染色体11q上共同缺失区域抑癌基因与鼻咽癌的相关性研究

鼻咽癌好发于中国南部地区人群,是该地区最常见的头颈部恶性肿瘤之一,其病因学极其复杂。全基因组染色体杂合性缺失分析可定位鼻咽癌患者中染色体高频缺失区域,鉴定出多个鼻咽癌相关的候选抑癌基因。研究表明11号染色体长臂(11q)缺失区域与鼻咽癌的发生、发展密切相关,并且定义了最小共同缺失区域,分别是11q14-23、11q23、11q23-24和11q24-11qter。近年来,研究者们发现11q缺失区域存在几个与鼻咽癌发病密切相关的抑癌基因,如αB-晶状体蛋白(CRYAB)、THY1、细胞黏附因子1(CADM1)、OPCML等基因。深入研究11q上抑癌基因将有助于更好地理解鼻咽癌的发病机理、诊断、治疗和预后,从而做到早发现、早诊断和早治疗,提高鼻咽癌患者的存活率和生存质量。

Y染色体AZFc区域部分缺失与精神发育迟滞伴小阴茎关联性分析

目的采用基因芯片技术筛查精神发育迟滞伴小阴茎男童的基因组微失衡,探讨Y染色体无精子症因子C区(AZFc)部分缺失对其的致病性。方法提取1例精神发育迟滞伴小阴茎男童(先证者)及其父亲外周血DNA,利用Cyto One Array染色体芯片行全基因组微失衡初筛,之后采用定制4×180K SNP+CNV精神发育相关芯片行全基因组微失衡筛查。选择特异性STS标签s Y1191,s Y1291作为引物,利用PCR特异性扩增11例正常男童,9/20例4×180K SNP+CNV芯片检测异常的精神发育迟滞未伴小阴茎男童,先证者及其父亲的Y染色体AZFc区域。进一步对170例精神发育迟滞未伴小阴茎男童行PCR扩增,分析AZFc区域缺失频率。结果 1Cyto One Array染色体芯片检测发现先证者存在AZFc区域全缺失(chr Y:24646690-28103711),定制4×180K SNP+CNV精神发育相关芯片排除其他精神发育相关基因组微失衡,发现AZFc区域部分缺失(chr Y:24873066-25203027;chr Y:25850255-26245019),结果不同于Cyto One Array染色体芯片。220例精神发育迟滞伴小阴茎男童行4×180K CNV+SNP芯片检测,5例存在Y染色体AZFc区域部分缺失,但缺失起止点不同;4例为已知的致精神发育异常的基因组微失衡。3PCR验证表明先证者及其父亲为AZFc区域b2/b3缺失,此片段缺失同时存在于1/11例正常男童、4/9例精神发育迟滞未伴小阴茎男童。4精神发育迟滞未伴小阴茎男童AZFc区域b2/b3缺失频率为15.1%(27/179)。结论 AZFc区域b2/b3缺失可能不是精神发育迟滞伴小阴茎男童的致病病因,此AZFc区域部分缺失在中国人群中为多态性位点。

基于单应性扩散约束的二步网格优化视差图像对齐

目前,在带有视差场景的图像对齐中,主要难点在某些无法找到足够匹配特征的区域,这些区域称为匹配特征缺失区域.现有算法往往忽略匹配特征缺失区域的对齐建模,而只将有足够匹配特征区域中的部分单应变换系数(如相似性变换系数)传递给匹配特征缺失区域,或者采用将匹配特征缺失区域转化为有足够匹配特征区域的间接方式,因此对齐效果仍不理想.在客观事实上,位于相同平面的区域应该拥有相同的完整单应变换而非部分变换参数.由此出发,利用单应变换系数扩散的思想设计了一个二步网格优化的图像对齐算法,简称单应扩散变换(Homography diffusion warping,HDW)算法.该方法在第一步网格优化时获得有足够匹配特征区域的单应变换,再基于提出的单应性扩散约束将这些单应变换系数扩散到邻域网格,进行第二步网格优化,在保证优化任务简洁高效的前提下实现单应变换系数的传播与图像对齐.相较于现有的针对视差场景图像对齐算法,所提方法在各项指标上都获得了更好的效果.

