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石榴肉桂酰辅酶A还原酶基因的克隆与表达分析 被引量:13
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作者 董丽丽 龚凌燕 +2 位作者 陈磊 涂佳丽 张水明 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第5期747-753,共7页
[目的]肉桂酰辅酶A还原酶(CCR)是木质素合成的关键酶。本文旨在通过克隆和鉴定石榴CCR基因(Pg CCR)来探究石榴木质素的合成机制以及培育软籽石榴新品种。[方法]以石榴品种‘红玉石籽’(Punica granatum‘Hongyushizi’)籽粒为材料... [目的]肉桂酰辅酶A还原酶(CCR)是木质素合成的关键酶。本文旨在通过克隆和鉴定石榴CCR基因(Pg CCR)来探究石榴木质素的合成机制以及培育软籽石榴新品种。[方法]以石榴品种‘红玉石籽’(Punica granatum‘Hongyushizi’)籽粒为材料,利用RACE和RT-PCR的方法,获得Pg CCR基因的全长序列。通过实时荧光定量PCR分析Pg CCR基因在不同品种、不同组织、籽粒不同发育时期的表达水平。[结果]Pg CCR基因c DNA全长序列1 017 bp,编码338个氨基酸,包含被认为是CCR蛋白催化位点的保守序列KNWYCYGK。系统进化树分析表明,Pg CCR与其他物种起源相同,而与葡萄Vv CCR的亲缘关系最近。Pg CCR基因在不同品种的石榴籽粒中均有表达,其中‘红玉石籽’中表达较高,‘会理软籽’和‘突尼斯软籽’中表达量较低。Pg CCR在叶、花、茎中均有表达,茎中的表达量最高,而叶片中的表达量最低。Pg CCR在‘红玉石籽’籽粒的不同时期均有表达,20-80 d相对表达量逐步上升,并在80 d时达到峰值,80 d以后表达量逐渐下降。[结论]克隆得到石榴CCR基因,其表达水平与木质素的合成及含量有一定相关性。 展开更多
关键词 石榴 肉桂酰辅酶a还原酶基因(CCR) 基因克隆 表达分析
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苎麻肉桂酰辅酶A还原酶基因cDNA序列的克隆与分析 被引量:11
2
作者 唐映红 陈建荣 +3 位作者 刘芳 袁有美 郭清泉 昌洪涛 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第9期1324-1332,共9页
根据苎麻转录组测序信息,利用RACE法克隆出2个肉桂酰辅酶A还原酶基因全长cDNA序列,对其进行生物信息学分析,并利用荧光定量技术对苎麻快速生长期、成熟期和成熟后期该基因在木质部和韧皮部的表达模式进行研究。结果表明,BnCCR1全长1056 ... 根据苎麻转录组测序信息,利用RACE法克隆出2个肉桂酰辅酶A还原酶基因全长cDNA序列,对其进行生物信息学分析,并利用荧光定量技术对苎麻快速生长期、成熟期和成熟后期该基因在木质部和韧皮部的表达模式进行研究。结果表明,BnCCR1全长1056 bp,编码277个氨基酸,Blast比对BnCCR1基因与白桦、蓖麻CCR基因核苷酸序列相似性均为70%,推测的氨基酸与蓖麻CCR基因氨基酸序列相似度为77%,蛋白质预测显示其N端存在一个3 Beta-HSD/Epimerase/NAD-binding-10的保守域;BnCCR2基因全长1291 bp,编码248个氨基酸,Blast比对BnCCR2基因与毛果杨CCR基因核苷酸序列相似度为74%,推测的氨基酸与蓖麻、毛果杨CCR基因氨基酸序列相似度均为81%,蛋白质预测显示其N端存在一个3 Beta-HSD/Epimerase/NAD-binding-4的保守域;BnCCR1和BnCCR2基因编码蛋白三维模型与矮牵牛CCR基因相似度分别达30.68%、44.77%,建模结果可靠;荧光定量结果显示BnCCR1和BnCCR2基因具有时期表达差异性,不具有组织表达差异,但不同组织表达量具有差异。推测BnCCR1和BnCCR2基因是存在于苎麻木质素代谢中的两种CCR基因。 展开更多
关键词 苎麻 肉桂酰辅酶a还原酶基因 木质素 组织表达
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马尾松肉桂酰辅酶A还原酶基因(CCR)克隆及分析(英文) 被引量:9
