;酶联免疫吸附(ELISA)法检测氨基末端脑钠肽前体(N-terminal pro-brain natriuretic peptide,NT-proBNP)、肌酸激酶(creatine kinase,CK)、肌酸激酶同工酶(creatine kinase isoenzymes,CK-MB)、心肌肌钙蛋白(cardiac troponin,cTn)I、肌红蛋白(myoglobin,MYO)浓度;超声心动图检查左心室射血分数(left ventricular ejection fraction,LVEF)、左心室舒张末期内径(left ventricular end-diastolic diameter,LVEDD)、左心室收缩末期内径(left ventricular end-systolic diameter,LVESD);分析AMI患者血清lncRNA KCNQ1OT1、Runx3表达水平与心功能指标的相关性;分析血清lncRNA KCNQ1OT1、Runx3表达水平对AMI的诊断价值;分析影响AMI发生的因素。结果AMI组患者lncRNA KCNQ1OT1(1.54±0.36 vs. 1.01±0.26)、LVESD[(52.68±6.74)mm vs.(42.73±6.52)mm]、LVEDD[(61.79±6.03)mm vs.(51.62±5.32)mm]、NT-proBNP[(292.23±34.27)ng/L vs.(96.27±23.42)ng/L]、CK[(746.82±210.55)U/L vs.(70.32±15.48)U/L]、CK-MB[(156.95±49.87)U/L vs.(1.25±0.37)U/L]、cTnI[(27.48±7.92)ng/mL vs.(1.13±0.26)ng/mL]、MYO[(678.94±159.78)ng/mL vs.(12.45±2.73)ng/mL]浓度高于对照组,Runx3(0.67±0.20 vs.1.02±0.24)、LVEF(43.26%±4.31%vs. 56.38%±5.12%)低于对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。心功能Ⅳ级组lncRNA KCNQ1OT1、LVESD、LVEDD、NT-proBNP、CK、CK-MB、cTnI、MYO高于Ⅲ级组和Ⅱ级组,Runx3、LVEF低于Ⅲ级组和Ⅱ级组,差异有统计学意义(P<0.05);Ⅲ级组lncRNA KCNQ1OT1、LVESD、LVEDD、NT-proBNP、CK、CK-MB、cTnI、MYO高于Ⅱ级组,Runx3、LVEF低于Ⅱ级组,差异有统计学意义(P<0.05)。血清lncRNA KCNQ1OT1、Runx3表达水平与病变支数、Gensini积分有关,且随着病变支数、Gensini积分增加,lncRNA KCNQ1OT1表达水平升高、Runx3表达水平降低(P<0.05)。AMI患者血清lncRNA KCNQ1OT1与Runx3表达水平呈负相关(r=-0.584;P<0.05);lncRNA KCNQ1OT1与LVESD、LVEDD、NT-proBNP、CK、CK-MB、cTnI、MYO呈正相关,与LVEF呈负相关(P<0.05);Runx3与LVESD、LVEDD、NT-proBNP、CK、CK-MB、cTnI、MYO呈负相关,与LVEF呈正相关(P<0.05)。血清lncRNA KCNQ1OT1、Runx3水平诊断AMI的曲线下面积(AUC)分别为0.859、0.743,特异度分别为81.6%、74.7%,敏感度分别为76.1%、78.3%;两者联合诊断的曲线下面积为0.901,特异度为92.0%,敏感度为73.9%。lncRNA KCNQ1OT1是影响AMI发生的独立危险因素(P<0.05),Runx3是影响AMI发生的保护因素(P<0.05)。结论 血清lncRNA KCNQ1OT1、Runx3参与AMI的发生、发展,二者表达水平对AMI的诊断可能具有重要意义。

