重症监护病房耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌的耐药基因型及系统进化分析

目的通过分析某三甲医院重症监护病房(ICU)的耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(CRKP)的耐药基因及系统进化关系,为耐药菌防控的管理提供参考依据。方法收集安徽医科大学第二附属医院2018年3―7月ICU住院病人分离的19株CRKP,使用VITEK-2 Compact系统进行细菌鉴定及药敏试验,应用Illumina Hiseq 2500平台进行全基因组测序(WGS),应用MLST软件测定ST型,应用Kaptive软件检测荚膜型,应用Staramr软件筛查菌株的耐药基因,应用Ridom SeqSphere+软件进行cgMLST分型及最小生成树(MST)的构建,并应用CSI Phylogeny 1.4软件及FigTree v1.4.4软件构建最大似然树(MLT),以分析其系统进化关系。结果19株CRKP除了对替加环素敏感,对其他常用抗菌药物均呈现耐药,19株CRKP均携带blaKPC-2耐药基因,均属于ST11-KL64型,MST图中以AY7007、AY7003为中心聚集为一簇,cgMLST分型均为CT1774型,MLT图显示分为四组克隆型,组内亲缘性关系相近。结论该院ICU分离的CRKP以ST11-KL64-CT1774型为主,并具有多重耐药性,存在医院内播散的风险。

耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌临床分布特征及耐药基因型分析

目的:分析耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(CRKP)的临床分布特征及不同耐药基因类型。方法:收集2022年1—12月广州市荔湾区人民医院临床血培养分离的CRKP菌株,分析其CRKP的检出率,统计临床科室分布、标本来源等。结果:我院共检出肺炎克雷伯菌(KP)754株,其中CRKP 247株,检出率32.76%;50岁以上患者227株(91.90%);CRKP分离自痰/支气管肺泡灌洗液(147株,59.52%)。其次为尿液(52株,21.05%),临床科室分布顺序依次为ICU、心血管内科、糖尿病一区、康复科、呼吸内科以及综合内科。抗菌药物敏感试验结果显示,CRKP对多数抗生素耐药率较高,除对亚胺培南、美罗培南这类碳青霉烯类抗生素耐药率较高外,其对β-内酰胺类抗生素以及左旋氧氟沙星抗生素的耐药率也近100.0%,而对多黏菌素B、替加环素耐药率为10.1%。对110株CRKP菌株进行碳青霉烯酶表型筛选,其中产A类丝氨酸碳青霉烯酶107株(97.27%),产B类金属ß内酰胺酶3株(2.73%)。针对57株完成表型筛选的CRKP菌株进行耐药基因分析,其中54株(94.74%)携带KPC基因,2株(3.51%)携带NDM基因,1株(1.75%)同时携带KPC和NDM基因,未检出携带OXA-48基因的菌株。结论:院内携带肺炎克雷伯菌碳青霉烯酶(KPC)基因的CRKP占据主导地位,对多种抗菌药物耐药率较高,存在院内传播风险,需加强监测,防止CRKP的传播与流行。

95个猪场大肠杆菌耐药表型及氨基糖苷类药物耐药基因型调查

为调查我国规模化猪场大肠杆菌细菌耐药性及其氨基糖苷类药物耐药基因的流行状况,采用K-B(Kir-by-Bauer)法检测2006-2007年从四川、重庆、湖北等19个省95个规模化猪场分离的480株大肠杆菌对19种抗生素的耐药性。结果表明:仅有多黏菌素B(85.6%)、头孢噻肟(85.3%)、阿米卡星(84.8%)和大观霉素(65.0%)相对敏感。480株大肠杆菌以多重耐药菌株为主,其中13、14、15、16和17重耐药较多,并且有26株18重耐药,14株19重耐药。采用WHONET5.4软件分析大肠杆菌耐药性,对阿米卡星、头孢噻肟和多黏菌素B耐药的猪场相对较少,分别是29、26和24个。采用PCR方法检测氨基糖苷类相关耐药基因,耐药基因检出率分别是aadA1(65.89%)、aaC2(52.35%)、aaC4(12.91%)和aphA3(10.95%)。耐药基因型检出率较高的是aadA1/aaC2(29.61%)、aadA1(18.04%)。Excel软件统计相关耐药基因的猪场分布,表明耐药基因型aadA1/aaC2(43)、aa-dA1/aaC2/aaC4(20)和aadA1/aaC2/aaC4/aphA3(20)在猪场分布较普遍。耐药基因和耐药性比较表明大肠杆菌对氨基糖苷类药物耐药表型与耐药基因型符合率较高的是阿米卡星(68.39%)。本研究表明猪肠道内常在大肠杆菌菌群不仅产生较高的多重耐药性,也成为耐药基因的储存库,对猪场环境中耐药基因在致病菌和非致病菌间传播发挥重要作用,能够作为检测细菌耐药性的指示菌。