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作者 陈碧华 《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2009年第12期46-53,共8页
对马尾松肉桂酰辅酶A还原酶基因(CCR)进行扩增、克隆和测序(GenBank登录号:EU753854)。应用MEGA4.0.2软件对不同树种CCR基因的核苷酸和氨基酸序列进行比对,结果表明:马尾松CCR基因的外显子和内含子数目与火炬松、杨树、银合欢、光皮桦... 对马尾松肉桂酰辅酶A还原酶基因(CCR)进行扩增、克隆和测序(GenBank登录号:EU753854)。应用MEGA4.0.2软件对不同树种CCR基因的核苷酸和氨基酸序列进行比对,结果表明:马尾松CCR基因的外显子和内含子数目与火炬松、杨树、银合欢、光皮桦、冈尼桉、柳桉、蓝桉的外显子和内含子数目相同,都有5个外显子和4个内含子。马尾松CCR基因编码区975bp,编码324个氨基酸。马尾松外显子Ⅰ,Ⅱ,Ⅲ,Ⅳ,V分别为133,155,186,353,148bp,而内含子Ⅰ,Ⅱ,Ⅲ,Ⅳ分别为1450,216,737,941bp。马尾松CCR外显子和内含子连接处序列除内含子Ⅱ/外显子Ⅲ出现GTPuGG/外显子Ⅲ,其余遵循外显子/GTPuAG/外显子组成规律。马尾松外显子Ⅱ,Ⅲ,Ⅳ核苷酸数目与桉属、杨属、桦木属和松属树种相同,但外显子Ⅰ和外显子Ⅴ不尽相同。比对的树种间在该基因编码区核苷酸序列和氨基酸序列上相对保守,也存在一定差异。马尾松与火炬松、光皮桦、银合欢、杨树、冈尼桉、柳桉、蓝桉各物种间编码区核苷酸序列相似性大小分别为99.2%,67.8%,68.0%,68.9%,69.5%,69.3%,69.9%,而相应的氨基酸序列间相似性大小分别为99.1%,73.5%,72.5%,74.4%,75.0%,74.4%,75.0%。马尾松与其他13个树种CCR序列构建的系统进化树表明:3个针叶树种形成1个独立分支,而且最早进化。 展开更多
关键词 马尾松 肉桂酰辅酶a还原酶基因(CCR) 克隆 序列分析 系统进化树
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芹菜肉桂酰辅酶A还原酶基因的克隆与表达分析 被引量:7
4
作者 吴蓓 李梦瑶 +2 位作者 王广龙 黄蔚 熊爱生 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第6期907-914,共8页
[目的]肉桂酰辅酶A还原酶CCR(cinnamoyl-Co A reductase)在植物木质素代谢中起重要的作用,能够将羟基肉桂酸还原生成肉桂醛。本文目的是研究不同芹菜中肉桂酰辅酶A还原酶基因AgCCR在芹菜中组织表达和非生物胁迫过程中的响应情况。[方法]... [目的]肉桂酰辅酶A还原酶CCR(cinnamoyl-Co A reductase)在植物木质素代谢中起重要的作用,能够将羟基肉桂酸还原生成肉桂醛。本文目的是研究不同芹菜中肉桂酰辅酶A还原酶基因AgCCR在芹菜中组织表达和非生物胁迫过程中的响应情况。[方法]以2个芹菜品种‘六合黄心芹’和‘文图拉’为材料,分别克隆出编码肉桂酰辅酶A还原酶的基因AgCCR。利用荧光定量PCR分析不同芹菜组织和2种芹菜在高温、低温、干旱和盐胁迫下AgCCR的表达情况。[结果]序列分析表明,‘六合黄心芹’和‘文图拉’中AgCCR基因均含有1个长度为1 014 bp的开放阅读框,编码337个氨基酸,二者的核苷酸位点有3个位点的差异,编码的氨基酸有1个位点的差异。对2个芹菜中的AgCCR基因进行多重比对并绘制进化树,发现其编码的氨基酸序列与其他15种植物的CCR蛋白同源性较高,氨基酸高度保守。荧光定量PCR(qRT-PCR)分析表明,芹菜AgCCR基因在‘六合黄心芹’和‘文图拉’叶中的表达水平较高,AgCCR基因在高温和低温下表达上调,在干旱处理下表达下调。[结论]芹菜AgCCR基因对多种非生物胁迫均有响应。特别是低温下该基因响应明显,表明AgCCR基因或许与芹菜抗寒机制相关。 展开更多
关键词 芹菜 肉桂酰辅酶a还原酶基因 序列分析 非生物胁迫 基因表达
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茶树‘紫娟’肉桂酰辅酶A还原酶基因(CCR)克隆及序列分析 被引量:6
5
作者 陈林波 宋维希 +4 位作者 李晓霞 夏丽飞 周萌 梁名志 焉文光 《西北农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第1期80-85,共6页
