Bromodomains识别并结合配体的机理研究

关于酵母重组蛋白内的Bromodomain识别乙酰化赖氨酸的研究近年来受到广泛的关注,但是其识别配体并与之相紧密结合的机理有待进一步的研究。本文采用2015年开发的结合位点拓扑学方法(FCTM)和分子动力学模拟的方式对Bromodomains识别并结合配体的机理进行了充分研究,其中分子动力学模拟时间达24 ns。通过FCTM方法发现结合位点的几何结构具有高度的凹性,且其alphaspace达到了131。分子动力学模拟的结果显示:在模拟的过程中结合位点表面的脯氨酸(Pro66)始终对配体保持着强的分子间相互作用,同时pocket内的水分子分布对配体的氢键网络也一直存在影响。以上结果表明Bromodomains识别并结合配体有两个重要因素:蛋白结构域自身的几何结构和配体受到来自于结合位点表面的氨基酸分子相互作用和pocket内水分子的氢键网络作用。

甲基多巴分子印迹聚合物的制备

目的以甲基多巴为模板分子,分别用4-乙烯吡啶(4-VP)、甲基丙烯酸(MAA)和丙烯酰胺(AM)为功能单体制备了相应的聚合物。方法制得的棒状聚合物经研磨、过筛后,采用平衡结合方法评价了该模板聚合物的结合特性。在模板分子、功能单体和交联剂比例固定的前提下,研究了不同极性溶剂中制备的分子印迹聚合物(MIP)对甲基多巴的吸附,并研究了模板分子与聚合物中结合位点之间的作用力。结果研究表明,采用AM为功能单体,以1∶1的甲醇-乙腈做溶剂合成的MIP对模板分子的结合性最佳。结论甲基多巴MIP对临床样品中甲基多巴的富集和检测有应用前景。