山东地区樱桃绿环斑驳病毒(CGRMV)的RT-PCR检测及外壳蛋白基因的克隆

为调查我省甜樱桃感染樱桃绿环斑驳病毒(Cherry Green Ring Mottle Virus,CGRMV)情况,本研究以甜樱桃(Prunus avium L.)品种"红灯"叶片总RNA为模板,根据CGRMV基因组序列设计特异引物,对山东地区37份甜樱桃"红灯"样品进行RT-PCR检测,共检测出19份阳性样品。利用CGRMV外壳蛋白基因序列引物,从阳性植物样本中分离到约800 bp的目的片段,克隆测序,序列分析显示该片段全长807 bp,编码268个氨基酸,与GenBank中已登录的CGRMV分离物的外壳蛋白基因序列一致性为87%～97%,氨基酸序列相似性为95%～99%。该结果表明山东地区甜樱桃生产园中感染CGRMV的病例较为普遍。

红了樱桃,绿了芭蕉

黄里透红的一排路灯,照得深秋的夜犹如黄昏一般。冷雨轻轻的飘落,我把手插在牛仔裤的口袋里,在校园的梧桐树下徘徊。天上没有星星,四周一片静谧,所有怀旧思绪纷至沓来,这让我不由得想起了远在家乡的锋。

樱桃病毒PNRSV、CGRMV、PDV多重RT-PCR检测方法的建立与应用

采用多重RT-PCR方法,建立可同时检测李属坏死环斑病毒(Prunus necrotic ring spot virus,简称PNRSV)、李矮缩病毒(Prune dwarf virus,简称PDV)、樱桃绿环斑驳病毒(Cherry green ring mottle virus,简称CGRMV)的方法。根据GenBank中PNRSV、PDV、CGRMV的保守基因序列设计特异性引物,并对多重RT-PCR的退火温度、循环数、灵敏度、特异性、dNTPs浓度等因素进行优化,建立能同时检测3种樱桃病毒的多重RT-PCR方法。该方法能同时扩增出PNRSV(675 bp)、CGRMV(363 bp)、PDV(304 bp)特异片段,扩增产物大小与预期相符。测序结果表明,3种病毒的序列与相应参考序列相似性达90%以上。多重RT-PCR反应条件优化结果显示,在退火温度为58℃、35个循环条件下,效果均较为理想;dNTP的浓度对试验结果影响不大,最适的浓度为0.6 mmol/L;灵敏度分析结果显示,最低检测浓度为59.7 ng/μL。应用该方法对新疆石河子地区的樱桃样本进行检测,结果显示,该方法可以准确、快速、灵敏地同时检测单一或复合侵染的3种樱桃病毒。

红樱桃 绿樱桃

那天去听讲座，讲授前，教授拿出一把樱桃挨个请我们品尝。我们一阵惊喜，尚未见樱桃上市，他打哪儿弄来的？

樱桃绿环斑驳病毒(CGRMV)外壳蛋白基因的克隆及生物信息学分析

以感染樱桃绿环斑驳病毒(Cherry green ring mottle virus,CGRMV)的甜樱桃叶片为试材,采用RT-PCR和生物信息学分析的方法,研究了樱桃绿环斑驳病毒外壳蛋白(coat protein,CP)基因的核酸序列、进化关系以及蛋白性质和结构,以期为CGRMV的检测及外壳蛋白功能的研究提供参考依据。结果表明:克隆的CGRMV-CP(MW201963)全长807个核苷酸,编码由268个氨基酸残基组成的29.71 kD蛋白。其与17个已报道分离物CP的序列分析显示,核酸序列同源率为75.84%~96.28%,氨基酸一致率为81.72%~98.51%,与来自美国的李树(KC218931.1)进化关系最近。克隆的CGRMV-CP是等电点pI为8.25的疏水性非跨膜蛋白,二级结构由6个α-螺旋,7个β-片层和无规则卷曲构成。

流光轻抛，红了樱桃绿了芭蕉

最近这段时间，不知原因地懈怠．整个人就像一块从繁华尘世滚落到山脚，的石头．密密麻麻的青苔和绿草，葳蕤茂盛地覆盖了灵魂。