Y染色体微缺失和精子染色体非整倍体与不育关系的探讨

目的:探讨Y染色体AZF区微缺失和精子染色体非整倍体与男性不育的关系。方法:采用多重PCR-凝胶电泳技术对32例男性不育患者AZF4个区15个序列标签位点(STS)进行微缺失检测,并应用X、Y、18号染色体探针对其中16例弱精子症患者和8例健康男性进行三色荧光原位杂交,分析精子染色体非整倍体。结果:32例患者中4例在AZF区有微缺失,缺失率12.5%。病例组计数47691个精子,对照组计数28952个精子,杂交率分别为99.53%和99.93%。非整倍体主要类型为YY18、XX18、XY18、Y1818和X1818。病例组依次为(0.102±0.154)%、(0.103±0.073)%、(0.273±0.278)%、(0.381±0.493)%和(0.318±0.585)%,非整倍体率为5.64%;对照组则为(0.050±0.040)%、(0.030±0.031)%、(0.098±0.080)%、(0.093±0.087)%和(0.085±0.106)%,非整倍体率为4.28%,两组之间差异有统计学意义(P<0.01)。结论:Y染色体AZF区域发生微缺失和精子染色体非整倍体增加可能是男性不育的重要病因之一。

基于工业机器人的三维扫描技术研究

在被测曲面表面形貌和轮廓未知的情况下,由于存在无法准确布置采样点、视点偏移等问题,三维扫描过程中会出现缺失区域,严重影响表面完整性和扫描质量。因此,提出了一种工业机器人+三维扫描仪的解决方案,以工业机器人为运动平台,搭载三维扫描仪对曲面进行扫描操作。在获取快速扫描点云数据后,通过弦长离散法判断缺失区域并确定边界点,然后运用最小包容球对缺失区域进行包容计算,预估扫描缺失区域的范围和无效扫描区域的法线方向,并采用圆周等分法重新布置采样点,规划扫描路径,最后转化为工业机器人精扫描运动轨迹,补全缺失区域。

基于生成对抗网络的分级联合图像补全方法

已有的图像补全工作大都基于规则的、区域较小或者有足够上下文信息的待补全区域。当待补全区域面积较大时,由于上下文信息的缺失及生成对抗网络(GAN)训练的不稳定性,往往会产生模糊或失真的补全结果。尤其是当缺失区域位于图像边缘位置时,补全结果会出现较大的空白及伪彩色。基于以上情况,在已有的基于GAN的补全方法的基础上提出一种分级联合图像补全方法,并针对GAN训练不稳定的问题对网络结构做出了改进。一方面改善了由于缺失区域面积较大产生的补全结果有空白生成的问题,从而使补全结果的纹理细节更加真实、清晰;另一方面使得对抗网络训练更加稳定,抑制了伪彩色的生成。实验结果表明分级联合图像补全方法取得了更好的补全结果。

利用生成对抗网络的人脸图像分步补全法

人脸图像修复技术是近年来图像处理领域的研究热点,而人脸图像大面积缺失导致损失语义信息过多,一直是该领域的重点难点问题。针对这一问题,文中提出了一种基于生成对抗网络的图像分步补全算法。将人脸图像修复问题分为两步,设计两个串联的生成对抗网络,首先残缺图像通过预补全网络进行图像的预补全,预补全图像进入增强网络进行特征增强;判别器分别判断预补全图像和增强图像与理想图像的差异性;采用长短时记忆单元连接两部分的信息流,增强信息的传递。然后使用内容损失、对抗损失和全变分损失相结合的损失函数,提高网络的修复效果。最后在CelebA数据集上进行实验,结果显示,所提算法相较于对比算法在峰值信噪比指标上提高了16.84%~22.85%,在结构相似性指标上提高了10%~12.82%。