外周血长链非编码核糖核酸和组蛋白去乙酰化酶水平与脓毒症患者感染程度及预后的相关性分析

目的探究外周血长链非编码核糖核酸(long non-coding ribonucleic acid,lncRNA)H19和组蛋白去乙酰化酶(histone deacetylase,HDAC)2水平与脓毒症患者感染程度及预后的相关性。方法选择邯郸市中心医院自2020年2月至2022年5月收治的142例脓毒症患者为研究对象,根据疾病感染程度分为轻度组(61例)、中度组(45例)、休克组(36例),并根据随访结局将所有脓毒症患者分为死亡组(28例)和存活组(114例)。检测所有脓毒症患者外周血lncRNA H19、HDAC2水平,并采用序贯器官衰竭评分(sequential organ failure assessment,SOFA)、急性生理与慢性健康评分Ⅱ(acute physiology and chronic health evaluationⅡ,APACHEⅡ)评估患者预后恢复情况。Pearson分析法分析外周血lncRNA H19、HDAC2水平与SOFA评分、APACHEⅡ评分的相关性;受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线预测外周血lncRNA H19、HDAC2水平对脓毒症预后的诊断价值。结果外周血lncRNA H19水平:轻度组为(1.07±0.25),中度组为(2.67±0.69),休克组为(4.85±1.36);SOFA评分:轻度组为(4.63±0.91)分,中度组为(7.43±1.32)分,休克组为(9.05±1.84)分;APACHEⅡ评分:轻度组为(11.59±2.06)分,中度组为(15.74±3.12)分,休克组为(19.14±3.68)分;HDAC2水平:轻度组为(2.96±0.71)ng/L,中度组为(1.79±0.43)ng/L,休克组为(1.12±0.26)ng/L;存活组外周血lncRNA H19水平(1.92±0.47)低于死亡组(5.05±1.44)(P<0.05),HDAC2水平(2.41±0.34)ng/L高于死亡组(0.95±0.16)ng/L(P<0.05)。外周血lncRNA H19水平与SOFA评分、APACHEⅡ评分呈正相关(P<0.05),外周血HDAC2水平与SOFA评分、APACHEⅡ评分呈负相关(P<0.05)。ROC结果显示,外周血lncRNA H19水平单独诊断脓毒症患者预后的曲线下面积(area under the curve,AUC)为0.869,灵敏度、特异度分别为69.23%、91.23%;外周血HDAC2水平单独诊断脓毒症患者预后的AUC为0.861,灵敏度、特异度分别为73.08%、86.84%;二者联合诊断脓毒症预后的AUC(0.942)显著大于lncRNA H19单独诊断的AUC(Z=2.453,P=0.014)和HDAC2单独诊断的AUC(Z=2.066,P=0.039)。结论外周血lncRNA H19、HDAC2水平与脓毒症患者感染程度密切相关,且对患者预后具有较高的预测价值。

沉默长链非编码RNA ANO1-AS1对食管鳞癌细胞迁移、侵袭的影响

目的研究长链非编码(Lnc)RNA ANO1-AS1对食管鳞癌细胞迁移和侵袭的影响及其可能的分子机制。方法食管癌细胞株(EC109、TE)转染ANO1-AS1敲减慢病毒,沉默ANO1-AS1表达为LV-sh-ANO1-AS1组,阴性肿瘤对照为LV-Con组,未进行转染为空白对照(Blank)组。通过实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)检测各组食管癌细胞中ANO1-AS1和ANO1的相对表达量。通过划痕实验和Transwell迁移实验检测各组细胞的迁移能力。通过Transwell侵袭实验检测各组细胞的侵袭能力。通过Western印迹测定每组细胞中ANO1、基质金属蛋白酶(MMP)2、MMP9、上皮间质转化(EMT)相关蛋白及细胞外信号调节激酶(ERK)/丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路相关蛋白表达。结果qRT-PCR结果显示,转染ANO1-AS1敲减慢病毒后,食管癌细胞EC109、TE中LV-sh-ANO1-AS1组LncRNA ANO1-AS1和ANO1 mRNA表达水平均显著低于LV-Con组和Blank组(P<0.05)。划痕实验结果表明,LV-sh-ANO1-AS1组细胞划痕愈合率显著低于LV-Con组和Blank组(P<0.05)。Transwell结果表明,LV-sh-ANO1-AS1组细胞迁移和侵袭能力显著低于LV-Con组和Blank组(P<0.05)。Western印迹结果显示,与LV-Con组和Blank组比较,LV-sh-ANO1-AS1组MMP2、MMP9、Vimentin、p-ERK及ANO1蛋白表达水平显著降低,E-cadherin蛋白表达水平显著升高(P<0.05)。结论LncRNA ANO1-AS1在食管鳞癌细胞EC109、TE中高表达,并可能通过影响ERK/MAPK信号通路促进食管癌细胞的迁移和侵袭。

