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大豆根部水压胁迫耐逆指数遗传体系解析
1
作者
王吴彬
童飞
+6 位作者
KHAN Mueen Alam
张雅轩
贺建波
郝晓帅
邢光南
赵团结
盖钧镒
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第5期847-859,共13页
大豆是重要的植物蛋白质和植物油脂来源,干旱是影响大豆产量的重要环境因子之一。为解析大豆耐旱性的遗传基础,本研究在PEG水压胁迫条件下,对由409个家系组成的巢式关联作图群体(具有1个共同亲本的2个重组自交系群体组成)进行叶片脯氨...
大豆是重要的植物蛋白质和植物油脂来源,干旱是影响大豆产量的重要环境因子之一。为解析大豆耐旱性的遗传基础,本研究在PEG水压胁迫条件下,对由409个家系组成的巢式关联作图群体(具有1个共同亲本的2个重组自交系群体组成)进行叶片脯氨酸含量测定,通过限制性二阶段多位点全基因组关联分析(restrictivetwo-stagemultilocus genome-wide association study,RTM-GWAS),解析了大豆根部水压胁迫耐逆指数(root hydraulic stress tolerance index,RHSTI)的遗传体系。结果表明,在春季和夏季环境下,3个亲本蒙8260(共同亲本)、通山薄皮黄豆甲和正阳白毛平顶在RHSTI上均存在显著差异,其衍生群体RHSTI表型变异丰富,变幅分别为0.11~2.94和0.03~1.93,遗传力分别为97.7%和97.9%;2个环境联合分析发现,家系遗传力和家系与环境互作遗传力分别为37.9%和60.1%,说明群体RHSTI的变异受遗传和环境共同控制。通过RTM-GWAS方法,共检测到45个与RHSTI相关的QTL,分布在大豆18条染色体上,可以解释37.58%的表型变异,其中7个QTL的表型贡献率超过1%,为大贡献位点;这些QTL中,有34个位点与环境存在显著互作,可以解释12.50%的表型变异。结合PEG胁迫下大豆转录组数据,在定位区间500kb范围内共筛选到38个差异表达基因,可归为ABA响应因子、逆境响应因子、转录因子、发育因子、蛋白代谢因子、未知功能和其他等7类,其中逆境响应因子、转录因子和发育因子是最大的3类;其中位于主效位点的6个基因,与ABA响应因子、逆境响应因子、转录因子相关,应为主要候选基因。上述结果表明,大豆耐旱性是一个由多位点、多基因控制的复杂数量性状,且与环境存在互作,遗传基础复杂。研究结果为大豆耐旱性分子育种提供了依据。
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关键词
大豆
根部水压
胁迫
耐
逆
指数
脯氨酸含量
数量性状位点
巢式关联作图群体
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职称材料
基于穗粒重的甜高粱耐旱性全基因组关联分析
被引量:
1
2
作者
高丽娜
杨斌
+2 位作者
金志琴
胡文明
徐翠莲
《塔里木大学学报》
2023年第1期39-44,共6页
干旱是限制作物生产潜力的主要非生物因素。为解析甜高粱耐旱的分子机制,识别与耐旱性状关联的显著SNP位点,采用田间耐旱鉴定方法在甜高粱生育中后期进行水分控制,以400份甜高粱种质在干旱胁迫和正常滴灌条件下的穗粒重得出的耐胁迫指...
干旱是限制作物生产潜力的主要非生物因素。为解析甜高粱耐旱的分子机制,识别与耐旱性状关联的显著SNP位点,采用田间耐旱鉴定方法在甜高粱生育中后期进行水分控制,以400份甜高粱种质在干旱胁迫和正常滴灌条件下的穗粒重得出的耐胁迫指数作为表型数据,重测序获得的7079个SNP标记作为基因型数据,利用一般线性模型(GLM)和混合线性模型(MLM)分别进行全基因组关联分析。结果表明:分布在甜高粱第9号染色体和第10号染色体上的SNP数目相对较多;对SNP基因型数据进行主成分分析,从7079个SNP标记提取到两个主成分,第一主成分可将基因型分为两组;400份甜高粱种质穗粒重耐胁迫指数呈现右偏的正态分布;利用一般线性模型和混合线性模型的检测结果表明,两种模型均检测到9个显著的SNP位点,它们分别位于甜高粱第1,3,4,7,8和9号染色体以及3条super_1122染色体片段上,且具有相同的物理位置,并且两种方法检测到的SNP位点的变异碱基也无差异。两种模型对于甜高粱穗粒重在全基因组范围内检测结果较为一致,此结果可为甜高粱耐旱候选基因的挖掘和抗旱分子机理的研究奠定基础。
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关键词
甜高粱
穗粒重
耐胁迫指数
全基因组关联分析
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职称材料
国内外小麦品种苗期耐氮胁迫能力综合评价
被引量:
3
3
作者
董振杰
马超
+2 位作者
田修斌
李欢欢
刘文轩
《贵州农业科学》
CAS
2019年第3期16-20,共5页
为筛选和培育小麦氮高效品种资源,对36个国内外小麦品种(20个国内品种、16个国外品种)在低氮(0.3mmol/L)和高氮(90mmol/L)水平下的种苗生长情况进行鉴定,利用最大苗高、最大根长、茎叶干重、根干重、根冠比、植株干重、植株含水量、根...