应用基因芯片分析结核分枝杆菌常见耐药基因型的研究

目的应用基因芯片快速检测结核分枝杆菌耐药基因型,建立一种新的分子药敏试验方法。方法以传统药敏试验和PCR-直接测序方法为对照,应用基因芯片快速检测157株结核分枝杆菌临床分离株异烟肼(INH)、利福平(RFP)、链霉素(SM)和乙胺丁醇(EMB)耐药基因(katGr、poB、rp-sLr、rs和embB)的带荧光素标记的PCR产物。结果PCR-直接测序和基因芯片检测36株结核分枝杆菌药物敏感株的5种耐药基因均为野生型。121株结核分枝杆菌耐药分离株中,56株耐INH分离株,katG基因突变率为62.5%,其中katG缺失率为7.5%,315位密码子突变率为55.4%,279位密码子突变率为1.8%;104株耐RFP株,rpoB基因突变率为94.2%,最常见的突变位点为531位和526位密码子(突变率分别为60.6%、15.4%),双位点突变率为5.8%,还发现511、513、515、516、517、518和533位密码子突变;62株耐SM分离株,rpsL和rrs总突变率为88.7%(两者分别为82.3%、6.5%),rpsL突变位于43位和88位密码子(突变率分别为77.4%、4.8%),rrs突变位于513位和516位碱基(突变分别为4.8%、1.6%);57株为耐EMB株,embB基因突变率为61.4%,均为306位密码子突变,最常见的突变为ATG→GTG或ATA(突变率分别为35.1%、15.8%),还发现306位密码子ATG→ATC、ATT和CTG突变。通过基因芯片检出的突变与基因测序结果一致。结论应用基因芯片可分析大多数结核分枝杆菌耐药基因型,弥补传统药敏试验方法的不足,指导临床治疗。

亚胺培南耐药鲍曼不动杆菌的耐药性及其耐药基因型分析

目的 研究亚胺培南耐药鲍曼不动杆菌的耐药性特点以及分析碳青霉烯酶相关的耐药基因型。 方法 选取2016年6月-2017年6月在我院进行了亚胺培南耐药鲍曼不动杆菌分离操作的菌株40例；对其使用VITEK-2 compact的方法进行全自动微生物鉴定以及药敏测试；通过检测数据分析研究亚胺培南耐药鲍曼不动杆菌的耐药性特点，并检测其最小抑菌浓度；同时对已分离完毕的40株亚胺培南耐药鲍曼不动杆菌菌株使用基因扩增仪对其16S rRNA甲基化酶耐药基因以及碳青霉烯酶进行扩增测序。 结果 在40株亚胺培南耐药鲍曼不动杆菌菌株中：其中有38株菌株携带OXA-23型基因，且这38株菌株携带OXA-23型基因中均发现其上游序列ISAbal的存在。 结论 导致鲍曼不动杆菌对亚胺培南耐药性不断增长的主要原因是由带有OXA-23型基因的碳青霉烯酶而产生的；并且主导耐药性产生作用的物质是存在于上游序列的ISAbal。

一株致猪肺炎大肠杆菌的分离鉴定及其耐药表型、耐药基因型分析

为了了解猪肠外致病性大肠杆菌的耐药性,试验采用菌落形态观察、小鼠毒力试验、回归动物试验和PCR等方法对1株引起猪肺炎的病原菌进行鉴定,并通过微量稀释法进行耐药性检测,在全基因组测序的基础上对耐药基因型进行分析。结果表明:该病原菌是肠外致病性大肠杆菌,呈多重耐药,其染色体基因组携带有外排调控基因Mar C、SoxR,外排泵基因MATE和ABC,耐药基因移动原件IS,四环素耐药基因tet,氟苯尼考耐药基因FloR及氯霉素乙酰转移酶基因等。