长链非编码RNA小核仁RNA宿主基因22调控微小RNA-27b-3p对口腔鳞状细胞癌细胞增殖、侵袭和迁移的影响

目的探究长链非编码RNA(LncRNA)小核仁RNA宿主基因(SNHG)22调控微小RNA(miR)-27b-3p对口腔鳞状细胞癌(OSCC)细胞增殖、侵袭和迁移的影响。方法收集52例OSCC患者的癌组织及癌旁组织标本,体外培养人正常口腔角质细胞HOK和3种人OSCC细胞(CAL-27、SCC-25和HSC-3),实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)检测癌组织、癌旁组织、HOK细胞和3种OSCC细胞中SNHG22、miR-27b-3p表达情况。对SCC-25细胞进行转染并将其分为Ctrl组(未进行转染)、si-SNHG22组、si-NC组、miR-27b-3p inhibitor组、inhibitor-NC组、si-SNHG22+inhibitor-NC组和si-SNHG22+miR-27b-3p inhibitor组,检测各组SCC-25细胞增殖情况[细胞计数试剂盒8(CCK-8)法检测增殖率、流式细胞术检测增殖指数(PI)];Transwell实验检测各组SCC-25细胞侵袭情况;划痕愈合实验检测各组SCC-25细胞迁移情况;双荧光素酶实验验证SNHG22与miR-27b-3p的靶向作用关系。结果与癌旁组织比较,OSCC癌组织中SNHG22表达显著升高,miR-27b-3p表达显著降低(P<0.05);与HOK细胞比较,CAL-27、SCC-25和HSC-3细胞中SNHG22表达显著升高,miR-27b-3p表达显著降低,且SCC-25细胞中SNHG22与miR-27b-3p的表达与HOK细胞差异最大(P<0.05)。与Ctrl组比较,si-SNHG22组SCC-25细胞增殖率、PI、侵袭数和划痕面积愈合率均显著减少(P<0.05),miR-27b-3p inhibitor组SCC-25细胞增殖率、PI、侵袭数和划痕面积愈合率均显著增加(P<0.05);与si-SNHG22组比较,si-SNHG22+miR-27b-3p inhibitor组SCC-25细胞增殖率、PI、侵袭数和划痕面积愈合率均显著增加(P<0.05)。双荧光素酶实验显示SNHG22与miR-27b-3p存在靶向作用关系。结论SNHG22在OSSC中高表达,miR-27b-3p在OSSC中低表达,SNHG22可能通过海绵化miR-27b-3p促进SCC-25细胞增殖、侵袭和迁移,SNHG22/miR-27b-3p轴可能是OSCC一个新的诊断和治疗靶点。

先天性心脏病非编码核糖核酸研究进展

先天性心脏病(congenital heart disease,CHD)由于先天性的心脏和大血管发育异常出现的解剖畸形,是新生儿最常见的先天性畸形之一,在中国,每1 000名新生儿就有9例患病[1]。随着外科手术技术的提高,大大改善的危重症CHD患者的预后;但是,CHD患者成年后不良健康事件,如癌症,心力衰竭,心律失常较于正常人明显增加[2]。CHD已成为影响儿童身心健康及人口生命质量的重大公共卫生问题,给社会和家庭造成严重的经济和精神方面的负担[3]。目前研究结果显示,先天性心脏病发病机制复杂、影响因素众多。

