日粮物理有效中性洗涤纤维对奶牛瘤胃细菌组成的影响

研究日粮物理有效中性洗涤纤维(peNDF)含量对奶牛瘤胃细菌组成的影响,旨在为奶牛日粮配制提供依据。选取12头体重相近的2胎次荷斯坦奶牛(产奶量为33.0±1.7 kg/d、泌乳天数131±8 d),随机分为3组,分别饲喂日粮组成相同但peNDF_(8.0)水平为高(11.25%)、中(10.56%)、低(9.02%)的全混合日粮。试验期为25 d,其中前21 d为适应期,后4 d为采样期。利用高通量测序技术测定3种日粮条件下瘤胃细菌的多样性。结果表明,低peNDF_(8.0)组ACE指数有低于其它两组的趋势(P<0.10)。在门水平上,拟杆菌门(Bacteroidetes)、厚壁菌门(Firmicutes)和变形菌门(Proteobacteria)为优势菌门,在属水平上,普雷沃氏菌(Prevotella)为优势菌属。BS11科在高peNDF_(8.0)组和中peNDF_(8.0)组显著高于低peNDF_(8.0)组(P<0.05)。综上所述,高精料日粮情况下,奶牛日粮中peNDF_(8.0)水平从9.02%上升至11.25%对瘤胃细菌群落的影响较小。

16S rDNA克隆文库方法分析好氧颗粒污泥细菌组成

采用构建16SrDNA克隆文库方法对好氧颗粒污泥的细菌种群多样性进行研究.随机测定了82个克隆子序列(700 bp),Blast比对结果表明,好氧颗粒污泥中微生物群落具有高度多样性,可分为7个主要类群,其中,β变形菌(β-Proteobacteria)类群和鞘脂杆菌(Sphingobacteria)类群在文库中所占比例最大,分别为34.16%和30.50%;其次是Candidate division TM7类群、黄杆菌(Flavobacteria)类群和γ变形菌(γ-Proteobacteria)类群,分别为9.76%,7.32%和7.32%;放线菌(Actinobacteria)类群和α变形菌(α-Proteobacteria)类群所占比例相对较小,分别为4.88%和1.22%.序列分析结果表明,好氧颗粒污泥中不仅含有对好氧颗粒污泥形成和稳定运行具有重要作用的食酸菌属(Acidovorax)细菌、假单胞菌(Pseudomonas)等细菌,还含有对CODCr和氨氮具有很好去除能力的Micropruina glycogenica,丛毛单胞菌科(Comamonadaceae)等细菌.

盐碱地养虾池塘养殖期间细菌组成分析

对天津地区盐碱地凡纳滨对虾（Litopenaeus vannamei）养殖池塘的细菌种类和垂直变化规律进行了研究。结果表明：池塘中细菌总数维持在2.4×10^3-8.5×10^5cfu/mL之间,弧菌总数维持在1.75×10^2-2.3×10^5cfu/mL之间,细菌总数和弧菌总数分别在8月份和9月份达到高峰。反硝化细菌总数维持在3.4×10^4-2.8×10^5cfu/mL之间,硫酸盐还原菌总数维持在2.9×10^2-7.5×10^4cfu/mL之间,氨化细菌总数维持在1.2×10^2-7.0×10^4cfu/mL之间。养殖水体中共检测到13种细菌,养殖前期弧菌属、产碱菌属、棒杆菌属为优势菌群;养殖中期产碱菌属、弧菌属、气单胞菌属、肠杆菌科为优势菌群;养殖后期弧菌属、气单胞菌属、噬纤维菌属为优势菌群。通过多样性指数分析表明,7月份细菌多样性指数最高,9月份细菌多样性指数最低。

