叠氮丙啶-实时荧光聚合酶链式反应-高通量测序技术鉴定冷链食品中多种病原菌

目的 应用叠氮丙啶-实时荧光聚合酶链式反应-高通量测序技术鉴定冷链食品中多种病原菌,构建病原菌分子进化树。方法 以冷链食品中的沙门氏菌、金黄色葡萄球菌、蜡样芽胞杆菌、副溶血性弧菌、单核细胞增生李斯特氏菌5种病原菌作为研究对象,应用叠氮丙啶-实时荧光聚合酶链式反应技术作为冷链食品中病原菌检测初筛手段,应用微生物培养法以及生化鉴定仪器法进行方法比对与结果验证,运用高通量测序以及分子进化树构建作为冷链食品中所分离病原菌的种属地位确证方法。结果 叠氮丙啶-实时荧光聚合酶链式反应技术成功扩增了冷链食品中生活状态病原菌的特征性核酸片段,排除了死亡细菌以及阴性对照菌的干扰,病原菌检出限可达到1×10^(3)CFU/mL,一次反应可检测42份试样,可以在18 h内完成检测工作。在冷链食品中病原菌抽样检测调查中,随机采集的751份冷链食品,共检出62株病原菌,病原菌总体检出率为8.3%(62/751)。通过后续的16S rRNA测序以及葡萄球菌属、弧菌属以及李斯特菌属分子进化树的构建,成功溯源了金黄色葡萄球菌的污染来源并完成病原菌种属定位。结论 本方法特异性好、灵敏度高、检测通量高,为冷链食品及相关食品中病原菌的精确检测与溯源分析提供新的思路与方法。

聚合酶链式反应技术的研究进展

聚合酶链式反应技术自诞生以来 ,已在生物学及相关学科中得到了广泛应用 ,并得以不断的深入和发展。本文就近年来研究和发展出现的一些特殊PCR技术 ,如 :逆转录PCR、反向PCR、定量PCR、锚定PCR、重组PCR、长PCR、热起动PCR、免疫PCR、复合PCR、差向显示PCR等作一简述 ,以供参考。

应用依赖随机化末端连接物聚合酶链反应技术研究重铬酸钾对大鼠肺p53基因DNA损伤

应用依赖随机化末端连接物PCR(RandomizedTerminalLinker-dependentPCR ,RDPCR)技术于体内试验的研究 ,从而检测特定基因的DNA损伤。腹腔注射重铬酸钾染毒大鼠 ,提取肺组织基因组DNA ,经p5 3基因外显子 7特异性引物P1重复直线延伸后与接头 (Linker)连接 ,用基因特异性引物P2和连接物引物经PCR扩增 ,电泳、转印 ,再与地高辛标记的探针杂交后显色。结果显示 ,在 2 0 .0mg kg和 40 .0mg kg剂量下 ,出现了两条清晰的杂交带 ,表明重铬酸钾可引起大鼠肺p5 3基因外显子 7的DNA损伤 ,且有两个损伤位点。此结果有助于进一步探讨六价铬化合物的致突变机制 。

实时荧光聚合酶链式反应技术与国标方法检测致病菌的应用与研究

目的比较实时荧光聚合酶链式反应技术(real-time polymerase chain reaction,RT-PCR)与国标方法在食品致病菌检测中的异同。方法应用RT-PCR法及国标GB 4789系列对采集的60件畜产品、禽产品、水产品和乳及乳制品中的沙门氏菌、金黄色葡萄球菌、单核细胞增生李斯特氏菌以及副溶血性弧菌同时进行检测。结果除了金黄色葡萄球菌检测结果均为阴性外,其他3种致病菌2种方法都有检出,但RT-PCR方法的阳性率均高于国标方法。对于沙门氏菌,国标方法阳性率为1.67%,RT-PCR方法阳性率3.33%;单核细胞增生李斯特氏菌国标方法阳性率为7.50%,RT-PCR方法阳性率为15.00%;副溶血性弧菌国标方法阳性率为8.33%,RT-PCR方法阳性率为11.67%。结论在本实验条件下,RT-PCR技术的阳性检测结果多于国标GB4789系列,并且结果可完全覆盖国标GB4789。各企业实验室甚至政府主导的食品风险监测项目可根据产品特点,合理应用RT-PCR技术以减少人员工作量,方便产品放行并提高工作效率。

