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聚合酶链反应-高分辨率熔解曲线技术在下呼吸道细菌鉴定中的应用 被引量:4
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作者 赵焕英 薛冰 +2 位作者 方霄 陈瑛 郭伟 《微生物与感染》 2015年第5期308-314,共7页
为探讨聚合酶链反应-高分辨率熔解曲线(PCR-HRM)技术在检测呼吸道菌群中的应用,本研究用支气管镜从慢性阻塞性肺病患者下呼吸道采集分泌液,提取细菌总DNA,以16S通用引物27F/1492R扩增16S rDNA全长,PCR产物经电泳、纯化后连接到pGEMT-Eas... 为探讨聚合酶链反应-高分辨率熔解曲线(PCR-HRM)技术在检测呼吸道菌群中的应用,本研究用支气管镜从慢性阻塞性肺病患者下呼吸道采集分泌液,提取细菌总DNA,以16S通用引物27F/1492R扩增16S rDNA全长,PCR产物经电泳、纯化后连接到pGEMT-Easy载体上,构建16SrDNA克隆文库。然后以16S rDNA V3区通用引物338F/518R扩增克隆文库,V3区PCR-HRM分析在罗氏LightCycler 480实时荧光定量PCR系统中进行,采用HRM基因扫描软件分析数据。根据不同HRM图型,挑选克隆株测序并鉴定菌株。结果显示,PCR-HRM技术可灵敏区分下呼吸道不同细菌16SrDNA V3区,根据HRM图谱可极大减少克隆菌株测序样本,提示PCR-HRM技术可作为一种快速、高通量、敏感、经济的菌群多样性检测方法。 展开更多
关键词 聚合酶链反应-高分辨率熔解曲线技术 微生物菌群 16S rDNA文库 慢性阻塞性肺病 哮喘
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高分辨率熔解曲线技术常用的仪器和荧光染料 被引量:6
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作者 郭心灵 尤崇革 《分子诊断与治疗杂志》 2012年第1期50-53,共4页
高分辨率熔解曲线技术(HRM)是近年来发展迅速的一项用于基因突变扫描与检测的新技术。由于具备快速、简便、价廉、高通量和闭管均相检测等优点,HRM已被广泛地应用于突变基因的扫描、基因分型、遗传配型以及法医学鉴定等领域,并受到越来... 高分辨率熔解曲线技术(HRM)是近年来发展迅速的一项用于基因突变扫描与检测的新技术。由于具备快速、简便、价廉、高通量和闭管均相检测等优点,HRM已被广泛地应用于突变基因的扫描、基因分型、遗传配型以及法医学鉴定等领域,并受到越来越多的关注且发展迅速。本文就该技术常规应用时的相关仪器与荧光染料的发展及应用进行分析总结。 展开更多
关键词 高分辨率熔解曲线技术 聚合反应 荧光染料 PCR仪
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qPCR-HRM曲线分析技术与普通PCR加直接测序法检测胶质瘤EGFR突变比较 被引量:3
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作者 熊亮 梁朝峰 +5 位作者 陈川 罗伦 凌聪 拳峰 蔡梅钦 史志东 《新医学》 2012年第5期327-330,共4页
目的:比较实时聚合酶链反应-高分辨率融解(qPCR-HRM)曲线分析技术和普通PCR法加直接测序法检测胶质瘤患者EGFR基因突变类型,探讨适用于临床的EGFR基因突变检测方法,为胶质瘤患者术后放射、化学治疗及预后判断研究提供可靠的依据。方法:... 目的:比较实时聚合酶链反应-高分辨率融解(qPCR-HRM)曲线分析技术和普通PCR法加直接测序法检测胶质瘤患者EGFR基因突变类型,探讨适用于临床的EGFR基因突变检测方法,为胶质瘤患者术后放射、化学治疗及预后判断研究提供可靠的依据。方法:用普通PCR加测序法与qPCR-HRM曲线分析技术检测胶质瘤患者EGFR基因突变类型,检测结果比较采用卡方检验。结果:两种方法检测EGFR外显子19基因突变结果比较差异无统计学意义,且qPCR-HRM曲线分析技术比直接测序法更快捷、灵敏。结论:与直接测序法相比,qPCR-HRM曲线分析技术可能更适用于临床检测胶质瘤患者标本EGFR突变性质。 展开更多
关键词 表皮生长因子受体 基因突变 普通PCR DNA测序法 实时聚合反应-高分辨率融解曲线分析技术
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荧光PCR-探针熔解曲线法在缺失型α-地中海贫血快速诊断中的应用
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作者 李恋湘 肖奇志 +1 位作者 张素粉 吴洪秋 《中国当代医药》 2020年第15期24-27,F0004,共5页
