历史人物群体对比可视化

在历史研究中,历史人物的群体对比具有重要意义。人们希望从历史人物的各种特征中提炼出群体之间的异同,以更深入地理解历史事件。然而,现有的可视化系统主要聚焦于单个群体的探索和内部差异,缺乏群体间层次的对比。为了填补这一空白,提出了一种历史人物群体对比视觉分析方法,从结构化的历史人物数据中抽取并可视化历史人物群体特征,以多个维度进行群体对比。开发了一个交互式的可视化系统,采用基于花朵的视觉隐喻来编码群体的多元特征,历史学家可以交互地探索群体,并研究不同群体之间的相关性和异同。经过历史学家的使用反馈评估以及案例的分析,历史人物群体对比可视化系统被证实是进行群体对比研究的有效工具,并能从中获得有关历史事件的深入洞察。

基于线粒体Cyt b基因的洪泽湖翘嘴鲌群体遗传多样性分析

为全面了解洪泽湖翘嘴鲌的种质资源遗传状况,采用Cyt b基因(线粒体细胞色素b基因),分析了洪泽湖6个群体共计210尾翘嘴鲌的遗传多样性及遗传结构。结果显示,Cyt b基因序列全长为1141 bp,碱基A+T的含量(56.0%)大于G+C的含量(44.0%)。试验共检测到31个变异位点,定义26个单倍型,平均单倍型多样性(H d)和核苷酸多样性(P i)分别为0.735±0.032和0.0019±0.0001;6个群体的单倍型多样性(H d)为(0.618±0.096)~(0.788±0.064),核苷酸多样性(P i)为(0.0015±0.0003)~(0.0021±0.0002);翘嘴鲌的遗传多样性属于高H d低P i类型,暗示其遗传多样性较低。分子方差分析显示,遗传差异主要来源于群体内部,群体间的遗传分化指数F st为-0.0177~0.0182,P>0.05,表明群体间没有显著的遗传分化。单倍型邻接关系树和单倍型网络结构图显示,所有单倍型聚为1个分支,6个群体未形成特定的地理遗传结构。Tajima’s D和Fu’s F s中性检验均为负值,且具有显著性差异,核苷酸错配分布曲线呈现明显的单峰分布,均表明翘嘴鲌在历史上经历了显著的群体扩张事件。研究结果表明,洪泽湖翘嘴鲌6个群体间没有显著的遗传分化,应作为1个整体进行管理和保护。洪泽湖翘嘴鲌资源遗传多样性较低,需要采取措施增加翘嘴鲌种群数量,提高其遗传多样性。

区域保护视野下的历史城镇群体发展特征研究——以安徽省桐城市为例

随着文化遗产保护类型与内涵的不断丰富,保护关注的空间层次体现了从单体到城市,再到文化地域的发展态势。文章以安徽省桐城地域为例,引入了历史地理学的研究视角,解析其区域综合地理环境特征,重点研究了明清时期城镇群体空间分布格局与功能关系组织情况,并对比了在不同的发育机制与功能下,城与镇的空间结构特征。对于今天更加完整的评估历史城镇群体的系统价值,建立区域整体保护的框架与机制具有重要意义。

中国南部沿海美蓝拟相手蟹的群体遗传多样性研究

为探明中国南部沿海美蓝拟相手蟹(Parasesarma eumolpe)的群体遗传多样性,本文基于线粒体DNA的细胞色素氧化酶亚基Ⅰ(Cytochrome OxidaseⅠ,COⅠ)基因片段序列,对中国南部沿海8个美蓝拟相手蟹地理群体共95个个体进行群体遗传多样性分析。结果表明,美蓝拟相手蟹所有个体的线粒体COⅠ基因片段序列长度均为631 bp,共有49个单倍型,群体平均单倍型多样度为0.8768±0.0325,平均核苷酸多样度为0.0422±0.0263,表现为高水平的遗传多样性。单倍型邻接关系树的拓扑结构显示美蓝拟相手蟹群体没有分化出明显的单倍型类群,尚未形成显著的分支谱系;单倍型的网络关系图呈现出明显的星状结构,未表现出显著的地理谱系结构。分子方差分析(Analysis of Molecular Variance,AMOVA)和群体间的遗传分化指数F st值结果表明,美蓝拟相手蟹群体在分布范围内尚未形成独立的遗传结构,遗传变异主要来自群体内。核苷酸不配对分布和中性检验结果表明,美蓝拟相手蟹在历史上经历了明显的群体扩张,扩张时间大约在14万年前。幼体阶段具较强的潜在扩散能力,群体间能进行频繁的基因交流,再加上群体扩张事件,可能是美蓝拟相手蟹群体间无显著遗传分化的原因。研究结果有助于揭示我国红树林潮间带相手蟹类种群遗传结构和分子系统地理学规律。

