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应用肠杆菌科基因间重复序列聚合酶链反应对鲍曼不动杆菌进行同源性分析 被引量:2
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作者 闻海丰 秦瑾 +2 位作者 于文静 冯彦蕊 冯忠军 《分子诊断与治疗杂志》 2015年第4期247-252,共6页
目的了解临床不同来源的鲍曼不动杆菌是否存在同源性,判断其是否存在耐药菌株的克隆播散,追踪其在医院交叉感染的可能途径,以便有效防控鲍曼不动杆菌在医院中传播。方法收集2012年10月至2013年6月临床分离的73株多重耐药鲍曼不动杆菌,... 目的了解临床不同来源的鲍曼不动杆菌是否存在同源性,判断其是否存在耐药菌株的克隆播散,追踪其在医院交叉感染的可能途径,以便有效防控鲍曼不动杆菌在医院中传播。方法收集2012年10月至2013年6月临床分离的73株多重耐药鲍曼不动杆菌,用肠杆菌科基因间重复序列-聚合酶链反应(enterobacterial repetitive intergenic consensus-polymerase chain reaction,ERIC-PCR)对菌株进行同源性分析。结果 73株多重耐药鲍曼不动杆菌经ERIC-PCR分型分为8个基因型,分别用A、B、C、D、E、F、G、H表示,其中A型31株,B型15株,C型12株,D型8株,E型3株,F型2株,G和H型各为1株。A型为主要的流行株,分布在多个不同的科室。重症监护室(intensive care unit,ICU)分离的菌株存在6个基因型;骨科系统病区存在4个基因型;急诊科有5个基因型;内科发现有6个基因型;外科发现3个基因型。ICU病房环境物体表面共分离出4株鲍曼不动杆菌,其中9号和10号菌株来自于不同患者的床旁,12号和13号来自于护理站电脑键盘。结论临床分离的多重耐药鲍曼不动杆菌存在多个基因型。多重耐药鲍曼不动杆菌存在时间和空间的聚集性。 展开更多
关键词 鲍曼不动杆菌 多重耐药性 杆菌基因重复序列-聚合反应 同源性
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住院新生儿大肠埃希菌分离株的肠杆菌基因间重复共有序列聚合酶链反应分型 被引量:3
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作者 丁翊君 王亚娟 +3 位作者 姚开虎 高薇 许宏 俞桑洁 《中华实用儿科临床杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第22期1702-1705,共4页
目的 探讨住院新生儿大肠埃希菌临床分离株菌株之间的亲缘关系,分析大肠埃希菌的流行病学状况。方法 对在北京儿童医院新生儿中心住院的102例新生儿的110株大肠埃希菌临床分离株应用肠杆菌基因间重复共有序列PCR(ERIC-PCR)分型方... 目的 探讨住院新生儿大肠埃希菌临床分离株菌株之间的亲缘关系,分析大肠埃希菌的流行病学状况。方法 对在北京儿童医院新生儿中心住院的102例新生儿的110株大肠埃希菌临床分离株应用肠杆菌基因间重复共有序列PCR(ERIC-PCR)分型方法进行研究,分析菌株之间的同源性关系。结果 入选的102例新生儿中,男61例,女41例;足月儿94例,早产儿8例;年龄≤7 d25例,〉7 d77例。110株新生儿大肠埃希菌临床分离株经ERIC-PCR分型共58型,指纹图谱条带为4~12条,相似系数为26.2% ~100.0% 。优势基因型有6株,条带为4~5条,相似系数为88.9% ~100.0% 。优势基因型E58型的6株菌株有5株在3月份发病,1株在2月底发病。次优势型E32型的5株菌株中4株分布在5月份,1株在7月份;E23型的5株菌株中4株分布在9月份,1株在10月份。有8对菌株分别来自8例患儿不同时期或不同部位的培养,其中7对经ERIC-PCR分型方法证实分别属于同一型别,另外1对经ERIC-PCR分型证实不是同一型别,亲缘关系较远,故从同源性分析来看不除外不同菌株感染或污染的可能。有2株菌株来自同一患儿的血液和脑脊液,且属于同一基因型,相似系数达100.0% 。5株菌株经ERIC-PCR分型证实菌株间亲缘关系较近,其中1株分离菌株来源的患儿曾与另外4株分离菌株来源的患儿同住一病房,考虑为院内获得性感染。结论 大肠埃希菌感染患儿以足月儿多见,且晚发感染居多,男婴比女婴多。大肠埃希菌引起的呼吸道感染在不同的季节可能有不同的型别流行。来自同一患儿的临床分离株各自的同源性较高,且北京儿童医院存在大肠埃希菌的院内获得性感染。ERIC-PCR分型方法可追踪传染源,有利于院内感染的防控。 展开更多
关键词 埃希菌 基因共有序列 聚合反应 新生 婴儿