目的探讨荧光PCR-探针熔解曲线法(PMCA)在缺失型α-地中海贫血(简称“α-地贫”)快速诊断中的应用。方法收集2019年10~12月珠海市妇幼保健院2261份血样本和35份羊水样本。通过双盲法,采用PMCA和单管多重PCR技术(gap-PCR)同时对上述2296... 目的探讨荧光PCR-探针熔解曲线法(PMCA)在缺失型α-地中海贫血(简称“α-地贫”)快速诊断中的应用。方法收集2019年10~12月珠海市妇幼保健院2261份血样本和35份羊水样本。通过双盲法,采用PMCA和单管多重PCR技术(gap-PCR)同时对上述2296份临床样本进行3种常见缺失型α-地贫基因检测,结果不符样本用DNA测序技术以确认。结果2296份临床样本中,除PMCA检测出1例未知突变基因之外,其余与gap-PCR检测结果一致,两者符合率为99.9%,此例经DNA测序显示在探针覆盖区域发生了单个碱基突变(A>G)。结论PMCA技术能快速准确检测3种常见缺失型α-地贫基因,可作为gap-PCR技术的替代或验证方法,也可用于大规模人群筛查及产前诊断。 展开更多
关键词 探针 熔解曲线 Α-地中海贫血 多重聚合反应
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荧光定量聚合酶链反应检测基质金属蛋白酶组织抑制因子-1方法的建立 被引量:6
5
作者 丛敏 阎钟钰 +6 位作者 王萍 张岩 徐雍 卢炎 王宝恩 贾继东 尤红 《中华检验医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第5期533-537,共5页
目的构建含有金属蛋白酶组织抑制因子-1(TIMP-1)的重组质粒并以其为模板建立荧光定量聚合酶链反应(PCR)技术检测TIMP-1的标准曲线,为荧光定量PCR准确检测TIMP-1奠定基础.方法提取大鼠星状细胞系HSC-T6的mRNA,经RT-PCR扩增TIMP-1基因后与... 目的构建含有金属蛋白酶组织抑制因子-1(TIMP-1)的重组质粒并以其为模板建立荧光定量聚合酶链反应(PCR)技术检测TIMP-1的标准曲线,为荧光定量PCR准确检测TIMP-1奠定基础.方法提取大鼠星状细胞系HSC-T6的mRNA,经RT-PCR扩增TIMP-1基因后与pGMT-Vector 连接,转化到大肠杆菌DH5α,以筛选得到的阳性克隆质粒作为标准品进行梯度稀释,分别用Taqman荧光探针技术和SYBR Green I荧光染料技术进行荧光定量PCR检测,建立标准曲线,并对两者结果进行了对比.同时进行普通PCR检测,与荧光定量PCR方法检测结果进行比较.结果重组质粒经PCR扩增及序列测定,表明pGMT-TIMP-1基因已成功克隆.以不同稀释水平的标准品质粒进行荧光定量PCR扩增, 应用Taqman荧光探针技术建立的标准曲线的线性检测范围为7×104~7×108拷贝,检测灵敏度为7×104拷贝;应用SYBR Green I荧光染料技术的线性检测范围为7×106~7×108拷贝,检测灵敏度为7×106拷贝,且熔解曲线显示出现非特异性扩增;两种技术相对于普通PCR技术均具有定量功能.结论所构建的pGMT-TIMP-1基因荧光定量PCR检测标准品应用Taqman荧光探针技术建立的标准曲线线性关系好, 灵敏度和特异性高,准确可靠,此方法可作为荧光定量PCR检测TIMP-1基因的标准方法. 展开更多
关键词 基质金属蛋白组织抑制因子-1 荧光定量聚合反应检测 Taqman荧光探针技术 荧光定量PCR检测 TIMP-1基因 聚合反应(PCR) 荧光定量PCR方法 RT-PCR扩增 Green 检测灵敏度 标准曲线 HSC-T6 重组质粒 SYBR 荧光染料
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高分辨熔解曲线技术快速筛查 UGT1 A1基因变异 被引量:3
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作者 杨辉 杨立业 +1 位作者 郑磊 蔡贞 《中华检验医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第2期101-104,共4页
目的:利用高分辨熔解曲线技术,建立一种快速分子筛查UGT1A1基因缺陷相关的Gilbert ( GS)和Crigler-Najjar综合征( CNS)的方法。方法方法学建立。临床收集的61例不明原因严重高胆红素血症的新生儿样本以待验证,有明确黄疸原因如... 目的:利用高分辨熔解曲线技术,建立一种快速分子筛查UGT1A1基因缺陷相关的Gilbert ( GS)和Crigler-Najjar综合征( CNS)的方法。方法方法学建立。临床收集的61例不明原因严重高胆红素血症的新生儿样本以待验证,有明确黄疸原因如ABO溶血,G6PD缺乏,败血症,缺血缺氧性脑病的黄疸儿除外。根据亚洲人群UGT1A1基因常见突变位点-G211A 、C686A、 C1091T、C1352T和T1456G,设计特异性HRM引物,建立和优化HRM反应条件。用优化的HRM方法对临床标本进行UGT1A1基因突变的筛查,所有的样本经测序进一步验证。结果 HRM检测方法能够准确地将有突变的样本与无突变的样本区分开来。经HRM 分子筛查,61例严重黄疸儿中,42例检出携带有UGT1A1突变,共检测出4种UGT1A1突变类型。结论本研究建立的PCR-HRM分型技术可以经济、简便、快速、有效的检测UGT1 A1基因异常,为临床诊断GS及CNS提供可靠的依据,也有利于UGT1A1基因相关疾病的大规模的分子流行病学研究。(中华检验医学杂志,2017,40:101-104) 展开更多
