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2016年黑龙江省猪流行性腹泻病毒S1基因的遗传变异分析
被引量:
2
1
作者
朱金海
王恩雨
孙东波
《黑龙江畜牧兽医》
CAS
北大核心
2018年第5期5-10,共6页
为了解2016年黑龙江省猪场内猪流行性腹泻病毒(PEDV)的流行与变异情况,试验利用RT-PCR方法对采自黑龙江省的29份腹泻仔猪的小肠组织样品进行检测,针对PEDV S1基因进行扩增及测序,构建系统进化树,并对其进行系统进化性分析和氨基酸序...
为了解2016年黑龙江省猪场内猪流行性腹泻病毒(PEDV)的流行与变异情况,试验利用RT-PCR方法对采自黑龙江省的29份腹泻仔猪的小肠组织样品进行检测,针对PEDV S1基因进行扩增及测序,构建系统进化树,并对其进行系统进化性分析和氨基酸序列插入或缺失突变分析。结果表明:10个S1基因测序成功,鉴定毒株间核苷酸序列同源性为96.2%-99.7%,推导出的氨基酸序列同源性为96.2%-99.5%;与已知的中国HGC-01-2015、FJ-FQ 2014野毒株和美国高致病性毒株USA/Colorado/2013同源性较高,而与经典毒株CV777、中国早期毒株同源性较低;以S1基因构建系统进化树,主要分为GⅠ群和GⅡ群,新鉴定的10株PEDV毒株均属于GⅡb亚群的non S-INDEL型毒株,与经典毒株CV777及亚洲其他地区毒株、欧洲毒株分属于不同亚群;鉴定毒株与亚洲地区常用疫苗株相比,存在相同的突变位点,并集中在S1蛋白的N末端结构域。
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关键词
黑龙江省
猪流行性腹泻病毒(PEDV)
S1基因
系统进化树
插入
缺失突变分析
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职称材料
RM07 DNA片段在嗜盐古生菌中的启动子功能研究
2
作者
杨洋
沈萍
《武汉大学学报(理学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2003年第4期519-522,共4页
以二氢叶酸还原酶基因 (dhfr )和 β 半乳糖苷酶基因 (bgaH)为报告基因 ,利用启动子探针检测技术研究了在大肠杆菌和酵母菌中均具有启动子活性的RM0 7DNA片段在嗜盐古生菌中的功能 ,结果从mRNA转录和蛋白质表达水平证明RM0 7片段在嗜盐...
以二氢叶酸还原酶基因 (dhfr )和 β 半乳糖苷酶基因 (bgaH)为报告基因 ,利用启动子探针检测技术研究了在大肠杆菌和酵母菌中均具有启动子活性的RM0 7DNA片段在嗜盐古生菌中的功能 ,结果从mRNA转录和蛋白质表达水平证明RM0 7片段在嗜盐古生菌中同样具有启动子功能 .缺失分析进一步定位了RM 0 7片段中启动子活性必需的重要功能区 。
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关键词
嗜盐古生菌
启动子
启动功能
微生物遗传学
RM07DNA片段
缺失突变分析
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职称材料
题名
2016年黑龙江省猪流行性腹泻病毒S1基因的遗传变异分析
被引量:
2
1
作者
朱金海
王恩雨
孙东波
机构
黑龙江八一农垦大学动物科技学院
出处
《黑龙江畜牧兽医》
CAS
北大核心
2018年第5期5-10,共6页
基金
国家自然科学基金面上项目(31472209)
“十三五”国家重点研发计划项目(2017YFD0501600)
黑龙江省博士后科研启动金项目(LBH-Q16188)
文摘
为了解2016年黑龙江省猪场内猪流行性腹泻病毒(PEDV)的流行与变异情况,试验利用RT-PCR方法对采自黑龙江省的29份腹泻仔猪的小肠组织样品进行检测,针对PEDV S1基因进行扩增及测序,构建系统进化树,并对其进行系统进化性分析和氨基酸序列插入或缺失突变分析。结果表明:10个S1基因测序成功,鉴定毒株间核苷酸序列同源性为96.2%-99.7%,推导出的氨基酸序列同源性为96.2%-99.5%;与已知的中国HGC-01-2015、FJ-FQ 2014野毒株和美国高致病性毒株USA/Colorado/2013同源性较高,而与经典毒株CV777、中国早期毒株同源性较低;以S1基因构建系统进化树,主要分为GⅠ群和GⅡ群,新鉴定的10株PEDV毒株均属于GⅡb亚群的non S-INDEL型毒株,与经典毒株CV777及亚洲其他地区毒株、欧洲毒株分属于不同亚群;鉴定毒株与亚洲地区常用疫苗株相比,存在相同的突变位点,并集中在S1蛋白的N末端结构域。
关键词
黑龙江省
猪流行性腹泻病毒(PEDV)
S1基因
系统进化树
插入
缺失突变分析
Keywords
Heilongjiang area
Porcine epidemic diarrhea virus(PEDV)
S1 gene
phylogenetic tree
insertions and deletions mutation analysis
分类号
S828 [农业科学—畜牧学]
Q786 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
RM07 DNA片段在嗜盐古生菌中的启动子功能研究
2
作者
杨洋
沈萍
机构
武汉大学生命科学学院
出处
《武汉大学学报(理学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2003年第4期519-522,共4页
基金
国家自然科学基金资助项目 ( 3 9770 0 0 9
2 9973 0 3 0 )
文摘
以二氢叶酸还原酶基因 (dhfr )和 β 半乳糖苷酶基因 (bgaH)为报告基因 ,利用启动子探针检测技术研究了在大肠杆菌和酵母菌中均具有启动子活性的RM0 7DNA片段在嗜盐古生菌中的功能 ,结果从mRNA转录和蛋白质表达水平证明RM0 7片段在嗜盐古生菌中同样具有启动子功能 .缺失分析进一步定位了RM 0 7片段中启动子活性必需的重要功能区 。
关键词
嗜盐古生菌
启动子
启动功能
微生物遗传学
RM07DNA片段
缺失突变分析
Keywords
archaea
promoter
three domains of life
分类号
Q933 [生物学—微生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
2016年黑龙江省猪流行性腹泻病毒S1基因的遗传变异分析
朱金海
王恩雨
孙东波
《黑龙江畜牧兽医》
CAS
北大核心
2018
2
下载PDF
职称材料
2
RM07 DNA片段在嗜盐古生菌中的启动子功能研究
杨洋
沈萍
《武汉大学学报(理学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2003
0
下载PDF
职称材料
已选择
0
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引证文献
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