应用16S rDNA克隆文库法分析B6-Co小鼠角膜炎细菌组成

目的鉴定B6-Co突变系小鼠角膜的病原菌组成,并与人类细菌性角膜炎病原菌组成进行比较分析。方法选取10 d龄B6小鼠和B6-Co小鼠各6只为实验动物,提取小鼠角膜组织刮取物细菌基因组DNA,通过PCR扩增构建16S rDNA克隆文库,采用随机测序法分析B6-Co小鼠角膜细菌组成,B6小鼠作为对照。结果 B6-Co角膜混浊小鼠中共鉴定出20种细菌,隶属于15个属,包括葡萄球菌属、假单胞菌属、链球菌属、微球菌属、棒状杆菌属等。葡萄球菌属和假单胞菌属为优势群,葡萄球菌属丰度为19.7%~53.1%,假单胞菌属的丰度为17.4%~32.8%。其中葡萄球菌属主要是表皮葡萄球菌,丰度为13.8%~20.9%;缓慢葡萄球菌,丰度为14.0%~30.9%;金黄色葡萄球菌,丰度为7.4%~20.3%。此外,棒状杆菌和微球菌也比较常见。10 d龄B6小鼠未检测出细菌。结论 B6-Co突变系小鼠角膜细菌组成与人类角膜炎病原菌相似,是研究人类角膜炎诊断方法、发病机理及临床用药的很好的动物模型。

应用16S rDNA克隆文库法分析有机物料腐熟菌剂细菌组成

应用16SrDNA克隆文库法对有机物料腐熟菌剂A和B样品中的细菌组成进行分析研究。结果表明,样品A有14个OTU,主要是融合乳杆菌(Weissella confusa)、枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)和短小芽孢杆菌(Bacillus pumilus),其比例分别占总克隆文库的28.6%、30.4%和23.2%;样品B有43个OTU,主要是布氏乳杆菌(Lactobacillus buchneri)、香肠乳杆菌(Lactobacillus farciminis)和耐酸乳杆菌(Lactobacillus acetotolerans),占总克隆文库的比例分别为18.03%、18.86%和13.12%;所得出的结果均与产品标注存在差异,样品A未提及细菌的种类,而样品B只标注短小芽孢杆菌。研究表明这一方法在微生物菌剂细菌组成分析及其质量检测中具有良好的应用前景。

近自然管理对橡胶林土壤细菌组成及多样性的影响

以更好地了解近自然管理方式对于橡胶林土壤细菌的影响为目的,依据自然林核心理论建立一个1 hm 2的橡胶林固定样地进行近自然管理,通过四点采样法进行样品采集,运用土壤农业化学分析方法和基因测序,对土壤理化性质、微生物生物功能、细菌组成等进行实验分析,研究近自然管理后橡胶林土壤细菌群落的变化。结果显示:对橡胶林进行近自然管理后,土壤pH升高,土壤细菌中的酸杆菌门种类减少;橡胶林土壤细菌α多样性并未显著增加,但是在OUT水平上γ多样性(伽玛多样性)显著提高;雨季时近自然管理橡胶林土壤细菌γ多样性高于常规管理,旱季时则相反。研究表明:橡胶林进行近自然管理后土壤pH升高,从而改变了细菌群落的物种组成,细菌多样性提高。其研究结果可为橡胶林近自然管理方式下生物多样性的恢复提供理论依据。

有机、无机肥配施比例对植烟土壤细菌组成及烤烟产质量的影响

在贵州黔西县采用定点田间试验的方法,研究了不同有机、无机肥配施比例(有机氮取代无机氮比例分别为0%、25%、50%、75%、100%)下植烟土壤细菌组成的变化及烤烟产质量的差异,以期为贵州烟区施用有机肥替代部分无机肥、实现减肥增效提供理论依据和技术支撑。结果表明,与单施无机肥处理相比,有机、无机肥配施处理可以提高土壤细菌的多样性,主要表现在Sobs指数、Shannon指数、Ace指数和Chao指数提高;可以改变土壤细菌科、属水平的结构组成,施有机肥处理间的土壤细菌各菌属丰度更为相似,且提高了有益微生物如鞘脂单细胞菌属、亚硝化单胞菌科、厌氧绳菌科、小单孢菌科等的丰度,从而改善土壤细菌的组成;同时,也能在一定程度上提高烤烟的产值和中上等烟比例,增加烤烟的经济效益。综合比较,以有机氮取代无机氮比例为50%时的效果最好。