两种模式生物核小体定位比较研究

在对两种模式生物酵母与果蝇胚胎期核小体定位进行研究时,发现不同物种间以及同一物种中不同表达模式基因上的核小体分布呈现出差显著异性。在总体上,转录起始位点附近的酵母核小体NFR区域比果蝇的NFR短。经基因中心对齐后,酵母与果蝇胚胎期沉默型基因的核小体缺失区域的两个边界中间处共同呈现了一个明确有着均匀间隔的核小体数n,且随着基因长度L的变长其周期性特性逐渐变模糊,但果蝇的图谱表现的更为复杂。结果表明,从单细胞酵母生物到多细胞果蝇生物间基因组的进化过程中,核小体组织的演化既有变异性,也具有保守性。

酵母和果蝇胚胎期核小体定位模式比较研究

在进行酵母与果蝇胚胎期核小体定位研究时,发现不同物种或同一物种中不同表达模式基因与全体基因的排列比较中,核小体分布呈现出差异性。我们观察到酵母全体基因中核小体排列对核小体缺失区域(NFR)的基因3’端比基因5’端的影响小,而果蝇中对两者的影响却是一样的。且酵母与果蝇胚胎期沉默型基因中NFR的两个边界之间的核小体排列都出现了相同规律。它揭示了核小体组织在基因组的整个进化过程中具有的前进性,同时也具有保守性。

长三角城市群协调发展机制问题新探

本文对长三角城市群20多年来在区域协调机制方面所做的积极探讨进行了历史回顾,对该区域在协调发展机制缺失方面的问题进行了剖析,在此基础上,提出对构建长三角城市群协调发展机制的总体设想与初步思考。

Y染色体AZFc区域缺失及FSH水平升高与男性不育的关系

目的分析Y染色体AZFc区域缺失及卵泡刺激素(FSH)水平升高与男性不育的关系。方法选择2016年2月-2020年4月期间浙江中医药大学第二临床医学院收治的符合纳入条件的男性不育患者180例为观察组,选择同期在本院进行健康体检的符合纳入条件的生育正常男性180名为对照组。观察两组受试者精液Y染色体AZFa、AZFb、AZFc区域微缺失情况及血清FSH水平并进行比较分析。同时分析观察组患者Y染色体AZFc区域缺失与FSH水平的相关性。结果观察组Y染色体AZF区域缺失率为12.78%(23/180),其中Y染色体存在AZFc区域缺失者占所有AZF区域缺失的60.87%(14/23),对照组Y染色体AZF区域不存在缺失。不同Y染色体AZF缺失区域类型患者的生精障碍类型差异有统计学意义(P<0.05)。观察组患者血清FSH水平显著高于对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。无精症患者FSH水平明显高于弱精症患者,差异有统计学意义(P<0.05)。Y染色体AZF区域未缺失不育患者FSH水平明显低于Y染色体AZF区域缺失患者,差异有统计学意义(P<0.05)。Spearman相关性分析显示,FSH水平与Y染色体AZFc区域缺失呈正相关(rs=0.207,P=0.005)。结论Y染色体AZF微缺失区域类型与患者精液障碍类型有关,Y染色体AZFc区域缺失与患者FSH升高呈正相关,临床对难以明确原因的精子异常型男性不育患者同时进行Y染色体AZF区域检测及FSH检测可能对患者精液障碍类型判断具有一定的临床价值。

