多重序列比对Alignment的信息度量准则

多重序列的比对(Alignment)的核心问题是对多重DNA(或RNA、蛋白质)序列,寻找它们的相似部分或稳定区域,但如何定义多重序列的相似度(或罚分函数)则是解决多重序列比对的前提。首先对多重序列相似度的合理性进行了讨论,给出了一组合理的相似度所必需具备的条件;再利用Shannon熵的特点,给出一个满足这些合理性条件的多重序列比对的优化准则。

基于脚本的乳腺癌切线野机架角度设置

目的 通过脚本寻找乳腺癌保乳术后正向调强放疗计划（fIMRT）中最优的切线野机架角度，以降低危及器官的受量。方法 采用脚本对手动布置切线野的46例（左、右两侧病例分别为26和20例）已治疗的保乳术后正向调强放疗计划进行重新设计，脚本程序由Pinnacle3计划系统内置的脚本功能配合Python语言编写。脚本程序统计保乳术后放疗患者在不同切线野角度下患侧肺V20、健侧乳腺D1和心脏V10等剂量学指数，采用罚分函数计算不同机架角度下各个危及器官的罚分值，以选取最优的切线野角度。结果 对于26例左侧乳腺癌计划，手动和脚本设置切线野患侧肺V20分别为（18.2±3.4）%和（18.1±3.4）%（P〉0.05），健侧乳腺D1分别为（249.2±88.4）和（230.4±80.2）cGy（t=2.27，P〈0.05），心脏V10分别为（13.7±5.7）%和（13.1±5.7）%（t=2.82，P〈0.05）。对于20例右侧乳腺癌计划，患侧肺的V20分别为（19.8±3.8）%和（19.8±3.9）%（P〉0.05），健侧乳腺D1分别为（340.0±286.2）和（298.0±239.7）cGy（t=2.53，P〈0.05）。结论 与手动相比，脚本能个性化、量化地评估切线野机架角度对乳腺癌危及器官受量的影响，更好地平衡各个危及器官间的受量，进一步提升计划质量。