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应用多重PCR在肠杆菌科细菌中检测blaTEM、blaSHV、blaOXA-1基因 被引量:3
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作者 李虹玲 刘文恩 +3 位作者 张运丽 陈腊梅 梁湘辉 吴清阳 《中国感染控制杂志》 CAS 2008年第6期377-380,共4页
目的应用多重聚合酶链反应(PCR)法在肠杆菌科细菌中检测blaTEM、blaSHV、blaOXA-1基因。方法收集2004年10月—2005年7月湖南地区中南大学3所附属医院临床标本分离的多重耐药肠杆菌科细菌171株,以美国临床实验室标准化研究所(CLSI)规定... 目的应用多重聚合酶链反应(PCR)法在肠杆菌科细菌中检测blaTEM、blaSHV、blaOXA-1基因。方法收集2004年10月—2005年7月湖南地区中南大学3所附属医院临床标本分离的多重耐药肠杆菌科细菌171株,以美国临床实验室标准化研究所(CLSI)规定的方法进行超广谱β-内酰胺酶(ESBLs)表型确证试验,多重PCR进一步进行blaTEM、blaSHV、blaOXA-1三种耐药基因的检测。结果171株多重耐药的肠杆菌科细菌中,142株(83.04%)ESBLs表型检测阳性,经多重PCR扩增,105株获得阳性结果。根据扩增片段大小判断:检出携带blaTEM菌株85株,携带blaSHV菌株26株,携带blaOXA-1菌株10株,其中15株菌同时携带多种耐药基因。结论多重PCR可以快速、准确地检测出ESBLs表型阳性肠杆菌科细菌是否携带blaTEM、blaSHV、blaOXA-1基因。 展开更多
关键词 多重聚合反应 杆菌 blaTEM blaSHV blaOXA-1 耐药基因 抗药性 微生物
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阴沟肠杆菌高产AmpC酶基因检测及分子流行病学研究 被引量:5
4
作者 杨绍敏 胡大春 +2 位作者 邵剑春 李超 苏平 《中国抗生素杂志》 CAS CSCD 北大核心 2008年第4期228-231,共4页
目的研究医院阴沟肠杆菌高产AmpC酶及分子流行病学特征。方法采用KB法药敏试验,双纸片增效试验和酶提取物三维试验检测阴沟肠杆菌高产AmpC酶,聚合酶链反应检测AmpC酶基因、ERIC-PCR,研究昆明市第一人民医院2002年7月~2004年12月临床分... 目的研究医院阴沟肠杆菌高产AmpC酶及分子流行病学特征。方法采用KB法药敏试验,双纸片增效试验和酶提取物三维试验检测阴沟肠杆菌高产AmpC酶,聚合酶链反应检测AmpC酶基因、ERIC-PCR,研究昆明市第一人民医院2002年7月~2004年12月临床分离的84株阴沟肠杆菌的耐药性、AmpC酶基因型和克隆传播状况。结果表型初筛试验和ESBLs确认试验,高产AmpC酶检出率为27.38%(23/84),ESBLs检出率16.67%(14/84),同时高产AmpC酶和ESBLs检出率44.05%(37/84)。AmpC酶基因检出率43.75%(28/64)。三维试验高产AmpC酶检出率为47.62%(40/84)。克隆传播分析,结果发现菌株编号EC2和EC11、EC13和EC14、EC19和EC20分别具有相同的DNA指纹图,其余菌株间未见DNA指纹图。结论阴沟肠杆菌的耐药性较为复杂。表现出去阻遏高产AmpC酶、产ESBLs、同时产AmpC酶和ESBLs和质粒AmpC酶多种耐药表型。分子流行病学结果显示,虽然阴沟肠杆菌的传播与抗生素的诱导和选择作用、患者机体抵抗力下降及肠道内寄居菌的内源性感染等因素有关,但仍然要警惕医院感染的发生。 展开更多
关键词 阴沟杆菌 AMPC Β-内酰胺 提取物三维试验 杆菌基因 聚合反应
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44株阴沟肠杆菌耐药基因分析 被引量:17
5
作者 黄支密 仵蕾 +6 位作者 陈榆 糜祖煌 单浩 郭满盈 秦玲 蔡培泉 王春新 《中华医院感染学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2007年第2期139-142,共4页
