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基于表型术语及CBK理念构建罕见病知识库
被引量:
1
1
作者
张睿
陈薇
+1 位作者
师庆科
王觅也
《中国数字医学》
2021年第2期34-38,共5页
通过扩展人类表型术语集(HPO)的中文同义词,通过自然语言处理程序对电子病历中的表型概念进行识别后,借助可计算生物医学知识(CBK)理论,重新构建了整合电子病历及权威知识库的罕见病诊断知识库。因真实世界罕见病患者信息还包括各种合...
通过扩展人类表型术语集(HPO)的中文同义词,通过自然语言处理程序对电子病历中的表型概念进行识别后,借助可计算生物医学知识(CBK)理论,重新构建了整合电子病历及权威知识库的罕见病诊断知识库。因真实世界罕见病患者信息还包括各种合并症及并发症,其疾病-表型关联更加混杂,整合二者知识库是对目前罕见病诊断知识库在国内EMR落地的有益探索。未来通过CBK及其KGrid平台,该罕见病诊疗知识可以进行聚合计算、推演,封装后以便提供知识即服务(KaaS)的云计算服务,最终提升知识的复用及互操作性。
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关键词
HPO术语
可计算生物医学
知识
罕见病诊断知识库
OMIM
知识库
互操作性
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题名
基于表型术语及CBK理念构建罕见病知识库
被引量:
1
1
作者
张睿
陈薇
师庆科
王觅也
机构
四川大学华西医院
四川省妇幼保健院
出处
《中国数字医学》
2021年第2期34-38,共5页
基金
四川省科技厅重点研发项目-基于表型术语的罕见病早期预警决策支持系统构建(编号:2019YFS0152)。
文摘
通过扩展人类表型术语集(HPO)的中文同义词,通过自然语言处理程序对电子病历中的表型概念进行识别后,借助可计算生物医学知识(CBK)理论,重新构建了整合电子病历及权威知识库的罕见病诊断知识库。因真实世界罕见病患者信息还包括各种合并症及并发症,其疾病-表型关联更加混杂,整合二者知识库是对目前罕见病诊断知识库在国内EMR落地的有益探索。未来通过CBK及其KGrid平台,该罕见病诊疗知识可以进行聚合计算、推演,封装后以便提供知识即服务(KaaS)的云计算服务,最终提升知识的复用及互操作性。
关键词
HPO术语
可计算生物医学
知识
罕见病诊断知识库
OMIM
知识库
互操作性
Keywords
human phenotype ontology
computable biomedical knowledge base
knowledge base of rare disease
OMIM knowledge base
interoperability
分类号
R319 [医药卫生—基础医学]
TP391 [自动化与计算机技术—计算机应用技术]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于表型术语及CBK理念构建罕见病知识库
张睿
陈薇
师庆科
王觅也
《中国数字医学》
2021
1
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