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应用肠杆菌科基因间重复序列聚合酶链反应对鲍曼不动杆菌进行同源性分析 被引量:2
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作者 闻海丰 秦瑾 +2 位作者 于文静 冯彦蕊 冯忠军 《分子诊断与治疗杂志》 2015年第4期247-252,共6页
目的了解临床不同来源的鲍曼不动杆菌是否存在同源性,判断其是否存在耐药菌株的克隆播散,追踪其在医院交叉感染的可能途径,以便有效防控鲍曼不动杆菌在医院中传播。方法收集2012年10月至2013年6月临床分离的73株多重耐药鲍曼不动杆菌,... 目的了解临床不同来源的鲍曼不动杆菌是否存在同源性,判断其是否存在耐药菌株的克隆播散,追踪其在医院交叉感染的可能途径,以便有效防控鲍曼不动杆菌在医院中传播。方法收集2012年10月至2013年6月临床分离的73株多重耐药鲍曼不动杆菌,用肠杆菌科基因间重复序列-聚合酶链反应(enterobacterial repetitive intergenic consensus-polymerase chain reaction,ERIC-PCR)对菌株进行同源性分析。结果 73株多重耐药鲍曼不动杆菌经ERIC-PCR分型分为8个基因型,分别用A、B、C、D、E、F、G、H表示,其中A型31株,B型15株,C型12株,D型8株,E型3株,F型2株,G和H型各为1株。A型为主要的流行株,分布在多个不同的科室。重症监护室(intensive care unit,ICU)分离的菌株存在6个基因型;骨科系统病区存在4个基因型;急诊科有5个基因型;内科发现有6个基因型;外科发现3个基因型。ICU病房环境物体表面共分离出4株鲍曼不动杆菌,其中9号和10号菌株来自于不同患者的床旁,12号和13号来自于护理站电脑键盘。结论临床分离的多重耐药鲍曼不动杆菌存在多个基因型。多重耐药鲍曼不动杆菌存在时间和空间的聚集性。 展开更多
关键词 鲍曼不动杆菌 多重耐药性 杆菌科基因重复序列-聚合反应 同源性
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肠道细菌基因间重复共有序列-聚合酶链式反应指纹图谱技术用于细菌分型的研究进展 被引量:1
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作者 侯霞霞 王云霞 +3 位作者 胡雪 吕志勇 刘丽君 李翠枝 《乳业科学与技术》 2019年第2期28-34,共7页
肠道细菌基因间重复共有序列-聚合酶链式反应(enterobacterial repetitive intergenic consensus-polymerase chain reaction,ERIC-PCR)指纹图谱技术利用普遍存在于生物体内的ERIC进行引物设计,通过基因扩增,获得能够表征其基因组结构... 肠道细菌基因间重复共有序列-聚合酶链式反应(enterobacterial repetitive intergenic consensus-polymerase chain reaction,ERIC-PCR)指纹图谱技术利用普遍存在于生物体内的ERIC进行引物设计,通过基因扩增,获得能够表征其基因组结构的产物,该方法简单易行、重复性好、用时短,被广泛应用于细菌基因分型及同源性判别。本文简述细菌分型的研究背景和ERIC-PCR指纹图谱技术的原理及特点,归纳该技术在细菌基因分型方面的优缺点及其在常见食源性致病菌基因分型中的应用现状,并对ERIC-PCR指纹图谱技术应用于乳品企业污染菌溯源的研究进行展望。 展开更多
关键词 道细菌基因重复共有序列-聚合链式反应 指纹图谱技术 细菌分型 污染菌溯源
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肉鸡生产链中肠炎沙门氏菌耐药性分析及ERIC-PCR分型 被引量:9
