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东乡野生稻耐冷渐渗系DNA甲基化水平和模式变化研究
被引量:
1
1
作者
温秀芳
戴亮芳
+4 位作者
赵俊
罗向东
邓晓娟
张帆涛
谢建坤
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第4期694-700,共7页
根据水稻全基因组和特定位点的CpG岛序列设计引物,采用McrBC酶酶切DNA,以东乡野生稻耐冷渐渗系(IL5335和IL5423)及其双亲为试材,研究其基因组和特定位点的DNA甲基化水平和模式变化特征,探讨甲基化变异对野生优异基因渐渗的影响。结果...
根据水稻全基因组和特定位点的CpG岛序列设计引物,采用McrBC酶酶切DNA,以东乡野生稻耐冷渐渗系(IL5335和IL5423)及其双亲为试材,研究其基因组和特定位点的DNA甲基化水平和模式变化特征,探讨甲基化变异对野生优异基因渐渗的影响。结果显示:(1)在覆盖全基因组的83个CpG岛中,IL5335和IL5423的基因组甲基化频率分别为46.6%和53.8%,低于受体亲本协青早B的62.6%;大部分(75.9%-80.7%)受体亲本的甲基化模式在两耐冷渐渗中能稳定遗传,另外一些位点发生了甲基化模式的改变,主要表现为脱甲基化(13.3%-18.1%)和过甲基化(4.4%-6.0%)。(2)在耐冷QTLs区间,两耐冷渐渗系的甲基化水平为13.3%-26.7%,远低于受体亲本的61.4%;它们在该区域的甲基化模式变异主要为脱甲基化(33.3%-40.0%),高于全基因组的平均变异率。(3)分析逆转座子Houba和Osr14区域的51个CpG岛发现,耐冷渐渗系在该区域具有较高频率的甲基化修饰和较低的甲基化模式变异。研究表明,种间杂交渐渗诱发了受体亲本广泛的甲基化水平和模式变异,为野生优异基因的有效利用提供了新的机遇和挑战。
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关键词
东乡野生稻
耐冷渐渗系
DNA甲基化
McrBC酶
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职称材料
题名
东乡野生稻耐冷渐渗系DNA甲基化水平和模式变化研究
被引量:
1
1
作者
温秀芳
戴亮芳
赵俊
罗向东
邓晓娟
张帆涛
谢建坤
机构
江西师范大学生命科学学院
出处
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第4期694-700,共7页
基金
国家自然科学基金(31260255)
江西省教育厅科技计划项目(GJJ12184)
+1 种基金
江西省科技支撑计划(20122BBF60064)
江西省青年科学家培养计划(20112BCB23007)
文摘
根据水稻全基因组和特定位点的CpG岛序列设计引物,采用McrBC酶酶切DNA,以东乡野生稻耐冷渐渗系(IL5335和IL5423)及其双亲为试材,研究其基因组和特定位点的DNA甲基化水平和模式变化特征,探讨甲基化变异对野生优异基因渐渗的影响。结果显示:(1)在覆盖全基因组的83个CpG岛中,IL5335和IL5423的基因组甲基化频率分别为46.6%和53.8%,低于受体亲本协青早B的62.6%;大部分(75.9%-80.7%)受体亲本的甲基化模式在两耐冷渐渗中能稳定遗传,另外一些位点发生了甲基化模式的改变,主要表现为脱甲基化(13.3%-18.1%)和过甲基化(4.4%-6.0%)。(2)在耐冷QTLs区间,两耐冷渐渗系的甲基化水平为13.3%-26.7%,远低于受体亲本的61.4%;它们在该区域的甲基化模式变异主要为脱甲基化(33.3%-40.0%),高于全基因组的平均变异率。(3)分析逆转座子Houba和Osr14区域的51个CpG岛发现,耐冷渐渗系在该区域具有较高频率的甲基化修饰和较低的甲基化模式变异。研究表明,种间杂交渐渗诱发了受体亲本广泛的甲基化水平和模式变异,为野生优异基因的有效利用提供了新的机遇和挑战。
关键词
东乡野生稻
耐冷渐渗系
DNA甲基化
McrBC酶
Keywords
Dongxiang wild rice
cold tolerance introgression lines
DNA methylation
McrBC enzyme
分类号
Q789 [生物学—分子生物学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
东乡野生稻耐冷渐渗系DNA甲基化水平和模式变化研究
温秀芳
戴亮芳
赵俊
罗向东
邓晓娟
张帆涛
谢建坤
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015
1
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