大西洋鲑循环水养殖水体异养细菌组成的研究

采集养殖池水样,选取Zobell 2216E琼脂培养基、溶菌肉汤琼脂培养基、硫代硫酸盐柠檬酸盐胆盐蔗糖琼脂培养基、脑心浸液琼脂培养基、胰蛋白胨大豆琼脂培养基、营养琼脂培养基6种常见固体培养基进行细菌分离培养,以平板菌落计数法和菌落外观形态特征辨别及16SrRNA基因测序方法进行异养菌计数和种类组成分析。结果显示:(1)养殖池水体异养菌可分为4大类,分别属于变形菌门(包括α-、γ-变形菌纲)、厚壁菌门、拟杆菌门、放线菌门,其中以γ-变形菌纲为优势菌群。按属分类大多为假交替单胞菌属和弧菌属。(2)不同培养基分离菌落数量2216E培养基>溶菌肉汤琼脂培养基>胰蛋白胨大豆琼脂培养基>脑心浸液琼脂培养基>营养琼脂培养基>硫代硫酸盐柠檬酸盐胆盐蔗糖琼脂培养基,且2216E培养基菌落数极显著高于其余5种培养基(P<0.01);2216E培养基所分离细菌的种类最多,分属于12个属,假交替单胞菌属为优势类群,占比50%,弧菌属仅占3.13%;脑心浸液琼脂培养基、溶菌肉汤琼脂培养基、胰蛋白胨大豆琼脂培养基所分离细菌均以弧菌属为优势菌群,分别占33.33%、60%、25%;硫代硫酸盐柠檬酸盐胆盐蔗糖琼脂培养基所分离细菌仅分属于1个属,即弧菌属;营养琼脂培养基无弧菌,但有假单胞菌分离出。

基于高通量测序的土壤细菌组成、丰度及多样性分析

研究盐碱地土壤微生物群落结构变化,细菌数量变化可以作为高粱耐盐材料筛选的标准之一,本研究将为高粱耐盐材料的选育及高粱耐盐性研究提供理论依据。试验采用Illumina Miseq高通量测序方法对盐碱地高粱根际菌群结构进行分析,选用10份不同的高粱亲本材料,采集盐碱地高粱根际土壤样品,研究结果表明:耐盐材料OTU数量较多,土壤微生物的群体数量的增加及其生长速率的增大可有效地促进土壤酶的活性,从而提高材料的生长速率;样品342、473的Chao1、ACE和Shannon指数均最高,Simpson指数最小,该材料的物种多样性最高;相反,盐敏材料68、622的Chao1、ACE和Shannon指数均最低,Simpson指数最大,多样性最低。研究结果表明耐盐材料根际土壤细菌具有较高的物种多样性,该指标可以作为耐盐材料筛选的评价指标。

万峰湖丰水期和枯水期细菌群落组成和多样性比较

为比较贵州省黔西南州万峰湖丰水期和枯水期细菌群落组成和多样性,于2020年11月(丰水期)和2021年5月(枯水期)采集了万峰湖3个生态位点(大坝、梅家湾和巴结)表层(0~5 m)水体的水样,采用16S rRNA高通量测序技术分析其群落组成。结果表明:3个取样点丰水期细菌的OTUs共1647个,枯水期细菌的OTUs共1530个,枯水期细菌丰度高于丰水期,而丰水期细菌群落多样性高于枯水期;在门水平上,丰水期浮游细菌群落主要由变形菌门(Proteobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)和蓝藻门(Cyanobacteria)等18门202属细菌组成,枯水期浮游细菌群落则主要由放线菌门、变形菌门和拟杆菌门(Bacteroidetes)等20门236属细菌组成;在属水平上,丰水期和枯水期共有属为55属,147属为丰水期特有,其中放线菌门的Nanopelagicaceae属、蓝菌属(Cyanobium)和羊栖菜弧菌属(Limnohabitans)丰度最高,181属为枯水期特有,其中蓝藻门的Gplla属、土生单胞菌属(Terrimonas)和玫瑰单胞菌属(Roseomonas)丰度最高;PICRUSt功能预测显示,大部分代谢途径中菌群预测的基因拷贝数为枯水期明显高于丰水期。研究表明,万峰湖丰水期和枯水期细菌群落组成和多样性存在明显差异,丰水期和枯水期均有其特有的细菌群落结构,且枯水期菌群代谢比丰水期更活跃。