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作者 李楠 赵思俊 +7 位作者 王娟 赵建梅 李玉清 黄秀梅 王君玮 丁宜宝 刘焕奇 曲志娜 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2016年第3期120-124,共5页
目的:了解肉鸡生产链中肠炎沙门氏菌耐药性情况以及各生产环节菌株间亲缘关系,为临床用药及菌株追踪溯源提供依据。方法:采用微量肉汤稀释法对171株肠炎沙门氏菌进行13种抗菌药物药敏实验;采用肠杆菌基因间重复共有序列-聚合酶链式反... 目的:了解肉鸡生产链中肠炎沙门氏菌耐药性情况以及各生产环节菌株间亲缘关系,为临床用药及菌株追踪溯源提供依据。方法:采用微量肉汤稀释法对171株肠炎沙门氏菌进行13种抗菌药物药敏实验;采用肠杆菌基因间重复共有序列-聚合酶链式反应(enterobacterial repetitive intergenic consensus-polymerase chain reaction,ERIC-PCR)法对33株不同生产环节耐药菌株进行分子分型;采用SPSS 20.0软件、Gel-Pro Analyer 4.0和NTSYS pc 2.1软件进行分析。结果:171株肠炎沙门氏菌对13种药物耐药情况不同,其中对氨苄西林耐药情况最严重,耐药率高达90.06%,对恩诺沙星、氧氟沙星最为敏感,耐药率均仅为5.26%;不同环节间耐药性差异极显著(P〈0.01);多重耐药率高达95.32%,共有26种耐药谱型。不同环节的33株肠炎沙门氏菌分为4种(Ⅰ~Ⅳ)基因型,遗传相似性在66%~100%,Ⅰ型为优势基因型;基因型相同的菌株耐药谱不一定相同,反之,耐药谱相同的菌株基因型不一定相同。结论:肉鸡生产链条中沙门氏菌对多种抗菌药物产生耐药性,且耐药谱种类繁多;沙门氏菌能够沿着生产链进行水平传播,肉鸡场环节菌株基因型相对复杂,菌株基因型与耐药表型之间无明显相关性。 展开更多
关键词 炎沙门氏菌 肉鸡 耐药性 杆菌基因重复共有序列-聚合链式反应
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猪源肠出血性大肠杆菌的分离、鉴定及特性研究 被引量:6
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作者 满晓营 吴斌 +5 位作者 张璇 余腾 罗勇 刘峰 金梅林 陈焕春 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第10期984-987,共4页
目的探讨猪源肠出血性大肠埃希菌病原学特征。方法对所分离的菌株进行生化鉴定、药敏试验,并使用聚合酶链反应(PCR)技术检测毒力基因、耐药基因,同时对致病性的菌株进行外膜蛋白分型、REP-PCR和ERIC-PCR分析。结果从315株大肠杆菌中筛... 目的探讨猪源肠出血性大肠埃希菌病原学特征。方法对所分离的菌株进行生化鉴定、药敏试验,并使用聚合酶链反应(PCR)技术检测毒力基因、耐药基因,同时对致病性的菌株进行外膜蛋白分型、REP-PCR和ERIC-PCR分析。结果从315株大肠杆菌中筛选到山梨醇阴性的EHEC21株,其中含有stx1基因的菌株有4株,含有stx2基因3株,含有eae基因的17株,外膜蛋白分型属于三个型,其中OMP-1型最多,有15株,OMP-2型3株,OMP-3型3株,REP-PCR和ERIC-PCR结果显示这些致病性菌株带型差异性较大,分属于不同的亚群。结论华中地区是养殖业比较发达的地区,而且人均消费猪肉比例也较高,EHEC的存在对人是一种潜在的威胁,应加强监测力度,防止该菌在人群中感染和流行。 展开更多
关键词 出血性大杆菌 外膜蛋白 杆菌基因重复一致序列聚合链式反应(ERIC-PCR)和重复一致回文序列 聚合链式反应(REP—PCR)
