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基于元分析的差异表达基因识别
被引量:
2
1
作者
刘桂霞
田原
+3 位作者
郑明
赖丽娜
臧雪柏
周春光
《吉林大学学报(工学版)》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2010年第5期1308-1312,共5页
针对传统差异表达基因分析方法使用单一数据集,不能处理异质性特性数据集、分析结果偏差大的问题,提出了联合驱动排除的概念,设计实现一种使用多研究数据集的元分析算法。应用公共数据库GEO中GDS2490和GDS2491数据集对设计的算法与微芯...
针对传统差异表达基因分析方法使用单一数据集,不能处理异质性特性数据集、分析结果偏差大的问题,提出了联合驱动排除的概念,设计实现一种使用多研究数据集的元分析算法。应用公共数据库GEO中GDS2490和GDS2491数据集对设计的算法与微芯片显著性分析方法进行了对比。实验结果表明:设计的算法可以对数据集实行联合驱动排除,与微芯片显著性分析方法相比,可以有效分析异质性特性的数据集,准确找到差异表达的基因,验证了算法的有效性。该方法为差异表达基因识别提供了新思路。
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关键词
人工智能
元分析
联合驱动排除
芯片显著性分析
异质性
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职称材料
题名
基于元分析的差异表达基因识别
被引量:
2
1
作者
刘桂霞
田原
郑明
赖丽娜
臧雪柏
周春光
机构
吉林大学计算机科学与技术学院
出处
《吉林大学学报(工学版)》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2010年第5期1308-1312,共5页
基金
国家自然科学基金项目(60973092
60673099
+1 种基金
60873146)
'863'国家高技术研究发展计划项目(2009AA02Z307)
文摘
针对传统差异表达基因分析方法使用单一数据集,不能处理异质性特性数据集、分析结果偏差大的问题,提出了联合驱动排除的概念,设计实现一种使用多研究数据集的元分析算法。应用公共数据库GEO中GDS2490和GDS2491数据集对设计的算法与微芯片显著性分析方法进行了对比。实验结果表明:设计的算法可以对数据集实行联合驱动排除,与微芯片显著性分析方法相比,可以有效分析异质性特性的数据集,准确找到差异表达的基因,验证了算法的有效性。该方法为差异表达基因识别提供了新思路。
关键词
人工智能
元分析
联合驱动排除
芯片显著性分析
异质性
Keywords
artificial intelligence
meta-analysis
integration-driven exclusion
significance analysis of microarrays
heterogeneity
分类号
TP18 [自动化与计算机技术—控制理论与控制工程]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于元分析的差异表达基因识别
刘桂霞
田原
郑明
赖丽娜
臧雪柏
周春光
《吉林大学学报(工学版)》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2010
2
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