土壤深度对凤丹根际细菌群落组成和多样性影响

为探究凤丹不同土层根际细菌群落组成及结构的垂直分布规律,采用高通量测序技术,分析了凤丹根际不同土层(0~20、20~40、40~60 cm)中细菌群落组成和多样性的变化。测序结果表明,所有土壤样品共获得3 588个OTUs,分属于20门,60纲、100目、110科、98属。0~20 cm深度土壤中的根际细菌丰富度显著高于20~40 cm和40~60 cm,不同土壤深度间根际细菌组成存在一定的差异,且随着土壤深度的增加根际细菌多样性逐渐减少。其中,3种土层间主要的差异细菌门为酸杆菌门、厚壁菌门、放线菌门,酸杆菌门在0~20 cm土层中占比18.7%,而在40~60 cm土层中酸杆菌门丰度达到34.5%;主要的差异细菌纲为酸杆菌纲、放线菌纲以及芽胞杆菌纲,酸杆菌纲在0~20 cm和20~40 cm土层中丰度分别达到18.7%和21.8%,而在40~60 cm土层中为34.5%,是前二者占比的1.58~1.84倍。放线细菌纲(Actinobacteria)在0~20 cm土层中仅占比6.5%,在20~40、40~60 cm土层中分别达到34.8%和20.7%。芽胞杆菌纲(Bacilli)在0~20 cm土层中丰度达到9.5%,而在20~40 cm与40~60 cm土层中丰度不到1%。Alpha多样性分析表明,土壤深度间根际细菌群落多样性无差异,但0~20 cm与40~60 cm土层间的根际细菌丰富度具有显著性差异。Bate多样性表明,组内样本间细菌群落差异较小,而各土层组间差异较大。凤丹不同深度土层根际细菌多样性及丰富度具有一定的差异,但各土层优势细菌种类无显著差异。

塔里木河上游不同生境细菌群落结构及多样性分析

【目的】研究新疆塔里木河上游不同生境细菌群落结构及多样性。【方法】采用免培养和可培养方法,研究塔里木河上游流域原始生境与人工开发后生境细菌群落结构及多样性差异,同时对分离的1株潜在新种进行多相分类鉴定。【结果】原始生境与人工开发后生境细菌群落结构组成差异明显,人工开发后生境细菌α多样性低于原始生境,不同生境细菌β多样性差异较大。变形菌门和放线菌门为优势菌群,并获1株链霉菌属潜在新物种。【结论】塔里木河上游不同生境样品中含有丰富的微生物资源,其细菌群落组成受人为活动的影响较大。

对虾养殖前期5种类型水体中细菌的组成和比较研究

本文对天津和河北沧州地区的5种类型养虾水体(淡水、盐碱地水、浅层盐碱水、海水、高盐海水)养殖前期的细菌数量及组成进行比较研究。结果为:(1)5种水体中异养细菌、弧菌、氨化细菌、反硝化细菌、硫酸还原菌数量差异明显,异养细菌总数高低的顺序为:海水>高盐海水>浅层盐碱水>盐碱地水>淡水;弧菌总数:高盐海水>海水>浅层盐碱水>盐碱地水>淡水;氨化细菌总数:海水>浅层盐碱水>盐碱地水>淡水>高盐海水;反硝化细菌总数:盐碱地水>淡水>海水>浅层盐碱水>高盐海水;硫酸还原菌总数:浅层盐碱水=淡水>海水>盐碱地水>高盐海水。(2)不同水体中细菌种类及相对数量存在差异,淡水中气单胞菌属、邻单胞菌属、肠杆菌科为主要菌群,分别占总数的21.34%,18.57%,17.14%;盐碱地水中产碱菌属、弧菌属、肠杆菌科、棒杆菌属为主要菌群,分别占总数的29.27%,19.51%,14.63%,14.63%;浅层盐碱水中弧菌属、气单胞菌属为主要菌群,分别占总数的23.08%,15.38%;海水中弧菌属、肠杆菌科为主要菌群,分别占总数的19.35%,16.13%;高盐海水中弧菌属、假单胞菌属为主要菌群,分别占总数的38.71%,12.90%。研究表明,养殖前期,5种类型养虾群体中的细菌组成结构存在明显差异。

暗纹东方鲀几种组织中可培养细菌的组成分析(英文)

采用16S rDNA特征序列PCR-DGGE法,分析了不同饵料饲养的暗纹东方鲀的表皮、肠道和河鲀毒素累积组织(肝和卵巢)中可培养细菌的群落组成。根据分子系统发育分析,共鉴定出45种可培养细菌,在这些细菌中,以变形细菌的gamm a亚群占多数,其它分别隶属于低GC含量革兰氏阳性菌和高GC含量革兰氏阳性菌。摄食不同饵料的暗纹东方鲀,其肠道、表皮或河鲀毒素累积组织中的细菌菌落组成是不同的,但不管是摄食人工配合饲料或天然饵料,在暗纹东方鲀的肠道、表皮或河鲀毒素累积组织中,均发现已有报道的可产河鲀毒素的细菌类群,表明饵料来源对暗纹东方鲀的河鲀毒素产生不是必需的。