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ERIC-PCR技术在鲍曼不动杆菌基因分型中的应用评估 被引量:14
5
作者 李永丽 应春妹 陈艺升 《检验医学》 CAS 2013年第7期621-624,共4页
目的了解仁济医院鲍曼不动杆菌的基因同源性,验证肠杆菌科基因间重复序列(ERIC)-聚合酶链反应(PCR)在鲍曼不动杆菌基因分型中的实用性。方法采用琼脂稀释法检测临床分离的81株鲍曼不动杆菌对临床常用抗菌药物的最低抑菌浓度(MIC);采用ER... 目的了解仁济医院鲍曼不动杆菌的基因同源性,验证肠杆菌科基因间重复序列(ERIC)-聚合酶链反应(PCR)在鲍曼不动杆菌基因分型中的实用性。方法采用琼脂稀释法检测临床分离的81株鲍曼不动杆菌对临床常用抗菌药物的最低抑菌浓度(MIC);采用ERIC-PCR对81株鲍曼不动杆菌进行基因分型;使用脉冲场凝胶电泳(PFGE)技术对其中的43株耐亚胺培南鲍曼不动杆菌进一步分型,以PFGE分型为参考标准,验证ERIC-PCR在基因分型中的实用性。结果 81株鲍曼不动杆菌对临床常用的13种抗菌药物普遍耐药,只对米诺环素耐药率最低,为30.9%,其次是亚胺培南,为53.1%,对其他抗菌药物的耐药率均>60%。81株鲍曼不动杆菌ERIC-PCR分型主要为A、B、C、D、E、F 6型,其中A、B、C型为主要的流行株。43株耐亚胺培南鲍曼不动杆菌分型为A型41株(A1型29株,A2型12株)、B型1株、C型1株。PFGE分型将其分为5型,A型34株(A1型31株,A2型3株),B型6株,C、D、E分型各1株。结论仁济医院鲍曼不动杆菌存在克隆播散,且主要为耐亚胺培南鲍曼不动杆菌。ERIC-PCR分辨力较强,结果可靠,与PFGE结果具有一定的相关性,是一种简便、快捷的基因分型技术。 展开更多
关键词 鲍曼不动杆菌 杆菌科基因重复序列 聚合反应 脉冲场凝胶电泳 同源性
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多重耐药鲍曼不动杆菌ERIC-PCR的分子流行病学研究 被引量:10
6
作者 钟海波 伍哓锋 +4 位作者 曾瑜 彭湘明 邹石海 潘海燕 汪得喜 《现代医院》 2013年第12期19-22,共4页
目的监测医院不同病区分离的多重耐药鲍曼不动杆菌属耐药性变迁及基因同源性,为临床治疗和医院感染控制提供依据。方法收集2006—2008年医院临床分离非重复多重耐药鲍曼不动杆菌株23株,采用Kirby—Bauer(K—B)法进行药敏试验,应用... 目的监测医院不同病区分离的多重耐药鲍曼不动杆菌属耐药性变迁及基因同源性,为临床治疗和医院感染控制提供依据。方法收集2006—2008年医院临床分离非重复多重耐药鲍曼不动杆菌株23株,采用Kirby—Bauer(K—B)法进行药敏试验,应用肠杆菌科基因间重复序列聚合酶链反应(ERIC—PCR)对菌株进行DNA分型及同源性分析。结果23株鲍曼不动杆菌中,对3种或以上抗茵药耐药有22株;ERIC—PCR谱型表现为7种基因型,其中来源于不同的2个克隆株A型和B型,共占79.3%,且2个克隆株的相似度为72.7%。结论来自多个病区的多重鲍曼不动杆菌对抗生素耐药率高,且具有基因同源性,存在院内克隆传播。 展开更多
关键词 鲍曼不动杆菌 杆菌科基因重复序列聚合反应 分子流行病学
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青岛两所医院鲍曼不动杆菌碳青霉烯酶基因及同源性分析 被引量:4
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作者 李茜 李庆淑 +2 位作者 李智 曲彦 胡丹 《中国感染控制杂志》 CAS 北大核心 2015年第7期437-442,共6页
