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大麦在网斑病菌侵染后的转录组学分析
被引量:
1
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作者
李桃
汪军成
+7 位作者
姚立蓉
李葆春
马小乐
杨柯
司二静
尚勋武
王化俊
孟亚雄
《麦类作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第9期1070-1081,共12页
近年来,由子囊菌亚门真菌网斑病菌(Pyrenophora teres)引起的大麦网斑病在我国大麦(Hordeum vulgare L.)主产区大面积发生并流行,导致大麦产量和品质下降。为探索大麦响应网斑菌侵染的分子机制,以抗网斑病种质材料BYT-CYA3(B)和敏感型...
近年来,由子囊菌亚门真菌网斑病菌(Pyrenophora teres)引起的大麦网斑病在我国大麦(Hordeum vulgare L.)主产区大面积发生并流行,导致大麦产量和品质下降。为探索大麦响应网斑菌侵染的分子机制,以抗网斑病种质材料BYT-CYA3(B)和敏感型材料美41/I(M)为研究对象,利用转录组测序技术(RNA-Sep),分析了2个材料在接种网斑病菌后不同时间点的基因表达差异。结果表明,对比网斑病菌侵染后不同时间点的转录组测序数据,共鉴定出35545个差异表达基因;网斑病侵染大麦3 h、6 h、12 h、24 h和72 h时,抗病材料与敏感型材料间富集到GO和KEGG途径的差异表达基因数目有明显区别;共获得435个网斑病菌侵染诱导表达基因;共筛选出182个主要参与过氧化物酶体(peroxisome)、代谢途径(metabolic pathways)、MAPK信号传导途径-植物(MAPK signaling pathway-plant)、植物-病原体相互作用(plant-pathogen)、植物激素信号转导(plant hormone signal transduction)、次生代谢物生物合成(biosynthesis of secondary metabolites)等生物学过程的差异表达基因,推测这些基因与大麦响应网斑病菌侵染有关。随机从中选取10个基因进行了荧光定量PCR检测,并对其转录组测序结果进行定量分析,发现荧光定量PCR结果与转录结果趋势一致。本试验从分子水平初步探索了大麦对网斑病菌侵染的响应机制,为深入研究抗病基因提供了候选基因。
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关键词
大麦
网斑病菌侵染
转录组分析
差异表达基因
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职称材料
题名
大麦在网斑病菌侵染后的转录组学分析
被引量:
1
1
作者
李桃
汪军成
姚立蓉
李葆春
马小乐
杨柯
司二静
尚勋武
王化俊
孟亚雄
机构
甘肃农业大学农学院
甘肃省干旱生境作物学重点实验室/甘肃省作物遗传改良与种质创新重点实验室
甘肃农业大学生命科学技术学院
出处
《麦类作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第9期1070-1081,共12页
基金
甘肃省现代农业产业技术体系特色作物岗位专家资助项目(GARS-TSZ-2)
国家大麦青稞产业技术体系专项(CARS-05-03B-03)
+4 种基金
甘肃省重大科技专项(17ZD2NA016)
甘肃农业大学学科建设专项(GAU-XKJS-2018-082,GAU-XKJS-2018-083)
盛彤笙科技创新基金项目(GSAU-STS-1513,GSAU-STS-1735)
国家自然科学基金项目(30771331)
农业产业技术体系建设项目(CARS-05)。
文摘
近年来,由子囊菌亚门真菌网斑病菌(Pyrenophora teres)引起的大麦网斑病在我国大麦(Hordeum vulgare L.)主产区大面积发生并流行,导致大麦产量和品质下降。为探索大麦响应网斑菌侵染的分子机制,以抗网斑病种质材料BYT-CYA3(B)和敏感型材料美41/I(M)为研究对象,利用转录组测序技术(RNA-Sep),分析了2个材料在接种网斑病菌后不同时间点的基因表达差异。结果表明,对比网斑病菌侵染后不同时间点的转录组测序数据,共鉴定出35545个差异表达基因;网斑病侵染大麦3 h、6 h、12 h、24 h和72 h时,抗病材料与敏感型材料间富集到GO和KEGG途径的差异表达基因数目有明显区别;共获得435个网斑病菌侵染诱导表达基因;共筛选出182个主要参与过氧化物酶体(peroxisome)、代谢途径(metabolic pathways)、MAPK信号传导途径-植物(MAPK signaling pathway-plant)、植物-病原体相互作用(plant-pathogen)、植物激素信号转导(plant hormone signal transduction)、次生代谢物生物合成(biosynthesis of secondary metabolites)等生物学过程的差异表达基因,推测这些基因与大麦响应网斑病菌侵染有关。随机从中选取10个基因进行了荧光定量PCR检测,并对其转录组测序结果进行定量分析,发现荧光定量PCR结果与转录结果趋势一致。本试验从分子水平初步探索了大麦对网斑病菌侵染的响应机制,为深入研究抗病基因提供了候选基因。
关键词
大麦
网斑病菌侵染
转录组分析
差异表达基因
Keywords
Barley Pyrenophora teres infection
Transcriptome analysis
Differentially expressed gene
分类号
S512.3 [农业科学—作物学]
S330 [农业科学—作物遗传育种]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
大麦在网斑病菌侵染后的转录组学分析
李桃
汪军成
姚立蓉
李葆春
马小乐
杨柯
司二静
尚勋武
王化俊
孟亚雄
《麦类作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020
1
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职称材料
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