肿瘤专科医院CRE感染的临床特征和耐药基因型分析

目的分析肿瘤专科医院患者碳青霉烯类耐药肠杆菌科细菌(CRE)感染的临床特征及耐药基因型,为临床治疗和感染防控提供参考。方法选取2015年1月至2018年12月云南省肿瘤医院临床科室送检标本中检出的31株CRE为研究对象。采用改良碳青霉烯灭活试验(mCIM)、乙二胺四乙酸协同碳青霉烯灭活试验(eCIM)进行耐药表型检测。采用PCR检测blaKPC-2、blaSME、blaNDM-1、blaIMP、blaVIM、blaOXA-486种耐药基因型。结果31株CRE中,以肺炎克雷伯菌为主要类型,占48.4%;以尿液标本和体液标本为主要标本来源,分别为12株(38.7%)、9株(29.0%);7株(22.6%)来源于重症医学科,7株(22.6%)来源于泌尿外科。31株CRE分离自30例患者,其中40~<60岁的有15例(50.0%),60~<80岁的有13例(43.3%)。从直肠癌、膀胱癌和颅内肿瘤患者中分离出的CRE菌株所占比例最高,均为12.9%。mCIM阳性的有27株,eCIM阳性的有20株。单独blaKPC-2阳性11株,阳性率为35.5%;单独blaNDM-1阳性12株,阳性率为38.7%;单独blaIMP阳性2株,阳性率为6.5%;1株肺炎克雷伯菌同时出现blaKPC-2和blaNDM-1阳性。结论肿瘤专科医院分离的CRE菌株主要来源于直肠癌、膀胱癌、颅内肿瘤患者,感染人群主要为中老年人群,以肺炎克雷伯菌为主要类型,主要耐药基因型为blaKPC-2和blaNDM-1。

耐碳青霉烯类抗菌药物的肠杆菌科细菌耐药基因型分析及治疗

目的通过对齐齐哈尔市第一医院碳青霉烯类抗生素耐药的肠杆菌科细菌(CRE)耐药基因型的检测及耐药机制分析,为临床抗生素的合理应用和感染的防控提供科学依据。方法收集2018年5月—2020年1月齐齐哈尔市第一医院检验科住院患者的痰液、创口分泌物、肺泡灌洗液、尿液及血液等临床病房患者合格标本中分离到的肠杆菌科细菌,应用梅里埃Vitek2-compact全自动微生物细菌鉴定与药敏仪及K-B纸片扩散法鉴定和筛选CRE菌株;采用改良Hodge试验初步判断CRE菌株产碳青霉烯酶情况;应用聚合酶链式反应PCR法检测CRE菌株的耐药基因型以及膜孔蛋白相关基因型。结果38株CRE中,26株肺炎克雷伯菌,9株大肠埃希菌及3株阴沟肠杆菌,标本主要来源于痰,主要分布于ICU、神经外科等科室。检测了CRE菌株对该院临床常用的19种抗生素的耐药性:头孢菌素类药物,除头孢吡肟耐药率89.5%、头孢他啶耐药率94.8%外,头孢唑啉、头孢呋辛及头孢曲松耐药率都为100%;β-内酰胺类抑制剂复合制剂类药物氨苄西林/舒巴坦、头孢哌酮/舒巴坦及哌拉西林/他唑巴坦耐药率分别为100%、84.2%及81.6%;喹诺酮类药物环丙沙星及左氧氟沙星耐药率分别为94.7%及81.6%;碳青霉烯类药物厄他培南及亚胺培南耐药率分别为97.4%及84.2%;氨基糖苷类药物庆大霉素、妥布霉素及阿米卡星耐药率分别为60.5%、42.1%及26.3%;氨曲南耐药率为84.2%;复方新诺明耐药率为57.9%;未检出对替加环素耐药的菌株。改良Hodge试验阳性菌株都为产KPC型碳青霉烯酶的肺炎克雷伯菌。PCR方法检测菌株耐药基因型:SHV有24株,CTX有23株,KPC有15株,NDM有5株,其中IMP、TEM、VIM、GES、OXA基因型未检出,检出膜孔蛋白OmpC有36株,膜孔蛋白OmpF、OmpK35、OmpK36均未检出,有15株菌株检测出两种或两种以上耐药基因型。结论该院CRE菌株主要为肺炎克雷伯菌,主要来源于临床患者痰液标本,CRE感染常发生于ICU、神经外科等患者基础疾病较多、抗生素应用以及机械通气较频繁的科室;CRE菌株对临床常用药物耐药情况严重,使CRE在治疗中面临用药选择的困难;改良Hodge试验可以用来初筛菌株是否产KPC型碳青霉烯酶;该院CRE菌株耐药机制以产碳青霉烯酶为主,其次为β-内酰胺酶和/或AmpC酶基因的表达同时合并膜孔蛋白的突变或缺失。