目的了解青岛市两所医院鲍曼不动杆菌(AB)耐药情况、分布特征,碳青霉烯酶基因携带情况。方法收集两所医院临床分离的145株(A院78株,B院67株)AB进行药敏试验,采用聚合酶链反应(PCR)扩增碳青霉烯酶基因,肠杆菌科基因间一致重复序列(ERIC)-... 目的了解青岛市两所医院鲍曼不动杆菌(AB)耐药情况、分布特征,碳青霉烯酶基因携带情况。方法收集两所医院临床分离的145株(A院78株,B院67株)AB进行药敏试验,采用聚合酶链反应(PCR)扩增碳青霉烯酶基因,肠杆菌科基因间一致重复序列(ERIC)-PCR对菌株进行同源性分析。结果 A院AB对临床常用的16种抗菌药物普遍耐药,对头孢哌酮/舒巴坦耐药率最低(3.85%),其次是米诺环素(16.67%),对其他抗菌药物耐药率均>73%。B院AB对常用的23种抗菌药物普遍耐药,对米诺环素和替加环素均不耐药,对阿米卡星和左氧氟沙星的耐药率分别为23.88%、38.81%,对其他抗菌药物的耐药率均>64%。两院所有菌株均携带OXA-51基因,A、B两院碳青霉烯耐药组OXA-23基因的携带率分别为86.76%(59/68),56.67%(34/60),差异有统计学意义(χ2=14.53,P<0.001);A院3株菌携带OXA-58基因,B院未检出OXA-58基因。145菌株共分为8个基因型,其中A型71株和E型37株,为主要流行株;A院主要流行A型(46.15%)和E型(41.03%),B院主要流行A型(52.24%)和C型(17.91%)。结论两所医院临床分离的AB耐药情况严重,且存在医院流行,OXA型酶OXA-23、OXA-51基因在介导AB对碳青霉烯类药物耐药中发挥重要作用。 展开更多
关键词 鲍曼不动杆菌 碳青霉烯 多重耐药 抗药性 微生物 杆菌科基因重复序列-聚合反应
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采用ERIC-PCR与PFGE分析鲍曼不动杆菌基因型和同源性并对比方法学差异 被引量:7
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作者 闻海丰 冯忠军 +1 位作者 秦瑾 于文静 《分子诊断与治疗杂志》 2016年第1期27-31,22,共6页
目的比较脉冲场凝胶电泳(pulsed field gel electrophoresis,PFGE)与肠杆菌科基因间重复序列聚合酶链式反应(enterobacterial repetitive intergenic consensus-polymerase chain reaction,ERICPCR)检测鲍曼不动杆菌同源性的结果差异。... 目的比较脉冲场凝胶电泳(pulsed field gel electrophoresis,PFGE)与肠杆菌科基因间重复序列聚合酶链式反应(enterobacterial repetitive intergenic consensus-polymerase chain reaction,ERICPCR)检测鲍曼不动杆菌同源性的结果差异。方法分别采用PFGE和ERIC-PCR对我院院内分离的43株鲍曼不动杆菌进行分型检测。结果 43株鲍曼不动杆菌通过PFGE分型得出:A型22株、B型10株、C型3株、D型4株、E型2株、F型1株、G型1株;通过ERIC-PCR得出7种型别:Ⅰ型22株、Ⅱ型10株、Ⅲ型3株、Ⅳ型2株、V型3株、Ⅵ型1株、Ⅶ型2株。2种方法结果相符率为76.8%。我院鲍曼不动杆菌存在克隆株传播。结论 ERIC-PCR操作简便、结果可靠,与PFGE结果一致性高,2种分型方法均适合作为医院进行病原菌流行病学调查的分型检测手段。 展开更多
关键词 脉冲场凝胶电泳 杆菌科基因重复序列聚合链式反应 鲍曼不动杆菌
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应用ERIC-PCR对多重耐药大肠埃希菌进行基因分型 被引量:1
9
作者 余方友 胡龙华 贾坤茹 《江西医学检验》 CAS 2005年第6期513-514,525,共3页