为筛选和培育小麦氮高效品种资源,对36个国内外小麦品种(20个国内品种、16个国外品种)在低氮(0.3mmol/L)和高氮(90mmol/L)水平下的种苗生长情况进行鉴定,利用最大苗高、最大根长、茎叶干重、根干重、根冠比、植株干重、植株含水量、根体积共8个性状指标,采用主成分分析和系统聚类相结合方法对不同基因型小麦苗期的耐低氮胁迫和耐高氮伤害的能力进行综合评价。结果表明,国外品种耐低氮胁迫能力明显优于国内品种,12份耐低氮型小麦全为国外品种;而国内小麦品种在耐高氮伤害能力方面比国外品种稍占优势,11份耐高氮伤害品种类型中国内品种占7份;来自澳大利亚的Silverstar和来自美国的Art、Jackpot、Armour共4份小麦品种既耐低氮胁迫又耐高氮伤害,可作为进一步进行耐氮机制研究和氮高效新品种选育的资源加以利用。
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关键词
小麦
国内外品种
苗期
耐
氮
胁迫
指数
主成分分析
聚类分析
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职称材料
大豆氮高效种质苗期筛选与鉴定
被引量:
4
4
作者
远月丽
易媛媛
+6 位作者
战勇
陈李淼
袁松丽
黄毅
肖之源
张婵娟
周新安
《中国油料作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第3期539-547,共9页
氮高效利用种质资源的筛选与鉴定是大豆高产育种的重要前提。本研究以78份大豆种质资源为材料,采用水培养法,分析正常氮(氮浓度为7.5 mmol/L)和低氮(氮浓度为0.75 mmol/L)条件下大豆生物量和耐低氮指数。根据地上部干重、总干重、耐低...
氮高效利用种质资源的筛选与鉴定是大豆高产育种的重要前提。本研究以78份大豆种质资源为材料,采用水培养法,分析正常氮(氮浓度为7.5 mmol/L)和低氮(氮浓度为0.75 mmol/L)条件下大豆生物量和耐低氮指数。根据地上部干重、总干重、耐低氮胁迫指数初步筛选出3份耐低氮材料(2011-X-559、2011-X-618、2011-X-639)、3份低氮敏感材料(2011-X-472、2011-X-531、2011-X-547)和2份中间型材料(吉育86、东农53)。进一步复筛测定8份大豆种质材料的叶绿素含量、生物量、氮含量和根系形态构型等17个氮利用相关指标,通过对性状指标的变异系数、相关性和主成分分析,筛选出总干重、整株氮含量、整株总氮、总根长、根体积和根表面积6个指标可作为大豆苗期耐低氮评价关键指标,并依此鉴定出耐低氮材料2011-X-618和低氮敏感材料2011-X-531。本研究为大豆耐低氮机制解析和氮高效育种提供了优异种质资源和理论指导。
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关键词
大豆
氮利用效率
耐
低氮
胁迫
指数
生物量
根构型
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职称材料
题名
大豆根部水压胁迫耐逆指数遗传体系解析
1
作者
王吴彬
童飞
KHAN Mueen Alam
张雅轩
贺建波
郝晓帅
邢光南
赵团结
盖钧镒
机构
南京农业大学大豆研究所/国家大豆改良中心/农业农村部大豆生物学与遗传育种重点实验室(综合)/作物遗传与种质创新国家重点实验室/江苏作物生产协同创新中心
江苏徐淮地区徐州农业科学研究所
出处
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第5期847-859,共13页
基金
中央高校基本科研业务费专项(KYZZ201901)
国家自然科学基金项目(31601325)
+2 种基金
教育部长江学者和创新团队项目(PCSIRT_17R55)
国家现代农业产业技术体系建设专项(CARS-04)
江苏省JCIC-MCP项目资助。
文摘