目的了解解放军第98医院临床分离的阴沟肠杆菌耐药基因存在状况。方法采用聚合酶链反应及序列分析的方法分析44株阴沟肠杆菌中15种耐药相关基因。结果44株中,12种基因blaTEM、blaOXA-1群、blaMIR、blaDHA、aac(3)-Ⅱ、aac(6′)-Ⅰ、ant(... 目的了解解放军第98医院临床分离的阴沟肠杆菌耐药基因存在状况。方法采用聚合酶链反应及序列分析的方法分析44株阴沟肠杆菌中15种耐药相关基因。结果44株中,12种基因blaTEM、blaOXA-1群、blaMIR、blaDHA、aac(3)-Ⅱ、aac(6′)-Ⅰ、ant(3″)-Ⅰ、intⅠ1、qacE△1-sul1、dfrA1、dfrA17、qnr的阳性株数分别为24株(54.50%)、3株(6.82%)、35株(79.50%)、5株(11.40%)、11株(25.00%)、31株(70.50%)、15株(34.10%)、38株(86.40%)、36株(81.80%)、1株(2.27%)、20株(45.05%)、3株(6.82%),bla0XA-1群基因PCR产物经序列分析确认为blaOXA-1型广谱β-内酰胺酶基因,其他3种基因blaSHV、blaCTX-M-1群、blaOXA-10群均阴性。结论临床分离的阴沟肠杆菌至少存在12种耐药相关基因;在阴沟肠杆菌中检出blaOXA-1、dfrA1、dfrA17和qnr基因均为国内首次报道。 展开更多
关键词 阴沟杆菌 耐药基因 聚合反应 序列分析
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青岛两所医院鲍曼不动杆菌碳青霉烯酶基因及同源性分析 被引量:4
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作者 李茜 李庆淑 +2 位作者 李智 曲彦 胡丹 《中国感染控制杂志》 CAS 北大核心 2015年第7期437-442,共6页
目的了解青岛市两所医院鲍曼不动杆菌(AB)耐药情况、分布特征,碳青霉烯酶基因携带情况。方法收集两所医院临床分离的145株(A院78株,B院67株)AB进行药敏试验,采用聚合酶链反应(PCR)扩增碳青霉烯酶基因,肠杆菌科基因间一致重复序列(ERIC)-... 目的了解青岛市两所医院鲍曼不动杆菌(AB)耐药情况、分布特征,碳青霉烯酶基因携带情况。方法收集两所医院临床分离的145株(A院78株,B院67株)AB进行药敏试验,采用聚合酶链反应(PCR)扩增碳青霉烯酶基因,肠杆菌科基因间一致重复序列(ERIC)-PCR对菌株进行同源性分析。结果 A院AB对临床常用的16种抗菌药物普遍耐药,对头孢哌酮/舒巴坦耐药率最低(3.85%),其次是米诺环素(16.67%),对其他抗菌药物耐药率均>73%。B院AB对常用的23种抗菌药物普遍耐药,对米诺环素和替加环素均不耐药,对阿米卡星和左氧氟沙星的耐药率分别为23.88%、38.81%,对其他抗菌药物的耐药率均>64%。两院所有菌株均携带OXA-51基因,A、B两院碳青霉烯耐药组OXA-23基因的携带率分别为86.76%(59/68),56.67%(34/60),差异有统计学意义(χ2=14.53,P<0.001);A院3株菌携带OXA-58基因,B院未检出OXA-58基因。145菌株共分为8个基因型,其中A型71株和E型37株,为主要流行株;A院主要流行A型(46.15%)和E型(41.03%),B院主要流行A型(52.24%)和C型(17.91%)。结论两所医院临床分离的AB耐药情况严重,且存在医院流行,OXA型酶OXA-23、OXA-51基因在介导AB对碳青霉烯类药物耐药中发挥重要作用。 展开更多
关键词 鲍曼不动杆菌 碳青霉烯 多重耐药 抗药性 微生物 杆菌基因重复序列-聚合反应
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医院感染阴沟肠杆菌多重耐药基因分析 被引量:2
7
作者 罗甫花 蒋晓军 王朝艳 《中国感染控制杂志》 CAS 2009年第5期318-321,共4页
目的了解医院感染阴沟肠杆菌的耐药性及其耐药基因,为防控感染提供依据。方法对40株临床分离的阴沟肠杆菌,以纸片扩散法和琼脂稀释法进行药敏试验,聚合酶链反应(PCR)及序列分析法分析12种耐药相关基因。结果 40株阴沟肠杆菌仅对亚胺培... 目的了解医院感染阴沟肠杆菌的耐药性及其耐药基因,为防控感染提供依据。方法对40株临床分离的阴沟肠杆菌,以纸片扩散法和琼脂稀释法进行药敏试验,聚合酶链反应(PCR)及序列分析法分析12种耐药相关基因。结果 40株阴沟肠杆菌仅对亚胺培南和美罗培南高度敏感,敏感率均为100.00%;对头孢吡肟耐药率较低,为15.00%;对其他15种抗菌药物耐药率较高,为42.00%~92.50%。共检出8种耐药基因,分别为TEM-1、SHV-2a、CTX-M-3、CTX-M-9、AmpC、aac(3′)-Ⅰ、IntⅠ1、sul1,大多数菌株携带sul1+IntⅠ1型基因;耐药谱共分为A~I9型,以C和D型为主。抗菌药物耐药谱分型和基因分型有一定相关性。结论阴沟肠杆菌呈现多重和高度耐药性,耐药机制复杂且呈多种耐药机制共同作用。 展开更多
关键词 阴沟杆菌 医院感染 抗药性 微生物 耐药基因 聚合反应 序列分析 多重耐药
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导致阿米卡星双圈耐药肠杆菌科细菌耐药性研究 被引量:1
8
