绒山羊分子生物学数据库的设计与构建

结合国内外对绒山羊的分子生物学研究,利用已有的遗传多态、基因序列和结构、功能等方 面的数据,以计算机网络为载体,参考国际通用数据库的格式,建立一个简洁、友好、通用而且专用 性强的绒山羊分子生物学数据库。该数据库主要由文献索引库,基因组学库及绒山羊知识库组成。 数据库的建立为绒山羊的分子生物学研究提供一个良好的数据平台,为从事绒山羊遗传多态、遗传 进化、分子育种、绒毛生长机理等方面的理论和应用研究的工作者提供方便和帮助,并为探索其他 草食家畜分子生物学数据库的构建积累经验。

分子生物学课程教学资源数据库的建设

分子生物学教学资源数据库是为了满足分子生物学课程建设以及教学需要,整合优秀的教学资源,实现资源共享,提高教学质量,将进一步促进科研、教学及其他相关领域的发展。

国际互联网上的NCBI分子生物学数据库简介

编者的话近２０年来，在科学技术的发展过程中，呈现出各学科及其分支学科之间互相渗透及融合的新潮流和新趋势，新的学术思想，工业产品，乃至新的科系随之应运而生，如数码分类、环境微生物、极端环境微生物、混合发酵、基固工程等。与此相适应，本刊拟开辟此新栏目，以餐本刊的爱好者，并欢迎赐稿，提出批评和建议。让我们共同努力，把本刊办成为学术思想活跃，格式多样，内容丰富，为微生物学工作者喜闻乐见的园地，迎接建国５０周年和蕴育着新的机遇和激烈挑战的新世纪的到来。

基于Linux+Apache+MySQL+PHP的棉花分子生物学数据库系统构建

利用课题组积累的数据信息和网上公用数据库中有关棉花分子生物学数据,采用MySQL为后台数据库,以Apache+PHP为环境,在Linux操作系统下实现了棉花分子生物学数据库系统的构建和wwwBLAST的本地化服务。在脱机状态下使用blast进行同源性比对,使得数据查询和序列比对更加方便、快捷、稳定和安全,而且增强了针对性。数据库最终以局域网的形式发布,通过授予权限可向同行提供利用。本课题组在棉纤维品质、黄萎病抗性等相关基因的克隆研究中使该数据库得到初步应用。

分子生物学数据库及其应用

分子生物学突飞猛进地发展,并逐渐成为生物学的主导性学科.在当前多学科交叉发展的趋势下,分子生物学已经逐渐形成了与化学、数学、物理学等的融合.本文主要论述了生物信息学在分子生物学方面的应用,即分子生物学数据库及其应用.文中以实际操作系统介绍了数据库查询与数据库搜索及其相互区别,并且列举了分子生物学数据库综合目录若干.

猪专门化分子生物学数据库的建立及其初步应用

以公共数据库为基础,利用自编过滤程序初步建立了以核酸序列为主的猪专门化分子生物学数据库。在此基础上初步实现了数据库应用,包括核酸电子自动延伸系统、BLAST同源序列检索程序、参照数据库、siRNA序列设计等。本数据库为猪生物信息学研究平台的建立打下了基础。

辽宁绒山羊副结核分枝杆菌的分离鉴定及分子生物学检测

为了对某辽宁绒山羊饲养场疑似副结核病例作出正确诊断,本研究针对疑似病羊的内脏组织和肠内容物在Dubods油酸琼脂培养基上经过37℃条件下9～13周培养,从其肝脏组织中分离获得1株细菌,对该分离菌株开展了形态学观察、抗酸染色镜检、PCR检测及基因序列测定等研究工作。结果显示,分离菌为抗酸染色阳性菌,而且形态学符合副结核分支杆菌的特征; PCR检测结果为阳性,测定的序列与Gen Bank中JⅡ-1961(CP022105. 1)基因序列同源性高达100%,证实了该分离菌株为副结核分支杆菌。

面向对象的分子生物学二次数据库平台建模分析

在生物信息学中,建立生物二次数据库可以针对特定物种进行深入研究。为方便研究人员对生物分子学数据进行存储、检索、查询,在分子生物学二次数据库基础上,通过基于UML的面向对象技术进行建模和开发,实现B/S方式的可视化平台。利用StarUML可视化建模工具,快速高效完成软件分析。

《中国生物化学与分子生物学报》征稿简则

1《中国生物化学与分子生物学报》简介《中国生物化学与分子生物学报》(Chinese Journal of Biochemistry and Molecular Biology,CJBMB)是由中国科学技术协会主管、中国生物化学与分子生物学会和北京大学共同主办,国内外公开发行的国家生物学类/基础医学类核心期刊(月刊)。本刊被美国《化学文摘》(CA)、美国《生物学文摘》(BA)、俄罗斯《文摘杂志》(AJ)、世界卫生组织西太平洋地区医学索引(WPRIM)、中国科技论文与引文数据库(CSTPCD)、Scopus数据库、中国科学引文数据库(CSCD)、《中国科技论文统计源期刊》、《中文核心期刊要目总览(第1~8版)》、《中国生物学文摘数据库》、《中国期刊网》、《中国学术期刊(光盘版)全文数据库》和《中国科技期刊精品数据库》等检索数据库收录。