实时荧光定量聚合酶链反应技术对结核性脑膜炎的诊断价值

目的探讨实时荧光定量聚合酶链反应技术(RT-PCR)对结核性脑膜炎的诊断价值。方法分别采用涂片法、RT-PCR法对结核性脑膜炎、疑似结核性脑膜炎以及非结核性脑膜炎患者的脑脊液标本进行检测,并对检测结果进行比较分析。结果涂片法共检出10例阳性,其中结核性脑膜炎7例(70.00%),疑似结核性脑膜炎3例(30.00%);RT-PCR法共检出46例阳性,其中结核性脑膜炎31例(67.39%),疑似结核性脑膜炎15例(32.61%)。对结核性脑膜炎患者检测,涂片法阳性率(12.28%)低于RT-PCR法阳性率(54.39%),差异有统计学意义(P<0.05);对疑似结核性脑膜炎患者检测,涂片法阳性率(2.91%)低于RT-PCR法阳性率(14.56%),差异有统计学意义(P<0.05);脑脊液涂片法检测结核性脑膜炎的灵敏度为12.28%,漏诊率为87.72%,RT-PCR法检测的灵敏度为54.39%,漏诊率为45.61%,差异有统计学意义(P<0.05)。结论 RT-PCR法诊断结核性脑膜炎具有灵敏度好,准确度高等特点,临床有重要的指导意义。

用聚合酶链反应技术探讨B群链球菌与胎膜早破的关系

目的:探讨应用聚合酶链反应技术检测B群链球菌与胎膜早破之间的关系。方法:将316例孕妇采取细菌培养法进行生殖道B群链球菌筛查的结果汇总为对照组,再采取聚合酶链反应技术对同样316例孕妇实施生殖道B群链球菌筛查并将结果汇总为研究组;对比两组筛查结果的准确性。而后按照筛查结果将316例孕妇分为阳性组与阴性组,通过对比分析B群链球菌与发生胎膜早破的关系。结果:对照组生殖道B群链球菌阳性检测准确率为76.53%,研究组准确率为98.98%;阳性组胎膜早破发生率为29.59%,阴性组发生率为11.93%。结论:聚合酶链反应技术的检出率明显高于细菌培养法,尽早检出生殖道B群链球菌感染可有效降低或预防胎膜早破的发生。

聚合酶链反应技术检测阴道毛滴虫的研究

目的:建立PCR检测阴道毛滴虫的方法。方法:按照滴虫TV-E650-1基因设计一对引物,采用PCR技术扩增滴虫目的基因,将扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳,根据扩增及电泳结果判断PCR法体外诊断阴道毛滴虫感染的可行性。同时,通过与其它常见阴道微生物PCR结果对比,判断所设计引物的特异性;根据模板DNA的稀释倍数判断引物的敏感性。结果:设计的一对引物以滴虫DNA为模板,扩增出大小为438bp的基因片断,与目的基因相符;空白对照扩增阴性。以乳酸杆菌、大肠杆菌、阴道加德纳菌等阴道常见微生物DNA为模板,扩增结果均为阴性。将滴虫DNA稀释至1 000倍(相当于1.36pg/μL)仍可见明显扩增。结论:PCR检测滴虫方法可行,且准确,特异性好,敏感性高,能用于临床批量检测,可作为体外诊断阴道毛滴虫感染及流行病学调查的候选方法。

基于扩增阻滞突变系统-聚合酶链式反应法的A1/A2牛奶鉴别试剂盒的开发及应用

目的基于扩增阻滞突变系统-聚合酶链式反应(amplification refractory mutation system polymerase chain reaction,ARMS-PCR)技术,开发A1A2牛奶鉴别试剂盒,并对市场上A2牛奶产品进行检测应用,实现对A2牛奶的鉴别检测。方法本研究先利用D-loop基因片段设计了牛内参基因引物探针组(标记FAM荧光)。随后,在β-酪蛋白基因突变位点分别设计了A1基因引物探针组和A2基因引物探针组(均标记VIC荧光)。基于ARMS-PCR技术构建了双通道ARMS-PCR反应体系与程序,进而成功开发了A1A2牛奶实时荧光ARMS-PCR试剂盒。为进一步验证试剂盒性能,将其应用于市场上A2牛奶的检测,并将检测结果与DNA测序法结果对比。结果本试剂盒特异性强,检测DNA灵敏度为0.1 ng/L;10份市售实际样品的应用检测结果与测序结果一致。结论本试剂盒特异性好,灵敏度高、准度度高,适用于A2牛奶的真实性鉴别。

脆性X染色体综合征快速筛查的聚合酶链反应技术

目的 建立一种简便的筛查脆性X综合征的聚合酶链反应 (PCR)方法。 方法 提取 76例原因不明的智力低下男性患儿外周血DNA ,用PCR扩增FMR1基因的三核苷酸重复序列。 结果 96 1% (73/ 76 )的标本PCR反应出现产物 ,条带大小为 4 0 0～ 5 0 0bp ,相当于三核苷酸重复次数 2 0～ 30 ;3 9% (3/ 76 )PCR反应无产物 ,其中 2例被证实为脆性X综合征患者。 结论 该方法简便、快速、价廉 ,可用于高危人群的快速筛查。