脑卒中相关性肺炎患者多药耐药菌感染影响因素及其耐药基因型

目的探讨脑卒中相关性肺炎患者多药耐药菌耐药性及耐药基因情况,分析感染的影响因素。方法选择2018年2月-2021年5月温岭市第一人民医院收治的90例脑卒中相关性肺炎患者作为研究对象,收集患者临床资料,进行病原菌检测及耐药性分析,统计多药耐药菌感染比例及影响因素。结果90例脑卒中相关性肺炎患者共分离95株细菌,其中革兰阴性菌58株(61.05%),革兰阳性菌28株(29.47%),真菌9株(9.47%)。鲍氏不动杆菌检出CTX-M、TEM、SHV、gyrA、PBP2B基因突变株5、6、2、4、2株,肺炎克雷伯菌检出CTX-M、TEM、SHV、mecA、gyrA、PBP2B基因突变株4、3、2、2、2、1株;金黄色葡萄球菌检出mecA、PBP2B基因突变株3、2株;表皮葡萄球菌检出mecA、PBP2B基因突变株1、2株。90例脑卒中相关性肺炎患者中,多药耐药感染者44例。多因素分析示,入住ICU治疗、意识障碍、晚发型肺炎、预防性抗菌药物使用是发生多药耐药菌感染的独立影响因素(P<0.05)。结论脑卒中相关性肺炎多药耐药菌感染比例较高,且入住ICU治疗、意识障碍、晚发型肺炎、预防性抗生素使用是发生多药耐药菌感染的影响因素,可为早期干预提供参考。

耐碳青霉烯类肠杆菌目细菌的耐药性及基因型检测情况

目的对224株耐碳青霉烯类肠杆菌目细菌(CRE)进行回顾调查,重点对其耐药基因型的检测及耐药机制进行分析,帮助临床医生采取针对性的有效治疗。方法回顾性分析224株CRE来自联勤保障部队第九〇〇医院在2021年1月至2022年1月所送检的标本。使用全自动微生物鉴定药敏仪对细菌进行分离鉴定以及药敏试验分析;并使用荧光定量PCR仪采取SYBR Green结合染料法来对菌株的DNA进行检测。结果CRE耐药率超过60%的抗菌药物有4种,为总数的55.56%;试验结果可见CRE对绝大部分的β-内酰胺类的抗生素的耐药率偏高,其中对亚胺培南的耐药率高达100%;对于头孢他啶等第三代头孢菌素类、头孢西丁等头孢霉素类以及头孢呋辛等二代头孢菌素药物耐药性在80.00%以上;相反,CBE对环丙沙星、庆大霉素、妥布霉素以及左氧氟沙星的耐药性较低。存在KPC基因的株数最多为86株,占总株数的38.39%;其次是存在NDM、IMP基因的株数,占总株数的25.00%(56/224)和28.13%(63/224);再者是存在OXA基因的株数,为20株,占总株数的8.93%;而本研究未发现存在VIM基因的株数。结论CRE对大部分的抗菌药物均有较强的耐药性,其中以携带KPC基因的株数为多数。临床医生在治疗中可根据其耐药机制以及耐药基因型对抗菌药物的选择及使用。