大豆是重要的植物蛋白质和植物油脂来源,干旱是影响大豆产量的重要环境因子之一。为解析大豆耐旱性的遗传基础,本研究在PEG水压胁迫条件下,对由409个家系组成的巢式关联作图群体(具有1个共同亲本的2个重组自交系群体组成)进行叶片脯氨酸含量测定,通过限制性二阶段多位点全基因组关联分析(restrictivetwo-stagemultilocus genome-wide association study,RTM-GWAS),解析了大豆根部水压胁迫耐逆指数(root hydraulic stress tolerance index,RHSTI)的遗传体系。结果表明,在春季和夏季环境下,3个亲本蒙8260(共同亲本)、通山薄皮黄豆甲和正阳白毛平顶在RHSTI上均存在显著差异,其衍生群体RHSTI表型变异丰富,变幅分别为0.11~2.94和0.03~1.93,遗传力分别为97.7%和97.9%;2个环境联合分析发现,家系遗传力和家系与环境互作遗传力分别为37.9%和60.1%,说明群体RHSTI的变异受遗传和环境共同控制。通过RTM-GWAS方法,共检测到45个与RHSTI相关的QTL,分布在大豆18条染色体上,可以解释37.58%的表型变异,其中7个QTL的表型贡献率超过1%,为大贡献位点;这些QTL中,有34个位点与环境存在显著互作,可以解释12.50%的表型变异。结合PEG胁迫下大豆转录组数据,在定位区间500kb范围内共筛选到38个差异表达基因,可归为ABA响应因子、逆境响应因子、转录因子、发育因子、蛋白代谢因子、未知功能和其他等7类,其中逆境响应因子、转录因子和发育因子是最大的3类;其中位于主效位点的6个基因,与ABA响应因子、逆境响应因子、转录因子相关,应为主要候选基因。上述结果表明,大豆耐旱性是一个由多位点、多基因控制的复杂数量性状,且与环境存在互作,遗传基础复杂。研究结果为大豆耐旱性分子育种提供了依据。
关键词
大豆
根部水压
胁迫
耐
逆
指数
脯氨酸含量
数量性状位点
巢式关联作图群体
Keywords
soybean
root hydraulic stress tolerance index
proline content
QTL
nested association mapping population
分类号
S565.1 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
基于穗粒重的甜高粱耐旱性全基因组关联分析
被引量:
1
2
作者
高丽娜
杨斌
金志琴
胡文明
徐翠莲
机构
塔里木大学农学院
出处
《塔里木大学学报》
2023年第1期39-44,共6页
基金
国家自然科学基金地区科学基金项目“甜高粱耐旱性评价及其与SSR标记的关联分析”(31660397)
国家自然科学基金地区科学基金项目“基于多性状联合分析的甜高粱抗倒伏性状相关优异等位变异挖掘”(31660300)。
文摘
干旱是限制作物生产潜力的主要非生物因素。为解析甜高粱耐旱的分子机制,识别与耐旱性状关联的显著SNP位点,采用田间耐旱鉴定方法在甜高粱生育中后期进行水分控制,以400份甜高粱种质在干旱胁迫和正常滴灌条件下的穗粒重得出的耐胁迫指数作为表型数据,重测序获得的7079个SNP标记作为基因型数据,利用一般线性模型(GLM)和混合线性模型(MLM)分别进行全基因组关联分析。结果表明:分布在甜高粱第9号染色体和第10号染色体上的SNP数目相对较多;对SNP基因型数据进行主成分分析,从7079个SNP标记提取到两个主成分,第一主成分可将基因型分为两组;400份甜高粱种质穗粒重耐胁迫指数呈现右偏的正态分布;利用一般线性模型和混合线性模型的检测结果表明,两种模型均检测到9个显著的SNP位点,它们分别位于甜高粱第1,3,4,7,8和9号染色体以及3条super_1122染色体片段上,且具有相同的物理位置,并且两种方法检测到的SNP位点的变异碱基也无差异。两种模型对于甜高粱穗粒重在全基因组范围内检测结果较为一致,此结果可为甜高粱耐旱候选基因的挖掘和抗旱分子机理的研究奠定基础。
关键词
甜高粱
穗粒重
耐胁迫指数
全基因组关联分析
Keywords
sweet sorghum
grain weight per spike
stress tolerance index
genome-wide association study
分类号
S514 [农业科学—作物学]
下载PDF
职称材料
题名
国内外小麦品种苗期耐氮胁迫能力综合评价
被引量:
3
3
作者
董振杰
马超
田修斌
李欢欢
刘文轩
机构
河南农业大学生命科学学院
出处
《贵州农业科学》
CAS
2019年第3期16-20,共5页
基金
国家自然科学基金项目"西尔斯山羊草2Ss染色体上抗白粉病新基因的精细定位与候选基因发掘"(31571658)
河南省科技重大专项"高产
+1 种基金
多抗
广适小麦新品种选育与产业化"(161100110400)
文摘