长链非编码RNA-P21在过氧化氢诱导的人晶状体上皮细胞损伤中的表达

目的检测过氧化氢诱导的人晶状体上皮细胞HLE-B3生物活性及长链非编码RNA-p21(lncRNA-p21)的表达变化。方法将HLE-B3细胞分为正常对照组和过氧化氢组,分别用正常培养液和含200μmol/L过氧化氢的培养液培养24 h。采用MTS比色法检测细胞活力;采用活性氧试剂盒检测细胞活性氧簇(ROS)的水平;采用流式细胞术检测细胞凋亡情况;采用Caspase-3活性试剂盒法检测细胞Caspase-3活性;采用Western Blot方法检测细胞凋亡相关Bax,Bcl-2蛋白表达;采用流式细胞术检测细胞周期分布;采用EDU增殖试剂盒检测细胞增殖能力;采用实时荧光定量PCR法检测细胞中lncRNA-p21的表达;采用荧光原位杂交实验法检测细胞中lncRNA-p21的定位。结果过氧化氢组细胞ROS水平为4.65±0.38,明显高于正常对照组的1.00±0.01,差异具有统计学意义(t=16.66,P<0.05)。与正常对照组相比,过氧化氢组细胞凋亡率显著上升,Caspase-3活性增强,凋亡蛋白Bax相对表达量明显升高,差异均有统计学意义(t=20.69、39.80、12.73,均P<0.05)。与正常对照组相比,过氧化氢组G2期细胞比例明显增多,差异有统计学意义(t=23.10,P<0.05)。过氧化氢组EDU阳性细胞比例为(25.41±6.99)%,明显低于正常对照组的(50.58±9.15)%,差异具有统计学意义(t=6.559,P<0.05)。过氧化氢组lncRNA-p21相对表达量为2.36±0.29,明显高于正常对照组的1.02±0.02,差异具有统计学意义(t=7.893,P<0.05)。荧光原位杂交实验结果显示,lncRNA-p21定位于细胞质中。结论过氧化氢诱导的氧化应激模型中晶状体上皮细胞增殖能力显著降低、凋亡水平显著上升,ROS和lncRNA-p21表达水平升高。lncRNA-p21可能参与晶状体上皮细胞的氧化应激损伤过程。

长链非编码RNA在肝细胞癌中的作用机制研究进展

肝细胞癌(HCC)是一种常见的恶性肿瘤,具有发病率高、生存率低等特点,目前的治疗方法缺乏有效性。HCC的发生发展是一个复杂的过程,其潜在的分子机制目前尚未完全阐明。长链非编码RNA(lncRNA)参与调控细胞分化、增殖、死亡、代谢等生物学过程,在HCC进展中也发挥重要作用。lncRNA可通过调节基因表达或蛋白活性影响HCC细胞增殖、死亡、迁移、血管生成、免疫逃逸以及细胞代谢重编程等。因此,lncRNA可作为HCC潜在治疗靶点,使HCC患者达到精准治疗,提高患者生存率。

长链非编码RNA ZIM2-AS1在肝细胞癌中的表达及其临床意义

目的:利用癌症基因组图谱(TCGA)数据探讨长链非编码RNA(lncRNA)ZIM2-AS1在肝细胞癌(HCC)中的表达及其临床意义和诊断价值。方法:从TCGA数据库下载374例HCC组织样本和50例癌旁组织样本的转录组测序(RNA-seq)数据及相关临床资料,基于R语言进行相关生物信息学分析,以解析ZIM2-AS1在HCC中的表达模式及其与临床病理特征、预后及免疫细胞浸润的相关性,并评估其在HCC中的诊断价值;采用qRT-PCR检测ZIM2-AS1在人正常肝细胞及不同HCC细胞系中的表达情况。结果:ZIM2-AS1在HCC组织中的表达呈升高趋势(P<0.001),其表达水平与患者年龄、性别、肿瘤N分期、组织学分级和AFP水平显著相关(P均<0.05),且高表达患者的总生存期(OS)和疾病相关生存期(DSS)显著短于低表达患者(P<0.05),是影响HCC患者OS的独立危险因素。肿瘤免疫细胞浸润分析显示,ZIM2-AS1与Th2细胞、CD56brightNK细胞、滤泡辅助性T细胞(Tfh)、中性粒细胞和浆细胞样树突状细胞(pDC)的浸润水平显著相关(|Spearman's r|>0.1,P<0.05)。受试者工作特征(ROC)曲线分析显示ZIM2-AS1表达水平对HCC、N0分期、组织学分级G1和G2期、OS及DSS均具有一定诊断价值(AUC均>0.50)。qRT-PCR结果显示ZIM2-AS1在HCC细胞系中的表达水平显著高于人正常肝细胞(P均<0.05)。结论:LncRNA ZIM2-AS1的高表达是HCC预后不良的独立危险因素,具有成为HCC诊断、预后判断及肿瘤免疫微环境评估生物标志物的潜在应用价值。