我国生物化学与分子生物学基础研究合作特征的科学计量学分析

基于美国InstituteforscientificInformation穴ISI雪出版的《ScienceCitationIndexExpanded》穴SCI-Expanded雪网络版,创建了1999～2002年中国生物化学与分子生物学论文数据库,采用科学计量学的方法,定量描述了中国生物化学与分子生物学基础研究的合作特征。

互联网中的分子生物学资源研究

通过互联网技术手段和对分子生物学资源的查询 ,对互联网中丰富的分子生物学数据库、网上资料查询和一些分子生物学电子出版物进行了研究 ,得出了分子生物学资源的热门站点 .认为互联网将对分子生物学研究产生巨大影响 。

有关分子生物学的知识发现研究进展

介绍当前国外有关分子生物学知识发现研究的进展,重点介绍其中运用文本挖掘技术对MEDLINE数据库中的文摘和元数据进行挖掘的最新进展。

运动性疲劳的分子生物学机制

目的:许多学者对运动性疲劳机制提出了不少假说。文章总结了前人的工作,结合部分运动生理学和运动分子生物学知识对运动性疲劳的分子生物学机制进行分析。资料来源:应用计算机检索Medline1990-01/2004-12期间的相关文章,检索词exercise-inducedfatigue,molecularbiologicalmechanism,mito-chondriaDNA,nervousmediator,oxygenfreeradical,并限定文章语言种类为英文。同时计算机检索重庆维普全文数据库1995-01/2004-12的相关文章,限定文章语言种类为中文,检索词为“运动性疲劳,分子生物学机制,线粒体DNA,神经递质,氧自由基。资料选择:对资料进行初审,选取细胞内分子、细胞膜分子、细胞外分子和细胞内外广泛存在的运动性疲劳分子生物学机制的相关内容。资料提炼:共收集到34篇与运动性疲劳分子生物学机制有关的文章,其中有26篇被本文直接引用,其余文献虽未有直接引用,但对于全文的写作具有一定的参考价值。资料综合:从引起运动性疲劳的细胞内分子(如信号传导因子、基因、连接蛋白、酶等)、细胞膜分子(如受体、膜转运蛋白、酶等)、细胞外分子(如激素、神经递质、细胞因子、转运蛋白、酶、免疫球蛋白、补体分子等)和细胞内外广泛存在的分子(如葡萄糖、脂肪酸、氨基酸和水、无机元素、氧自由基等)

基于ESI和InCites的我国学科评价实证研究——以分子生物学与遗传学学科为例

目的为国内高校和科研机构发展ESI分子生物学与遗传学学科提供科研合作参考和指引,为该领域的研究人员提供建议和指导。方法从发文量和总被引次数两方面综合考虑选取大陆及港台地区Top20所具有标杆意义的机构作为研究对象,对其近10年的数据运用文献计量学方法进行发展态势分析,分析维度包括科研生产力、科研影响力、发文期刊、发文作者统计、国际合作论文五方面。结果和结论通过分析对比大陆及港台Top20所机构在科研生产力、科研影响力和国际交流合作中的发展情况和变化趋势,认为大陆机构在该学科科研产出方面表现亮眼,所选的港台机构科研影响力较强,且国际合作水平高的机构发展速度更快。

国际计算机互联网络上的分子生物学E-mail服务器

国际计算机互联网络(Internet)近年来发展迅猛,已成为现阶段事实上的信息高速公路。在这个庞大的网络上存在着各种各样的信息,也有许多有关分子生物学的信息,如果能够正确地加以利用,将会极大方便研究工作的开展。

生物信息学数据库资源建设

大量的蛋白质和核酸数据的积累与理性地分析这些数据中所蕴涵的生物学意义的双重需要,产生了综合生物学研究与计算技术研究等领域最新成果的交叉性学科生物信息学。分别从生物信息学的基因组数据库,核酸和蛋白质一级结构序列数据库,生物大分子(主要是蛋白质)三维空间结构数据库,以上述3类数据库和文献资料为基础构建的二次数据库包括基因组二次数据库、蛋白质序列二次数据库、蛋白质结构二次数据库,生物信息学数据库的集成系统等几个方面,概述了发展中的生物信息学数据库的最近动态和有关信息,同时对主要的热门生物信息学数据库站点和资源进行了评价。此外,就国内生物信息学数据库存在的问题与前景进行了讨论,指出生物信息学将是一次国际性的科学大协作,也是我国生命科学振兴的一个新契机。