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高脂饮食背景下小鼠肝脏脂质代谢重编程及免疫微环境重塑
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作者 赵勇 杜志伟 +3 位作者 刘旭旭 孟宪志 薛东波 郝晨钧 《哈尔滨医科大学学报》 CAS 2023年第1期12-18,共7页
目的探讨高脂饮食(high-fat diet,HFD)背景下的肝脏脂质代谢重编程及免疫微环境的改变。方法首先基于数据集GSE182668筛选出高脂饮食背景下的肝脏差异表达基因,通过基因本体论(gene ontology,GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(Kyo... 目的探讨高脂饮食(high-fat diet,HFD)背景下的肝脏脂质代谢重编程及免疫微环境的改变。方法首先基于数据集GSE182668筛选出高脂饮食背景下的肝脏差异表达基因,通过基因本体论(gene ontology,GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)进行通路富集分析,使用String数据库对差异基因以互作评分>0.7分进行蛋白-蛋白互作(protein-protein interaction,PPI)网络构建,使用单样本基因集富集分析(single sample gene set enrichment analysis,ssGSEA)算法评估出各免疫细胞的浸润情况。结果高脂饮食背景下,过氧化物酶体增殖物激活受体(peroxisome proliferator-activated receptor,PPAR)信号通路显著活化,脂质代谢相关基因ME1、CYP8B1、Bien、CYP4A1在HFD组中表达下调,而CYP7A1表达上调,肝脏免疫微环境发生显著改变。结论高脂饮食背景下,肝脏发生显著的脂质代谢重编程,并且伴随着肝脏免疫微环境的重塑。 展开更多
关键词 生物信息学分析 肝脏脂质代谢重编程 差异表达基因 肝脏免疫微环境
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