作者 周万青 沈瀚 +5 位作者 宁明哲 张之烽 徐学静 朱宏 曹小利 张葵 《检验医学》 CAS 2013年第11期1012-1015,共4页
目的探讨临床分离的纸片扩散法药物敏感性试验对阿米卡星(AMK)呈双圈耐药的肠杆菌科细菌相关携带基因及药物诱导对耐药基因mRNA表达量的影响。方法收集纸片扩散法药物敏感性试验对AMK呈双圈耐药的大肠埃希菌(编号Eco85)和肺炎克雷伯菌(... 目的探讨临床分离的纸片扩散法药物敏感性试验对阿米卡星(AMK)呈双圈耐药的肠杆菌科细菌相关携带基因及药物诱导对耐药基因mRNA表达量的影响。方法收集纸片扩散法药物敏感性试验对AMK呈双圈耐药的大肠埃希菌(编号Eco85)和肺炎克雷伯菌(编号Kpn110)各1株;纸片诱导法探讨耐药表型的改变;聚合酶链反应(PCR)扩增氨基糖苷类修饰酶基因、整合子及其可变区以及16S rRNA甲基化酶基因;逆转录PCR分析armA基因在AMK诱导前后菌株中的表达情况;接合试验探讨耐药基因的可传递性。结果 Eco85和Kpn110分别在第10代和第16代诱导后转变为双圈消失;2株菌均扩增出Ⅰ类整合子基因,可变区分别携带aadA5-dfra17和aadA2-dfrA12基因盒,未扩增出Ⅱ和Ⅲ类整合子基因;Eco85扩增出aac(6)-Ⅰ基因,而Kpn110扩增出ant(3″)-Ⅰ基因;Eco85和Kpn110均扩增出armA基因,基因测序未发现突变,未检出rmtB基因;经AMK诱导后菌株armA基因mRNA表达量明显上升;接合试验未获成功。结论大肠埃希菌和肺炎克雷伯菌对AMK呈双圈耐药可能与16S rRNA甲基化酶armA基因的诱导表达相关。 展开更多
关键词 双圈耐药 诱导 armA基因 阿米卡星 杆菌细菌 逆转录-聚合反应
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碳青霉烯类非敏感肠杆菌科细菌分子流行病学研究
9
作者 苏小燕 夏云 《临床检验杂志》 CAS CSCD 北大核心 2012年第4期293-295,共3页
目的调查碳青霉烯类抗生素非敏感肠杆菌科细菌的流行情况,并研究其耐药性传播方式。方法收集本院临床分离的碳青霉烯类抗生素非敏感肠杆菌科细菌34株,用Vitek2 Compact系统进行细菌鉴定和常规药敏检测,改良Hodge试验筛选产碳青霉烯酶菌... 目的调查碳青霉烯类抗生素非敏感肠杆菌科细菌的流行情况,并研究其耐药性传播方式。方法收集本院临床分离的碳青霉烯类抗生素非敏感肠杆菌科细菌34株,用Vitek2 Compact系统进行细菌鉴定和常规药敏检测,改良Hodge试验筛选产碳青霉烯酶菌株,用肠杆菌基因间重复一致序列(enterobacterial repetitive intergenic consensus,ERIC)-PCR进行分子流行病学调查。PCR扩增Int 1、Int 2、Int 3整合酶基因,质粒接合和消除试验研究细菌耐药基因的传播方式。结果 19株细菌改良Hodge试验阳性。来自7个不同科室的12株大肠埃希菌和17株阴沟肠杆菌可以分为3种和6种基因型,来自4个不同科室的5株肺炎克雷伯菌只有1种基因型。27株菌Int 1基因阳性,未检出Int 2和Int 3基因。除骨科1株阴沟肠杆菌外,其余33株细菌质粒消除和接合试验均成功。结论本院碳青霉烯类抗生素非敏感肠杆菌科细菌主要发生在外科各科室;所有肺炎克雷伯菌和泌尿外科大肠埃希菌属同一基因型,表明此类菌株呈局部流行;碳青霉烯类抗生素非敏感肠杆菌科细菌耐药性主要通过质粒传播。 展开更多
关键词 杆菌细菌 碳青霉烯 杆菌基因重复一致序列-PCR
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耐碳青霉烯类大肠埃希菌产碳青霉烯酶基因型和同源性检测及分析 被引量:4
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作者 范晓蓓 李莲 《山东医药》 CAS 2021年第20期25-29,共5页
目的检测并分析耐碳青霉烯类大肠埃希菌(CRECO)产碳青霉烯酶基因型及其同源性。方法对2020年湖北省十堰市3家三甲医院临床分离的31株CRECO采用MALDI-TOF质谱仪进行菌种再鉴定,K-B纸片扩散法和E test条复核药敏结果,得到23株CRECO。采用... 目的检测并分析耐碳青霉烯类大肠埃希菌(CRECO)产碳青霉烯酶基因型及其同源性。方法对2020年湖北省十堰市3家三甲医院临床分离的31株CRECO采用MALDI-TOF质谱仪进行菌种再鉴定,K-B纸片扩散法和E test条复核药敏结果,得到23株CRECO。采用碳青霉烯类药物的协同试验初筛产碳青霉烯酶基因型,PCR法检测8种常见碳青霉烯酶基因型并对阳性产物测序,用肠杆菌科基因间重复一致序列(ERIC)PCR法检测其同源性。结果23株CRECO中,9株产NDM-5酶,6株产KPC-2酶,2株产IMP-4酶。产碳青霉烯酶的大肠埃希菌大多从呼吸系统标本中分离出,多数来自呼吸重症病房,大多数为70岁以上老年患者,且患者经历过机械辅助通气、留置尿管或外科手术等侵入性操作。23株CRECO只对少数几种抗生素(阿米卡星、庆大霉素、复方新诺明)耐药率较低。同源性分析结果显示,本地区CRECO分7型,未见覆盖本地区的优势型别。结论十堰地区CRECO耐药机制复杂,产酶基因型主要是NDM-5和KPC-2基因,菌株对多种抗生素耐药。未发现本地区的克隆菌株爆发流行。 展开更多
