肠道细菌基因间重复共有序列-聚合酶链式反应指纹图谱技术用于细菌分型的研究进展

肠道细菌基因间重复共有序列-聚合酶链式反应(enterobacterial repetitive intergenic consensus-polymerase chain reaction,ERIC-PCR)指纹图谱技术利用普遍存在于生物体内的ERIC进行引物设计,通过基因扩增,获得能够表征其基因组结构的产物,该方法简单易行、重复性好、用时短,被广泛应用于细菌基因分型及同源性判别。本文简述细菌分型的研究背景和ERIC-PCR指纹图谱技术的原理及特点,归纳该技术在细菌基因分型方面的优缺点及其在常见食源性致病菌基因分型中的应用现状,并对ERIC-PCR指纹图谱技术应用于乳品企业污染菌溯源的研究进行展望。

ERIC-PCR技术临床应用现状

围绕ERIC-PCR技术特点及其临床应用现状做一综述。ERIC-PCR技术不仅具有分辨率高、敏度性高、重复性高的特点而且还具有成本低、操作简便、快速检测的优势。ERIC-PCR指纹图谱能够反映细菌基因组组成和微生物种群的多样性与群落结构,在临床上有广泛的应用前景。

海产品中沙门氏菌的分离及其ERIC-PCR指纹分析

目的了解常见市售鲜活海产品沙门氏菌污染情况及不同菌株间遗传相似性,为沙门氏菌的流行病学研究提供有价值的信息。方法采集市售常见海鱼、贝类和蟹等海产品,按照常规方法分离沙门氏菌,分析分离菌的ERIC-PCR DNA指纹图谱。结果共检查191份样品,从42份中分离到沙门氏菌45株。ERIC-PCR DNA指纹图谱分析,45株分离菌被分为两个大的分支,遗传相似性在50%~100%之间。结论市售海产品有沙门菌污染,同一种海产品污染菌的基因型可有不同,不同海产品之间也存在相同基因型沙门氏菌株污染。

猪源肠出血性大肠杆菌的分离、鉴定及特性研究

目的探讨猪源肠出血性大肠埃希菌病原学特征。方法对所分离的菌株进行生化鉴定、药敏试验,并使用聚合酶链反应(PCR)技术检测毒力基因、耐药基因,同时对致病性的菌株进行外膜蛋白分型、REP-PCR和ERIC-PCR分析。结果从315株大肠杆菌中筛选到山梨醇阴性的EHEC21株,其中含有stx1基因的菌株有4株,含有stx2基因3株,含有eae基因的17株,外膜蛋白分型属于三个型,其中OMP-1型最多,有15株,OMP-2型3株,OMP-3型3株,REP-PCR和ERIC-PCR结果显示这些致病性菌株带型差异性较大,分属于不同的亚群。结论华中地区是养殖业比较发达的地区,而且人均消费猪肉比例也较高,EHEC的存在对人是一种潜在的威胁,应加强监测力度,防止该菌在人群中感染和流行。

高校学生宿舍室内空气中产超广谱β-内酰胺酶大肠埃希菌分离株ERIC-PCR指纹图谱分析

【目的】了解大学生宿舍空气中产超广谱β-内酰胺酶(ESBLs)大肠埃希菌的检出率和分离株之间的遗传相似性,为预防和控制传染病的传播提供依据。【方法】用FA-1型六级筛孔撞击式空气微生物采样器采集大学生宿舍内室内空气并分离鉴定其中的产ESBLs大肠埃希菌,采用ERIC-PCR扩增基因组DNA,形成聚类图谱,分析分离株的相似性。【结果】从收集到的300份空气样品中分离鉴定出194株大肠埃希菌,30株鉴定为超广谱β-内酰胺酶分离株,检出率达15.46%;产ESBLs大肠埃希菌ERIC-PCR指纹图谱条带相似性在50%100%之间。【结论】大学生宿舍空气中存在着产ESBLs大肠埃希菌污染,应加强对空气中大肠埃希菌耐药性监测。