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基于基因组数据分析的细菌耐药基因识别与表型预测
1
作者
周秀娟
何逸尘
+2 位作者
张利达
崔妍
史贤明
《微生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第2期432-442,共11页
利用基因组数据和生物信息学分析方法,快速鉴定耐药基因并预测耐药表型,为细菌耐药状况监测提供了有力辅助手段。目前,已有的数十个耐药数据库及其相关分析工具这些资源为细菌耐药基因的识别以及耐药表型的预测提供了数据信息和技术手...
利用基因组数据和生物信息学分析方法,快速鉴定耐药基因并预测耐药表型,为细菌耐药状况监测提供了有力辅助手段。目前,已有的数十个耐药数据库及其相关分析工具这些资源为细菌耐药基因的识别以及耐药表型的预测提供了数据信息和技术手段。随着细菌基因组数据的持续增加以及耐药表型数据的不断积累,大数据和机器学习能够更好地建立耐药表型与基因组信息之间的相关性,因此,构建高效的耐药表型预测模型成为研究热点。本文围绕细菌耐药基因的识别和耐药表型的预测,针对耐药相关数据库、耐药特征识别理论与方法、耐药数据的机器学习与表型预测等方面展开讨论,以期为细菌耐药的相关研究提供手段和思路。
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关键词
细菌
耐
药
耐
药
数据库
生物信息学
耐
药
基因识别
耐药表型预测
原文传递
题名
基于基因组数据分析的细菌耐药基因识别与表型预测
1
作者
周秀娟
何逸尘
张利达
崔妍
史贤明
机构
上海交通大学农业与生物学院、中美食品安全联合研究中心微生物代谢国家重点实验室
上海健康医学院健康与公共卫生学院
出处
《微生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第2期432-442,共11页
基金
国家重点研发计划(2019YFE0119700)。
文摘
利用基因组数据和生物信息学分析方法,快速鉴定耐药基因并预测耐药表型,为细菌耐药状况监测提供了有力辅助手段。目前,已有的数十个耐药数据库及其相关分析工具这些资源为细菌耐药基因的识别以及耐药表型的预测提供了数据信息和技术手段。随着细菌基因组数据的持续增加以及耐药表型数据的不断积累,大数据和机器学习能够更好地建立耐药表型与基因组信息之间的相关性,因此,构建高效的耐药表型预测模型成为研究热点。本文围绕细菌耐药基因的识别和耐药表型的预测,针对耐药相关数据库、耐药特征识别理论与方法、耐药数据的机器学习与表型预测等方面展开讨论,以期为细菌耐药的相关研究提供手段和思路。
关键词
细菌
耐
药
耐
药
数据库
生物信息学
耐
药
基因识别
耐药表型预测
Keywords
bacterial antibiotic resistance
antibiotic resistance database
bioinformatics
identification of antibiotic resistance genes
prediction of antibiotic resistance phenotypes
分类号
Q933 [生物学—微生物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于基因组数据分析的细菌耐药基因识别与表型预测
周秀娟
何逸尘
张利达
崔妍
史贤明
《微生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024
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