Y染色体无精子因子区域微缺失与男性不育的相关性研究

目的探讨Y染色体无精子因子区域(AZF)微缺失与男性不育患者发病的关系。方法从2015年1月开始筛选患者,截止2017年8月,入选不育且精子数目、活力正常患者156例,不育且重度少精子症患者86例,不育且无精子症患者62例。提取研究对象的血液基因DNA后,采用聚合酶链反应、凝胶电泳进行Y染色体AZF微缺失分析并进行比较,并比较3组血清卵泡刺激素与抑制素B水平。结果 3组AZFa缺失、AZFb缺失、AZFc缺失发生率比较差异有统计学意义(P<0.05),不育且无精子组发生率显著高于其它两组(P<0.05)。3组gr/gr部分缺失、b2/b3部分缺失比较差异有统计学意义(P<0.05),从高到低依次为不育且无精子组>不育且重度少精子组>不育且精子数目、活力正常组。3组血清卵泡刺激素、抑制素B比较差异有统计学意义(P<0.05),抑制素B从低到高依次为不育且无精子组<不育且重度少精子组<不育且精子数目、活力正常组;卵泡刺激素从高到低依次为不育且无精子组>不育且重度少精子组>不育且精子数目、活力正常组。结论 Y染色体AZF微缺失会造成男性精子生成障碍,在无精子症或者重度少精子症男性不育患者中进行Y染色体AZF微缺失的检测对于临床进一步诊疗具有重要的指导意义。

术中冰冻病理检查对甲状腺微小乳头状癌的临床诊断意义

目的研究男性不育患者Y染色体AZF区域微缺失的STS位点,以此确定男性不育症的诊治方案。方法选择2015年1月-2018年1月我中心就诊的156例不育男性患者作为研究对象,分析156例患者AZF基因15个序列标签位点(STS),以琼脂糖凝胶电泳分析片段。结果 156例不育男性患者中有16例AZF区域存在微缺失,分析AZF微缺失组合类型,其中发生位点微缺失最大的组合是AZFc+AZFd,在156例不育男性患者中占到12例,达7.69%。结论男性不育患者Y染色体AZF区域微缺失是重要遗传致病因素,检测男性不育患者的精液质量,可以分析AZF的基因微缺失情况,利于分析病因和后期制定治疗方案。

AZF缺失患者Y染色体断裂点定位分析

目的分析导致无精子因子区域（azoospermiafactor，AZF）缺失的Y染色体断裂的特点。方法在272例无精子症、240例严重少精子症患者进行Y染色体AZF微缺失筛查基础上，对筛查发现大片段缺失的49例患者，选择AZFa、AZFb、AZFc区23个序列标签位点（sequencetaggedsite，STS），对断裂点进行定位分析。颖有无精子症缺失基因家族（deletedinazoospermia，DAz）、基因部分拷贝缺失病例进行单核苷酸多态性（singlenuecleotidevarians，SNV）缺失分析以确定DAZ基因的拷贝数。结果6例AZFb＋c缺失患者，1例为sY98／sY1206缺失，4例为P5／P1远端重组，1例为P4／P1远端重组。3例筛查发现AZFb区缺失患者，1例为P5／P3缺失，2例为PS／P1近端重组，伴有DA幼、DAZ2拷贝缺失。40例AZFc区全缺失患者，均为b2／b4同源重组。部份AZFb、AZFb＋c缺失患者，睾丸穿刺活检发现精子生成减少或精子成熟障碍。结论对Y染色体AZF大片段缺失断裂点的大致定位有利于判断缺失发生机制，进而分析丢失的生精相关基因拷贝性质与数量，以评价其与生精障碍表型之间的关联。

恶性血液病中20q-异常的研究进展

20q-异常起源于多能造血干细胞,多见于髓系疾病,淋系肿瘤少见.研究发现,20q-病例均存在一个常见共同缺失区域（CDR）.目前已鉴定出一些位于CDR的候选基因,其中h-1（3）mbt（即L3MBTL）基因被认为最可能是与白血病发生相关的重要肿瘤抑制基因.20q-具有重要的预后意义：当它作为原发性或唯一异常核型出现于疾病的早期阶段时,提示预后良好;当它作为继发性或与其他异常核型伴随出现于疾病的中、晚期阶段时,提示预后不良.20q-的衍生异常包括i（20q-）、多拷贝20q-和der（20）del（20q）t（20;21）（q11;q11）等,其意义尚待积累更多病例进行更深入的研究方可明了.