目的研究ERIC-PCR用于大肠埃希菌基因分型的可靠性。方法102株多重耐药大肠埃希菌采用双纸片扩散法检测ESBLs,用ERIC-PCR进行基因分型。结果102株多重耐药大肠埃希菌可分为六个基因型,主要为I和II型,分别为40株和24株。结论ERIC-PCR可... 目的研究ERIC-PCR用于大肠埃希菌基因分型的可靠性。方法102株多重耐药大肠埃希菌采用双纸片扩散法检测ESBLs,用ERIC-PCR进行基因分型。结果102株多重耐药大肠埃希菌可分为六个基因型,主要为I和II型,分别为40株和24株。结论ERIC-PCR可用于大肠埃希菌的基因分型。 展开更多
关键词 杆菌重复序列-多聚反应 埃希菌 基因分型
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新疆维吾尔族肠道中高产胞外多糖双歧杆菌的筛选及其抗氧化活性 被引量:4
10
作者 蔡静静 徐晓裕 +4 位作者 张艳 张亚川 魏小晶 阚泽宇 倪永清 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2020年第8期144-151,共8页
使用Wilkins-Chalgren厌氧菌琼脂和BSM培养基作为筛选平板,结合重复基因外回文序列-聚合酶链式反应和16S rRNA序列分析,对新疆维吾尔族婴儿及其母亲粪便中的双歧杆菌(Bifidobacterium)进行分离鉴定,并筛选出高产胞外多糖的双歧杆菌,测... 使用Wilkins-Chalgren厌氧菌琼脂和BSM培养基作为筛选平板,结合重复基因外回文序列-聚合酶链式反应和16S rRNA序列分析,对新疆维吾尔族婴儿及其母亲粪便中的双歧杆菌(Bifidobacterium)进行分离鉴定,并筛选出高产胞外多糖的双歧杆菌,测定其多糖的抗氧化活性以及菌株的耐受性和黏附性。结果显示,20份粪便样品中共分离出52株双歧杆菌,其中假小链双歧杆菌(B.pseudocatenulatum)14株,假长双歧杆菌(B.pseudolongum)8株,两歧双歧杆菌(B.bifidum)9株,短双歧杆菌(B.breve)7株,长双歧杆菌婴儿亚种(B.longum subsp.infantis)5株,动物双歧杆菌乳亚种(B.animal subsp.lactis)6株以及长双歧杆菌(B.longum)3株。经过表型初筛和苯酚-硫酸法复筛,共筛选出7株高产胞外多糖的双歧杆菌,37℃发酵36 h后胞外多糖产量均可达400 mg/L以上。抗氧化活性实验结果表明7株双歧杆菌所产的胞外多糖对过氧化氢自由基、超氧阴离子自由基、羟自由基和1,1-二苯基-2-三硝基苯肼自由基均有一定的清除能力。此外,菌株BF66-16相较于其他几株双歧杆菌具有较强的胃肠液耐受性以及黏附性,因此来源于婴儿粪便的BF66-16可以作为潜在的抗氧化菌株应用于制药和食品工业中。 展开更多
关键词 双歧杆菌 重复基因外回文序列-聚合链式反应 胞外多糖 抗氧化活性
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长沙地区产金属β-内酰胺酶铜绿假单胞菌的分子流行病学特征 被引量:5
11
作者 邬靖敏 邹明祥 李军 《中国感染控制杂志》 CAS 北大核心 2016年第7期447-451,共5页
目的了解长沙地区多重耐药铜绿假单胞菌(PA)产金属β-内酰胺酶(MBL)菌株基因型和流行情况。方法收集该地区7所综合医院临床分离的PA,对菌株进行鉴定和药敏试验,采用EDTA协同试验、E-test MBL进行MBL表型筛选,聚合酶连反应(PCR)明确其基... 目的了解长沙地区多重耐药铜绿假单胞菌(PA)产金属β-内酰胺酶(MBL)菌株基因型和流行情况。方法收集该地区7所综合医院临床分离的PA,对菌株进行鉴定和药敏试验,采用EDTA协同试验、E-test MBL进行MBL表型筛选,聚合酶连反应(PCR)明确其基因型,肠杆菌科基因间重复序列聚合酶链反应(ERIC-PCR)进行同源性分析。结果经EDTA协同和E-test MBL初步筛查,81株PA中仅10株为强阳性;PCR结果显示,18株PA MBL基因阳性,其中IMP-9型11株,IMP-1型1株和VIM-2型6株,未检测出SIM、SPM、GIM和NDM-1基因型。ERIC-PCR分型结果显示,12株产IMP PA存在多个型别,而6株产VIM-2菌株为同一型别。结论长沙地区多重耐药PA以IMP-9和VIM-2基因型最常见。 展开更多