通过克隆茶树肉桂酰辅酶A还原酶基因(CCR)的cDNA序列,为研究其蛋白结构和功能奠定基础。对利用cDNA-AFLP技术获得的‘紫娟’茶树成熟叶片上调的差异表达片段TDF,设计特异引物,利用RACE末端扩增技术,分别扩增出5′端和3′端目的片段,测... 通过克隆茶树肉桂酰辅酶A还原酶基因(CCR)的cDNA序列,为研究其蛋白结构和功能奠定基础。对利用cDNA-AFLP技术获得的‘紫娟’茶树成熟叶片上调的差异表达片段TDF,设计特异引物,利用RACE末端扩增技术,分别扩增出5′端和3′端目的片段,测序后进行拼接获得茶树肉桂酰辅酶A还原酶基因(CCR)cDNA全长序列,并进行序列分析。结果表明:克隆的茶树CsCCR基因cDNA全长1 259bp(GenBank登录号为KJ995737),其中开放阅读框957bp。同源比对发现,与蓖麻、丹参、草莓、番茄的CCR蛋白同源性分别为67%、68%、69%和70%。 展开更多
关键词 茶树 肉桂辅酶a还原酶 基因克隆 序列分析
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青花菜肉桂酰辅酶A还原酶基因的克隆与表达特征分析 被引量:6
6
作者 李小艳 裴徐梨 +1 位作者 荆赞革 唐征 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2016年第11期2199-2203,共5页
为研究肉桂酰辅酶A还原酶在青花菜生长发育中的作用,采用RT-PCR技术克隆青花菜Bo CCR基因全长c DNA序列,并利用q RT-PCR检测其在不同器官中的表达模式。结果表明:Bo CCR基因开放阅读框为987 bp,推导编码328个氨基酸。预测蛋白分子量为36... 为研究肉桂酰辅酶A还原酶在青花菜生长发育中的作用,采用RT-PCR技术克隆青花菜Bo CCR基因全长c DNA序列,并利用q RT-PCR检测其在不同器官中的表达模式。结果表明:Bo CCR基因开放阅读框为987 bp,推导编码328个氨基酸。预测蛋白分子量为36.86 ku,PI值为6.04。该蛋白亲水性氨基酸多于疏水性氨基酸,为亲水性蛋白。高级结构预测表明青花菜Bo CCR蛋白具有完整的二级结构,三级结构的α-螺旋主要位于外部,β-折叠位于内部。分子进化分析显示CCR蛋白在植物进化过程中,各属形成单独的分枝,可以区分其亲缘关系。荧光定量技术检测到青花菜的Bo CCR基因在花蕾发育早期表达最高,推测该基因可能与青花菜花粉发育相关。 展开更多
关键词 青花菜 肉桂辅酶a还原酶 基因克隆 表达分析
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小麦中两个肉桂酰辅酶A还原酶基因的分离和表达分析(英文) 被引量:4
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作者 蔺占兵 马庆虎 麻密 《Acta Botanica Sinica》 CSCD 2001年第10期1043-1046,共4页
肉桂酰辅酶A还原酶 (CCR)负责催化木质素单体生物合成中最重要的代谢反应 ,它将类苯丙酸类代谢物转移到木质素的合成途径中。为了更好地了解木质素在小麦生长发育中的作用 ,从小麦 (TriticumaestivumL .cv .H4 5 64)中克隆了两个肉桂酰... 肉桂酰辅酶A还原酶 (CCR)负责催化木质素单体生物合成中最重要的代谢反应 ,它将类苯丙酸类代谢物转移到木质素的合成途径中。为了更好地了解木质素在小麦生长发育中的作用 ,从小麦 (TriticumaestivumL .cv .H4 5 64)中克隆了两个肉桂酰辅酶A还原酶的cDNA。相似性和进化关系的分析表明这两个cDNA片段分别属于不同的肉桂酰辅酶A还原酶 ,这两个cDNA片段分别命名为W_cr6和W_cr19。RT_PCR和Northern杂交结果证明 ,W_cr6基因主要在小麦的茎和叶中表达 ,W_cr19基因主要在根和茎中表达。上述结果表明在小麦的基因组中至少存在两类肉桂酰辅酶A还原酶基因。 展开更多
关键词 小麦 CDNA克隆 肉桂辅酶a还原酶 木质素 基因分离
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植物肉桂酰辅酶A还原酶基因的结构功能及应用潜力 被引量:14
8
作者 李魏 谭晓风 陈鸿鹏 《经济林研究》 2009年第1期7-12,共6页