关键词 吉尔伯特病 Crigler-Najjar综合征 高胆红素血症 新生儿 葡糖醛酸基转移 突变 聚合反应 高分辨率熔解曲线
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高分辨熔解曲线分析技术的发展与展望 被引量:7
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作者 郑昭璟 傅启华 Zhou Luming 《中华检验医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第2期77-79,共3页
高分辨熔解曲线分析技术简便快速、灵活性高、成本低、敏感性及特异性高、闭管操作的优势,使其成为临床实验诊断及科研工作中得到广泛应用的分子诊断技术之一。随着高分辨熔解曲线分析检测仪器、DNA染料及熔解曲线分析软件的发展,高... 高分辨熔解曲线分析技术简便快速、灵活性高、成本低、敏感性及特异性高、闭管操作的优势,使其成为临床实验诊断及科研工作中得到广泛应用的分子诊断技术之一。随着高分辨熔解曲线分析检测仪器、DNA染料及熔解曲线分析软件的发展,高分辨熔解曲线分析技术的敏感性、特异性及准确度不断提高,为遗传病、肿瘤、病原微生物及个体化用药等提供快速、高效、经济的分子诊断检测平台。(中华检验医学杂志,2017,40:77-79) 展开更多
关键词 聚合反应 荧光染料 分子诊断技术 高分辨率熔解曲线 算法
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采用多重PCR结合高分辨熔解曲线法单管同时检测JAK2V617F突变和JAK2外显子12突变 被引量:2
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作者 许笑 陈宇明 +4 位作者 吴之源 张心菊 胡婷婷 张瑾 关明 《中华检验医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第3期194-197,共4页
目的 建立能单管同时检测JAK2 V617F突变和外显子12突变的方法.方法 以PC-3细胞株DNA为野生型对照,分别以HEL细胞株DNA和含有JAK2外显子12突变的质粒作为JAK2V617F突变和外显子12突变的阳性对照,采用多重PCR扩增不同DNA片段,并结合高分... 目的 建立能单管同时检测JAK2 V617F突变和外显子12突变的方法.方法 以PC-3细胞株DNA为野生型对照,分别以HEL细胞株DNA和含有JAK2外显子12突变的质粒作为JAK2V617F突变和外显子12突变的阳性对照,采用多重PCR扩增不同DNA片段,并结合高分辨熔解曲线法建立检测JAK2V617F和外显子12突变的联合检测体系.同时选取42例真性红细胞增多症患者,分别采用上述方法和常规方法在外周血中检测JAK2的2种突变.结果 采用多重PCR结合高分辨熔解曲线法成功建立了JAK2突变联合检测体系,能够同时检测JAK2V617F突变和外显子12突变,2种突变的检测灵敏度皆可达5%,2种扩增片段的溶解温度(Tm)的批间及批内变异系数都小于0.01%.42例真性红细胞增多症患者中,发现37例携有JAK2V617F突变,在5例JAK2V617F突变阴性真性红细胞增多症病例中检出2例JAK2外显子12突变.与常规方法相比,结果符合率达到100%.2例JAK2外显子12突变经克隆测序确认突变类型为H538K539delinsL和F537-I546dul10+F547L.结论 该方法可同时在外周血中检测出JAK2的2种突变,将有助于对骨髓增殖性肿瘤尤其是真性红细胞增多症的分子诊断. 展开更多
关键词 JANUS激2 外显子 突变 多重聚合反应 高分辨率熔解曲线 红细胞增多症 真性
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PCR-HRM分析筛查成骨不全一家系患儿基因突变 被引量:1
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作者 白雪 李克秋 +5 位作者 任秀智 何晓波 王毅 官士珍 景亚青 李光 《天津医药》 CAS 北大核心 2014年第7期693-696,共4页
