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尾叶桉GLU4无性系肉桂酰乙醇脱氢酶基因克隆及序列分析
被引量:
5
1
作者
陈博雯
蒋华
+1 位作者
覃鹏飞
姜伟
《西部林业科学》
CAS
北大核心
2014年第2期19-24,共6页
根据植物中CAD基因保守序列设计引物,以尾叶桉GLU4嫩茎为材料克隆到其CAD基因,命名为EuCAD。序列分析结果表明,该基因gDNA长2 200 bp,cDNA长1 102 bp,开放阅读区编码356个氨基酸。EuCAD编码的蛋白质序列分析显示,序列中具有完整CAD1保...
根据植物中CAD基因保守序列设计引物,以尾叶桉GLU4嫩茎为材料克隆到其CAD基因,命名为EuCAD。序列分析结果表明,该基因gDNA长2 200 bp,cDNA长1 102 bp,开放阅读区编码356个氨基酸。EuCAD编码的蛋白质序列分析显示,序列中具有完整CAD1保守结构域,并包含NADP结合位点以及2个Zn结合位点。同源性分析结果显示,EuCAD核酸序列与其他5种桉属植物CAD基因同源性达到97%以上,EuCAD编码蛋白与碧桃等植物中CAD蛋白同源性也在79%以上。对EuCAD编码蛋白进行理化性质及结构的生物信息学分析结果显示,该蛋白为一种无信号肽、无跨膜区的酸性蛋白质,二级结构包含典型的α-螺旋和β-折叠,三级结构同源建模显示与拟南芥的AtCAD4同源性极高。系统进化树分析结果显示,该蛋白与桉属、杨属植物亲缘关系较近,与杉科植物较远。
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关键词
尾叶桉
肉桂酰乙醇脱氢酶
木质素合成
基因克隆
序列
生物信息学分析
下载PDF
职称材料
EuCAD基因小片段RNAi对烟草木质素合成的影响
被引量:
3
2
作者
陈博雯
肖玉菲
+4 位作者
李军集
张烨
覃子海
张晓宁
刘海龙
《广东农业科学》
CAS
2020年第6期1-7,共7页
【目的】深入研究尾叶桉(Eucalyptus urophylla)肉桂酰乙醇脱氢酶(CAD)基因序列中的关键片段并利用其进行木质素合成调控。【方法】采用生物信息学工具对EuCAD基因进行序列分析,根据编码蛋白保守结构域的分布情况进行筛选,获得一段44 b...
【目的】深入研究尾叶桉(Eucalyptus urophylla)肉桂酰乙醇脱氢酶(CAD)基因序列中的关键片段并利用其进行木质素合成调控。【方法】采用生物信息学工具对EuCAD基因进行序列分析,根据编码蛋白保守结构域的分布情况进行筛选,获得一段44 bp关键序列用于构建RNA干扰载体并转化烟草,获得转基因植株并对基因表达水平、木质素含量等表型进行检测。【结果】获得28个转基因株系,转基因植株正常生长发育,与野生型无异,随机挑选3个株系进行检测,发现CAD基因表达水平均较野生型显著降低,以R1株系降幅最大,降至野生型的12.51%。对R1株系进一步检测发现,其茎部直径与野生型无异,但木质部厚度较野生型显著降低,其中第4节处降低11.75%,第6节处降低10.06%,茎部整体木质素含量较野生型降低15.26%。表明该RNAi片段显著抑制烟草中CAD基因表达并影响烟草木质素合成。【结论】通过序列分析筛选出的EuCAD基因小片段,可通过RNA干扰显著影响烟草木质素合成,为尾叶桉木质素合成调控研究提供了技术参考。
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关键词
肉桂酰乙醇脱氢酶
RNA干扰片段
木质素合成
烟草转化
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职称材料
EuCAD基因不同位置片段RNAi对烟草木质素合成的调控效果
3
作者
陈博雯
肖玉菲
+4 位作者
李军集
张烨
覃子海
张晓宁
刘海龙
《贵州农业科学》
CAS
2020年第9期22-26,共5页
为尾叶桉GLU4无性系(Eucalyptus urophylla clone GLU4)肉桂酰乙醇脱氢酶基因(EuCAD)调控其木质素的合成提供技术参考,以模式植物烟草为试验材料,采用生物信息学技术分析其EuCAD基因序列,根据保守结构域的分布情况选择EuCAD基因不同位置...
