人类混血群体连锁不平衡的遗传学模型与基因定位

人类混血群体可以说是混合群体的一种特例．在无选择、无突变、无限随机交配群体的假定前提下,研究了亲本群体的基因频率对混血群体及其衍生后代群体连锁不平衡结构的影响,导出了各群体连锁不平衡值的表达式,建立了一个估计基因间重组率的简便方法;同时, 采用估算分子标记与QTL之间连锁不平衡系数的统计分析方法,分析了人类混血群体及其衍生后代群体QTL检测与估计的关系,建立了该关系的系列理论公式．研究结果表明,本方法不仅适用于人类疾病(包括复杂遗传疾病)基因定位,而且适合于人类正常基因的定位,同时也适用于人类普通多基因性状的QTL分析．

R^n(n≥3)上群体遗传学中的选择迁移模型

群体遗传学的选择迁移模型归结为研究含参数及不定权函数的半线性椭圆方程。本文对于R^n中解在无穷远处的渐近性质作出先验估计,从而得到其非平凡解存在性与不存在性等结果。

抗生素耐药性的群体遗传学：分子机制与治疗相结合

在致病菌的耐药性及其进化的研究方面，尽管经过多学科的共同努力，目前的预测及防治能力仍然有限。这是因为耐药性进化涉及具体药物、细菌遗传学、自然生态学和治疗环境等因素间复杂的相互作用。目前已证明，将耐药分子机制与生态学及进化模型相结合，可对耐药进化的动力学作出有效预测。

群体遗传学AI模型在我国弯曲杆菌感染散发病例归因中的初探与应用

目的探索群体遗传学模型在食源性疾病归因分析中的应用,定量识别导致我国弯曲杆菌感染散发病例的主要宿主来源。方法利用PubMLST公共数据库获得我国弯曲杆菌MLST数据,采用群体遗传学AI模型(AIM)对弯曲杆菌病例进行归因分析。结果弯曲杆菌感染散发病例归因于鸡的贡献比例最高,为50.49%,其次为鸭鹅、牛和猪,分别为22.56%、18.36%和4.52%,归因于环境和野生鸟类的贡献比例较低,分别为0.78%和0.66%。结论本研究采用AIM方法,实现了结合微生物分子分型数据和统计学建模的归因方法在我国食源性疾病中的实践应用,定量获得了不同来源对我国弯曲杆菌感染散发病例的贡献,并为下阶段归因工作提供了方向和思路。

数量遗传学的发展与动物育种应用(续完)

上期从“正确地估计动物群体的遗传参数和个体育种值”和“以混合模型方程组理论和方法为核心的育种值和遗传参数估计方法”两个方面对数量遗传学的发展进行了阐述。

基因频率动态特征的随机过程模型

本文简要论述了群体遗传学的核心问题 ,生物群体在进化过程中 ,目标基因在中性状态 (没有选择压力 ) ,或选择压力随机波动情况下 ,基因频率随机变化动态特征 ,及描述这些特征的随机过程数学模型的原理 ,基本公式的来源 ,目前常用模型的主要类型、用途 ,解决实际问题时所需的约束条件 ,参数的设置及其遗传学意义 ,主要方程的解析公式等。主要模型包括离散状态的 Markov链和连续状态的 Markov过程 ,扩散方程 ,Kolm ogolov前向方程和后向方程 ,Wright- Fisher模型等。

近亲繁殖下复等位基因群体的熵性质

研究了在近亲繁殖下复等位基因群体的基因库信息熵和基因型信息熵,并讨论了在世代交替中基因型信息熵的性质。结果表明,应用信息论模型研究群体遗传学与统计学方法具有一致性,而且还具有信息学含义。

