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光子晶体薄膜的制备以及在编码载体中的应用 被引量:6
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作者 刘兆斌 赵祥伟 +1 位作者 张帅 顾忠泽 《化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2008年第2期229-233,共5页
通过将由聚苯乙烯纳米粒子构成的光子晶体膜镶嵌在聚二甲基硅氧烷(PDMS)薄膜中制备得到了具有PDMS/光子晶体/PDMS夹心结构的可用于多重生物分析的光子晶体编码载体.用编码载体进行了大肠杆菌3种基因的杂交检测:以3种光子晶体膜作为编码... 通过将由聚苯乙烯纳米粒子构成的光子晶体膜镶嵌在聚二甲基硅氧烷(PDMS)薄膜中制备得到了具有PDMS/光子晶体/PDMS夹心结构的可用于多重生物分析的光子晶体编码载体.用编码载体进行了大肠杆菌3种基因的杂交检测:以3种光子晶体膜作为编码载体固定核酸探针,然后在含有荧光标记的目标分子的缓冲液中进行杂交反应.杂交反应后以光子晶体膜的特征反射谱为核酸编码,以荧光信号的有无来确定目标分子的存在与否.实验结果表明PDMS/光子晶体/PDMS夹心结构是一种有效的构建悬浮载体的方法. 展开更多
关键词 光子晶体 核酸检测 编码载体
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人釉原蛋白编码区基因真核表达载体PsecTaq2A-AMG的构建 被引量:2
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作者 杨爱玲 徐琛蓉 +3 位作者 章锦才 钟良军 殷春一 赵川江 《华西口腔医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2003年第2期133-135,共3页
目的 构建人釉原蛋白 (AMG)编码区基因真核表达载体PsecTaq2A_AMG。方法 采用PCR技术体外扩增AMG完整分泌肽编码区。将扩增产物与PsecTaq2A分别用BamHI和XholI行双酶切 ,将获取的AMG目的基因片段连接到双酶切后的PsecTaq2A ,构建重组... 目的 构建人釉原蛋白 (AMG)编码区基因真核表达载体PsecTaq2A_AMG。方法 采用PCR技术体外扩增AMG完整分泌肽编码区。将扩增产物与PsecTaq2A分别用BamHI和XholI行双酶切 ,将获取的AMG目的基因片段连接到双酶切后的PsecTaq2A ,构建重组质粒PsecTaq2A_AMG ,并对重组质粒进行鉴定。结果 ①PCR扩增产物经 1 5 %琼脂糖凝胶电泳 ,可见大小约 5 19bp的特异性条带 ,与预期结果一致。②重组克隆PsecTaq2A_AMG酶谱分析与预期结果一致 ,序列测定结果与GenBank中的人釉原蛋白序列完全一致。结论 用此方法可成功构建AMG编码区基因真核表达载体PsecTaq2A_AMG。 展开更多
关键词 人釉原蛋白 重组质粒 编码区基因真核表达载体 基因治疗
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基于VAE的编码DNA载体阻断事件聚类分析与研究
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作者 魏梓轩 周家乐 《华东理工大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2020年第3期411-418,共8页
纳米孔道检测技术是单分子检测领域一个重要的研究方向。对纳米孔道阻断电流信号进行特征提取和转换,是对阻断事件进行分类以确定分析物种类的关键。由于有监督学习只能对已知种类的阻断事件进行预测,难以实现对信号本质特征的区分,因... 纳米孔道检测技术是单分子检测领域一个重要的研究方向。对纳米孔道阻断电流信号进行特征提取和转换,是对阻断事件进行分类以确定分析物种类的关键。由于有监督学习只能对已知种类的阻断事件进行预测,难以实现对信号本质特征的区分,因此本文基于编码DNA载体的阻断事件,利用卷积神经网络的特征提取特性,提出了一种应用于纳米孔道信号的无监督聚类方法。结合深度嵌入聚类和变分自编码器(Variational Autoencoder, VAE),实现了对阻断事件的特征转换和聚类的整体性训练。实验结果表明,该聚类方法能对编码DNA载体阻断事件提供较好的聚类结果,与其他聚类算法相比,最高提升了29%的聚类精度,具有更高的聚类准确度。 展开更多
关键词 变分自编码 聚类 深度嵌入 纳米孔道数据分析 编码DNA载体
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编码微载体的制备及其生物医学应用 被引量:1