为尾叶桉GLU4无性系(Eucalyptus urophylla clone GLU4)肉桂酰乙醇脱氢酶基因(EuCAD)调控其木质素的合成提供技术参考,以模式植物烟草为试验材料,采用生物信息学技术分析其EuCAD基因序列,根据保守结构域的分布情况选择EuCAD基因不同位置的4个片段(S1、S2、S3和S4)分别构建RNA干扰载体并转化烟草后获得转基因烟草植株(pS1、pS2、pS3和pS4),检测分析转基因烟草植株中CAD基因表达水平、茎部解剖结构、木质素及纤维素的含量变化。结果表明:S1和S2片段对木质素的调控效果最明显,其转基因烟草植株pS1和pS2的基因表达水平分别较野生型降低87.48%和87.30%,木质素含量较野生型降低15.26%和11.44%;S3和S4片段的调控效果较差,pS3和pS4多项表型检测结果与野生型相比降幅较小或无差异。
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关键词
肉桂酰乙醇脱氢酶
基因
RNA干扰
木质素合成
烟草转化
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职称材料
题名
尾叶桉GLU4无性系肉桂酰乙醇脱氢酶基因克隆及序列分析
被引量:
5
1
作者
陈博雯
蒋华
覃鹏飞
姜伟
机构
广西优良用材林资源培育重点实验室
广西国有维都林场
广西国有大桂山林场
广西大学生命科学与技术学院
出处
《西部林业科学》
CAS
北大核心
2014年第2期19-24,共6页
基金
广西优良用材林资源培育重点实验室开放课题基金项目(12A0302)
国家自然科学基金项目(31100473)
文摘
根据植物中CAD基因保守序列设计引物,以尾叶桉GLU4嫩茎为材料克隆到其CAD基因,命名为EuCAD。序列分析结果表明,该基因gDNA长2 200 bp,cDNA长1 102 bp,开放阅读区编码356个氨基酸。EuCAD编码的蛋白质序列分析显示,序列中具有完整CAD1保守结构域,并包含NADP结合位点以及2个Zn结合位点。同源性分析结果显示,EuCAD核酸序列与其他5种桉属植物CAD基因同源性达到97%以上,EuCAD编码蛋白与碧桃等植物中CAD蛋白同源性也在79%以上。对EuCAD编码蛋白进行理化性质及结构的生物信息学分析结果显示,该蛋白为一种无信号肽、无跨膜区的酸性蛋白质,二级结构包含典型的α-螺旋和β-折叠,三级结构同源建模显示与拟南芥的AtCAD4同源性极高。系统进化树分析结果显示,该蛋白与桉属、杨属植物亲缘关系较近,与杉科植物较远。
关键词
尾叶桉
肉桂酰乙醇脱氢酶
木质素合成
基因克隆
序列
生物信息学分析
Keywords
Eucalyptus urophylla
cinnamyl alcohol dehydrogenase
lignin biosynthesis
gene cloning
sequence
bioinformatics analysis
分类号
S792.39 [农业科学—林木遗传育种]
下载PDF
职称材料
题名
EuCAD基因小片段RNAi对烟草木质素合成的影响
被引量:
3
2
作者
陈博雯
肖玉菲
李军集
张烨
覃子海
张晓宁
刘海龙
机构
广西壮族自治区林业科学研究院/国家林业和草原局中南速生材繁育实验室/广西优良用材林资源培育重点实验室
出处
《广东农业科学》
CAS
2020年第6期1-7,共7页
基金
广西林业科技项目(桂林科字〔2016〕第11号)
广西科技基地和人才专项(桂科AD18281086)。
文摘