张静如历史群体思想研究

社会是由群体和个人组成的集合体。正确反映群体在社会发展中的作用是历史学研究的重要内容。就中共党史研究而言,研究者在历史群体的探讨方面不断取得进展。其中,张静如不仅明确地提出了要加强对历史群体问题的研究,而且就如何深入研究历史群体提出了有影响的思想观点,主要涉及到历史群体的基本内涵、内容构成、研究方法、重要作用、与个人的关系等。张静如历史群体思想的价值和意义,主要包括三个方面:拓展了党史研究的范围和领域、完善了党史学的“中介理论体系”、全面认知唯物史观的内在需要。

斑尾复虾虎鱼群体遗传多样性比较分析

基于线粒体DNA控制区序列比较分析了斑尾复虾虎鱼丹东和天津群体的遗传多样性及其遗传结构现状。研究结果显示,在长度为478 bp的线粒体DNA控制区序列上,两群体间存在一定程度的差异。丹东群体的单倍型多样度、核苷酸多样度以及两两序列比较的平均碱基差异数分别为(0.006 3±0.003 8),(0.889 5±0.050 8)和(3.000 0±1.634 3),均大于天津群体。基于控制区单倍型序列构建的邻接关系树可以看出,两群体个体相互混杂,没有明显的分支与之相对应。两个群体之间遗传分化指数FST值为0.239 5(P=0.000),表明两群体之间存在较大的遗传分化,并且确切P检验的结果表明两群体不存在随机交配现象。核苷酸不配对分布呈单峰类型,Fu’sFs和Tajima’D中性检验的结果也提示斑尾复虾虎鱼经历过近期群体扩张事件。基于核苷酸不配对分布的峰值τ计算得到斑尾复虾虎鱼发生群体扩张事件的时间在52 400～104 900年前。

乌鳢群体遗传多样性和遗传结构分析

为了解乌鳢群体遗传变异规律,本研究对8个群体共212个个体的mtDNA控制区全序列进行群体遗传多样性、遗传结构和群体历史动态分析。结果显示,乌鳢控制区全序列长度为907 bp,乌鳢群体单倍型多样性水平变化较大,中国黄河及以北的乌鳢群体单倍型多样性水平比淮河和长江等南方群体相对较低,所有群体表现出较低的核苷酸多样性水平(h<0.5%)。基于单倍型构建的系统发育树和群体聚类树结果均未显示出与地理位置相对应的谱系结构。单倍型网络图显示存在多个主单倍型。遗传结构分析显示,不同水系间存在显著的遗传差异,相同水系间遗传差异较小。群体历史动态分析显示,中国乌鳢所有群体有效种群数量在中更新世晚期到晚更新世0.222—0.050百万年出现了一次较明显的快速增长,之后在晚更新世末次冰期0.050—0.010百万年出现了有效种群下降,伴随着全新世到来,在0.010百万年之后,乌鳢群体又发生了一次较小的有效种群增长。洞庭湖群体则发生一次有效种群的快速增长,增长时间大约在0.160百万年。研究表明,青藏高原隆起后,东亚季风在中国南北方气候的差异和秦岭山脉屏障对季风的阻断作用加大了这一差异,可能对乌鳢群体的遗传多样度差异造成一定影响。乌鳢群体不存在显著的谱系结构可能与乌鳢遗传分化时间较短有关,但是地理隔离等因素导致了不同水系间确切的遗传差异。第四纪更新世气候的波动,尤其是中更新世间冰期气候的转暖、末次盛冰期的降温和冰后期全新世的到来可能对乌鳢群体的数量和栖息地的扩缩起着重要影响。

黄颡鱼群体遗传变异分析

为了解中国黄颡鱼群体遗传变异规律,基于线粒体DNA控制区片段对本研究采集到的5个群体和文献收集的4个群体共258尾黄颡鱼进行群体遗传多样性、遗传结构、基因交流和群体历史动态分析。结果显示,在长度为413 bp的控制区片段上,9个群体的单倍型多样度在0.336±0.095～0.700±0.078之间,核苷酸多样度为0.087%±0.096%～0.258%±0.208%。基于所有单倍型构建的系统发育树结果显示不存在明显的谱系结构。单倍型网络图显示存在两个主单倍型。遗传结构分析显示不同水系间存在显著的遗传结构差异,其中洪泽湖和射阳河群体遗传结构位置不确定。群体历史动态分析表明,黄颡鱼群体存在群体扩张事件,扩张时间发生在末次间冰期时期。研究表明,9个群体遗传多样性呈现中—低等水平;射阳河和洪泽湖群体与长江和黄河水系在历史上尤其在黄河夺淮期间存在广泛的基因交流,导致其遗传结构位置不确定。黄颡鱼有效种群数量变化与第四纪冰期—间冰期气候波动有一定关系,中更新世气候转型后的末次间冰期升温可能导致了黄颡鱼群体扩张。