抗病毒治疗失败的HIV感染/AIDS老年患者基因型耐药特点分析

目的 分析抗病毒治疗失败的HIV感染/AIDS老年患者的耐药特点。方法 回顾性分析2020年1月—2021年12月在四川省某地抗反转录病毒治疗(ART)失败并判定为耐药的HIV感染/AIDS老年患者,分析其基因型耐药特点。结果354例研究对象中,男性为主(74.3%);年龄中位数为66.6岁;基线CD4+T细胞<350个/μL为主(79.2%);ART中位时长26.6个月;初始ART方案与ART时长差异存在统计学意义(P<0.05)。各类药物耐药突变位点多样;亚型以CRF08_BC为主(40.7%);非核苷类反转录酶抑制剂(NNRTI)耐药率最高,其次为核苷类反转录酶抑制剂(NRTI),蛋白酶抑制剂(PI)耐药率最低;NRTI中,恩曲他滨(FTC)和拉米夫定(3TC)耐药率偏高,均为29.7%;NNRTI中,奈韦拉平(NVP)和依非韦伦(EFV)耐药率高,分别为92.4%和91.5%。Fisher确切概率法显示年龄与ART药物耐药模式差异存在统计学意义(P<0.05)。结论 ART失败的HIV感染/AIDS老年患者耐药情况复杂,需要加强ART管理,基线耐药检测可以为ART方案的选择提供依据,应该加强对HIV-1 RNA、CD4+T细胞等指标的基线及治疗过程中的监测,加强老年HIV感染/AIDS患者的随访管理,及时进行耐药检测。

耐碳青霉烯类大肠埃希菌耐药基因检测及同源性分析

目的探讨耐碳青霉烯类大肠埃希菌(carbapenem-resistan Escherichia coli,CREco)的耐药基因分布情况,并进行同源性分析,为细菌感染的治疗和预防其传播提供理论依据。方法自2016年1月至2022年7月济宁医学院附属医院住院患者分离出的大肠埃希菌1311株中筛选出CREco 16株。最低抑菌浓度法进行药敏试验,聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)扩增碳青霉烯酶基因及喹诺酮类耐药基因,对阳性基因进行测序比对,用脉冲场凝胶电泳检测菌株间的同源性。结果16株CREco仅对个别抗生素敏感,对多数抗生素表现为耐药,其中对β-内酰胺类和喹诺酮类耐药率最高。经PCR扩增发现,100%携带碳青霉烯酶基因,包括NDM-1型13株,NDM-5型3株,KPC-2型8株,未检测出OXA、IMP和VIM。喹诺酮类耐药基因中,5株扩增出qnrS基因,14株扩增出aac(6’)-Ib基因。脉冲场凝胶电泳分型共获得12种谱型,C谱型最多,为流行谱型。结论CREco耐药形势严峻。碳青霉烯酶以NDM-1最常见,其次为KPC-2。喹诺酮类耐药基因aac(6’)-Ib阳性率最高。脉冲场凝胶电泳分型呈现多态性,C谱型在院内存在流行趋势。应加强CREco耐药基因的监测,采取感染控制措施以帮助遏制耐药菌的传播。

貉源致病性肺炎克雷伯氏菌对喹诺酮类药物耐药表型及耐药基因检测

为了检测貉源致病性肺炎克雷伯氏菌对喹诺酮类药物的耐药性与耐药基因携带情况并分析其相关性,通过K-B药敏纸片和PCR方法分别检测24株貉源致病性肺炎克雷伯氏菌对喹诺酮类药物耐药性与耐药基因。结果表明:24株貉源致病性肺炎克雷伯氏菌呈现多重耐药性,对左氧氟沙星、恩诺沙星、环丙沙星、诺氟沙星耐药性为70.8%—79.2%,耐4种抗生素的菌株有16株,占分离菌株的66.7%;24株貉源致病性肺炎克雷伯氏菌的耐药基因gyrB、oqxA、parC、parE、oqxB、ompF检出率在70.8%以上,其他耐基因检出率为12.5%—20.8%,同时携带7、6种耐药基因的菌株最多,分别占分离菌株的76.9%、46.2%;左氧氟沙星、恩诺沙星、诺氟沙星、环丙沙星耐药表型与耐药基因oqxA、oqxB、gyrB、parC、parE的符合率为78.9%—100%;说明了24株貉源致病性肺炎克雷伯氏菌对喹诺酮类药物呈现多重耐药性,携带多种耐药基因,耐药表型与耐药基因之间具有一定相关性。