关键词 埃希菌 碳青霉烯类抗生素 产碳青霉烯基因 杆菌基因重复一致序列 耐药性
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某医院耐碳青霉烯酶类鲍曼不动杆菌耐药基因研究和同源性分析 被引量:2
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作者 沈进 孙少君 +3 位作者 杨茜云 马军 王晓明 王秋波 《当代医学》 2021年第23期5-7,共3页
目的研究本院耐碳青霉烯酶类鲍曼不动杆菌(CRAB)的耐药基因情况,并通过基因检测分析细菌同源性,为防止院内感染、预防性用药提供依据。方法收集无锡市骨科医院2019年1—11月临床分离的56株CRAB菌株,细菌经过分离培养,采用BD Phoenix100... 目的研究本院耐碳青霉烯酶类鲍曼不动杆菌(CRAB)的耐药基因情况,并通过基因检测分析细菌同源性,为防止院内感染、预防性用药提供依据。方法收集无锡市骨科医院2019年1—11月临床分离的56株CRAB菌株,细菌经过分离培养,采用BD Phoenix100全自动微生物分析鉴定仪进行菌株鉴定和药敏试验,并采用PCR的方法检测鲍曼不动杆菌的碳青霉烯类耐药基因,菌株的同源性分析使用肠杆菌科基因组内重复一致序列聚合酶链反应(ERIC-PCR)方法。结果56株CRAB菌株中有48株(85.7%)OXA51基因阳性,52株(92.9%)OXA23基因阳性,均未检测到OXA24及OXA58基因,对OXA23和OXA51阳性细菌进行同源性分析,38株(80.0%)属于同一基因谱。所有细菌对18种药物耐药率>95.0%,且对美罗培南,亚胺培南的耐药率均>98.0%。结论无锡市骨科医院CRAB主要为OXA23型、OXA51型菌株,且该类细菌呈多重耐药,提示临床应加强医院感染的管理,防止该类鲍曼不动杆菌的暴发传播。 展开更多
关键词 多重耐药鲍曼不动杆菌 碳青霉烯类耐药基因 同源性分析 杆菌重复基因一致性-聚合反应
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肉鸡生产链中肠炎沙门氏菌耐药性分析及ERIC-PCR分型 被引量:9
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作者 李楠 赵思俊 +7 位作者 王娟 赵建梅 李玉清 黄秀梅 王君玮 丁宜宝 刘焕奇 曲志娜 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2016年第3期120-124,共5页
目的:了解肉鸡生产链中肠炎沙门氏菌耐药性情况以及各生产环节菌株间亲缘关系,为临床用药及菌株追踪溯源提供依据。方法:采用微量肉汤稀释法对171株肠炎沙门氏菌进行13种抗菌药物药敏实验;采用肠杆菌基因间重复共有序列-聚合酶链式反... 目的:了解肉鸡生产链中肠炎沙门氏菌耐药性情况以及各生产环节菌株间亲缘关系,为临床用药及菌株追踪溯源提供依据。方法:采用微量肉汤稀释法对171株肠炎沙门氏菌进行13种抗菌药物药敏实验;采用肠杆菌基因间重复共有序列-聚合酶链式反应(enterobacterial repetitive intergenic consensus-polymerase chain reaction,ERIC-PCR)法对33株不同生产环节耐药菌株进行分子分型;采用SPSS 20.0软件、Gel-Pro Analyer 4.0和NTSYS pc 2.1软件进行分析。结果:171株肠炎沙门氏菌对13种药物耐药情况不同,其中对氨苄西林耐药情况最严重,耐药率高达90.06%,对恩诺沙星、氧氟沙星最为敏感,耐药率均仅为5.26%;不同环节间耐药性差异极显著(P〈0.01);多重耐药率高达95.32%,共有26种耐药谱型。不同环节的33株肠炎沙门氏菌分为4种(Ⅰ~Ⅳ)基因型,遗传相似性在66%~100%,Ⅰ型为优势基因型;基因型相同的菌株耐药谱不一定相同,反之,耐药谱相同的菌株基因型不一定相同。结论:肉鸡生产链条中沙门氏菌对多种抗菌药物产生耐药性,且耐药谱种类繁多;沙门氏菌能够沿着生产链进行水平传播,肉鸡场环节菌株基因型相对复杂,菌株基因型与耐药表型之间无明显相关性。 展开更多
关键词 炎沙门氏菌 肉鸡 耐药性 杆菌基因重复共有序列-聚合反应