基于线粒体DNA控制区高变区的黄河流域光泽黄颡鱼群体遗传学分析

光泽黄颡鱼(Pelteobagrus nitidus)是广泛分布在我国黑龙江至闽江水系的一种中小型经济鱼类。为了解黄河水系光泽黄颡鱼群体遗传变异规律,本研究采用线粒体DNA控制区高变区序列对采自黄河水系光泽黄颡鱼样品进行分析。研究显示:光泽黄颡鱼3个群体的单倍型多样度为0.682 8±0.043 7~0.753 6±0.056 2,核苷酸多样度为0.002 5±0.001 9~0.003 4±0.002 4,整体上呈中等程度的遗传多样性水平。以长须黄颡鱼的3个单倍型为外群,构建了光泽黄颡鱼5个单倍型的邻接关系树,结果显示2种黄颡鱼分别聚为2个分支,2个分支间的净遗传距离为0.109。3个群体间的遗传分化指数FST值为-0.030 2~0.003 8,且统计检验的结果均不显著,表现出较小的遗传分化。动态历史分析结果表明,光泽黄颡鱼表现出经历过近期的瓶颈效应事件。研究结果提示,黄河流域的光泽黄颡鱼在遗传管理上应作为一个管理单元进行管理,中等的遗传多样度及近期有效种群数量的瓶颈效应则提示我们应加大对黄河流域光泽黄颡鱼的保护。

作为心理学学科的历史心理学

历史心理学是从心理学的视角对个体和群体的历史资料进行研究,以验证和构建心理学理论的一门学科。历史心理学的研究范围和内容可分为心理传记学、群体历史心理和心理变迁三个领域。研究方法与技术上的进展、历史资料的电子化和共享以及一些知名心理学家的参与研究,使历史心理学的发展呈现出广阔的前景。

细条天竺鲷群体线粒体DNA控制区序列比较分析

基于线粒体DNA控制区序列比较分析了细条天竺鲷乳山、胶南、上海和舟山4个群体的遗传多样性。结果显示:114个个体的线粒体DNA控制区序列定义了30个单倍型,并检测到变异位点25个。4个地理群体的单倍型多样度和核苷酸多样度均较低;基于控制区单倍型序列构建的邻接关系树显示4个群体个体相互混杂,没有明显的分支与之对应;两两群体间的Fst值在-0.015到0.067之间,表明群体间的遗传差异不显著;确切P检验结果显示不同群体间存在随机交配现象。Tajima’s D和Fu’Fs中性检验的结果暗示细条天竺鲷经历过近期的群体扩张事件,核苷酸不配对分布结果也呈单峰型。基于核苷酸不配对分布的峰值τ计算得到细条天竺鲷发生群体扩张事件的时间在62 450～12 490a前,属于更新世晚期。乳山到舟山海域间地理障碍的缺少以及洋流的扩散作用可能是导致不同群体间无明显遗传分化的主要原因。

基于历史出行记录扩充的公交乘客下车站点推算方法

用出行链方法推算的下车站点的记录可作为历史出行数据集,而现有的研究在对出行链断裂的记录进行下车站点推算时使用的历史数据集较小,造成可推算下车站点数据量少、准确率低的缺点.提出基于历史出行记录扩充的公交乘客下车站点推算方法 .首先,使用多源数据集成的出行链方法进行下车站点推算,将已确定下车站点的数据作为历史数据集;其次,基于个人历史相似出行的方法对于未确定下车站点的记录进行推算;最后,选择同线路同站点上车的其他乘客的IC卡记录作为每条未识别下车站点记录的群体历史出行记录,并基于相似出行行为规律进行下车站点的推算.该方法增加了可推算下车站点记录的数据量、提高了推算的准确率.以厦门市为例的实验结果表明:在历史出行记录生成时,使用多源数据可比单源数据多生成3. 48%历史出行记录,推算准确率提高1. 99%;在历史出行记录选择时,选择群体历史出行记录分析得到的历史相似出行行为规律,可对前两种方法无法确定下车站点的所有记录进行推算,占全部待推算记录的21. 81%,其中5. 37%记录的下车站点推算正确.