基因频率随机过程模型的形成与发展

基因频率变化规律是群体遗传学研究的核心 ,也是理解生物进化的关键。近 1个世纪以来 ,许多遗传学家做出了重要贡献。在许多遗传学著作中 ,常常提到基因频率的 Hardy- Weinberg平衡定理 ,并把此定理作为群体遗传学的核心 ,不适当地夸大了这个定理的作用。而真正对群体遗传学的基本理论 ,特别是群体遗传学数学理论有开拓性贡献的遗传学家 ,当属 R.A.Fisher,S.Wright,J.B.S.Haldane,T.Dobzhansky,A.Kolm ogorov,G.Malecot和M.Kimura等人。本文简要总结他们的主要工作 。

复杂群体动力学 生态学、流行病学及遗传学中的非线性模型

本书是关于生态学、流行病学及环境系统等领域中数学建模的评述性论文的汇编。理论数学模型是深入理解这些自然系统中复杂群体动力学的最有力的工具之一。随着研究的深入发展，有许多新的更为复杂的问题有待解决，这促使应用许多新技术来应对这些挑战，其中有广义或结构建模、自适应动力学、多元过程等。

走向共同富裕:中国“扩中”量化效果及影响因素研究

不断扩大中等收入群体既是适应新发展阶段的必然之举,也是共同富裕取得更加明显的实质性进展的具体表现。基于CFPS调查数据所覆盖的全国及各地区不同群体比重变化趋势的分析,利用分布动态学模型构建了扩大中等收入群体量化效果指标,并构造“条件Markov模型”进一步考察了“扩中”量化效果的影响因素。研究显示:第一,样本调查期内,全国及各地区中等收入群体的比重不断提升,但中低收入群体进入中等收入群体的概率较低,阶层固化程度较为严重;第二,以绝对扩中指数和相对扩中指数衡量的“扩中”量化效果向好,且呈现“量高质低”和“量稳质升”的特征;第三,提升人力资本水平、增强社会关系、推进互联网的普及、加快户籍制度改革、降低家庭负担、扩大失业保险覆盖范围、提高职业地位、增加家庭的工资性、财产性和转移性收入是扩大中等收入群体的重要举措。鉴于此,扩大中等收入群体应着眼于多途径促进居民增收,降低阶层的固化程度,要兼顾“提低”和“稳中”,追求“量质齐升”。

马尔科夫链蒙特卡洛算法并行化及其应用

为使高性能计算助力群体遗传学和系统地理学研究,提出一种基于MPI(message passing interface)的群体遗传学分析软件,利用集群中多个CPU核心的计算能力加速群体遗传学分析。进行正确性验证,对并行加速比和并行效率进行评估,在保证计算结果正确性前提下,利用256个CPU核心时可以得到最好的并行加速比(185.16),在利用128个CPU核心时可以得到最好的并行效率(93.68%)。实验结果表明,利用高性能计算能够进行快速有效的群体遗传学分析。

内蒙古汉、回、蒙古族扣手、交叉臂及惯用手的分析

利用对数线性模型分析了郑连斌、陆舜华等1996年在内蒙古调查的汉、回、蒙古族的3项人类遗传学指标(扣手、交叉臂、惯用手),得出与其既有相同又有不同的结论。结果显示:(1)扣手与民族、性别都无关;(2)交叉臂与民族不相关,与性别相关;(3)惯用手、民族、性别三者存在三因子效应;(4)惯用手与扣手、惯用手与交叉臂分别存在相关性,而交叉臂与扣手之间相关性不显著。

具有Markov切换的随机多群体SIRI动力学行为

【目的】研究一类具有Markov切换的随机多群体SIRI模型。【方法】首先利用随机微分方程的基本理论给出模型解是正的、存在的、唯一的。再通过构造一些适当的新的Lyapunov函数,利用图论知识和不等式放缩技巧,获得了该传染病模型灭绝和持久的充分条件。【结果】得到该随机系统正解的存在唯一性,同时获得了疾病灭绝和在均值意义下持久的充分条件,得到了没有随机干扰时模型的阈值。【结论】通过分析可知调节系统的参数,即可以采取某些策略来调节疾病的动态,抑制疾病的爆发。