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ERIC-PCR技术在鲍曼不动杆菌基因分型中的应用评估 被引量:14
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作者 李永丽 应春妹 陈艺升 《检验医学》 CAS 2013年第7期621-624,共4页
目的了解仁济医院鲍曼不动杆菌的基因同源性,验证肠杆菌科基因间重复序列(ERIC)-聚合酶链反应(PCR)在鲍曼不动杆菌基因分型中的实用性。方法采用琼脂稀释法检测临床分离的81株鲍曼不动杆菌对临床常用抗菌药物的最低抑菌浓度(MIC);采用ER... 目的了解仁济医院鲍曼不动杆菌的基因同源性,验证肠杆菌科基因间重复序列(ERIC)-聚合酶链反应(PCR)在鲍曼不动杆菌基因分型中的实用性。方法采用琼脂稀释法检测临床分离的81株鲍曼不动杆菌对临床常用抗菌药物的最低抑菌浓度(MIC);采用ERIC-PCR对81株鲍曼不动杆菌进行基因分型;使用脉冲场凝胶电泳(PFGE)技术对其中的43株耐亚胺培南鲍曼不动杆菌进一步分型,以PFGE分型为参考标准,验证ERIC-PCR在基因分型中的实用性。结果 81株鲍曼不动杆菌对临床常用的13种抗菌药物普遍耐药,只对米诺环素耐药率最低,为30.9%,其次是亚胺培南,为53.1%,对其他抗菌药物的耐药率均>60%。81株鲍曼不动杆菌ERIC-PCR分型主要为A、B、C、D、E、F 6型,其中A、B、C型为主要的流行株。43株耐亚胺培南鲍曼不动杆菌分型为A型41株(A1型29株,A2型12株)、B型1株、C型1株。PFGE分型将其分为5型,A型34株(A1型31株,A2型3株),B型6株,C、D、E分型各1株。结论仁济医院鲍曼不动杆菌存在克隆播散,且主要为耐亚胺培南鲍曼不动杆菌。ERIC-PCR分辨力较强,结果可靠,与PFGE结果具有一定的相关性,是一种简便、快捷的基因分型技术。 展开更多
关键词 鲍曼不动杆菌 杆菌基因重复序列 聚合反应 脉冲场凝胶电泳 同源性
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猪源肠出血性大肠杆菌的分离、鉴定及特性研究 被引量:6
14
作者 满晓营 吴斌 +5 位作者 张璇 余腾 罗勇 刘峰 金梅林 陈焕春 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第10期984-987,共4页
目的探讨猪源肠出血性大肠埃希菌病原学特征。方法对所分离的菌株进行生化鉴定、药敏试验,并使用聚合酶链反应(PCR)技术检测毒力基因、耐药基因,同时对致病性的菌株进行外膜蛋白分型、REP-PCR和ERIC-PCR分析。结果从315株大肠杆菌中筛... 目的探讨猪源肠出血性大肠埃希菌病原学特征。方法对所分离的菌株进行生化鉴定、药敏试验,并使用聚合酶链反应(PCR)技术检测毒力基因、耐药基因,同时对致病性的菌株进行外膜蛋白分型、REP-PCR和ERIC-PCR分析。结果从315株大肠杆菌中筛选到山梨醇阴性的EHEC21株,其中含有stx1基因的菌株有4株,含有stx2基因3株,含有eae基因的17株,外膜蛋白分型属于三个型,其中OMP-1型最多,有15株,OMP-2型3株,OMP-3型3株,REP-PCR和ERIC-PCR结果显示这些致病性菌株带型差异性较大,分属于不同的亚群。结论华中地区是养殖业比较发达的地区,而且人均消费猪肉比例也较高,EHEC的存在对人是一种潜在的威胁,应加强监测力度,防止该菌在人群中感染和流行。 展开更多
关键词 出血性大杆菌 外膜蛋白 杆菌基因重复一致序列聚合反应(ERIC-PCR)和重复一致回文序列 聚合反应(REP—PCR)
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西安地区耐亚胺培南鲍曼不动杆菌的碳青霉烯酶及同源性研究 被引量:15
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作者 刘原 谭湘淑 韩新鹏 《中国感染与化疗杂志》 CAS 2009年第1期37-41,共5页
