南瓜干旱胁迫相关基因的转录组分析

南瓜是一种重要的经济作物,干旱是南瓜生产的主要限制因素之一。为探索南瓜耐旱的分子机制和挖掘耐旱相关基因,本研究通过PEG-6000模拟干旱胁迫处理南瓜品种金贝1号,对不同时期南瓜叶片进行高通量测序。结果表明:共获得1254个共表达差异基因,通过基因功能注释和富集分析,126个基因参与耐旱生物进程。值得关注的是,其中表达量最高的5个基因均参与糖酵解通路,因此,推测糖酵解是南瓜的耐旱分子机制的重要途径。

基于mRNA-Seq的沙漠植物花花柴干旱胁迫表达谱分析

以抗逆性较强的荒漠植物花花柴为材料,利用数字基因表达谱技术对用质量百分数20%的PEG溶液处理0、4、8、12和24 h后的花花柴幼苗的m RNA-Seq测序结果进行分析。结果表明,花花柴幼苗叶部在不同处理时间均上调表达的基因有122个,下调表达的基因54个,根部在不同处理时间均上调表达的基因73个,下调表达的基因79个。利用q RT-PCR和RT-PCR对可能与花花柴耐旱相关的6个差异表达基因进行了验证,发现其表达模式与表达谱结果一致,推测这些基因可能均与花花柴响应干旱胁迫相关。本研究为耐旱相关基因的发掘及应用提供了基础。