关键词 铜绿假单胞菌 金属Β-内酰胺 金属 基因型 杆菌科基因重复序列聚合反应
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中山市生鲜畜禽肉中变形杆菌的污染分布及ERIC-PCR分型 被引量:3
12
作者 陈善娇 孙冷宁 +2 位作者 陈少婉 王宗源 毕水莲 《肉类研究》 北大核心 2018年第7期13-17,共5页
调查中山市某菜市场生鲜畜禽肉中变形杆菌的污染情况,分析占优势的奇异变形杆菌的亲缘关系。采集268份生鲜畜禽肉样品,使用聚合酶链式反应检测和生化实验的方法对污染的变形杆菌进行分离鉴定,并利用肠杆菌基因间保守重复共同系列-聚合... 调查中山市某菜市场生鲜畜禽肉中变形杆菌的污染情况,分析占优势的奇异变形杆菌的亲缘关系。采集268份生鲜畜禽肉样品,使用聚合酶链式反应检测和生化实验的方法对污染的变形杆菌进行分离鉴定,并利用肠杆菌基因间保守重复共同系列-聚合酶链式反应(enterobacterial repetitive intergenic consensus-polymerase chain reaction,ERIC-PCR)技术对分离的奇异变形杆菌进行分子分型及同源性分析。结果表明:所有类型的样品受变形杆菌污染严重,程度由大到小依次为鸡肉、鸭肉和猪肉;PCR与生化鉴定结果一致,共检出123株变形杆菌,变形杆菌阳性携带率为51.6%,其中117株为奇异变形杆菌;ERIC-PCR指纹图谱条带均为3~9条,呈现良好的多态性;101株奇异变形杆菌集中分布在E、I、K簇,簇内相似性大于70%。ERIC-PCR技术适用于奇异变形杆菌的分型及同源性研究,对变形杆菌引起的食品污染和亲缘性溯源具有重要意义。 展开更多
关键词 鲜肉 变形杆菌 杆菌基因保守重复共同系列-聚合链式反应 分型 亲缘性溯源
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某医院耐碳青霉烯酶类鲍曼不动杆菌耐药基因研究和同源性分析 被引量:2
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作者 沈进 孙少君 +3 位作者 杨茜云 马军 王晓明 王秋波 《当代医学》 2021年第23期5-7,共3页
目的研究本院耐碳青霉烯酶类鲍曼不动杆菌(CRAB)的耐药基因情况,并通过基因检测分析细菌同源性,为防止院内感染、预防性用药提供依据。方法收集无锡市骨科医院2019年1—11月临床分离的56株CRAB菌株,细菌经过分离培养,采用BD Phoenix100... 目的研究本院耐碳青霉烯酶类鲍曼不动杆菌(CRAB)的耐药基因情况,并通过基因检测分析细菌同源性,为防止院内感染、预防性用药提供依据。方法收集无锡市骨科医院2019年1—11月临床分离的56株CRAB菌株,细菌经过分离培养,采用BD Phoenix100全自动微生物分析鉴定仪进行菌株鉴定和药敏试验,并采用PCR的方法检测鲍曼不动杆菌的碳青霉烯类耐药基因,菌株的同源性分析使用肠杆菌科基因组内重复一致序列聚合酶链反应(ERIC-PCR)方法。结果56株CRAB菌株中有48株(85.7%)OXA51基因阳性,52株(92.9%)OXA23基因阳性,均未检测到OXA24及OXA58基因,对OXA23和OXA51阳性细菌进行同源性分析,38株(80.0%)属于同一基因谱。所有细菌对18种药物耐药率>95.0%,且对美罗培南,亚胺培南的耐药率均>98.0%。结论无锡市骨科医院CRAB主要为OXA23型、OXA51型菌株,且该类细菌呈多重耐药,提示临床应加强医院感染的管理,防止该类鲍曼不动杆菌的暴发传播。 展开更多