木质素的合成途径非常复杂,肉桂酰辅酶A还原酶(cinnamoyl-CoA reductase,CCR)是木质素合成特异途径的第1个关键酶,可催化3种羟基肉桂酸的辅酶A酯的还原反应,生成相应的肉桂醛。主要综述了肉桂酰辅酶A还原酶基因在木质素合成中的功能、... 木质素的合成途径非常复杂,肉桂酰辅酶A还原酶(cinnamoyl-CoA reductase,CCR)是木质素合成特异途径的第1个关键酶,可催化3种羟基肉桂酸的辅酶A酯的还原反应,生成相应的肉桂醛。主要综述了肉桂酰辅酶A还原酶基因在木质素合成中的功能、基本结构方面的研究进展,并介绍了该基因在造纸林木改育、作物品质改良、植物抗病抗逆及生物质能等方面研究中的应用。 展开更多
关键词 分子生物学 木质素 肉桂辅酶a还原酶 功能 结构 应用潜力
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毛竹肉桂酰辅酶A还原酶基因PeCCR功能初步研究 被引量:2
9
作者 徐浩 杨克彬 +2 位作者 朱成磊 李英 高志民 《林业科学研究》 CSCD 北大核心 2020年第2期77-84,共8页
[目的]为研究肉桂酰辅酶A还原酶(CCR)基因表达对竹子木质素生物合成的影响,对毛竹(Phyllostachys edulis (Carrière) J. Houz.)中PeCCR基因的表达情况进行分析,并对PeCCR基因功能进行研究,以期为利用CCR基因在竹子中开展基因工程... [目的]为研究肉桂酰辅酶A还原酶(CCR)基因表达对竹子木质素生物合成的影响,对毛竹(Phyllostachys edulis (Carrière) J. Houz.)中PeCCR基因的表达情况进行分析,并对PeCCR基因功能进行研究,以期为利用CCR基因在竹子中开展基因工程育种提供参考依据。[方法]采用实时定量PCR(qRT-PCR)方法对PeCCR基因在毛竹不同组织以及不同高度笋中的表达进行了分析,采用RT-PCR方法克隆了PeCCR基因的编码区,构建了基因过量表达载体,采用蘸花法转化拟南芥(Arabidopsis thaliana L.),采用溴乙酰法测定转基因植株茎木质素的含量。[结果]qRT-PCR结果表明:在毛竹实生苗根中PeCCR的表达量最高,其次是笋中,而未展开叶中最低;在野外随着笋高度的增加,木质化程度加强,PeCCR基因的表达量呈上升趋势,在6.7 m笋中达到最高。克隆获得PeCCR编码区长度为1 026 bp,编码一个341 aa的蛋白,具有家族蛋白特有的保守结构域"NWYCYGK"。与野生型拟南芥相比,转PeCCR基因植株叶片明显增大,且抽苔时间提前3~4 d。茎横切的组织化学染色观察发现:转基因植株茎的木质部和束间纤维组织染色面积均大于野生型;木质素含量测定表明,2个过表达PeCCR1转基因株系中的木质素含量均明显高于野生型,分别为野生型对照的123.1%和116.7%。[结论]PeCCR基因在毛竹不同组织的表达存在差异,在笋中随高度增加其表达量上调。过量表达PeCCR促进了转基因拟南芥植株的生长发育,提高了木质素含量。 展开更多
关键词 毛竹 肉桂酰辅酶a还原酶基因 表达分析 木质素
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西南桦肉桂酰辅酶A还原酶基因的克隆与表达分析 被引量:2
10
作者 李云琴 金智伟 +3 位作者 严毅 原晓龙 王毅 张劲峰 《西部林业科学》 CAS 北大核心 2020年第5期18-22,29,共6页
为研究肉桂酰辅酶A还原酶基因(CCR)在西南桦木质素合成中的作用机制,采用RT-PCR技术从西南桦中克隆得到1个具完整开放阅读框的肉桂酰CoA还原酶基因(BaCCR),该基因全长975 bp,编码324个氨基酸。序列比对分析显示西南桦CCR蛋白序列与胡桃... 为研究肉桂酰辅酶A还原酶基因(CCR)在西南桦木质素合成中的作用机制,采用RT-PCR技术从西南桦中克隆得到1个具完整开放阅读框的肉桂酰CoA还原酶基因(BaCCR),该基因全长975 bp,编码324个氨基酸。序列比对分析显示西南桦CCR蛋白序列与胡桃、欧洲栓皮栎、梅、甜樱桃的蛋白序列相似性均在80%以上。BaCCR拥有CCR蛋白的NADP结合域和底物结合域KNWYCYGK。进化分析表明,BaCCR与梅、甜樱桃、亚洲棉、葡萄聚为一个枝系。转录模式分析表明,BaCCR基因在根和小枝中高量表达。 展开更多
关键词 西南桦 肉桂辅酶a还原酶 基因克隆 基因表达