目的采用PCR-高分辨率熔解曲线(HRM)分析筛查成骨不全(OI)一家系患儿(先证者)COL1A1基因突变位点,探讨其基因型与临床表型的联系。方法对先证者进行家族史及临床资料的调查,采集先证者、家属及50名正常对照者血液标本,应用PCR-HRM分析... 目的采用PCR-高分辨率熔解曲线(HRM)分析筛查成骨不全(OI)一家系患儿(先证者)COL1A1基因突变位点,探讨其基因型与临床表型的联系。方法对先证者进行家族史及临床资料的调查,采集先证者、家属及50名正常对照者血液标本,应用PCR-HRM分析筛查先证者及正常对照者COL1A1基因突变,基因测序确证突变位点。结果先证者COL1A1基因17外显子筛查结果异常,其熔解温度(Tm)值比正常对照者Tm值低约0.4℃。先证者与正常对照者的标准熔解曲线及差异熔解曲线均有明显差异。测序结果为c.1138G>A,突变导致380位氨基酸由甘氨酸(Gly)变成丝氨酸(Ser):p.(Gly 380 Ser),为错义突变。先证者父亲、祖母均具有相同突变位点。先证者母亲及正常对照者基因测序结果无此突变。该突变在中国人群中未见报道。该家系遗传特征为常染色体显性遗传,先证者临床诊断为Ⅳ型OI,临床表型较严重。结论 PCR-HRM分析是有效的OI基因筛查新方法。COL1A1基因c.1138G>A突变在中国人群中为新发现的突变位点。α螺旋结构域Gly被替换可能导致较严重的临床表型。 展开更多
关键词 成骨不全 遗传筛查 聚合反应 点突变 系谱 COL1A1基因 高分辨率熔解曲线分析
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高分辨熔解曲线分析在遗传病分子诊断中的应用 被引量:5
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作者 应斌武 《中华检验医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第2期146-148,共3页
高分辨熔解曲线分析( HRM)技术基本原理为:DNA饱和荧光染料加入PCR反应体系,在一定的温度范围内将PCR扩增子进行加热变性,专业仪器检测变性双链DNA荧光信号并绘制熔解曲线,根据不同熔解曲线形状来区分野生型和杂合突变型。 HRM技... 高分辨熔解曲线分析( HRM)技术基本原理为:DNA饱和荧光染料加入PCR反应体系,在一定的温度范围内将PCR扩增子进行加热变性,专业仪器检测变性双链DNA荧光信号并绘制熔解曲线,根据不同熔解曲线形状来区分野生型和杂合突变型。 HRM技术因其简单易行、准确快速、低成本,周期时间短、高通量等优点而广泛应用于基因突变扫描。此外,与其他突变筛查方法相比, HRM实现真正的闭管操作, PCR 结束后直接运行高分辨熔解分析,使HRM 技术更加方便易行。HRM技术是应用于突变筛查、基因分型等的遗传学分析新技术。(中华检验医学杂志,2017,40:146-148) 展开更多
关键词 遗传性疾病 先天性 聚合反应 突变 基因分型技术 高分辨率熔解曲线
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杂交探针技术结合熔解曲线快速鉴别水痘-带状疱疹病毒野毒株/疫苗株 被引量:1
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作者 王静 刘景壹 +5 位作者 杨玉颖 应颖 吴强松 陆菁 李崇山 孙晓冬 《预防医学情报杂志》 CAS 2013年第10期825-831,共7页
目的利用杂交探针结合熔解曲线分析技术,建立一种快速、可靠的适用于鉴别水痘一带状疱疹病毒(Varicella—zosterVirus,VZV)野毒株与疫苗株的方法。方法采集临床诊断为水痘患者的水疱液并进行病毒分离,抽提阳性分离物和部分阳性水... 目的利用杂交探针结合熔解曲线分析技术,建立一种快速、可靠的适用于鉴别水痘一带状疱疹病毒(Varicella—zosterVirus,VZV)野毒株与疫苗株的方法。方法采集临床诊断为水痘患者的水疱液并进行病毒分离,抽提阳性分离物和部分阳性水疱液的基因组脱氧核糖核酸(DeoxyribonucleicAcid,DNA)。以荧光素Cy5.5标记检测探针5端,相应的锚定探针在3端用FAM羧基荧光索标记,再从研究对象基因组DNA中用聚合酶链反应(PolymeraseChainReac—tion,PCR)特异引物扩增ORF62基因中301碱基对(basepair,bp)片段,将其与特异探针杂交后,引发荧光共振能量转移,通过罗氏LightCycler实时PCR仪描绘扩增的目标DNA片段的熔解曲线,根据熔解温度(MeltingTemperature,Tm)峰值对待测标本进行鉴别。最后,用限制性片段长度多态性(RestrictionFragmentLengthPolymorphism,RFLP)方法验证杂交探针结合熔解曲线鉴别野毒株/疫苗株的准确性。结果VZVOka疫苗株的扩增产物与检测探针的Tm为52.47℃,而水痘原始临床标本/临床分离株与检测探针的Tm在57.33℃~60.50℃。通过检测DNA扩增产物与VzVORF62探针Tm的差异可以明确鉴别VZV野毒株和疫苗株。利用杂交探针技术结合熔解曲线的方法对水痘原始临床标本及分离株进行野毒株/疫苗株的鉴别结果与传统的RFLP方法进行鉴别的结果完全一致。结论杂交探针技术结合熔解曲线操作简便省时,不易交叉污染;获得的病毒野毒株/疫苗株特征性强,适用于VZV野毒株/疫苗株在临床和流行病学调查中的快速鉴别诊断。 展开更多