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作者 王欢 商珞然 +2 位作者 顾笑晓 戎非 赵远锦 《化学进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2017年第10期1159-1172,共14页
高通量分析技术在生物检测、药物递送、材料评估和防伪等方面有着重要的应用,这些应用通常依赖于多元分析来实现。编码微载体技术为多元分析提供了一个可行的策略。编码微载体通过赋予不同微载体不同编码信息来实现编码,编码方式通常为... 高通量分析技术在生物检测、药物递送、材料评估和防伪等方面有着重要的应用,这些应用通常依赖于多元分析来实现。编码微载体技术为多元分析提供了一个可行的策略。编码微载体通过赋予不同微载体不同编码信息来实现编码,编码方式通常为图形编码、光学编码等的一种或多种,并通过每个微载体编码信息的不同来实现对生物分子、细胞和材料的区分和检测。本文总结了编码微载体领域的研究进展,介绍了微载体常用的编码策略,并重点阐述了基于编码微载体的分析技术在多元检测、细胞培养与捕获、药物评估、药物递送和防伪等领域的应用。最后,我们总结了编码微载体的优缺点,并对其发展前景进行了展望。 展开更多
关键词 编码载体 编码策略 多元检测 细胞培养 细胞捕获 药物评估 药物递送 防伪
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基于编码微粒的多元与高通量生物分子检测技术研究进展
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作者 赵祥伟 赵远锦 顾忠泽 《中国科学:化学》 CAS CSCD 北大核心 2011年第10期1657-1657,共1页
由于基因组和蛋白质组学的快速发展,生物医学检测、药物发现以及环境监测领域对于大量生物分子的检测提出了多元与高通量的技术需求.而生物分子结合反应是生物分子检测的一个重要基础,微粒技术在编码与识别生物分子结合反应以实现多元... 由于基因组和蛋白质组学的快速发展,生物医学检测、药物发现以及环境监测领域对于大量生物分子的检测提出了多元与高通量的技术需求.而生物分子结合反应是生物分子检测的一个重要基础,微粒技术在编码与识别生物分子结合反应以实现多元生物分子检测方面具有独到的优势,并且可以与高通量样品处理技术相整合,从而满足这一需求.本文主要介绍了多元与高通量生物分子检测技术的发展过程以及最新的微粒编码技术研究进展,同时对该技术的发展方向与面临的问题进行阐述. 展开更多
关键词 多元生物分子检测 多重标记 编码载体 生物分子结合分析 高通量筛选
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lncRNA SLC16A1-AS1调节miR-532-3p/TAGLN2信号通路对脑胶质瘤细胞恶性生物学行为的影响
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作者 金治宾 李贺扬 龙银波 《中国临床神经科学》 2024年第1期1-12,共12页
目的探讨长链非编码RNA溶质载体家族16成员1反义RNA 1(lncRNA SLC16A1-AS1)调节微小RNA-532-3p(miR-532-3p)/肌动蛋白结合蛋白2(TAGLN2)信号通路对脑胶质瘤细胞增殖、迁移和侵袭的影响及其机制。方法实时荧光定量PCR检测胶质瘤细胞中lnc... 目的探讨长链非编码RNA溶质载体家族16成员1反义RNA 1(lncRNA SLC16A1-AS1)调节微小RNA-532-3p(miR-532-3p)/肌动蛋白结合蛋白2(TAGLN2)信号通路对脑胶质瘤细胞增殖、迁移和侵袭的影响及其机制。方法实时荧光定量PCR检测胶质瘤细胞中lncRNA SLC16A1-AS1表达水平,筛选最佳干预细胞系;通过荧光原位杂交实验、下拉实验、双荧光素酶报告基因实验验证lncRNA SLC16A1-AS1、TAGLN2与miR-532-3p的靶向调控关系。①将U251细胞分为小干扰RNA阴性对照(si-NC)组、si-SLC16A1-AS1组、si-SLC16A1-AS1+NC inhibitor组、si-SLC16A1-AS1+miR-532-3p inhibitor组、miR-NC组、miR-532-3p mimics组、miR-532-3p mimics+pcDNA组、miR-532-3p mimics+TAGLN2组:检测U251细胞的增殖、迁移和侵袭变化;Western blot检测TAGLN2、E-钙黏附蛋白、波形蛋白表达水平。②小鼠体内肿瘤形成实验:验证lncRNA SLC16A1-AS1对胶质瘤生长的影响。