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巴西橡胶树PPCK基因家族成员的鉴定和表达分析 被引量:1
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作者 肖小虎 隋金蕾 +3 位作者 戚继艳 阳江华 朱晋恒 唐朝荣 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2016年第11期2164-2169,共6页
以已发表的PPCK序列为探针,对橡胶树和其他5种植物(木薯、水稻、杨树、蓖麻和拟南芥)的转录组和基因组进行全面搜索,鉴定得到17个PPCK基因,其中包括3个橡胶树PPCK基因,命名为Hb PPCK1-3。序列分析发现,Hb PPCK1-3和其他植物一样在结构... 以已发表的PPCK序列为探针,对橡胶树和其他5种植物(木薯、水稻、杨树、蓖麻和拟南芥)的转录组和基因组进行全面搜索,鉴定得到17个PPCK基因,其中包括3个橡胶树PPCK基因,命名为Hb PPCK1-3。序列分析发现,Hb PPCK1-3和其他植物一样在结构上非常保守,只有一个内含子和一个蛋白激酶结构域,并且相对位置也比较一致。在进化上,橡胶树、木薯和蓖麻3种大戟科植物的PPCK蛋白具有较近的亲缘关系。Hb PPCK3在树皮中表达丰度最高,其次是种子和雄花;Hb PPCK2在胶乳和根中表达丰度相对较高,而Hb PPCK1在各组织中的表达都比较低。另外,大部分家族成员的表达都受到真菌侵染、低温和干旱胁迫处理的诱导,而乙烯利处理却能抑制Hb PPCK2的表达。 展开更多
关键词 巴西橡胶树 PPCK 基因家族 结构和进化 表达分析
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巴西橡胶树膜联蛋白基因家族成员的鉴定和表达分析
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作者 肖小虎 隋金蕾 +3 位作者 戚继艳 方永军 王闯 唐朝荣 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2016年第12期2345-2352,共8页
膜联蛋白是一个多基因家族,在植物逆境胁迫应答和生长发育等方面起重要作用。本研究以已发表的膜联蛋白氨基酸序列为探针,对橡胶树和其他5种植物的转录组和基因组进行搜索,鉴定得到14个橡胶树膜联蛋白基因家族成员,命名为AnnHb1-AnnHb1... 膜联蛋白是一个多基因家族,在植物逆境胁迫应答和生长发育等方面起重要作用。本研究以已发表的膜联蛋白氨基酸序列为探针,对橡胶树和其他5种植物的转录组和基因组进行搜索,鉴定得到14个橡胶树膜联蛋白基因家族成员,命名为AnnHb1-AnnHb14。基因结构分析发现,14个家族成员的内含子数目为3-6个,结构域的数目为2-4个。在进化上,橡胶树、木薯和蓖麻共3种大戟科植物的膜联蛋白具有较近的亲缘关系。表达方面,AnnHb1在各组织中普遍表达,而AnnHb6和AnnHb7主要在胶乳中表达,AnnHb10、AnnHb8和AnnHb13分别在树叶、树皮和雄花中特异表达,其他成员在各组织中低丰度表达或不表达;部分家族成员的表达还与叶片发育、乙烯利刺激、真菌侵染和低温胁迫等具有一定相关性。 展开更多
关键词 巴西橡胶树 膜联蛋白 基因家族 结构和进化 表达分析
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中国14年来耐多药肺炎链球菌CC271进化轨迹的系统基因组学研究
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作者 崔兰卿 《中国临床药理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第23期3524-3524,共1页
该研究对14年来的1312株临床分离肺炎链球菌进行了基因组化分析,确定了CC271的种群结构和进化模式。结合来自全球肺炎球菌测序项目的数据,解析该克隆株的全球流行规律。此外还用贝叶斯分析方法分析了我国优势克隆株CC271的进化动态。
关键词 肺炎球菌 肺炎链球菌 克隆株 流行规律 基因组学研究 结构和进化 临床分离
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Urban structural evolution over a century in Changchun city, Northeast China 被引量:6
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作者 匡文慧 颜凤芹 《Journal of Geographical Sciences》 SCIE CSCD 2018年第12期1877-1895,共19页
Knowledge on urban land-use change and its driving forces has vital significance in the practice of urban planning and management. However, the characteristics of historical, long-term changes and their quantitative r... Knowledge on urban land-use change and its driving forces has vital significance in the practice of urban planning and management. However, the characteristics of historical, long-term changes and their quantitative relationships with the urban environment are still poorly understood. Based on multi-source data, including remote sensing imageries, large-scale topographic maps, historical maps, multi-temporal city maps, and other urban thematic maps, high-quality spatial information on urban land use in the built-up area of Changchun has been extracted for 1898, 1932, 1954, 1976, 1990, 2002, and 2012 by means of geographic information systems and remote sensing. We found that the land-use structure and spatial configuration has undergone tremendous alterations according to urban function in the 100-year history of Changchun city. The built-up area of Changchun expanded from 2.26 km^2 in 1898 to 328.12 km^2 in 2012, increasing about 144 times over the past century. Historically, the development of Changchun can be categorized into three stages: the initial forming stage, the old industrial development stage, and the modern metropolis development stage. Commercial and industrial land expanded rapidly following the founding of the People's Republic of China in 1949, with an increase from 1.74 km^2 in 1954 to 15.91 km^2 in 2012, and from 16.45 km^2 in 1954 to 107.05 km^2 in 2012, respectively. Although there was substantial growth in residential land use(from 1.81 km^2 in 1898 to 113.95 km^2 in 2012), the area percentage of residential land decreased continuously(from 80.09% in 1898 to 34.73% in 2012). Moreover, it was noted that the spatial configuration and structural percentage for commercial, industrial, and residential lands and others had tremendous divergences at different stages. These divergences of land-use structure occurred between the stages and were associated with social regimes and the functional orientation of urban society across the 100 years of historical development. Socio-economics, population growth, and planning policies from specific stages, especially after 1949, had strong effects on the divergence of urban structure. 展开更多
关键词 urban expansion land use urban structure driving factors Changchun city China
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