目的调查西安地区耐亚胺培南鲍曼不动杆菌的耐药性,研究其同源性及分子耐药机制。方法收集西安地区6所三级甲等医院1年间临床分离的非重复鲍曼不动杆菌株146株,采用K-B法进行药敏试验,E试验检测金属酶(MBL),PCR扩增OXA-23,-24,-58,-51l... 目的调查西安地区耐亚胺培南鲍曼不动杆菌的耐药性,研究其同源性及分子耐药机制。方法收集西安地区6所三级甲等医院1年间临床分离的非重复鲍曼不动杆菌株146株,采用K-B法进行药敏试验,E试验检测金属酶(MBL),PCR扩增OXA-23,-24,-58,-51like型及IMP-1型和VIM-2型碳青霉烯酶基因,其阳性产物经测序分析,应用肠杆菌科基因组内重复序列(ERIC)-PCR对菌株进行DNA分型和同源性分析。结果筛选出对亚胺培南耐药鲍曼不动杆菌(IRAB)非重复株15株,其中1株经E试验检测产金属酶,但扩增blaIMP-1,blaVIM-2均阴性,另外14株扩增blaOXA-66均阳性,11株blaOXA-23阳性,1株blaOXA-58阳性;ERIC-PCR将15株IRAB分为A型和B型,其中部分菌株的亲缘关系很近,同源性达90%以上。结论产OXA型碳青霉烯酶是西安地区该菌对亚胺培南耐药的主要原因,其中OXA-23型普遍存在,OXA-58型和OXA-66型基因在国内尚属新型碳青霉烯酶基因型;15株IRAB为2种克隆型,可能存在局部暴发流行。 展开更多
关键词 鲍曼不动杆菌 碳青霉烯 OXA-58 杆菌基因组内重复序列聚合反应
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大肠埃希菌耐药谱型、基因型和生物膜表型关系研究 被引量:7
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作者 陈朝喜 朱恒乾 +1 位作者 廖晓萍 刘雅红 《动物医学进展》 CSCD 北大核心 2011年第4期59-62,共4页
以ATCC25922为研究对象,采用改良结晶紫染色,快速银染法和扫描电镜技术对其生物被膜进行定量和定性研究,建立大肠埃希菌生物被膜体外模型,利用优化的模型条件对249株临床分离株进行验证。采用琼脂平板计数法绘制大肠埃希菌浮游菌和被膜... 以ATCC25922为研究对象,采用改良结晶紫染色,快速银染法和扫描电镜技术对其生物被膜进行定量和定性研究,建立大肠埃希菌生物被膜体外模型,利用优化的模型条件对249株临床分离株进行验证。采用琼脂平板计数法绘制大肠埃希菌浮游菌和被膜菌生长曲线,比较其生长特性的异同。对不同成膜能力的大肠埃希菌临床分离株进行色氨酸定量试验,分析不同培养条件对生物被膜菌胞外基质分泌量的影响。快速银染法和扫描电镜定性研究结果表明,大肠埃希菌形成生物被膜后,形成一种浮游细菌和生物被膜细菌共同分布于同一生存空间内的特殊生理结构;不同稀释度的接种量对细菌生物被膜生物量的变化影响不显著(P>0.05)。249株大肠埃希菌分为强成膜能力、中等成膜能力、弱成膜能力和无成膜能力4个表型,分别占3.21%、18.88%、51.81%、26.10%。 展开更多
关键词 耐药谱型 生物被膜表型 基因 杆菌基因重复一致序列聚合反应
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碳青霉烯类耐药大肠埃希菌耐药基因型检测及同源性分析 被引量:5
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作者 胡志军 吴希静 +4 位作者 潘晓龙 崇慧峰 朱娟娟 赵哲 唐吉斌 《安徽医药》 CAS 2020年第7期1464-1467,共4页
目的检测临床分离碳青霉烯类耐药大肠埃希菌的耐药基因型,并对其同源性进行分析,研究其流行情况。方法收集铜陵市人民医院2012年9月至2016年10月临床分离碳青霉烯类耐药大肠埃希菌,采用VITEK-2 Compact全自动微生物鉴定仪进行鉴定,改良H... 目的检测临床分离碳青霉烯类耐药大肠埃希菌的耐药基因型,并对其同源性进行分析,研究其流行情况。方法收集铜陵市人民医院2012年9月至2016年10月临床分离碳青霉烯类耐药大肠埃希菌,采用VITEK-2 Compact全自动微生物鉴定仪进行鉴定,改良Hodge试验检测碳青霉烯酶表型,EDTA双纸片协同试验进行金属酶初筛,聚合酶链反应(PCR)检测碳青霉烯酶基因(bla KPC、bla IMP、bla VIM、bla NDM和bla OXA-48),并对阳性扩增产物进行基因测序;同源性分析采用肠杆菌科基因间重复一致序列聚合酶链反应技术(ERIC-PCR)。结果共收集碳青霉烯类耐药大肠埃希菌25株,8株改良Hodge试验阳性,13株金属酶初筛试验阳性,其中4株携带bla NDM-1基因,1株携带bla IMP-4基因,1株携带bla KPC-2基因;ERIC-PCR检测分为10种型别。结论碳青霉烯类耐药大肠埃希菌的耐药机制主要是产金属酶,携带NDM-1型碳青霉烯酶大肠埃希菌需重点监测;碳青霉烯类耐药大肠埃希菌未在医院引起克隆流行。 展开更多
关键词 埃希氏菌属 序列同源性 基因 MDR 埃希菌 碳青霉烯 基因重复一致序列聚合反应技术(ERIC-PCR)
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产金属酶嗜麦芽窄食单胞菌13株的耐药谱和基因型分析 被引量:3
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作者 卓超 钱元恕 +3 位作者 郑行萍 李崇智 刘鸿渝 陈海 《中国抗感染化疗杂志》 CAS 2003年第6期340-343,共4页