不同饲养方式下藏猪盲肠与结肠细菌群落的差异分析

为了探讨不同饲喂方式与不同肠段间藏猪细菌群落组成的差异性,部分阐明藏猪肠道微生物的特异性。选用两年龄的放牧与舍饲藏猪各3头,分别采集盲肠与结肠食糜样品,测定细菌16S rRNA基因的V3-V4区域,分析细菌群落的组成,探讨盲肠与结肠细菌群落的空间差异格局;采用Person相关性分析探索盲肠与结肠细菌群落的相关性。结果表明,不同饲养方式下,在门水平细菌群落分别有4个差异分类单元,在属水平盲肠中有19个差异分类单元、结肠中有9个差异分类单元。不同饲养方式下,藏猪细菌群落的Beta多样性表现出明显的差异性。在放牧养殖条件下,藏猪的盲肠食糜中拟杆菌门、变形菌门和TM7的相对丰度显著高于结肠(P<0.05),厚壁菌门、螺旋体门、放线菌门、软壁菌门与疣微菌门相对丰度两个肠段间无显著差异(P>0.05)。放牧藏猪盲肠中Unclassified_Ruminococcaceae(厚壁菌门、瘤胃球菌科)、Unclassified_Clostridiales(厚壁菌门、梭菌目)、Unclassified_Bacteroidales(拟杆菌门、拟杆菌目)、Turicibacter(厚壁菌门、苏黎世杆菌科)与梭菌属(厚壁菌门、梭菌科)相对丰度显著高于结肠(P<0.05),但链球菌属(厚壁菌门、链球菌科)相对丰度显著低于结肠(P<0.05)。舍饲藏猪盲肠与结肠间细菌群落无显著差异(P>0.05)。放牧藏猪盲肠与结肠中细菌群落关联网络中各节点联系较为紧密,彼此间呈现竞争或者协同作用,舍饲藏猪盲肠与结肠细菌群落关联网络中各节点联系较为松散。结果说明,饲养方式影响藏猪肠道中细菌群落的组成,放牧养殖条件下藏猪肠道细菌表现出更加多元的状态。

应用PCR-DGGE技术分析黄海冷水团海域的细菌群落组成

利用PCR-DGGE技术对2个季节（2006-04和2006-10）的黄海冷水团海域的细菌群落组成和优势菌群进行了分析.通过软件Glyko Bandscan分析DGGE图谱,4月份所有站位的条带数相近（约17条）,多样性丰富;10月份,在冷水团范围以内站位的条带约16条,其多样性也较丰富;而在冷水团范围以外站位的条带少（约12条）,其多样性较低.细菌16S rDNA V3区特征片段经DGGE分离、条带切割,共得到24条条带,克隆、测序后,进行系统进化分析,结果显示这24条带分别归属于2个细菌类群：变形细菌门（Proteobacteria）和拟杆菌门（Bacteroides）.在24条序列中有16条分别与变形细菌亚群的γ-和δ-Proteobacteria相似,有5条与拟杆菌门相似.时空分析发现,4月份所有站位水体（海水温度为7-12℃）的细菌群落组成和10月份（冷水团存在期）冷水团内部水体（海水温度低于10℃）的细菌群落组成相同（都包括γ-Proteobacteria、δ-Proteobacteria和Bacteroides）,与10月份冷水团外部水体（海水温度大于19℃）的（包括γ-Proteobacteria和Bacteroides）不同.优势菌群也存在同样的分布特点,4月份所有站位水体的优势菌群与10月份冷水团内部水体的优势菌群也相同（都是γ-Proteobacteria）,而10月份冷水团外部水体不同的站位优势菌群不同.该海域细菌群落组成和优势菌群的分布特点,可能与冷水团的形成有一定的相关性.