非小细胞肺癌患者血清长链非编码RNA及血管内皮生长因子的表达变化及相关性研究

目的:探究非小细胞肺癌患者血清长链非编码RNA(lncRNA)及血管内皮生长因子(VEGF)的表达变化及相关性。方法:2020年1月—2023年5月武汉科技大学附属天佑医院收治的90例非小细胞肺癌患者为观察组,同时期收治的40例肺部良性病变患者为对照组。检测及比较两组血清lncRNA(lncRNA H19、lncRNA DANCR及lncRNA ANRIL)及VEGF(VEGF-A、VEGF-C及VEGF-D)的表达水平,并比较观察组中不同性别、年龄、疾病分期、分化程度及淋巴结转移情况患者的血清lncRNA及VEGF表达水平,采用Pearson相关性分析非小细胞肺癌患者上述血清lncRNA与VEGF的相关性。结果:观察组血清lncRNA与血清VEGF均显著高于对照组(P<0.05);观察组中不同疾病分期及淋巴结转移情况患者的血清lncRNA与VEGF比较,差异均有统计学意义(P<0.05);Pearson相关性分析显示,非小细胞肺癌患者的血清lncRNA与VEGF均呈正相关(P<0.05)。结论:非小细胞肺癌患者lncRNA H19、lncRNA DANCR及lncRNA ANRIL及VEGF均呈现高表达状态,且上述lncRNA与VEGF均呈正相关,在非小细胞肺癌早期诊断中具有一定价值。

长链非编码RNA核富集转录本1对瘢痕成纤维细胞增殖、凋亡和迁移的影响

背景:已有研究阐明核富集转录本1(nuclear enriched abundant transcript 1,NEAT1)下调抑制了瘢痕成纤维细胞的进展,但具体机制尚不完全清楚。目的:探讨长链非编码RNA NEAT1调节miR-136-5p/泛素特异性蛋白酶4(ubiquitin specific protease 4,USP4)轴对瘢痕成纤维细胞生物学行为的影响。方法:将瘢痕成纤维细胞分为5组:si-NC组、空白对照组、si-NEAT1组、si-NEAT1+miR-136-5p inhibitor组、si-NEAT1+inhibitor-NC组,qRT-PCR检测NEAT1、miR-136-5p表达;CCK-8法及EDU染色检测细胞增殖能力;流式细胞术检测细胞凋亡情况;划痕愈合实验检测细胞迁移情况;Western blot检测USP4、p27、Bax、基质金属蛋白酶9、α-平滑肌肌动蛋白、Ⅰ型胶原蛋白α1链蛋白表达;双荧光素酶实验检测NEAT1与miR-136-5p、miR-136-5p与USP4的关系。结果与结论:①与si-NC组比较,si-NEAT1组NEAT1表达、A450值、EDU阳性细胞百分比、划痕愈合率以及USP4、基质金属蛋白酶9、α-平滑肌肌动蛋白、Ⅰ型胶原蛋白α1链蛋白表达降低(P<0.05),miR-136-5p表达、细胞凋亡率及p27、Bax蛋白表达升高(P<0.05);②miR-136-5p inhibitor逆转了沉默NEAT1对瘢痕成纤维细胞生物学行为的影响;③miR-136-5p与NEAT1、miR-136-5p与USP4存在靶向调控关系。结果表明,沉默NEAT1可能通过调控miR-136-5p/USP4轴抑制瘢痕成纤维细胞的增殖和迁移,诱导其凋亡。