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秀珍菇3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶基因的克隆及表达分析
11
作者 周小华 林佳瑶 陆娜 《中国食用菌》 2024年第1期61-66,共6页
为获得秀珍菇3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶(HMGR)全长基因,并分析该基因在秀珍菇正常状态及热胁迫处理下的表达差异,对秀珍菇进行RNA测序(RNA-seq),经生物信息学分析筛选获得HMGR全长基因(命名为Pphg1),并利用荧光定量PCR(qRT-PCR)... 为获得秀珍菇3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶(HMGR)全长基因,并分析该基因在秀珍菇正常状态及热胁迫处理下的表达差异,对秀珍菇进行RNA测序(RNA-seq),经生物信息学分析筛选获得HMGR全长基因(命名为Pphg1),并利用荧光定量PCR(qRT-PCR)的方法,分析该基因在秀珍菇不同温度处理下的表达情况。结果表明,获得的Pphg1全长由4059个核苷酸组成,编码1352个氨基酸,其蛋白分子质量约144.04 kDa。经qRT-PCR检测,该基因在秀珍菇受热胁迫后表达量升高。本研究中首次克隆并获得秀珍菇HMGR基因全长cDNA,推测其与秀珍菇热胁迫应答相关,为阐明秀珍菇体内次生代谢产物合成的分子机制及其分子育种提供科学依据。 展开更多
关键词 秀珍菇 克隆 RT-PCR 3-羟基-3-甲基戊二辅酶a还原酶基因
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水稻肉桂酰辅酶A还原酶基因的克隆与表达分析 被引量:9
12
作者 白勇 巩威 +1 位作者 刘天昀 朱玉贤 《科学通报》 EI CAS CSCD 北大核心 2003年第16期1780-1784,共5页
用现有的OsCCR基因片段筛选水稻核DNA文库,获得了长为3045 bp的核DNA.它包含4个内含子和5个外显子,推测的可读框长为337个氨基酸.OsCCR与其他植物中同类酶在氨基酸水平上有70%的相似性和30%的相同性,含有保守的辅酶Ⅱ(NADP)结合位点... 用现有的OsCCR基因片段筛选水稻核DNA文库,获得了长为3045 bp的核DNA.它包含4个内含子和5个外显子,推测的可读框长为337个氨基酸.OsCCR与其他植物中同类酶在氨基酸水平上有70%的相似性和30%的相同性,含有保守的辅酶Ⅱ(NADP)结合位点及可能为该酶催化位点的特征序列.Northern杂交证实,该基因产物广泛存在于水稻根、茎和叶等各组织中,在茎中表达量较高.组织原位杂交结果表明,OsCCR基因在维管束及新生侧根中有强烈的表达信号,与该基因编码的酶的木质素合成特性相吻合.OsCCR基因的克隆、组织定位及生物化学方面的研究将有助于深入了解木质素形成的分子机理,并为通过遗传工程的手段改善植物的机械性能以获得低木质素纸浆原料打下基础. 展开更多
关键词 水稻 肉桂辅酶a还原酶 克隆 基因表达 维管束
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植物肉桂酰辅酶A还原酶(CCR)基因的研究进展 被引量:36
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作者 李波 梁颖 柴友荣 《分子植物育种》 CAS CSCD 2006年第z1期55-65,共11页
植物体内通过公共苯丙烷途径而进入木质素特异途径来合成木质素,这条代谢途径涉及到许多酶的参与,其中肉桂酰辅酶A还原酶(cinnamoyl-CoAreductase,CCR)是木质素特异途径的第一个关键酶,可催化3种羟基肉桂酸的CoA酯的还原反应,生成相应... 植物体内通过公共苯丙烷途径而进入木质素特异途径来合成木质素,这条代谢途径涉及到许多酶的参与,其中肉桂酰辅酶A还原酶(cinnamoyl-CoAreductase,CCR)是木质素特异途径的第一个关键酶,可催化3种羟基肉桂酸的CoA酯的还原反应,生成相应的肉桂醛。因此人们认为此酶可能对木质素合成途径的碳流具有潜在的调控作用,对木质素单体的生物合成起着重要作用。本文主要综述了CCR在木质素生物合成途径中的地位、CCR的分布、酶的提取和基本特性、CCR基因的克隆进展、CCR基因的转录特点、CCR启动子研究情况、转基因植物中表达抑制CCR基因的生物学效应等,并展望了CCR基因研究对于植物木质素研究、植物抗病和抗逆性研究、作物品质改良以及植被保护研究的意义。 展开更多
