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草菇不同菌株RT-qPCR参考基因筛选
被引量:
3
1
作者
王文沛
谭强飞
+3 位作者
程志虹
孙万合
贠建民
赵风云
《菌物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第5期749-758,共10页
适合的参考基因是应用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)技术进行基因表达分析的前提。本研究以7个食用菌常用参考基因(β-TUB 1、GPD、ACTB、Ras、α-TUB、β-TUB 2和SPRYp)为候选基因,利用RT-qPCR检测其在草菇常用生产菌株(CPS)V844、V5、V971...
适合的参考基因是应用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)技术进行基因表达分析的前提。本研究以7个食用菌常用参考基因(β-TUB 1、GPD、ACTB、Ras、α-TUB、β-TUB 2和SPRYp)为候选基因,利用RT-qPCR检测其在草菇常用生产菌株(CPS)V844、V5、V971和V844继代退化菌株(SDS)T8、T12、T16、T20中的表达;用Genorm、NormFinder和BestKeeper3种软件分析候选基因的表达稳定性,并结合几何平均数法筛选出最佳参考基因。结果表明,SPRYp、α-TUB和β-TUB2基因适用于草菇常用生产菌株检测,SPRYp、GPD和α-TUB基因适用于草菇继代退化检测,SPRYp基因适用于两种条件的检测。两两差异分析表明,草菇常用生产菌株的最佳参考基因组合为SPRYp、α-TUB和β-TUB 2,继代退化菌株的最佳参考基因组合为SPRYp和GPD,两种条件混合菌株的最佳参考基因组合为SPRYp和α-TUB。
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关键词
草菇
参考基因
RT-qPCR分析
常用生产
菌
株
继代退化菌株
原文传递
题名
草菇不同菌株RT-qPCR参考基因筛选
被引量:
3
1
作者
王文沛
谭强飞
程志虹
孙万合
贠建民
赵风云
机构
甘肃农业大学食品科学与工程学院
出处
《菌物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第5期749-758,共10页
基金
国家自然科学基金(32060708)。
文摘
适合的参考基因是应用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)技术进行基因表达分析的前提。本研究以7个食用菌常用参考基因(β-TUB 1、GPD、ACTB、Ras、α-TUB、β-TUB 2和SPRYp)为候选基因,利用RT-qPCR检测其在草菇常用生产菌株(CPS)V844、V5、V971和V844继代退化菌株(SDS)T8、T12、T16、T20中的表达;用Genorm、NormFinder和BestKeeper3种软件分析候选基因的表达稳定性,并结合几何平均数法筛选出最佳参考基因。结果表明,SPRYp、α-TUB和β-TUB2基因适用于草菇常用生产菌株检测,SPRYp、GPD和α-TUB基因适用于草菇继代退化检测,SPRYp基因适用于两种条件的检测。两两差异分析表明,草菇常用生产菌株的最佳参考基因组合为SPRYp、α-TUB和β-TUB 2,继代退化菌株的最佳参考基因组合为SPRYp和GPD,两种条件混合菌株的最佳参考基因组合为SPRYp和α-TUB。
关键词
草菇
参考基因
RT-qPCR分析
常用生产
菌
株
继代退化菌株
Keywords
Volvariella volvacea
reference gene
RT-qPCR analysis
commonly used production strains
subsequent degraded strains
分类号
S646.13 [农业科学—蔬菜学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
草菇不同菌株RT-qPCR参考基因筛选
王文沛
谭强飞
程志虹
孙万合
贠建民
赵风云
《菌物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022
3
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