基于GEO数据库的硒酵母影响肉鸡肝脏差异表达基因的生物信息学分析

试验旨在筛选补充硒酵母后肉鸡肝脏的差异表达基因(DEGs),探究硒酵母影响肉鸡生长发育和健康的分子作用机理。研究从基因表达综合数据库(GEO)获取基因表达谱数据集,进行生物信息挖掘。结果显示,筛选出与硒酵母有关的600个DEGs,利用DAVID软件对其进行基因本体论(GO)、京都基因和基因组百科全书(KEGG)注释,显著富集18个生物学过程和12个KEGG通路;利用STRING数据库构建546个节点和905个边的蛋白互作网络(PPI);利用Cytoscape软件筛选出6个枢纽基因(FN1、PLCG1、MYO3A、ITGA8、KDM6A和ATP2B2)和4个基因模块。研究表明,上述6个枢纽基因和心肌细胞中肾上腺素能信号、钙信号通路、同源重组、黏着斑及真核生物核糖体生物合成5个通路可能是硒酵母影响肉鸡生长发育和健康的关键基因和关键途径。

金霉素和代谢物差向金霉素在肉鸡肌肉和肝脏中的残留分布

为了研究金霉素（CTC）、差向金霉素（ECTC）在肉鸡肌肉、肝脏中的残留分布情况，样品经提取液提取后过Oasis HLB SPE小柱净化，采用电喷雾正离子模式（ESI＋）和多反应监测模式（MRM），用高效液相色谱一串联质谱仪检测；试验组鸡按体重以50mg／（kg·d）剂量内服CTC，连续5d，每天给药1次。结果表明：该方法测定肉鸡肌肉和肝脏中CTC检测限和定量限分别为5．0、10．0μg/kg。ECTC检测限和定量限分别为20．0、30．0μg/kg。CTC和ECTC在肉鸡肌肉中平均回收率分别在73．00％～95．20％和81．80％-101．60％，相对标准偏差（RSD）分别在8．85％～9．13％和2．05％～9．29％；在肉鸡肝脏中平均回收率分别在67．06％～90．80％和78．64％～106．98％，RSD分别在2．90％～8．88％和4．72％～9．48％；肉鸡肌肉和肝脏中CTC、代谢物ECTC的残留量分别在给药后第1、5d时达到最高。肉鸡肝脏中ECTC的残留量约占总残留量的1／2。停药后CTC及其代谢物ECTC代谢缓慢，在停药第6d时，仍能检测到CTC及其代谢物ECTC，但其残留量均低于最高残留限量（MRLs）。从保障食品安全方面考虑，建议我国将CTC和ECTC均作为金霉素的残留标示物进行监测。