目的 :研究产金属 β内酰胺酶 (MBL)的嗜麦芽窄食单胞菌感染的菌株同源性和耐药谱。 方法 :MBLE试验检测临床分离对亚胺培南耐药嗜麦芽窄食单胞菌的产MBL菌株 ;E试验检测MBL阳性株对 1 1种抗菌药物的药敏结果 ;用肠杆菌科基因间重复一... 目的 :研究产金属 β内酰胺酶 (MBL)的嗜麦芽窄食单胞菌感染的菌株同源性和耐药谱。 方法 :MBLE试验检测临床分离对亚胺培南耐药嗜麦芽窄食单胞菌的产MBL菌株 ;E试验检测MBL阳性株对 1 1种抗菌药物的药敏结果 ;用肠杆菌科基因间重复一致序列为引物的聚合酶链反应 (ERIC PCR)方法确定菌株之间的同源性。结果 :MBLE试验检测到MBL阳性株1 3株 ,为我院 1 998— 2 0 0 2年医院感染株 ,1 2株来源于下呼吸道感染 ,1株为尿路感染。 1 3株MBL阳性株对亚胺培南、庆大霉素、阿米卡星、头孢噻肟和头孢曲松均耐药 ,对哌拉西林 三唑巴坦、替卡西林 克拉维酸、头孢哌酮 舒巴坦、头孢他啶、头孢吡肟和环丙沙星等 6种抗菌药物呈现 8种耐药模式 ;ERIC PCR结果显示 ,1 3株MBL阳性株呈现 1 0种基因型 ,4株MBL阳性株为同一基因型 ,其余 9株为独立的基因型。综合分析 ,菌株来源、药敏谱和基因型与之间无显著相关性。结论 :我院产MBL嗜麦芽窄食单胞菌感染以下呼吸道为主 ,其发生呈散发性 ,抗生素的选择性压力可能是造成耐药谱和基因型多态性的主要原因。 展开更多
关键词 嗜麦芽窄食单胞菌 金属Β内酰胺 聚合反应 基因重复一致序列引物 耐药谱
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采用ERIC-PCR与PFGE分析鲍曼不动杆菌基因型和同源性并对比方法学差异 被引量:7
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作者 闻海丰 冯忠军 +1 位作者 秦瑾 于文静 《分子诊断与治疗杂志》 2016年第1期27-31,22,共6页
目的比较脉冲场凝胶电泳(pulsed field gel electrophoresis,PFGE)与肠杆菌科基因间重复序列聚合酶链式反应(enterobacterial repetitive intergenic consensus-polymerase chain reaction,ERICPCR)检测鲍曼不动杆菌同源性的结果差异。... 目的比较脉冲场凝胶电泳(pulsed field gel electrophoresis,PFGE)与肠杆菌科基因间重复序列聚合酶链式反应(enterobacterial repetitive intergenic consensus-polymerase chain reaction,ERICPCR)检测鲍曼不动杆菌同源性的结果差异。方法分别采用PFGE和ERIC-PCR对我院院内分离的43株鲍曼不动杆菌进行分型检测。结果 43株鲍曼不动杆菌通过PFGE分型得出:A型22株、B型10株、C型3株、D型4株、E型2株、F型1株、G型1株;通过ERIC-PCR得出7种型别:Ⅰ型22株、Ⅱ型10株、Ⅲ型3株、Ⅳ型2株、V型3株、Ⅵ型1株、Ⅶ型2株。2种方法结果相符率为76.8%。我院鲍曼不动杆菌存在克隆株传播。结论 ERIC-PCR操作简便、结果可靠,与PFGE结果一致性高,2种分型方法均适合作为医院进行病原菌流行病学调查的分型检测手段。 展开更多
关键词 脉冲场凝胶电泳 杆菌基因重复序列聚合反应 鲍曼不动杆菌
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应用ERIC-PCR对多重耐药大肠埃希菌进行基因分型 被引量:1
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作者 余方友 胡龙华 贾坤茹 《江西医学检验》 CAS 2005年第6期513-514,525,共3页
目的研究ERIC-PCR用于大肠埃希菌基因分型的可靠性。方法102株多重耐药大肠埃希菌采用双纸片扩散法检测ESBLs,用ERIC-PCR进行基因分型。结果102株多重耐药大肠埃希菌可分为六个基因型,主要为I和II型,分别为40株和24株。结论ERIC-PCR可... 目的研究ERIC-PCR用于大肠埃希菌基因分型的可靠性。方法102株多重耐药大肠埃希菌采用双纸片扩散法检测ESBLs,用ERIC-PCR进行基因分型。结果102株多重耐药大肠埃希菌可分为六个基因型,主要为I和II型,分别为40株和24株。结论ERIC-PCR可用于大肠埃希菌的基因分型。 展开更多
关键词 杆菌重复序列-多聚反应 埃希菌 基因分型
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