16S rDNA文库法分析草鱼肝胰脏和胆汁细菌群落组成

利用16S rDNA文库随机测序法分析了草鱼肝胰脏和胆汁细菌菌落组成,结果表明,在肝胰脏中共鉴定出19种共生细菌,分别隶属于气单胞菌属、假单胞菌属、摩根菌属、不动杆菌属、弧菌属和变形杆菌属。气单胞菌属和假单胞菌属为优势属,气单胞菌属的丰度为36.17%,假单胞菌属为31.91%。其中,气单胞菌属的GZ16和假单胞菌属的GZ9菌株丰度最高,均为12.77%。在胆汁中共鉴定出10种共生细菌,分别隶属于气单胞菌属、假单胞菌属、摩根菌属和变形杆菌属。气单胞菌属和假单胞菌属为优势属,气单胞菌属的丰度为35%,假单胞菌属为27.5%。其中,变形杆菌属的DN1菌株丰度最高,为25%。肝胰脏中只有10.5%的细菌群落与胆汁的细菌群落相似,胆汁中只有20%的细菌群落与肝胰脏相似,表明草鱼肝胰脏和胆汁有各自特有的共生细菌群落。本研究结果,为进一步探讨肝胰脏和胆汁共生细菌的生理功能,以及细菌与宿主草鱼之间的协同进化提供了基础。

不同草田轮作模式土壤养分及细菌群落组成特征

为研究不同草田轮作模式下土壤养分及细菌群落的组成特征,以5年紫花苜蓿-1年小麦(A5W1)、5年紫花苜蓿-1年玉米(A5C1)、5年紫花苜蓿-2年小麦(A5W2)和5年紫花苜蓿-2年玉米(A5C2)草田轮作模式为对象,测定了土壤有机质、全氮、全磷、全钾、碱解氮、速效磷和速效钾含量,在此基础上,基于16S rRNA基因序列扩增子测序研究了4种轮作模式下耕层土壤细菌群落组成特征。结果表明:轮作第2年各土壤养分含量较第1年显著下降。细菌组成研究结果显示,4种轮作模式下占优势的菌门为变形菌门、放线菌门和厚壁菌门。土壤细菌群落优势属以丙酸杆菌属(Propionibacterium)、芽孢杆菌属(Bacillus)、链球菌属(Streptococcus)以及奈瑟氏球菌属(Neisseria)为主。土壤细菌多样性以A5C2轮作处理最高,A5C1最低;聚类分析显示A5W1和A5C1的组成最接近,其次是A5C2,A5W2的组成与前两者相差较大。土壤养分含量与几种优势属之间呈显著相关性(P<0.05 or P<0.01)。研究结果揭示了河西走廊灌溉区种植紫花苜蓿多年后轮作小麦和玉米改善土壤肥力和防治某些土传植物病害微生物的机理。

应用PCR-DGGE技术分析长江口低氧区的细菌群落组成

应用 PCR 结合变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)技术对长江口外低氧区的细菌群落组成和优势菌群进行了分析。对25条 DGGE 条带进行了克隆、测序,所得到的细菌16SrDNA 基因 V3区序列进行了系统进化分析。结果显示这25条条带分别归属于4个细菌类群:变形菌门(Proteobacteria)、拟杆菌门(Bacteroides)、厚壁菌门(Firmicutes)和蓝细菌门(Cyanobacteria)。其中有16条分别与变形细菌亚群的γ-Proteobacteria 和δ-Proteobacteria 相似。时空分析发现,低氧水体的细菌群落组成与非低氧水体的组成不同,低氧水体包括变形菌门(Proteobacteria)、拟杆菌门(Bacteroides)、厚壁菌门(Firmicutes)和蓝细菌门(Cyanobac-teria),非低氧水体中没有发现蓝细菌门(Cyanobacteria)。并且8月份低氧水体中 Flavobac-teria 为优势菌群。

南海新村湾海草沉积物细菌群落组成及分布

采用聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳（PCR-DGGE）技术及产物序列分析方法,比较研究南海新村湾3个站位海草沉积物中细菌群落组成及分布。结果表明：根据DGGE图谱代表的遗传多样性显示春季二号和春季三号站位样品相似度最高为81.5%,秋季一号和秋季三号站位样品相似度最低为29.3%。春季和冬季细菌多样性指数较高,其Shannon指数范围分别为3.03~3.07和3.23~3.35。通过对16S r DNA V3高变区域42条条带克隆测序比对,结果显示：海草沉积物细菌类群主要分布在变形菌门（Proteobactetia）和厚壁菌门（Firmicutes）,其中变形菌门中Gammaproteobacteria含量最多,为新村湾海草沉积物中优势菌群,占总数的65.80%。蓝细菌（Cyanobacteria）普遍存在于所有沉积物样品中。细菌群落结构在不同季节、不同站位间具有一定差异。秋季二号站位和三号站位优势类群分别为嗜冷杆菌属和交替假单胞属,其含量分别为31.61%和19.41%。