江苏省HIV-1基因型抗病毒治疗失败患者耐药检测结果分析

目的了解江苏省2010—2014年HIV-1感染者抗病毒失败人群的HIV-1耐药情况,为临床抗病毒治疗提供参考。方法根据耐药检测实验室网络收集江苏省2010—2014年的HIV-1基因型耐药检测结果,对各年度相关药物耐药情况、耐药基因位点及病毒基因亚型进行统计分析。结果 2010—2014年分别纳入样本74、113、197、278、346份,其中检测出现耐药结果的比率分别为68.92%、48.67%、51.27%、52.52%和57.80%。各年度间HIV-1主要耐药药物类似,核苷类主要有3TC、ABC、DDI和FTC,非核苷类药物以EFV和NVP为主。HIV-1对蛋白酶类药物耐药差别较大,且目前使用的LPV/r的耐药率在1%以下。年度间HIV-1主要耐药位点为184、181、190及103位,其中184位突变主要引起3TC和FTC耐药,而181、190、103位突变与EFV和NVP耐药相关。HIV-1病毒基因亚型均以CRF01_AE为主,且呈上升趋势。结论江苏省HIV感染者抗病毒治疗失败人群HIV-1基因型耐药率有上升趋势,应加强对抗病毒治疗患者的耐药检测,从而及时合理调整抗病毒治疗方案。

广东省HIV/AIDS患者抗病毒治疗后基因型耐药分析

目的总结广东省261例HIV/AIDS患者抗病毒治疗1年以上,病毒未被抑制者的耐药基因型特征。方法采用实验室自建方法,进行HIV-1耐药基因型检测。构建系统进化树确定基因亚型,并通过斯坦福HIV耐药数据库在线序列分析,确定耐药突变位点及药物耐受情况。结果共检测样本280份,成功获得261条完整序列。序列分析显示:HIV-1病毒株以CRF01_AE亚型(194/261,74.3%)为主;逆转录酶(RT)区耐药位点以M184I/V(108/170,63.5%)、Y181C/V(61/170,35.9%)、K103N/S(56/170,32.9%)和G190A/S(48/170,28.2%)为主;蛋白酶(PR)区未发现主要位点突变,次要耐药位点主要为L10I/V(21/170,12.4%)和A71T/V(13/170,7.6%);未产生针对蛋白酶抑制剂(PI)的耐药;常见核苷类逆转录酶抑制剂(NRTIs)拉米夫定(3TC)、恩曲他滨(FTC)的耐药率均为43.7%,高度耐药率均为42.1%;非核苷类逆转录酶抑制剂(NNRTIs)奈韦拉平(NVP)及依非韦伦(EFV)的耐药率均为56.3%,高度耐药率分别为54.8%(143/261)和35.2%(92/261)。耐药率随着抗病毒治疗时间增长而增加,初始单一用药人群耐药率76.7%(23/30)高于初始联合用药人群耐药率54.5%(126/231)。结论广东省抗病毒治疗1年以上且病毒未抑制的HIV感染者NRTIs耐药以3TC、FTC为主,NNRTIs耐药以NVP、EFV为主。临床上应及早发现耐药更改方案以保护TDF作为二线药物的有效性;在抗病毒治疗开始时应尽量避免单一用药。

一项中国幽门螺杆菌耐药基因型及菌株谱系的全基因组测序研究

幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,H.pylori)是胃癌Ⅰ类致癌物,根除H.pylori能显著降低胃癌的发生率和死亡率。抗生素耐药是导致H.pylori根除治疗失败的最重要因素,因此药敏指导下的个性化诊疗日益重要。为了加强对H.pylori耐药机制的了解,并寻找新的耐药基因型位点,该研究从中国幽门螺杆菌分子医学中心(CCHpMM)菌株库复苏了60株H.pylori,进行了耐药表型检测和全基因组测序(whole genome sequencing,WGS),并评价了耐药表型和基因型的一致性。结果显示克拉霉素和左氧氟沙星耐药基因型与表型几乎完全一致,Kappa系数分别为0.867和0.833。所有携带R16H/C突变和rdxA截断的H.pylori都具有甲硝唑耐药性,特异性为100%。此外,研究还发现HP0399基因的A1378G突变和FabH基因的A149G突变两个新位点,可能分别导致了四环素耐药和多药耐药性。该研究结果表明,用克拉霉素和左氧氟沙星耐药基因型检测耐药是可靠的,WGS对发现新的H.pylori耐药位点有很大帮助,并为发现H.pylori新耐药机制提供了基础。