长链非编码RNA SLCO4A1-AS1靶向微小RNA-615-5p对食管癌细胞增殖、凋亡和炎症因子表达的影响

目的探讨长链非编码RNA(LncRNA)溶质载体有机阴离子转运蛋白家族成员4A1反义RNA1(SLCO4A1-AS1)靶向微小RNA-615-5p(miR-615-5p)对食管癌细胞增殖、凋亡和炎症因子表达的影响。方法运用实时荧光定量聚合酶链式反应(RT-qPCR)分析LncRNA SLCO4A1-AS1和miR-615-5p在食管癌组织、细胞系中表达情况。将si-NC、si-LncRNA SLCO4A1-AS1、miR-NC、miR-615-5p模拟物、pcDNA、pcDNA-LncRNA SLCO4A1-AS1、si-LncRNA SLCO4A1-AS1+anti-miR-NC、si-LncRNA SLCO4A1-AS1+anti-miR-615-5p分别转染Eca109细胞。CCK-8和流式细胞术用于检测细胞活力和凋亡率;平板克隆实验用于检测细胞增殖;酶联免疫吸附法(ELISA)试剂盒检测培养液中白细胞介素-6(IL-6)和肿瘤坏死因子-α(TNF-α)水平。采用双荧光素酶报告基因法确定LncRNA SLCO4A1-AS1与miR-615-5p的关系。结果食管癌组织、细胞系中LncRNA SLCO4A1-AS1表达上调,miR-615-5p表达下调。抑制LncRNA SLCO4A1-AS1表达后,细胞活力、细胞克隆形成数量以及培养液中IL-6和TNF-α水平降低,miR-615-5p表达量、细胞凋亡率升高,差异有统计学意义(P<0.05)。与miR-NC组比较,miR-615-5p组Eca109细胞中miR-615-5p表达量、Cleaved-caspase-3蛋白水平、凋亡率升高,细胞活力、细胞克隆形成数量、培养液中IL-6和TNF-α水平降低,差异有统计学意义(P<0.05)。与si-LncRNA SLCO4A1-AS1+anti-miR-NC比较,si-LncRNA SLCO4A1-AS1+anti-miR-615-5p组Eca109细胞中miR-615-5p表达量、Cleaved-caspase-3蛋白水平、凋亡率降低,细胞活力、细胞克隆形成数量、培养液中IL-6和TNF-α水平升高,差异有统计学意义(P<0.05)。结论LncRNA SLCO4A1-AS1能够促进食管癌的发生和发展。抑制LncRNA SLCO4A1-AS1能够减少食管癌细胞的增殖,降低炎症因子的表达,诱导癌细胞凋亡。

抑制长链非编码RNA MALAT1对糖脂毒性诱导的内皮细胞功能障碍的影响及可能机制

目的:探讨糖脂毒性环境中抑制长链非编码RNA(lnc RNA)人类肺腺癌转移相关转录本1(MALAT1)的表达水平对人脐静脉内皮细胞功能影响的分子机制。方法:用葡萄糖和棕榈酸处理人脐静脉内皮细胞,建立体外糖脂毒性内皮细胞模型,并分为对照组、高糖高脂组、高糖高脂对照组以及小干扰RNA(si-RNA)干预的高糖高脂+si-MALAT1组、高糖高脂+si-丝裂原活化蛋白激酶1(si-MAPK1)组。应用实时荧光定量PCR检测MALAT1、MAPK1的mRNA表达水平;蛋白免疫印迹法检测自噬、线粒体融合分裂、凋亡、通路相关蛋白的表达水平;免疫荧光共聚焦定位检测自噬及溶酶体相关蛋白的荧光共定位情况;透射电镜观察内皮细胞中自噬溶酶体的数目;线粒体探针染色检测线粒体形态;免疫荧光检测细胞内活性氧(ROS)的产生;流式细胞仪检测各组细胞的凋亡;细胞增殖及划痕实验检测不同时间点各组细胞的增殖及迁移能力;血管形成试验检测各组细胞中新生血管数量。结果:与对照组相比,高糖高脂组、高糖高脂对照组的MALAT1 mRNA、磷酸化的丝裂原活化蛋白激酶1(p-MAPK1)的表达水平增加,磷酸化的哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(p-mTOR)的表达水平下降,P均<0.05。与高糖高脂对照组相比,高糖高脂+si-MALAT1组微管相关蛋白1A/1B-轻链3(LC3)、螯合体1(p62)、ROS、剪切后活化的半胱氨酸天冬氨酸蛋白水解酶-3(cleaved caspase-3)、BCL-2相关X蛋白(BAX)、p-MAPK1的表达水平均下降,线粒体融合蛋白视神经萎缩蛋白1(OPA1)、BCL-2、p-mTOR的表达水平均增加,P均<0.05;LC3和溶酶体相关膜蛋白2(LAMP2)蛋白的荧光共定位阳性颗粒增加(P均<0.01),溶酶体数目减少;细胞增殖、迁移、成管能力均增加(P均<0.01)。与高糖高脂对照组相比,高糖高脂+si-MAPK1组内皮细胞中p-MAPK1的表达下降,p-mTOR的表达上升(P均<0.01)。结论:抑制MALAT1表达,可降低糖脂毒性环境中线粒体的自噬水平,减少内皮细胞的凋亡及改善内皮细胞的功能,可能与调节MAPK1/mTOR信号通路有关。