关键词 多重耐药鲍曼不动杆菌 碳青霉烯类耐药基因 同源性分析 杆菌重复基因一致性-聚合反应
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2型糖尿病合并急性胰腺炎大鼠肠道微生物ERIC-PCR指纹图谱的分析 被引量:2
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作者 王永磊 苏峰 +3 位作者 张静 杨彦文 张荣芳 倪军 《中华灾害救援医学》 2018年第5期251-257,共7页
目的应用肠杆菌基因间重复共有序列-聚合酶链式反应(enterobacteria repetitive intergenic consen sussequencespolymerase chain reaction,ERIC-PCR)技术检测2型糖尿病合并急性胰腺炎后大鼠肠道内菌群的数量及多样性的改变情况。方法4... 目的应用肠杆菌基因间重复共有序列-聚合酶链式反应(enterobacteria repetitive intergenic consen sussequencespolymerase chain reaction,ERIC-PCR)技术检测2型糖尿病合并急性胰腺炎后大鼠肠道内菌群的数量及多样性的改变情况。方法40只10周龄雄性大鼠,其中20只Wistar大鼠,随机分为空白对照组(QB组)、单纯急性胰腺炎大鼠模型(AP组);20只Goto-kakisaki自发性2型糖尿病大鼠(GK大鼠)随机分为2型糖尿病组(DM组)、2型糖尿病合并急性胰腺炎组(DAP组);每组10只,分别标号。其中AP组、DAP组作为造模组。检测DAP组和AP组24 h血清胰淀粉酶活性水平和随机血糖。48 h后:(1)处死各组大鼠,取胰腺观察病理损伤程度并以改良Schmidt法为标准进行胰腺组织病理评分。(2)采集各组大鼠新鲜粪便,并提取新鲜大鼠粪便基因组,进行基因组扩增,将PCR产物点样于琼脂糖凝胶,制作目的 ERIC-PCR指纹图谱;(3)同时将采集的新鲜粪便处理后制成不同浓度梯度细菌悬浊液,接种于BBL琼脂培养基、MRS肉汤培养基、SS琼脂培养基、MAC琼脂培养基上培养并计数。结果 (1)AP组、DAP组病死率分别是20%(2/10)和40%(4/10),QB组、DM组无死亡,DAP组病理评分最高;(2)DAP组术后24 h血糖水平较AP组升高,差异具有统计学意义(t=2.24,P<0.05);DAP组术后24 h血淀粉酶较AP组无明显变化,两组比较差异无统计学意义(t=6.40,P=0.53);(3)肠道菌群多样性指数、ERIC-PCR指纹图谱及相似性聚类分析显示,DAP组特征性条带数量减少且肠道菌群多样性改变;(4)4组间肠道微生物菌群比较,差异具有统计学意义。进一步两两比较,DAP组的双歧杆菌和乳酸杆菌低于QB组和AP组,差异具有统计学意义(P<0.05);DAP组的大肠杆菌和变形杆菌高于QB组和AP组,差异具有统计学意义(P<0.05)。结论 (1)2型糖尿病大鼠并发急性胰腺炎后肠道菌群的结构均发生改变,菌群多样性减少;益生菌减少及条件致病菌增多;(2)肠道菌群的变化参与2型糖尿病合并急性胰腺炎的病程进展。 展开更多
关键词 菌群失调 糖尿病合并急性胰腺炎 常规菌群培养 杆菌基因重复共有序列-聚合链式反应
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长沙地区临床分离碳青霉烯类耐药鲍曼不动杆菌的分子流行病学特征 被引量:17
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作者 梁伟 邹明祥 +4 位作者 邬靖敏 邬国军 李军 豆清娅 刘文恩 《中南大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2012年第5期521-526,共6页