关键词 进展 木质素 肉桂辅酶a还原酶(CCR) 生物合成途径
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甘蓝型和白菜型油菜肉桂酰辅酶A还原酶1基因的克隆与表达 被引量:4
14
作者 侯维海 王建林 +1 位作者 旦巴 胡单 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2017年第11期27-35,共9页
【目的】分别克隆甘蓝型油菜(Brassica napus L.)和白菜型油菜(Brassica rapa L.)肉桂酰辅酶A还原酶1(cinnamoyl-CoA reductase 1,CCR1)基因,并进行生物信息学和表达模式分析。【方法】基于甘蓝型油菜和白菜型油菜转录组测序信息,分别从... 【目的】分别克隆甘蓝型油菜(Brassica napus L.)和白菜型油菜(Brassica rapa L.)肉桂酰辅酶A还原酶1(cinnamoyl-CoA reductase 1,CCR1)基因,并进行生物信息学和表达模式分析。【方法】基于甘蓝型油菜和白菜型油菜转录组测序信息,分别从contig文库中获得了一个CCR1基因mRNA转录本片段,利用RACE技术分别获得一个CCR1基因的cDNA全长,对其进行生物学分析,并用实时定量PCR方法分析CCR1基因在甘蓝型和白菜型油菜开花期根、茎、叶、花中的表达差异。【结果】所克隆的甘蓝型油菜和白菜型油菜CCR1基因序列经同源序列比对分析后,将其分别命名为BnCCR1(登录号:KX138521)和BrCCR1(登录号:KX138522)。BnCCR1全长1 388bp,开放阅读框(ORF)长为1 032bp,编码343个氨基酸,分子质量11.56ku,等电点4.99;BrCCR1全长1 366bp,ORF长为1 026bp,编码341个氨基酸,分子质量为11.36ku,等电点5.0。2物种CCR1编码蛋白质二级结构无信号肽和跨膜结构域;亚细胞定位显示该蛋白在细胞质中存在的可能性最大。CCR蛋白多重比对分析显示,BnCCR1和BrCCR1均具有CCR蛋白典型的一个NAD(P)结合域和一个底物结合域(NWYCY)。系统进化树分析结果表明,BnCCR1和BrCCR1与同属十字花科的菘蓝、亚麻荠、拟南芥CCR形成了一个独立分支,且亲缘关系较近;其蛋白质三级结构均与矮牵牛CCR1(PDB:4r1t.1A)蛋白质三级结构相似,结构稳定。实时荧光定量PCR分析结果表明,CCR1基因在白菜型油菜和甘蓝型油菜根、茎、叶、花各器官中均有表达,其中在木质化程度较高的根和茎中表达丰度明显高于叶和花。【结论】从白菜型油菜和甘蓝型油菜中分别克隆到CCR1基因cDNA全长,该基因主要在木质化程度较高的根和茎器官中表达。 展开更多
关键词 甘蓝型油菜 白菜型油菜 肉桂辅酶a还原酶1 基因表达 生物信息学分析
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尾叶桉GLU4肉桂酰-辅酶A还原酶基因克隆及原核表达 被引量:3
15
作者 陈博雯 盖颖 蒋湘宁 《中南林业科技大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第11期71-76,97,共7页
肉桂酰-辅酶A还原酶(Cinnamoyl Co-A Reductase,CCR)是木质素合成中的关键酶,根据植物中CCR保守序列设计引物,以尾叶桉GLU4嫩茎为材料克隆到其CCR基因,命名为Eu CCR。该基因g DNA长2 918bp,c DNA长1 045 bp,CDS区编码336个氨基酸。EuCC... 肉桂酰-辅酶A还原酶(Cinnamoyl Co-A Reductase,CCR)是木质素合成中的关键酶,根据植物中CCR保守序列设计引物,以尾叶桉GLU4嫩茎为材料克隆到其CCR基因,命名为Eu CCR。该基因g DNA长2 918bp,c DNA长1 045 bp,CDS区编码336个氨基酸。EuCCR核酸序列与Gen Bank已登录的桉属植物CCR基因同源性达到96%以上,与伞房属、杯果木属植物CCR的同源性达85%以上,其编码的氨基酸序列经比对发现具有完整FR_SDR_e结构域及NADP结合位点和底物结合位点,与可可树等植物中CCR基因编码序列同源性也在84%以上,确定为CCR基因。对EuCCR蛋白序列理化性质及结构进行生物信息学分析,利用MEGA软件对基因序列进行系统进化树分析。采用pQE30/M15系统对EuCCR进行原核表达,重组质粒成功表达分子量约36 kD的目的蛋白。本研究从尾叶桉GLU4中克隆得到EuCCR基因并原核表达,为该基因的酶学分析以及利用该基因转化调控尾叶桉木质素合成奠定基础。 展开更多
