两株黑曲霉全基因组重测序分析

为探究导致不同黑曲霉中赭曲霉毒素A(ochratoxin A,OTA)生物合成差异的原因并对毒素进行去除及防控,该研究选用黑曲霉CICC 41702与黑曲霉3.316为试验材料,利用全基因组重测序分析两株黑曲霉菌株基因组水平的差异及OTA生物合成的机制。利用Illumina技术对产和不产OTA的两株黑曲霉菌株进行全基因组重测序,并以黑曲霉CBS 513.88的基因组序列为参考,深度挖掘单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)、插入或删除(insertions or deletions,InDel)、结构性变异(structural variants,SV)、拷贝数变异(copy number variation,CNV)等信息,并对参与OTA生物合成的基因进行特异性生物信息学分析。结果表明,黑曲霉3.316比黑曲霉CICC 41702显示出更高的变异,且An15g07920基因在黑曲霉3.316中存在大量的非同义突变并显示缺失了23600 bp,推测这可能是导致两株黑曲霉的OTA生物合成差异的原因。