关键词 水痘-带状疱疹病毒 荧光共振能量转移 熔解曲线 聚合反应-限制性片段长度多态性
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非标记探针结合高分辨熔解曲线分析快速区分第1类整合子可变区启动子 被引量:2
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作者 魏取好 李刚 +5 位作者 蒋晓飞 胡庆丰 吕火烊 周永列 关明 吕元 《中华检验医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第2期95-100,共6页
目的:建立一种基于非标记探针结合高分辨率熔解曲线分析快速区分第1类整合子可变区启动子种类的方法。方法 PCR扩增质粒pACW (PcW)、pACWP2(PcW-P2)含可变区启动子区域的DNA片段,再分别以纯化的PCR产物为模板,用扩增子高分辨率... 目的:建立一种基于非标记探针结合高分辨率熔解曲线分析快速区分第1类整合子可变区启动子种类的方法。方法 PCR扩增质粒pACW (PcW)、pACWP2(PcW-P2)含可变区启动子区域的DNA片段,再分别以纯化的PCR产物为模板,用扩增子高分辨率熔解曲线分析对P2启动子进行区分。以质粒 pACS ( PcS )、pACH2( PcH2)、pACH1( PcH1)、pACW ( PcW )及肺炎克雷伯菌HS07-68(PcWTGN-10)、HS05-1792(PcH2TGN-10)基因组DNA为模板,结合定点突变,PCR扩增获得分别含8种不同Pc启动子序列的DNA片段,再分别以纯化的PCR产物为模板,联合运用扩增子和非标记探针高分辨率熔解曲线分析对8种不同Pc启动子进行区分。运用上述方法对2004—2007年95株非重复分离自华山医院住院患者尿液标本的第1类整合酶阳性大肠埃希菌中可变区启动子进行分析,并与测序结果进行比对。结果 P2启动子扩增子熔解曲线的熔链温度( Tm)值明显高于无活性的P2启动子,通过扩增子高分辨率熔解曲线分析可将两者区分开,95株大肠埃希菌109个第1类整合子中,有2个整合子中检测出P2启动子,与测序结果完全一致。8种不同的Pc启动子通过扩增子高分辨率熔解曲线分析分为3组:PcS、PcSTGN-10;PcW、PcWTGN-10;PcH1、PcH1TGN-10、PcH2、PcH2TGN-10。非标记探针高分辨率熔解曲线分析将8种不同的 Pc 启动子分为4组 PcS, PcH1;PcH2, PcW;PcSTGN-10, PcH1TGN-10;PcH2TGN-10,PcWTGN-10。联合运用扩增子和非标记探针高分辨率熔解曲线分析可将8种不同的Pc启动子相互区分开,95株大肠埃希菌109个第1类整合子中,共检测出5种不同的Pc启动子PcS,PcW,PcH1,PcH2TGN-10,PcWTGN-10,与测序结果完全一致。结论本研究成功建立了一种基于非标记探针结合高分辨率熔解曲线分析的方法,用于快速区分第1类整合子可变区启动子,该方法结果准确、费用低,可用于临床对第1类整合子可变区启动子多态性的研究。(中华检验医学杂志,2017,40:95-100) 展开更多
关键词 整合子类 启动区 遗传 抗药性 细菌 聚合反应 高分辨率熔解曲线
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实时荧光PCR结合探针熔解曲线检测亚甲基四氢叶酸还原酶C677T基因多态性及其与肝硬化的相关性研究
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作者 刘国政 李一荣 吴健民 《中华检验医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2006年第7期618-620,共3页
聚合酶链反应.限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)是当前常用的检测基因多态性的方法之一,该法不仅操作时间长,且在采用限制性内切酶对PCR产物进行酶切后,通常采用溴乙锭或银染的方法观察结果。溴乙锭严重危害人体健康,而银染试剂... 聚合酶链反应.限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)是当前常用的检测基因多态性的方法之一,该法不仅操作时间长,且在采用限制性内切酶对PCR产物进行酶切后,通常采用溴乙锭或银染的方法观察结果。溴乙锭严重危害人体健康,而银染试剂相当不稳定。因此有必要建立一种快速且对人体危害性较低的多态性检测方法。实时荧光聚合酶链反应(PCR)是一种将先进的光学技术、温控技术、荧光素标记技术以及计算机软件有机结合的新型PCR,能够对PCR每一个循环的荧光强度进行监测,故称为实时荧光PCR。双探针杂交技术是一种重要的实时荧光PCR技术,通常用于基因的定量检测,但是如果结合探针熔解曲线则可用于基因多态性和突变的检测。 展开更多