关键词 尾叶桉 肉桂-辅酶a还原酶 生物信息学分析 原核表达
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植物肉桂酰辅酶A还原酶的研究进展
16
作者 王建国 《辽宁林业科技》 2023年第2期43-46,共4页
肉桂酰辅酶A还原酶是木质素合成中的一个关键酶,能够催化羟基肉桂酸辅酶A酯,生成相应的肉桂醛,对木质素代谢途径具有重要的调节作用。该文综述了CCR的酶学特征、植物CCR基因的克隆和基因功能研究进展、CCR基因的启动子研究现状,介绍了CC... 肉桂酰辅酶A还原酶是木质素合成中的一个关键酶,能够催化羟基肉桂酸辅酶A酯,生成相应的肉桂醛,对木质素代谢途径具有重要的调节作用。该文综述了CCR的酶学特征、植物CCR基因的克隆和基因功能研究进展、CCR基因的启动子研究现状,介绍了CCR基因在造纸植物上的应用,以及CCR基因在抗虫上的前景,为进一步研究CCR基因的功能提供参考。 展开更多
关键词 木质素 肉桂辅酶a还原酶 CCR基因 应用
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植物肉桂酰辅酶A还原酶基因克隆研究进展 被引量:5
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作者 樊飞飞 李杰勤 +2 位作者 詹秋文 王丽华 刘言龙 《中国生物工程杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第12期96-102,共7页
木质素单体合成的过程中涉及了许多酶的参与,而肉桂酰辅酶A还原酶(cinnamoyl-CoA reductase,CCR)是该过程中的一个关键酶。综述了CCR基因在植物体内的克隆、基因功能及在植物组织中的表达情况,并介绍了该基因在植物的抗病虫害和抗逆性... 木质素单体合成的过程中涉及了许多酶的参与,而肉桂酰辅酶A还原酶(cinnamoyl-CoA reductase,CCR)是该过程中的一个关键酶。综述了CCR基因在植物体内的克隆、基因功能及在植物组织中的表达情况,并介绍了该基因在植物的抗病虫害和抗逆性研究、饲草和能源上的应用潜力,为进一步研究CCR基因生物学功能和利用奠定了基础。 展开更多
关键词 木质素 肉桂辅酶a还原酶 基因克隆 基因功能 植物组织表达
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HMG-CoA还原酶ScrFI基因多态性对高胆固醇血症和AI的影响:一个中老年人群的横断面研究
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作者 刘文 张红 翟成凯 《东南大学学报(医学版)》 CAS 2024年第2期191-196,共6页
目的:探讨3-羟基-3-甲基戊二酸单酰辅酶A还原酶(HMG-CoA还原酶)的基因多态性对高胆固醇血症和动脉粥样硬化指数(AI)的影响。方法:检测南京市常住汉族174名中老年人血总胆固醇、高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)和低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C),计... 目的:探讨3-羟基-3-甲基戊二酸单酰辅酶A还原酶(HMG-CoA还原酶)的基因多态性对高胆固醇血症和动脉粥样硬化指数(AI)的影响。方法:检测南京市常住汉族174名中老年人血总胆固醇、高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)和低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C),计算AI;使用聚合酶链反应-限制性内切酶片段长度多态性(PCR-RFLP)技术检测HMG-CoA还原酶ScrFI基因多态性。结果:高胆固醇血症患者87例(高胆固醇组),男21例,女性66,平均年龄(63.59±8.37)岁;胆固醇正常87例(正常组),男21例,女66例,平均年龄(62.92±7.60)岁。