聚合酶链反应技术对棘阿米巴角膜炎诊断的临床应用

目的 探讨聚合酶链反应 (PCR)技术临床应用于棘阿米巴角膜炎诊断的可行性及优越性。方法 以一段特异性通用引物并配合热启动聚合酶链反应技术来检测临床标本中的棘阿米巴原虫。结果 在门诊初诊为棘阿米巴角膜炎的 13例 (13只眼 )中 ,通过 PCR检测法有 11只眼证实为棘阿米巴原虫感染 ,同时角膜刮片染色后镜检有 5例发现了棘阿米巴包囊。

聚合酶链反应技术应用进展

全血不需分离细胞 ,将红细胞低渗溶解 ,直接取细胞胞溶物进行PCR基因分型 ,结果可靠 ;血管紧张素转换酶 (ACE)等位基因缺失在缺血性心肌病中有重要意义 ,而ACE基因插入 /缺失 (I/D)多态性检测由FerencSomogyVari提出的迅速PCR ,在Lightcycler仪器上采用荧光标记的寡核苷酸杂交探针能准确快速的进行基因分型 ;DNA模板无需变性 ,进行HBVDNA扩增。

荧光定量聚合酶链反应技术在儿童肺炎支原体及肺炎衣原体感染中的应用

肺炎支原体是1898年Nocord等发现的一种类似细菌但不具细胞壁的原核微生物。肺炎支原体是对人类有致病性的病原体，引起原发性非典型肺炎（细支气管周围间质性肺炎），还可引起全身多脏器损害。肺炎支原体感染的临床表现复杂多样，无特异性，有效的实验室诊断对于判断肺炎支原体感染具有重要的意义。

聚合酶链反应技术检测后天感染鸭乙型肝炎病毒模型中共价闭环状DNA表达

目的:聚合酶链反应方法检测后天感染鸭乙型肝炎病毒模型中共价闭环状DNA的表达。方法:实验于2006-06/2007-01在解放军总医院老年医学研究所完成。1日龄北京雏鸭6只经腿静脉注射上海麻鸭DHBV阳性血清(中国医学科学院提供)0.2mL/只,感染7d后处死动物取血分离血清并取肝组织,同时取同日龄正常鸭6只肝组织作为对照。聚合酶链反应技术检测肝脏、血清中鸭乙型肝炎病毒DNA及共价闭环状DNA的表达。结果:①血清斑点杂交显示模型制备成功,平均病毒吸光度值为0.62±0.12。②琼脂糖凝胶电泳显示,模型肝脏、血清中DHBVDNA均高表达,而共价闭环状DNA仅在模型肝脏表达,正常鸭DNA与共价闭环状DNA均不表达。结论:后天感染鸭乙型肝炎病毒模型中共价闭环状DNA高表达,可作为临床乙肝药物筛选模型。

FQ-聚合酶链反应技术在结核病诊断中的价值

结核病是一种严重危害人类健康的传染病，近几年来，全球结核发病率有所回升。据2011年资料，全球每年新增870万结核患者，140万人死于结核病。目前，我国大约有600多万肺结核患者，每年约有25万人因结核病死亡，亦呈增长的趋势。其原因有很多，其中结核病尤其肺外结核和菌阴肺结核病的早期诊断不理想是其重要原因。

聚合酶链反应技术对慢性粒细胞白血病进行分子学诊断和监测

慢性粒细胞白血病(CML)是一种起源于造血多能干细胞的肿瘤性疾病。Ph染色体是CML的标记染色体,其分子基础是第9号染色体上的原癌基因c—abl易位至第22号染色体,并与bcr基因5’端相连接,形成bcr/abl融合基因。为从分子水平探讨bcr/abl融合基因在CML诊断及微量残留病(MRD)监测等方面的意义,我们应用筑巢法逆转录/聚合酶链反应(RT/PCR)技术。

用聚合酶链反应技术鉴别恶性疟原虫不同地理株的初步研究

目的 阐明 Fcc1/ HN株与云南株间的不同生物学特性。 方法 用 M2 6 - 32 作探针 ,筛选恶性疟原虫 c DNA基因表达文库 ,根据所获得的靶抗原决定簇表位的基因序列设计引物 ,分别进行 PCR扩增 ;地高辛酶促生物标记 Fcc1- HN株 DNA的 PCR扩增产物 ,分别与 Fcc1/ HN株 DNA、云南株 DNA和阳性克隆 5 11的扩增产物杂交。 结果 PCR扩增后 Fcc1/ HN株 DNA在约 5 0 0 bp和 4 5 0 bp处有 2条特异性条带 ;云南株 DNA在约 5 0 0 bp处有 1条较淡的条带和 130 0bp处一较亮的特异性条带 ;阳性克隆 5 11仅在约 5 0 0 bp处有 1条特异性条带。标记探针能与克隆 DNA、恶性疟原虫Fcc1/ HN株和云南株的 PCR扩增产物杂交。 结论 恶性疟原虫 Fcc1/ HN株与云南株在基因组 DNA结构上可能存在差异。