中国2007-2009年HIV-1耐药基因型检测质量评估结果

目的对2007-2009年统一发放至各省,针对艾滋病病毒Ⅰ型(HIV-1)蛋白酶和反转录酶基因的耐药突变基因型外部质控品的检测结果,进行分析和检测技术能力评价。方法对3年共5次由各省提交的,应用实验室自建方法(In house)、Viroseq(雅培公司,Abbott)和TruGene(西门子公司,Siemens)检测系统获得的耐药基因型数据进行综合分析。质控盘由6份血浆(HIV-1B及B/C重组毒株)组成,覆盖病毒的蛋白酶和反转录酶基因区的野生型和耐药突变型。每份序列与共享序列比较,使用扣分制对各实验室的结果进行评价。结果除3家核心实验室外,累计有19个省23家省市级疾病预防控制中心(CDC)或医院自愿参加,共提交了95份结果,其中3家实验室使用ViroSeq检测系统;提交了9份结果;1家使用TruGene检测系统;提交了1份结果;其余85份使用in-house检测系统。考核品总的序列阳性率(获得合格序列率)为97.7%,其中的低载量(1 000拷贝/mL)样本均得到阳性结果;根据累计提交的序列结果看,耐药位点判读的完全一致率为78.9%(75/95),序列编辑分析的一致率也有76.8%(73/95)。参加能力验证的省市级实验室由2007年的15家增加到2009年下半年的23家,合格率(001PT)由73.3%上升到(004PT)95.2%,3次以上优秀的实验室有13家。结论目前的检测方法均可成功扩增中国主要亚型流行毒株。所有检测结果在各实验室间的一致性均较高,因此基因型耐药检测技术是可靠的,但各实验室检测能力也存在差异。我国具备耐药基因型检测能力的实验室数量不断增加,检测水平逐年提高。

秦皇岛地区貂源肠外致病性大肠杆菌四环素类耐药表型与基因型相关性分析

为分析秦皇岛地区貂源肠外致病性大肠杆菌对四环素类药物的耐药性及耐药基因之间关系,对秦皇岛地区分离的20株貂源肠外致病性大肠杆菌采用K-B药敏纸片法,选择常见的3种四环素类药物进行耐药性的检测,并通过PCR扩增对其耐药基因进行判定。结果表明:20株肠外致病性大肠杆菌中,多重耐药菌株占75%,多重耐药基因的菌株占100%,耐药基因检出和耐药性结果比较表明,四环素、强力霉素、土霉素对5种耐药基因的符合率在88.89%~100%之间。

AIDS合并结核病患者抗结核联合HAART治疗后HIV基因型耐药研究

目的探讨抗结核治疗联合高效抗反转录病毒治疗（HAART）对AIDS合并结核病（AIDS/TB）患者HIV耐药性的影响。方法 101例AIDS患者（对照组）接受HAART,实验组126例AIDS/TB患者（实验组）抗结核治疗2~8周后开始HAART。监测两组患者的HIV病毒载量及CD4＋T细胞计数,对HIV病毒载量大于1 000拷贝/ml的患者进行基因型耐药检测,比较两组耐药情况及HAART疗效。结果治疗24周时,实验组有7例患者病毒载量大于1 000拷贝/ml,其中1例检测出耐药突变基因,为蛋白酶（PR）基因检测次要耐药位点;对照组有1例病毒载量大于1 000拷贝/ml,但未检出HIV耐药突变基因。两组患者基因型耐药发生率差异无统计学意义（P〉0.05）。两组患者治疗后CD4＋T细胞计数均较治疗前上升,但两组组间治疗前后CD4＋T细胞计数比较,差异均无统计学意义（P〉0.05）。治疗48周时两组患者病毒载量均低于检测下限。结论 AIDS/TB双重感染者同时接受抗结核及HAART,未导致HIV耐药性的产生。