中国地方品种黄鸡线粒体DNA D-loop遗传多样性研究

【目的】地方品种黄鸡是中国重要的家禽遗传资源,系统评估其遗传多样性水平,为提高利用率和制定科学的保护策略提供依据。【方法】对新测的694份样本和下载的589份样本,合计28个中国南方地方品种黄鸡共1283份的线粒体DNA片段(D-loop,519 bp)遗传多样性进行整合分析,构建单倍型中介网络图,通过单倍型地理分布格局、主坐标分析、分子变异分析和中性检测,确认其内部的群体遗传结构和群体历史。通过分析亚洲和太平洋地方鸡线粒体DNA地理分布格局,推测中国南方地方品种黄鸡稀有单倍型类群的来源。【结果】从1283份样本检测到101个变异位点,其中92个为多态位点。定义了169种单倍型,归属于6个单倍型类群A-E和G,其中A-C和E为优势单倍型类群,D和G为稀有单倍型类群,占总体样本比例分别为15.43%、49.26%、18.55%、16.37%、0.31%和0.08%。河南省单倍型类群最丰富(6个);广东省单倍型数量最多(61),浙江省(19)和海南省(12)较少。单倍型类群A和B在28个黄鸡品种中均有分布;D只分布于淮南麻黄鸡、固始鸡、宁都黄鸡和霞烟鸡中;G只分布于固始鸡中。从单倍型类群D的分布频率和单倍型数量来看,中国南方地方品种黄鸡单倍型类群D可能来源于东南亚地区。从单倍型类群G的地理分布和中介网络图来看,河南和南亚的单倍型类群G可能来源于中国西南地区。中国南方地方品种黄鸡总体单倍型多样性和核苷酸多样性分别为0.903±0.005和0.01269±n.d.。河南省和湖南省的单倍型多样性和核苷酸多样性最高,分别为0.916±0.011、0.01358±0.00039和0.913±0.012、0.01345±0.00042;海南省的单倍型多样性最低(0.736±0.076),江西省的核苷酸多样性最低(0.00981±0.00072)。在不同地方品种间,淮南麻黄鸡、固始鸡和郧阳大鸡的单倍型多样性最高,江汉鸡、淮南麻黄鸡和黄郎鸡的核苷酸多样性最高,洪山鸡、广西三黄鸡和萧山鸡的单倍型多样性和核苷酸多样性最低。文昌鸡与河田鸡的遗传关系最近,与历史记载相吻合。地方品种黄鸡群体遗传分化不明显,分子变异主要来源于品种内。中性检测显示黄鸡在品种水平上近期未经历明显种群扩张,但单倍型类群A、B和E经历明显的扩张历史。【结论】结果表明地方品种黄鸡总体上保留着较高的遗传多样性水平,处于较好的保种状态,但洪山鸡、萧山鸡和广西三黄鸡应加强保护。地方品种黄鸡存在杂交现象,整体上经历了群体扩张历史。东南亚和西南地方鸡对中国南方地方品种黄鸡有一定的遗传贡献。

瘦肉型猪基因组中ROH的应用及研究进展

连续性纯合片段(Runs of Homozygosity,ROH)是研究群体历史和性状特征的窗口,被广泛用于检测动物全基因组近交水平和识别基因组选择区域。目前,大量单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphisms,SNP)基因型的可用性使得基因组中ROH的特征变得更加准确,但缺乏可靠和统一的ROH分析指南。本文介绍了ROH发展简史、检测软件及参数,综述了ROH在杜洛克、大白、长白、皮特兰猪等商业瘦肉型猪遗传育种中的应用,包括遗传多样性的评估、近交系数的度量、人工选择痕迹的识别和不利ROH的检测,并对ROH在猪育种应用中的发展前景进行了展望。

“历史遗留群体”：社会转折中的人的研究

历史转折、社会转型不仅是与社会结构、国家制度相关的宏大议题，也直接关系到无数普通人的命运。蕴含于社会转折过程中的价值规范体系及社会体制、社会政策等的断裂性，在给一部分人带来新的生活机会的同时，也给另一部分人带来地位剥夺和价值危机。在中国近几十年的社会转折过程中，感受到价值剥离的社会成员长期致力于各种权益申诉行动，政府也在“历史遗留问题”的政治框架中，以“落实政策”的方式，对这些群体陆续作出回应。这构成了局部社会转型中民众追求社会公正的一种方式。

