目的:根据缺氧诱导因子1(Hypoxia Inducible Factor-1,HIF-1)信号通路预测治疗新型冠状病毒肺炎(Corona Virus Disease 2019,COVID-19)的潜在活性成分和中药。方法:通过京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genom...目的:根据缺氧诱导因子1(Hypoxia Inducible Factor-1,HIF-1)信号通路预测治疗新型冠状病毒肺炎(Corona Virus Disease 2019,COVID-19)的潜在活性成分和中药。方法:通过京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)数据库、人类基因的综合数据库(GeneCards Database)搜集HIF-1信号通路的相关基因,利用基因间功能关联关系搜索工具(Search Tool for Recurring Instances of Neighbouring Genes,STRING)数据库和Cytoscape软件构建蛋白质-蛋白质相互作用(Protein Protein Interaction,PPI)网络并筛选核心基因,然后在中药系统药理学数据库及分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)检索潜在治疗活性成分和中药,并构建基因-活性成分-中药网络,最后进行分子对接验证结合活性。结果:通过HIF-1信号通路中核心基因共预测出233个活性成分,439种中药。构建的基因-活性成分-中药网络中度值(Degree)最高的活性成和中药分别为槲皮素、山奈酚、木犀草素和余甘子、白果、枇杷叶、红花、苦参。分子对接结果均显示有较好的结合活性。结论:本研究通过网络药理学的方法根据HIF-1信号通路初步预测筛选了潜在的治疗活性成分及中药,为进一步探索COVID-19的治疗药物提供了理论依据。展开更多
中枢神经系统血管母细胞瘤(central nervous system hemangioblastoma,CNS-HB)是中枢神经系统的罕见肿瘤,好发生于小脑(63%)、脊髓(32%)、脑干(5%),是一种常染色体显性遗传病,2/3的CNS-HB与von Hippel-Lindau(VHL)基因相关[1]。VHL基因...中枢神经系统血管母细胞瘤(central nervous system hemangioblastoma,CNS-HB)是中枢神经系统的罕见肿瘤,好发生于小脑(63%)、脊髓(32%)、脑干(5%),是一种常染色体显性遗传病,2/3的CNS-HB与von Hippel-Lindau(VHL)基因相关[1]。VHL基因是位于3号染色体短臂的一个功能独特且功能复杂的抑癌基因,编码含213个氨基酸的蛋白,为pVHL蛋白[2]。VHL基因突变,导致pVHL蛋白失去功能,促进缺氧诱导因子(hypoxia-inducible factor,HIF)的表达,并激活HIF信号通路,最终导致肿瘤的发生[2]。目前,关于HIF信号通路的相关研究较多,并且已有作用于pVHL-HIF通路的多种靶向药物,如贝伐单抗、索拉非尼、舒尼替尼和帕唑帕尼[3,4]。展开更多
文摘目的:根据缺氧诱导因子1(Hypoxia Inducible Factor-1,HIF-1)信号通路预测治疗新型冠状病毒肺炎(Corona Virus Disease 2019,COVID-19)的潜在活性成分和中药。方法:通过京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)数据库、人类基因的综合数据库(GeneCards Database)搜集HIF-1信号通路的相关基因,利用基因间功能关联关系搜索工具(Search Tool for Recurring Instances of Neighbouring Genes,STRING)数据库和Cytoscape软件构建蛋白质-蛋白质相互作用(Protein Protein Interaction,PPI)网络并筛选核心基因,然后在中药系统药理学数据库及分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)检索潜在治疗活性成分和中药,并构建基因-活性成分-中药网络,最后进行分子对接验证结合活性。结果:通过HIF-1信号通路中核心基因共预测出233个活性成分,439种中药。构建的基因-活性成分-中药网络中度值(Degree)最高的活性成和中药分别为槲皮素、山奈酚、木犀草素和余甘子、白果、枇杷叶、红花、苦参。分子对接结果均显示有较好的结合活性。结论:本研究通过网络药理学的方法根据HIF-1信号通路初步预测筛选了潜在的治疗活性成分及中药,为进一步探索COVID-19的治疗药物提供了理论依据。