高胆固醇组AA基因型频率为25.10%,Aa基因型频率为55.31%,aa基因型频率为19.59%;正常组AA基因型频率为18.39%,Aa基因型频率为52.87%,aa基因型频率为28.74%;高胆固醇组的a等位基因频率为55.17%,高于正常组的47.13%,但差异无统计学意义(P>0.05),AA基因型人群的血HDL-C水平显著高于Aa和aa基因型人群(P<0.05);胆固醇正常组AA基因型人群的AI显著低于aa型基因人群(P<0.05);两组人群的AI随突变型杂合子和突变型纯合子的发生逐渐升高,但差异无统计学意义(P>0.05)。结论:HMG-CoA还原酶ScrFI基因多态性可能是高胆固醇血症发生的遗传易感因素之一;HMG-CoA还原酶ScrFI基因突变可能会影响HMG-COA还原酶的活性,降低对胆固醇的抑制作用,增加总胆固醇和LDL-C的合成,较暴露于同样环境中的基因非突变型人群发生高胆固醇血症和动脉粥样硬化的风险可能会增高。 展开更多
关键词 3-羟基-3-甲基戊二酸单辅酶a还原酶 ScrFI基因 动脉粥样硬化指数 高胆固醇血症 中老年人群
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拟南芥肉桂酰辅酶A还原酶(AtCCR1/2)基因的生物信息学分析 被引量:1
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作者 刘晓晶 崔浪军 +1 位作者 夏飞 杨章民 《陕西师范大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2011年第3期67-72,共6页
用生物信息学方法分别对拟南芥等植物中两种肉桂酰辅酶A还原酶(CCR)基因序列相似性、编码产物理化性质、三级结构、亚细胞定位、启动子序列、基因表达量以及功能进行预测和分析.结果表明,CCR1和CCR2基因序列、编码产物理化性质和三级结... 用生物信息学方法分别对拟南芥等植物中两种肉桂酰辅酶A还原酶(CCR)基因序列相似性、编码产物理化性质、三级结构、亚细胞定位、启动子序列、基因表达量以及功能进行预测和分析.结果表明,CCR1和CCR2基因序列、编码产物理化性质和三级结构相似性均较高,编码产物可能定位于细胞质.AtCCR1在拟南芥整株植物和各个器官中的的表达量均远比AtCCR2的高.不同因素处理下AtCCR1和AtCCR2表达状况差异较大,这可能与二者启动子区域含有的顺式作用元件不同有关. 展开更多
关键词 拟南芥 肉桂辅酶a还原酶 基因表达 生物信息学
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竹叶花椒肉桂酰辅酶A还原酶基因克隆与表达分析 被引量:2
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作者 关淑文 王毅 +2 位作者 郝佳波 原晓龙 陆斌 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2020年第11期5201-5206,共6页
肉桂酰辅酶A还原酶(cinnamoyl-CoA reductase,CCR)在木质素生物合成途径中起着关键作用。本研究依据转录组数据设计特异性引物,采用RT-PCR方法从竹叶花椒(Zanthoxylum armatum)中克隆得到一个全新的CCR基因的全长c DNA序列,命名为ZaCCR... 肉桂酰辅酶A还原酶(cinnamoyl-CoA reductase,CCR)在木质素生物合成途径中起着关键作用。本研究依据转录组数据设计特异性引物,采用RT-PCR方法从竹叶花椒(Zanthoxylum armatum)中克隆得到一个全新的CCR基因的全长c DNA序列,命名为ZaCCR。序列分析结果表明,ZaCCR包含完整的cDNA开放阅读框(OFR),由990 bp组成,编码329个氨基酸。Blast比对结果显示该蛋白质属于CCR家族蛋白;系统进化树结果显示竹叶花椒(Zanthoxylum armatum)与芸香科植物甜橙(Sweet orange,Citrus sinensis)、蜜柑(Satsuma mandarin,Citrus unshiu)等亲缘关系较近。荧光定量PCR检测显示,ZaCCR在竹叶花椒中的表达量从大到小分别为:嫁接树的茎、实生树的茎、嫁接树的叶、实生树的叶。 展开更多
关键词 竹叶花椒(Zanthoxylum armatum) 肉桂辅酶a还原酶 生物信息学分析
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