关键词 荧光PCR技术 探针杂交技术 基因多态性 亚甲基四氢叶酸还原 定量检测 实时荧光 熔解曲线 C677T 聚合反应(PCR) 限制性片段长度多态性
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葡萄糖-6-磷酸脱氢酶缺乏症新生儿葡萄糖-6-磷酸脱氢酶及其基因突变的研究 被引量:12
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作者 郭静 田国力 +2 位作者 王燕敏 周卓 纪伟 《中华妇幼临床医学杂志(电子版)》 CAS 2020年第6期672-679,共8页
目的探讨葡萄糖-6-磷酸脱氢酶(G6PD)缺乏症新生儿G6PD与其基因突变情况。方法 2017年8月至2019年4月,在上海市儿童医院新生儿筛查中心进行G6PD缺乏症筛查的新生儿为105 766例,初筛G6PD缺乏症呈阳性患儿为217例,选择其中被召回进行G6PD... 目的探讨葡萄糖-6-磷酸脱氢酶(G6PD)缺乏症新生儿G6PD与其基因突变情况。方法 2017年8月至2019年4月,在上海市儿童医院新生儿筛查中心进行G6PD缺乏症筛查的新生儿为105 766例,初筛G6PD缺乏症呈阳性患儿为217例,选择其中被召回进行G6PD复筛和(或)基因检测的161例新生儿为研究对象。这161例新生儿均接受G6PD复筛,其中146例接受G6PD基因检测。同时对男性患儿及其母亲、女性患儿及其父母(将男性患儿母亲与女性患儿父母统称为患儿家系成员)进行G6PD活性和基因检测,分析患儿及其家系成员G6PD活性、G6PD基因突变位点地域性分布特点,并分析G6PD活性与不同G6PD基因突变位点的关系。采用Mann-Whitney U检验或Kruskal-Wallis H秩和检验,对不同患儿与其家系成员的G6PD活性,以及不同G6PD基因突变位点患儿及其家系成员的G6PD活性进行比较。本研究研究遵循的程序符合2013年新修订的《世界医学协会赫尔辛基宣言》要求,并与患儿监护人签署临床研究知情同意书。结果 (1)本组联合实验室诊断和(或)基因诊断的结果,最终确诊的G6PD缺乏症新生儿为124例(经G6PD活性确诊为121例,G6PD基因检测确诊为113例,二者同时确诊为110例)。(2)经G6PD活性检测确诊为G6PD缺乏症的121例患儿中,男、女性患儿分别为103、18例。这121例患儿的G6PD活性为0.42 U/g血红蛋白(Hb)(0.35~0.67 U/g Hb),显著低于其家系成员的1.17 U/g Hb(0.91~1.42 U/g Hb),男性患儿G6PD活性为0.40 U/g Hb(0.32~0.53 U/g Hb),显著低于其母亲的1.12 U/g Hb(0.91~1.28 U/g Hb),女性患儿G6PD活性为1.16 U/g Hb(0.92~1.46 U/g Hb),显著低于其父母的1.74 U/g Hb(0.69~2.80 U/g Hb),并且上述差异均有统计学意义(Z=-9.981、-10.832、-2.021,P<0.001、<0.001、=0.043)。(3)本组161例受试儿中,共计146例患儿及其185例家系成员进行G6PD基因检测的结果显示,227例(113例患儿与114例患儿家系成员)携带G6PD基因突变,其中3例为复合型突变,共计检出230个G6PD基因突变位点,前4位为1376G>T、1388G>A、95A>G、1024C>T,占77.8%(179/230)。227例G6PD基因突变携带者的祖籍为福建省、广西壮族自治区、广东省、江西省、四川省及其他地区者分别为43、39、35、34、 30与46例,其前2位G6PD基因突变位点分别为1376G>T与1388G>A,1388G>A与1376G>T,871G>A与1024C>T,1388G>A与871G>A,1024C>T与1376G>T,以及1376G>T与1388G>A。(4)本组前4位G6PD基因突变位点(1376G>T、1388G>A、95A>G、1024C>T)携带者的G6PD活性比较,差异无统计学意义(χ~2=7.642,P=0.061)。结论 G6PD活性检测和G6PD基因检测,对G6PD缺乏症患儿都具有诊断意义。G6PD缺乏症患儿及其家系成员G6PD基因突变位点分布具有地域性特点,其G6PD基因突变位点与G6PD活性无明显相关性,临床不能以该病患儿G6PD基因突变位点推测其G6PD活性。 展开更多
关键词 葡糖磷酸脱氢缺乏 新生儿筛查 葡萄糖-6-磷酸脱氢缺乏症 聚合反应 荧光定量PCR法 荧光PCR熔解曲线 地域性分布 婴儿 新生
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GSTM1、GSTT1及GSTP1(rs1695)基因多态性与乳腺癌蒽环和(或)紫杉类药物化疗血液毒性关系的研究 被引量:2