为筛选和培育小麦氮高效品种资源,对36个国内外小麦品种(20个国内品种、16个国外品种)在低氮(0.3mmol/L)和高氮(90mmol/L)水平下的种苗生长情况进行鉴定,利用最大苗高、最大根长、茎叶干重、根干重、根冠比、植株干重、植株含水量、根体积共8个性状指标,采用主成分分析和系统聚类相结合方法对不同基因型小麦苗期的耐低氮胁迫和耐高氮伤害的能力进行综合评价。结果表明,国外品种耐低氮胁迫能力明显优于国内品种,12份耐低氮型小麦全为国外品种;而国内小麦品种在耐高氮伤害能力方面比国外品种稍占优势,11份耐高氮伤害品种类型中国内品种占7份;来自澳大利亚的Silverstar和来自美国的Art、Jackpot、Armour共4份小麦品种既耐低氮胁迫又耐高氮伤害,可作为进一步进行耐氮机制研究和氮高效新品种选育的资源加以利用。
关键词
小麦
国内外品种
苗期
耐
氮
胁迫
指数
主成分分析
聚类分析
Keywords
wheat
domestic and overseas variety
seedling stage
tolerance to nitrogen stress index
principle component analysis
clustering analysis
分类号
S512 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
大豆氮高效种质苗期筛选与鉴定
被引量:
4
4
作者
远月丽
易媛媛
战勇
陈李淼
袁松丽
黄毅
肖之源
张婵娟
周新安
机构
中国农业科学院油料作物研究所
中国农业科学院研究生院
福建农林大学农学院作物抗性与化学生态学研究所
新疆农垦科学院作物研究所/国家大豆产业技术体系石河子综合试验站/谷物品质与遗传改良兵团重点实验室
出处
《中国油料作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第3期539-547,共9页
基金
国家重点研发计划(2020YFD1000903-10)
转基因生物新品种培育重大专项(2016ZX08004005)。
文摘
氮高效利用种质资源的筛选与鉴定是大豆高产育种的重要前提。本研究以78份大豆种质资源为材料,采用水培养法,分析正常氮(氮浓度为7.5 mmol/L)和低氮(氮浓度为0.75 mmol/L)条件下大豆生物量和耐低氮指数。根据地上部干重、总干重、耐低氮胁迫指数初步筛选出3份耐低氮材料(2011-X-559、2011-X-618、2011-X-639)、3份低氮敏感材料(2011-X-472、2011-X-531、2011-X-547)和2份中间型材料(吉育86、东农53)。进一步复筛测定8份大豆种质材料的叶绿素含量、生物量、氮含量和根系形态构型等17个氮利用相关指标,通过对性状指标的变异系数、相关性和主成分分析,筛选出总干重、整株氮含量、整株总氮、总根长、根体积和根表面积6个指标可作为大豆苗期耐低氮评价关键指标,并依此鉴定出耐低氮材料2011-X-618和低氮敏感材料2011-X-531。本研究为大豆耐低氮机制解析和氮高效育种提供了优异种质资源和理论指导。
关键词
大豆
氮利用效率
耐
低氮
胁迫
指数
生物量
根构型
Keywords
soybean
nitrogen use efficiency
low nitrogen tolerance index
biomass
root morphology
分类号
S565.1 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
大豆根部水压胁迫耐逆指数遗传体系解析
王吴彬
童飞
KHAN Mueen Alam
张雅轩
贺建波
郝晓帅
邢光南
赵团结
盖钧镒
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021
0
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职称材料
2
基于穗粒重的甜高粱耐旱性全基因组关联分析
高丽娜
杨斌
金志琴
胡文明
徐翠莲
《塔里木大学学报》
2023
1
下载PDF
职称材料
3
国内外小麦品种苗期耐氮胁迫能力综合评价
董振杰
马超
田修斌
李欢欢
刘文轩
《贵州农业科学》
CAS
2019
3
下载PDF
职称材料
4
大豆氮高效种质苗期筛选与鉴定
远月丽
易媛媛
战勇
陈李淼
袁松丽
黄毅
肖之源
张婵娟
周新安
《中国油料作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022
4
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职称材料
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