长链非编码RNA在急性髓细胞白血病发生发展中作用的研究进展

近年来,长链非编码RNA(lnc RNA)在急性髓细胞白血病(AML)中的重要性引起人们的广泛关注,其中发挥促癌作用的lnc RNA主要有HOTAIR、UCA1、H19、ITGB2-AS1和SNHG家族的部分基因,而起抑癌作用的lnc RNA主要有H22954、NEAT1、SNHG4、LINC01128等。本文就lnc RNA在AML发生发展中的作用以及与AML耐药和预后判断相关的lncRNA进行综述,以期为AML的诊断和预后分析提供理论依据。

基因间长链非编码RNA 467对子宫内膜癌细胞增殖、凋亡及迁移和侵袭能力的影响

目的探讨基因间长链非编码RNA 467(linc00467)对子宫内膜癌细胞增殖、凋亡及迁移和侵袭能力的影响。方法体外培养子宫内膜癌细胞株HEC-1A、Ishikawa、KLE和RL-95-2,应用实时荧光定量聚合酶链反应(RT-qPCR)法检测4种细胞中linc00467的相对表达量,选择高表达linc00467的子宫内膜癌细胞株HEC-1A、Ishikawa进行后续实验。分别构建2个linc00467慢病毒沉默表达载体sh-linc00467#1、sh-linc00467#2和空载慢病毒质粒;将对数生长期HEC-1A、Ishikawa细胞分为sh-NC组、sh-linc00467#1组和sh-linc00467#2组,sh-NC组细胞转染空载慢病毒质粒,sh-linc00467#1组和sh-linc00467#2组细胞分别转染sh-linc00467#1和sh-linc00467#2;应用RT-qPCR法检测3组细胞中linc00467的相对表达量,5-乙炔基-2-脱氧尿苷(EdU)实验、克隆形成实验检测3组细胞增殖能力,流式细胞术检测3组细胞凋亡情况,划痕实验检测3组细胞的迁移能力,Transwell小室实验检测3组细胞侵袭能力。结果HEC-1A细胞中linc00467 mRNA的相对表达量显著高于KLE和RL-95-2细胞(P<0.05);Ishikawa细胞中linc00467 mRNA的相对表达量显著高于KLE和RL-95-2细胞(P<0.05);HEC-1A与Ishikawa细胞中linc00467 mRNA的相对表达量比较差异无统计学意义(P>0.05),KLE细胞中linc00467 mRNA的相对表达量显著低于RL-95-2细胞(P<0.05)。sh-linc00467#1组和sh-linc00467#2组HEC-1A、Ishikawa细胞中linc00467 mRNA的相对表达量显著低于sh-NC组(P<0.01);sh-linc00467#1组与sh-linc00467#2组HEC-1A、Ishikawa细胞中linc00467 mRNA的相对表达量比较差异无统计学意义(P>0.05)。sh-linc00467#1组和sh-linc00467#2组EdU阳性HEC-1A、Ishikawa细胞数显著少于sh-NC组(P<0.01);sh-linc00467#1组与sh-linc00467#2组EdU阳性HEC-1A、Ishikawa细胞数比较差异无统计学意义(P>0.05)。sh-linc00467#1组和sh-linc00467#2组HEC-1A、Ishikawa细胞克隆数显著少于sh-NC组(P<0.01);sh-linc00467#1组与sh-linc00467#2组HEC-1A、Ishikawa细胞克隆数比较差异无统计学意义(P>0.05)。sh-linc00467#1组和sh-linc00467#2组HEC-1A、Ishikawa细胞凋亡率显著高于sh-NC组(P<0.01);sh-linc00467#1组与sh-linc00467#2组HEC-1A、Ishikawa细胞凋亡率比较差异无统计学意义(P>0.05)。sh-linc00467#1组和sh-linc00467#2组HEC-1A、Ishikawa细胞划痕愈合率显著低于sh-NC组(P<0.01);sh-linc00467#1组与sh-linc00467#2组HEC-1A、Ishikawa细胞划痕愈合率比较差异无统计学意义(P>0.05)。sh-linc00467#1组和sh-linc00467#2组HEC-1A、Ishikawa侵袭细胞数显著少于sh-NC组(P<0.01);sh-linc00467#1组与sh-linc00467#2组HEC-1A、Ishikawa侵袭细胞数比较差异无统计学意义(P>0.05)。结论下调linc00467表达可抑制子宫内膜癌细胞的增殖、迁移和侵袭,促进子宫内膜癌细胞凋亡。