The Influence of the Gentry on Rural Political Construction

Based on some former studies of Chinese rural society, this paper summerizes the achievements and limitations of general Chinese rural studies and then proposes a social operation model in rural areas which is dominated by the squires. It uses some specific historical data and discoveries of feild sduty to further examine the profound influence of the squires on rural politcal construction in three different aspects： the model of clan and religion, the role as inter-mediator and the growth of basic armed forces. The study found that this special social group played a center role in Chinese rural political system from ancient to modem times, particularly, the research considers the decline of the squire society since the establishment of the new government in 1949. In the end, this paper points out the cultural guiding significance of this social model in the study to the rural construction in contemporay China by predicting the possiblity of renaissance

基于线粒体DNA控制区高变区序列的黄河东营段淡水梭鱼群体遗传多样性比较研究

基于mtDNA控制区高变区序列,对采自黄河东营段的梭鱼群体和其他已报道的13个群体进行了遗传学比较分析。结果表明在长度为435bp的控制区序列上,东营垦利群体与其他13个群体均表现出较高的核苷酸多样度,大多数群体单倍型多样度较高;梭鱼群体在分布范围内表现出3个明显的单倍型世系,其中两个单倍型世系呈现同域分布,东营垦利群体表现出与东海和黄渤海群体同的世系分布趋势;3个世系分化发生于更新世中期,更新世冰期-间冰期的交替导致海平面的下降和上升,西北太平洋边缘海隔离和连通,使得梭鱼群体发生隔离分化和二次接触;三个单倍型类群在地域上的分布频率具有明显差异,不同的地理群体间存在显著的遗传结构,分别对应着日本海组群、中国东海组群(中国东海、黄海和渤海群体)和中国南海组群;中国东海组群中,中国东海和黄海群体遗传差异相对较小,与渤海群体差异较大;东营垦利群体与采自东海和黄渤海的群体间遗传差异较小,与南海群体及日本群体间遗传差异较大。尽管梭鱼具有较强的潜在扩散能力,但是梭鱼群体间的基因交流有限。梭鱼不同组群群体历史动态检验显示梭鱼存在群体扩张事件。研究推测随着中更新世全球气候主导周期转型,中更新世冰期间冰期交替周期增加对梭鱼隔离分化和群体扩张产生了重要影响。

浙江和福建沿海厚壳贻贝Mytilus coruscus群体的COI序列比较分析

基于线粒体DNA COI基因序列分析了浙江和福建沿海的厚壳贻贝Mytilus coruscus群体遗传结构及遗传多样性现状。研究结果显示：在长度为564bp的COI基因片段上，厚壳贻贝的5个群体均呈现较高的单倍型多样度（0．867±0．129～1．000±0．177）和较低的核苷酸多样度（0．007±0．005～0．011±0．008）；邻接关系树显示，5个群体的单倍型相互混杂，仅有1个小的分支存在；厚壳贻贝单倍型网络关系图呈星状结构，存在1个与系统树相对应的分支；不同群体间的FST值较小，且统计检验的结果均不显著，表明浙江、福建沿岸的厚壳贻贝群体间在COI基因上存在同质性；Tajima’s D和Fu’s Fs中性检验的结果（Tajima＇s D=-1．828，P=0．017；Fs=-22．954，P=0．000）都显著偏离中性，提示厚壳贻贝经历了群体扩张。

果蝇分子群体遗传研究分析方法概述

果蝇属物种长期以来被作为基础生物学、特别是群体和进化遗传学的模式物种,来探讨生物学中的一些基本问题,如物种形成的遗传机制、新基因的起源及其方式、适应性进化的遗传机制等.群体遗传的方法贯穿于遗传学、生态学、古生物学、系统发育学等领域之中,已渐成为基础生物学研究的重要方法.围绕果蝇群体遗传研究中的3个主要问题,即起源地、群体历史动态和群体遗传结构,就当前用于分析上述问题的方法进行了概述,并强调了发展适用于多个座位数据的分析方法是将来的一个重要发展方向.

政治哲学和国际法中的少数群体权利

在过去的20年中,少数群体权利成为国际法和政治哲学中的重大议题。在国际法领域内,制定有关少数群体权利的国际规范成为一种热潮;政治哲学领域也出现了新的自由多元文化主义理论。文章指出,自由多元文化主义的理念有助于型塑国际法,而国际法也有助于促进自由多元文化主义。但是,两者之间也存在若干差距:它们在土著民族权利领域是最靠近的,在历史少数群体权利领域的分歧较大,在移民权利问题上的分歧可能是最大的。我们关于这两者之间关系的思考仍然处于初级阶段。