人类基因组计划的机遇和挑战:Ⅰ.从结构基因组学到功能基因组学

人类基因组计划的机遇和挑战：Ⅰ．从结构基因组学到功能基因组学陈竺＊李伟俞曼熊慧陈赛娟（上海第二医科大学附属瑞金医院、血液学研究所、卫生部暨上海市人类基因组研究重点实验室＊上海人类基因组研究中心、上海生命科学研究中心）关键词人类基因组计划结构基因组学功...

从结构基因组学到功能基因组学

基因组学研究随着模式生物基因组全序列测定的完成由结构基因组学阶段发展到功能基因组学阶段,基因组学成为当今最为活跃、最有影响的前沿学科.以结构基因组学的研究成果为基础,功能基因组学中各学科因其原理不同及其关键技术的特点和优势,具有各自的应用范畴和发展趋势.功能基因组学不断渗透入现代科学的各领域,促成了适用于不同研究目的新兴学科的诞生.

结构基因组学中的衍射相位问题

简要介绍了结构基因组学研究中,用于测定蛋白质结构的X射线分析在解决衍射相位问题方面的最新进展。

DNA和RNA的结构基因组学研究的应用前景

人类基因组计划的实施产生了大量的基因数据,如何利用这些数据是后基因时代生物学研究的主要内容。结构基因组学就是利用这些数据和计算机模拟技术建立模型来为人类服务。介绍了DNA和RNA的结构基因组学的主要研究内容和进展,讨论了结构基因组学的商业应用前景。

癌症与结构基因组学研究

综述了结构基因组学的研究进展,在基因组学水平上对癌症的研究现状及其在癌症研 究中的应用.

泉生热袍菌结构基因组的选靶研究

对泉生热袍菌进行了结构基因组的选靶研究,从泉生热袍菌的蛋白组中挑选了20个蛋白质作为第一批进行结构测定的目标,以发现新的蛋白质折叠模式.选靶研究主要使用了BLAST搜索,PSI-BLAST搜索和ProtoNet数据库搜索等方法.另外,还用PredictProtein程序对选中的蛋白质进行了二级结构和外形预测.选中的20个蛋白质中有8个被克隆、表达和纯化,其中2个得到了单晶并收集了X衍射数据.实验结果和最近一些文献报道的结果表明,挑选的一些蛋白质具有新的折叠模式,表明了这种选靶策略的有效性.

烟草基因组知识篇:4.结构基因组学

基因组学的研究可分为两方面：以基因组测序为目标的结构基因组学和以功能鉴定为目标的功能基因组。结构基因组学是在基因组学研究的早期阶段,着重进行基因作图、序列分析以研究基因组成、定位的科学。染色体不能直接用来测序，必须将基因组分解成容易操作的较小的结构，

结构基因组学与X-射线晶体衍射的研究进展

介绍了X-射线结晶学研究方面的新进展,包括蛋白质基因的克隆和表达载体的选择、蛋白质表达、蛋白质纯化、纯化的蛋白质的质量控制、高通量蛋白质结晶、晶体的收获和储存、同步加速器线束数据收集、自动的晶体固定和观察以及衍射质量分析和数据收集。

结构基因组学研究中的亲和接头

介绍了亲和接头在高通量生产目标蛋白质中的运用,这些亲和接头包括6组氨酸、麦芽糖结合蛋白、谷胱甘肽-S-转移酶和硫氧还蛋白,并讨论了高通量生产的蛋白质的溶解和复性。

结构基因组学研究进展(英文)

在结构基因组学研究方面,北美洲取得了巨大进展,欧洲是缓慢地开始但是强劲地结束,日本是最先开始进行结构基因组学研究的国家之一,并且一直在努力地从事这方面的研究,澳大利亚也在参与结构基因组学研究。核酸结合蛋白对阐明蛋白质-核酸相互作用机理是非常重要的,用结构基因组学研究蛋白质-核酸作用机理将清楚地解释象癌症、糖尿病等疾病的发病机制,这样人类就可以用相关蛋白质的结构信息合成药物来治疗这些疾病。

结构基因组学综合数据库分析的构建和作用

介绍了结构基因组学综合数据库构建的意义和综合数据库的功能,主要包括Gerstein总结的对有限的蛋白质片段的折叠分类和排列、种系发生信息、蛋白质的功能分类和蛋白质的相互作用信息、基因表达信息和综合数据库对报道结构基因组研究数据和格式的要求。

医学结构基因组学在研制新药中的作用

从药靶的选择、蛋白质片段为基础的新药开发、以寡聚酶为新药开发的靶、工业化的结构和蛋白质数据库以及专门研究传染病的结构基因组学工程等5个方面综述了医学结构基因组学在研制新药中的作用。

结构基因组学与蛋白质核磁共振(NMR)光谱

阐述了核磁共振光谱在蛋白质结构基因组学研究中的重要作用,包括核磁共振光谱在结构基因组学研究中的优点和缺点,研究技术进展和展望。

蛋白质数据库与结构基因组

介绍了蛋白质数据库中数据的存储和处理、交换、质量、分配和询问。

结构基因组学研究与核磁共振

各种生物的基因组DNA测序计划的完成 ,将结构生物学带入了结构基因组学时代 .结构基因组学是对所有基因组产物结构的系统性测定 ,它运用高通量的选择、表达、纯化以及结构测定和计算分析手段 ,为基因组的每个蛋白质产物提供实验测定的结构或较好的理论模型 ,这将加速生命科学各个领域的研究 .生物信息学、基因工程、结构测定技术等的发展为结构基因组学研究提供了保证 .近年来核磁共振在技术方法上的进展 。

结构基因组学的目标选择研究

本文论述了结构基因组学研究目标选择 ,包括确定的蛋白质范围、确定蛋白质家族、优选蛋白质家族和确定的蛋白质区域等研究方法 .

结构基因组学与蛋白质结构模型的应用

传统的蛋白质结构模型要首先将蛋白质纯化并结晶 ,再进行X -射线衍射和核磁共振分析才能得出 ;结构基因组学应用基因和基因组信息 ,通过计算机程序建立蛋白质结构模型 ,其速度快 ,精确度高 .利用建立的蛋白质模型 ,可以有目的地合成人类需要的药物和推动生物学理论研究 .本文介绍了建立蛋白质结构的同源模型计算机模拟技术 .

结构基因组研究现状及展望

随着自动控制和基因组数据库的日益完善 ,结构生物学也进入了新的发展时代。现在 ,结构基因组研究迅速兴起并快速开展起来 ,它将大大加速蛋白的结构解析过程及与其紧密相关的蛋白功能的研究进程。结构基因组的研究将会带动生物科学各个领域及医药、农业、酶工程等许多方面的新发展。

第4届国际结构基因组学大会在京召开

由国际结构基因组学联合会主办，中国科学院生物物理研究所、清华大学等单位联合承办的第4届国际结构基因组学大会于2006年10月22-26日在北京友谊宾馆隆重召开。大会吸引了来自中国、法国、美国、日本、德国、意大利，等21个国家和地区的520多名专家、学者，其中与会外国专家、学者近300名。