【目的】深入研究尾叶桉(Eucalyptus urophylla)肉桂酰乙醇脱氢酶(CAD)基因序列中的关键片段并利用其进行木质素合成调控。【方法】采用生物信息学工具对EuCAD基因进行序列分析,根据编码蛋白保守结构域的分布情况进行筛选,获得一段44 bp关键序列用于构建RNA干扰载体并转化烟草,获得转基因植株并对基因表达水平、木质素含量等表型进行检测。【结果】获得28个转基因株系,转基因植株正常生长发育,与野生型无异,随机挑选3个株系进行检测,发现CAD基因表达水平均较野生型显著降低,以R1株系降幅最大,降至野生型的12.51%。对R1株系进一步检测发现,其茎部直径与野生型无异,但木质部厚度较野生型显著降低,其中第4节处降低11.75%,第6节处降低10.06%,茎部整体木质素含量较野生型降低15.26%。表明该RNAi片段显著抑制烟草中CAD基因表达并影响烟草木质素合成。【结论】通过序列分析筛选出的EuCAD基因小片段,可通过RNA干扰显著影响烟草木质素合成,为尾叶桉木质素合成调控研究提供了技术参考。
关键词
肉桂酰乙醇脱氢酶
RNA干扰片段
木质素合成
烟草转化
Keywords
cinnamoyl alcohol dehydrogenase
RNA interference fragment
lignin synthesis
tobacco transformation
分类号
S792.39 [农业科学—林木遗传育种]
S572 [农业科学—烟草工业]
下载PDF
职称材料
题名
EuCAD基因不同位置片段RNAi对烟草木质素合成的调控效果
3
作者
陈博雯
肖玉菲
李军集
张烨
覃子海
张晓宁
刘海龙
机构
广西壮族自治区林业科学研究院国家林业局中南速生材繁育实验室/广西优良用材林资源培育重点实验室
出处
《贵州农业科学》
CAS
2020年第9期22-26,共5页
基金
广西林业科技项目“木质素合成调控高效RNA干扰片段筛选”[桂林科字(2016)第11号]
广西科技基地和人才专项项目“转基因手段培育桉树纸浆材新品种研究创新创业青年人才培养示范”(桂科AD18281086)。
文摘
为尾叶桉GLU4无性系(Eucalyptus urophylla clone GLU4)肉桂酰乙醇脱氢酶基因(EuCAD)调控其木质素的合成提供技术参考,以模式植物烟草为试验材料,采用生物信息学技术分析其EuCAD基因序列,根据保守结构域的分布情况选择EuCAD基因不同位置的4个片段(S1、S2、S3和S4)分别构建RNA干扰载体并转化烟草后获得转基因烟草植株(pS1、pS2、pS3和pS4),检测分析转基因烟草植株中CAD基因表达水平、茎部解剖结构、木质素及纤维素的含量变化。结果表明:S1和S2片段对木质素的调控效果最明显,其转基因烟草植株pS1和pS2的基因表达水平分别较野生型降低87.48%和87.30%,木质素含量较野生型降低15.26%和11.44%;S3和S4片段的调控效果较差,pS3和pS4多项表型检测结果与野生型相比降幅较小或无差异。
关键词
肉桂酰乙醇脱氢酶
基因
RNA干扰
木质素合成
烟草转化
Keywords
cinnamoyl alcohol dehydrogenase gene
RNA interference
lignin synthesis
tobacco transformation
分类号
S792.39 [农业科学—林木遗传育种]
Q943.2 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
尾叶桉GLU4无性系肉桂酰乙醇脱氢酶基因克隆及序列分析
陈博雯
蒋华
覃鹏飞
姜伟
《西部林业科学》
CAS
北大核心
2014
5
下载PDF
职称材料
2
EuCAD基因小片段RNAi对烟草木质素合成的影响
陈博雯
肖玉菲
李军集
张烨
覃子海
张晓宁
刘海龙
《广东农业科学》
CAS
2020
3
下载PDF
职称材料
3
EuCAD基因不同位置片段RNAi对烟草木质素合成的调控效果
陈博雯
肖玉菲
李军集
张烨
覃子海
张晓宁
刘海龙
《贵州农业科学》
CAS
2020
0
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职称材料
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