结果lncRNA SLC16A1-AS1在胶质瘤细胞中表达水平升高(P<0.05);U251细胞FISH实验、下拉实验、双荧光素酶基因实验证实lncRNA SLC16A1-AS1,TAGLN2与miR-532-3p存在靶向调控关系;抑制lncRNA SLC16A1-AS1表达或过表达miR-532-3p可显著抑制U251细胞增殖、迁移、侵袭及上皮间质转化(P<0.05);抑制miR-532-3p表达或过表达TAGLN2可逆转抑制lncRNA SLC16A1-AS1表达或过表达miR-532-3p对U251细胞增殖、迁移、侵袭及上皮间质转化的抑制作用(P<0.05)。小鼠体内实验显示,抑制lncRNA SLC16A1-AS1表达可显著抑制移植瘤的生长(P<0.05)。结论lncRNA SLC16A1-AS1在胶质瘤细胞中表达水平上调,抑制lncRNA SLC16A1-AS1表达可通过调节miR-532-3p/TAGLN2信号通路,进而抑制胶质瘤的恶性进展。 展开更多
关键词 长链非编码RNA溶质载体家族16成员1反义RNA 1 微小RNA-532-3p 肌动蛋白结合蛋白2 E-钙黏附蛋白 胶质瘤细胞 增殖 迁移与侵袭
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Expression of bkt and bch genes from Haematococcus pluvialis in transgenic Chlamydomonas 被引量:1
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作者 ZHENG KaiJing WANG ChaoGang +3 位作者 XIAO Ming CHEN Jun LI JianCheng HU ZhangLi 《Science China(Life Sciences)》 SCIE CAS 2014年第10期1028-1033,共6页
β-carotene ketolase and β-carotene hydroxylase encoded by bkt and bch, respectively, are key enzymes required for astaxanthin biosynthesis in Haematococcu pluvialis 34-1n. Two expression vectors containing cDNA sequ... β-carotene ketolase and β-carotene hydroxylase encoded by bkt and bch, respectively, are key enzymes required for astaxanthin biosynthesis in Haematococcu pluvialis 34-1n. Two expression vectors containing cDNA sequences of bkt and bch were constructed and co-transformed into cell-wall-deficient Chlamydomonas reinhardtii CC-849. Transgenic algae were screened on TAP agar plates containing 10 gg mL 1 Zeomycin. PCR-Southern analysis showed that bkt and bch were integrated into the genomes of C. reinhardtii. Transcripts of bkt and bch were further confirmed by RT-PCR-Southern analysis. Compared with the wild type, transgenic algae produced 29.04% and 30.27% more carotenoids and xanthophylls, respectively. Moreover, the transgenic algae could accumulate 34% more astaxanthin than wild type. These results indicate that foreign bkt and bch genes were successfully translated into β-carotene ketolase and β-carotene hydroxylase, which were responsible for catalyzing the biosynthesis of astaxanthin in transgenic algae. 展开更多
关键词 CHLAMYDOMONAS β-carotene ketolase β-carotene hydroxylase carotenoids XANTHOPHYLLS ASTAXANTHIN
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