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作者 刘新兰 赵艳姣 +1 位作者 黄英 姜敏 《天津医药》 CAS 北大核心 2014年第8期741-745,共5页
目的:研究乳腺癌外周血中谷胱甘肽转硫酶(GST)M1、GSTT1和GSTP1(rs1695)基因多态性与乳腺癌患者采用蒽环类和(或)紫杉类药物化疗发生血液毒性的关系。方法应用多重PCR技术(M-PCR)和高分辨熔解曲线技术(HRM)检测3个基因在252... 目的:研究乳腺癌外周血中谷胱甘肽转硫酶(GST)M1、GSTT1和GSTP1(rs1695)基因多态性与乳腺癌患者采用蒽环类和(或)紫杉类药物化疗发生血液毒性的关系。方法应用多重PCR技术(M-PCR)和高分辨熔解曲线技术(HRM)检测3个基因在252例女性乳腺癌患者外周血中的基因多态性。结果采用紫杉类、蒽环联合紫杉类药物化疗,携带GSTP1(rs1695)AG/GG的患者是发生Ⅲ~Ⅳ度中性粒细胞减低的危险因素(OR=6.111,95%CI 1.526~24.469, P<0.05和OR=9.257,95%CI 2.903~29.522, P〈0.01),而GSTM1(+)与GSTM1(-)、GSTT1(+)与GSTT1(-)患者Ⅲ~Ⅳ度血液毒性的发生率差异均无统计学意义;采用蒽环类药物化疗,GSTM1(+)和GSTM1(-)、GSTT1(+)和GSTT1(-)、GSTP1AA和GSTP1AG/GG患者Ⅲ~Ⅳ度血液毒性发生率差异均无统计学意义(P〉0.05)。结论 GSTP1(rs1695)基因多态性可作为预测乳腺癌患者采用紫杉类药物化疗发生中性粒细胞毒性的标志。 展开更多
关键词 乳腺肿瘤 抗肿瘤联合化疗方案 谷胱甘肽转移 多态现象 遗传 聚合反应 谷胱甘肽转硫 化疗血液毒性 高分熔解曲线技术
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分子信标熔解曲线法分析SLC11A1基因插入/缺失多态性
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作者 朱玉梅 刘小立 +3 位作者 龚春梅 莫俊銮 谭春燕 周继昌 《中国卫生检验杂志》 CAS 2015年第13期2167-2170,共4页
目的针对溶质转运蛋白家族11成员1蛋白(SLC11A1)基因插入/缺失多态性位点rs17235416,建立基于荧光定量PCR(q PCR)的分子信标熔解曲线法对其进行基因分型。方法针对该位点设计特异性的引物和分子信标探针,联合应用非对称q PCR、分子信标... 目的针对溶质转运蛋白家族11成员1蛋白(SLC11A1)基因插入/缺失多态性位点rs17235416,建立基于荧光定量PCR(q PCR)的分子信标熔解曲线法对其进行基因分型。方法针对该位点设计特异性的引物和分子信标探针,联合应用非对称q PCR、分子信标探针和熔解曲线分析等技术建立分子信标熔解曲线法进行基因分型。对210份全血样本提取DNA后,用上述方法和改进的PCR-RFLP法对该位点进行检测和分型,并以测序法验证。结果 210份样本的基因型TGTG+/+、TGTG-/-和TGTG+/-分布频率分别为69.5%、4.8%和25.7%。分子信标熔解曲线法和PCR-RFLP法的分型结果与测序结果完全一致。结论国内外首次成功建立分子信标熔解曲线法检测SLC11A1基因rs17235416位点;该方法在大人群样本检测中具有简便、快速、准确等优点。 展开更多
关键词 溶质转运蛋白家族11成员1蛋白 插入/缺失多态性 分子信标 熔解曲线分析 聚合反应-限制性片段长度多态性
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胶质瘤表皮生长因子受体基因突变检测方法的对比研究
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作者 王敏 李兴涛 《检验医学与临床》 CAS 2013年第15期1930-1931,共2页
目的分析普通聚合酶链式反应(PCR)联合直接测序法与实时聚合酶链式反应-高分辨率融解(qPCR-HRM)曲线分析技术对胶质瘤表皮生长因子受体(EGFR)基因突变的检测效果。方法用普通PCR联合直接测序法与qPCR-HRM曲线分析技术检测胶质瘤患者EGF... 目的分析普通聚合酶链式反应(PCR)联合直接测序法与实时聚合酶链式反应-高分辨率融解(qPCR-HRM)曲线分析技术对胶质瘤表皮生长因子受体(EGFR)基因突变的检测效果。方法用普通PCR联合直接测序法与qPCR-HRM曲线分析技术检测胶质瘤患者EGFR基因突变类型,检测结果比较采用χ2检验。结果普通PCR联合直接测序法与qPCR-HRM曲线分析技术对胶质瘤患者肿瘤组织EGFR突变的检测结果一致性较高,达90.91%,两者间差异无统计学意义(P>0.05)。结论 qPCR-HRM曲线分析技术操作较普通PCR联合直接测序法简便,实验时间较短,降低了交叉污染的风险,通过HRM曲线分析检测结果可以实现对样品基因型的判定。 展开更多
关键词 普通聚合反应联合直接测序法 实时聚合反应-高分辨率融解曲线分析技术 胶质瘤 表皮生长因子受体 突变
