慢性非细菌性前列腺炎患者前列腺组织中细菌16SrRNA基因和大肠杆菌tufA mRNA基因的检测

目的探讨细菌感染与慢性非细菌性前列腺炎的相关性。方法应用PCR方法检测慢性非细菌性前列腺炎患者前列腺组织中的细菌16SrRNA基因,同时用RT-PCR方法检测其中的大肠杆菌tufAmRNA基因。结果38例慢性非细菌性前列腺炎患者前列腺组织中31例(81.5%)呈细菌16SrRNA基因阳性;在31例细菌16SrRNA基因阳性的患者前列腺组织中,有6例(19.4%)检出大肠杆菌tufAmRNA基因。结论慢性非细菌性前列腺炎患者的前列腺组织中不仅有细菌的存在,而且部分被证实是活力细菌。细菌在慢性非细菌性前列腺炎的病因中可能起一定的作用。

LAMP法用于检测饮用水中细菌污染的研究

目的:建立一种快速明确饮用水中是否存在细菌污染的核酸检测方法。方法:根据细菌16SrRNA中高度保守的序列设计4条LAMP引物,交由商业公司合成;利用合成好的引物和标准菌株,通过LAMP方法验证引物扩增的效率和特异性,电泳观察扩增结果,并比较两种不同细菌基因组DNA提取方法及优化LAMP反应条件。结果:使用设计的引物可以很好的检测出各种标准菌株,而且检测灵敏度达到要求。使用碱裂解的方法可以非常方便的提取出细菌基因组DNA。结论:成功建立了LAMP法检测饮用水中细菌的方法,为饮用水是否存在细菌污染快速检测提供了一种可用的方法。

石油污染对土壤细菌结构特征的影响

[目的]探究准东油田地区石油污染对土壤细菌结构特征的影响。[方法]提取准东油田的背景土和油污土中的细菌DNA并进行PCR扩增,利用Miseq平台对其16S r DNA进行测序统计。[结果]总共得到93 033个细菌16S rRNA有效序列,划分为371个OTU单元;样品中优势菌群是放线菌门(Actinobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)及变形菌门(Proteobacteria),厚壁菌门在背景样本中总数为29 732个,污染样本中为8 097个,数量剧减;变形菌门和放线菌门在石油污染土样中数目分别增长70%和47%;污染样品中多样性shannon指数平均为3.77,高于背景样品的2.77。[结论]证明了石油污染物对环境中的细菌结构影响显著,石油污染土壤中细菌结构多样性高于背景土壤,环境中能降解利用石油烃的菌种可能属于放线菌门和变形菌门。