长链非编码RNA在膀胱癌干细胞中的研究现状及展望

膀胱癌是泌尿系统常见恶性肿瘤之一,具有高发病率和死亡率,且治疗后易出现复发和转移。越来越多的证据表明,具有启动和维持肿瘤生长的肿瘤干细胞是膀胱癌治疗失败的主要原因,所以,靶向膀胱癌干细胞的治疗方式成为了目前研究重点。研究发现长链非编码RNA(lncRNA)是膀胱癌干细胞的关键调节因子,多种lncRNA参与癌症干性。这些lncRNA可以调节干细胞相关转录因子在膀胱癌中的表达。其在膀胱癌的发生和进展中发挥重要作用,目前已经被研究为抗癌治疗的靶标。为此本文对不同lncRNA在分子水平上如何调控膀胱癌干细胞特性进行综述,为未来膀胱癌的临床治疗提供理论依据及可行方向。

非酒精性脂肪性肝病病人血清长链非编码RNA人类白细胞抗原复合体18水平与氧化应激指标、肝纤维化程度的相关性

目的 探究非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)病人血清长链非编码RNA人类白细胞抗原复合体18(lncRNA HCG18)与氧化应激指标及肝纤维化程度的相关性。方法 以儋州市人民医院2020年11月至2022年3月收治的92例NAFLD病人为NAFLD组,另选取同期健康体检志愿者90例为对照组。根据NAFLD肝纤维化(NFS)评分将NAFLD组病人分为排除晚期纤维化组(30例)、中间状态组(46例)、晚期纤维化组(16例)。采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)法检测血清lncRNA HCG18表达水平;酶联免疫吸附测定(ELISA)检测氧化应激指标水平;Pearson相关性分析NAFLD病人血清lncRNA HCG18与氧化应激指标的关系;Spearman相关性分析NAFLD病人血清lncRNA HCG18与NFS评分的关系。采用受试者操作特征(ROC)曲线分析血清lncRNA HCG18对NAFLD的诊断价值。结果 NAFLD组lncRNA HCG18(1.37±0.29比1.01±0.24)、丙二醛[(6.96±2.13)μmol/L比(4.17±1.04)μmol/L]水平明显高于对照组(P<0.001),谷胱甘肽过氧化物酶(GSH-Px)[(72.39±11.26)U/mL比(98.25±13.92)U/mL]、超氧化物歧化酶(SOD)[(68.36±10.65)U/mL比(92.84±12.89)U/mL]水平明显低于对照组(t=9.11、11.19、13.79、13.98,P<0.001)。排除晚期纤维化组、中间状态组、晚期纤维化组lncRNA HCG18(1.20±0.25比1.39±0.30比1.65±0.35)、丙二醛[(5.64±1.88)μmol/L比(7.12±2.16)μmol/L比(8.99±2.51)μmol/L]水平依次显著升高(F=12.36、13.06,P<0.001),GSH-Px[(81.56±13.58)U/mL比(71.74±10.52)U/mL比(57.06±9.05)U/mL]、SOD[(81.45±12.52)U/mL比(66.52±10.25)U/mL比(49.13±8.29)U/mL]水平依次显著降低(F=24.27、48.42,P<0.001)。Pearson相关性分析显示,NAFLD组血清lncRNA HCG18水平与丙二醛呈正相关(r=0.59,P<0.001),与GSH-Px、SOD均呈负相关(r=-0.57、-0.62,P<0.001);Spearman相关性分析显示NAFLD组血清lncRNA HCG18水平与NFS评分呈正相关(r=0.69,P<0.001)。血清lncRNA HCG18诊断NAFLD的ROC曲线下面积(AUC)为0.85。结论 NAFLD病人血清lncRNA HCG18显著升高,与氧化应激指标及肝纤维化程度存在一定的相关性。