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直接测序法和qPCR-HRM法检测NSCLC组织EGFR突变的比较研究 被引量:2
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作者 王海 李芳琼 +1 位作者 杨悦 崔大伟 《中华全科医学》 2015年第2期271-272,340,共3页
目的比较直接测序法和实时聚合酶链反应-高分辨率融解曲线技术(q PCR-HRM)检测非小细胞肺癌(NSCLC)表皮生长因子受体(EGFR)基因突变的差异,探讨适用于临床检测EGFR基因突变的方法,为NSCLC患者的靶向治疗提供理论依据。方法共收集NSCLC... 目的比较直接测序法和实时聚合酶链反应-高分辨率融解曲线技术(q PCR-HRM)检测非小细胞肺癌(NSCLC)表皮生长因子受体(EGFR)基因突变的差异,探讨适用于临床检测EGFR基因突变的方法,为NSCLC患者的靶向治疗提供理论依据。方法共收集NSCLC患者组织标本52例,分别采用q PCR-HRM法和直接测序法进行EGFR基因突变检测,采用χ2检验对检测结果进行统计学比较。结果 52例NSCLC患者组织标本中,直接测序法检测的EGFR基因突变率为30.8%(16/52),q PCR-HRM法检测的EGFR基因突变率为32.7%(17/52),两种方法检测结果相比较,差异无统计学意义(χ2=0.04,P>0.05)。结论与直接测序法相比较,q PCR-HRM法是一种操作简便、费用低、速度快、灵敏度高的检测方法,对于临床筛选适合EGFR-TKI治疗的NSCLC患者亚群,预测EGFR-TKI疗效都具有重要意义,值得临床进一步推广应用。 展开更多
关键词 表皮生长因子受体 基因突变 实时聚合反应-高分辨率融解曲线技术
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qPCR-HRM法检测NSCLC患者外周血中EGFR突变 被引量:1
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作者 王海 崔大伟 杨悦 《中国卫生检验杂志》 北大核心 2014年第9期1300-1302,共3页
目的比较直接测序法和实时聚合酶链反应-高分辨率融解曲线技术(qPCR-HRM)检测非小细胞肺癌(NSCLC)表皮生长因子受体(EGFR)基因突变的差异,探讨适用于临床的EGFR基因突变检测方法。方法 52例NSCLC患者外周血中EGFR突变采用qPCR-HRM法,其... 目的比较直接测序法和实时聚合酶链反应-高分辨率融解曲线技术(qPCR-HRM)检测非小细胞肺癌(NSCLC)表皮生长因子受体(EGFR)基因突变的差异,探讨适用于临床的EGFR基因突变检测方法。方法 52例NSCLC患者外周血中EGFR突变采用qPCR-HRM法,其组织标本中EGFR突变采用直接测序法,采用卡方检验比较检测结果。结果 qPCR-HRM法检测外周血中EGFR突变率为34.6%(18/52),直接测序法检测的组织标本中突变率为30.8%(16/52),结果差异无统计学意义(χ2=0.17,P>0.05);2种方法的总符合率为96.2%(50/52)。结论与直接测序法相比,qPCR-HRM法检测NSCLC患者外周血中EGFR突变更适用于临床筛选适合EGFR酪氨酸激酶抑制剂(EGFR-TKI)治疗的NSCLC患者。 展开更多
关键词 表皮生长因子受体 非小细胞肺癌 基因突变 实时聚合反应-高分辨率融解曲线技术
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钙网蛋白基因突变检测技术及临床应用选择 被引量:3
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作者 裴雨晴 王斐 崔巍 《中华检验医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第11期782-785,共4页
钙网蛋白基因(CALR)突变的发现有助于诊断JAK2/MPL突变阴性的骨髓增生性肿瘤(MPN),并与疾病进展、患者预后等关系密切。利用Sanger测序、PCR一片段分析、高分辨率熔解曲线、实时荧光定量PCR以及新一代测序等技术可进行CALR基因突... 钙网蛋白基因(CALR)突变的发现有助于诊断JAK2/MPL突变阴性的骨髓增生性肿瘤(MPN),并与疾病进展、患者预后等关系密切。利用Sanger测序、PCR一片段分析、高分辨率熔解曲线、实时荧光定量PCR以及新一代测序等技术可进行CALR基因突变的检测。选择合适的突变检测技术并遵循相关分子标志物的实验室诊断思路有利于MPN快速有效的诊治。 展开更多
关键词 骨髓增殖性疾病 钙网蛋白 突变 聚合反应 高分辨率熔解曲线 序列分析 DNA
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