基于联合残基力场的蛋白质能量优化

简述了蛋白质结构预测中存在的问题,主要介绍了蛋白质分子力场的一种模型即联合残基力场,然后利用这种模型对一种多肽和葡萄球菌蛋白的部分段进行试验,使它们的能量不同程度的得到了最小化,其中前者的初始能量为-71.50461kcal/mol,最小化后为-73.32767kcal/mol.

蛋白质空间结构预测的一种优化模型及算法

用理论方法预测蛋白质结构有两个难点，第一是要有一个合理的势函数，第二是要有一个有效的寻优方法找到势函数的全局极小点．本文采用联合残基力场建立了蛋白质空间结构预测模型，然后用我们给出的一种改进模拟退火算法搜索势函数的全局极小点，对脑啡肽的空间结构进行了预测和分析．