目的:了解长沙地区临床分离鲍曼不动杆菌的耐药性,探讨碳青霉烯类抗生素耐药菌株的分子流行病学特征。方法:收集长沙地区10所综合性医院2010年3月至2010年12月间临床分离的非重复鲍曼不动杆菌株205株;采用K-B法检测药物敏感性,改良双纸... 目的:了解长沙地区临床分离鲍曼不动杆菌的耐药性,探讨碳青霉烯类抗生素耐药菌株的分子流行病学特征。方法:收集长沙地区10所综合性医院2010年3月至2010年12月间临床分离的非重复鲍曼不动杆菌株205株;采用K-B法检测药物敏感性,改良双纸片协同试验检测金属β-内酰胺酶(金属酶),改良Hodge试验筛查碳青霉烯酶;PCR扩增OXA-23,OXA-24,OXA-51,OXA-58及IMP-1和VIM-2型碳青霉烯酶基因,并进行测序分析。应用肠杆菌科基因间一致重复序列聚合酶链反应(enterobacterial repetitive intergenic consensus PCR,ERIC-PCR)对菌株进行DNA分型及同源性分析。结果:在监测的18种药物中,耐药率超过50%的达14种。其中哌拉西林耐药率最高(80.5%),头孢哌酮/舒巴坦耐药率最低(2.5%)。共筛选出耐碳青霉烯类药物鲍曼不动杆菌115株,其金属酶表型及基因检测均为阴性;改良Hodge试验阳性71株,其中64株OXA-23基因扩增阳性。115株菌株OXA-51均阳性,未检出OXA-24,OXA-58基因。115株菌株共分为7个ERIC基因型。其中A型19株,B型72株,为主要的流行克隆。结论:长沙地区临床分离鲍曼不动杆菌多重耐药十分严重;产OXA-23和OXA-51型碳青霉烯酶是鲍曼不动杆菌对碳青霉烯类药物耐药的重要机制,且碳青霉烯类耐药菌株存在克隆流行。 展开更多
关键词 鲍曼不动杆菌 碳青霉烯 杆菌基因一致重复序列聚合反应 分子流行病学特征
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大蒜多糖对急性酒精性肝损伤小鼠肠道菌群失调的影响 被引量:14
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作者 范颖 赵鑫 +2 位作者 李娜 吴曼曼 李新莉 《食品研究与开发》 CAS 北大核心 2018年第22期141-146,共6页
应用肠杆菌基因间重复共有序列基因扩增(enterobacterial repetitive intergenic consensus-polymerase chain reaction,ERIC-PCR)和聚合酶链式反应--变性梯度凝胶电泳(polymerase chain reaction-denaturing gradient gel electrophore... 应用肠杆菌基因间重复共有序列基因扩增(enterobacterial repetitive intergenic consensus-polymerase chain reaction,ERIC-PCR)和聚合酶链式反应--变性梯度凝胶电泳(polymerase chain reaction-denaturing gradient gel electrophoresis,PCR-DGGE)研究大蒜多糖对急性酒精性肝损伤小鼠肠道菌群失调的影响。灌胃红星二锅头建立小鼠急性酒精性肝损伤模型,ERIC-PCR和PCR-DGGE电泳获得肠道菌群指纹图谱,分析肠道菌群的相似性和多样性并鉴定优势条带序列。ERIC-PCR结果表明急性酒精性肝损伤模型小鼠肠道菌群结构发生明显改变,以360 bp的条带为优势条带,610 bp左右的条带强度减弱,大蒜多糖预防给药组中360 bp左右的条带强度减弱。PCR-DGGE结果显示急性酒精性肝损伤的小鼠肠道菌群多样性指数降低,优杆菌属和乳酸菌属细菌明显减少。大蒜多糖高剂量组的多样性指数和均匀度指数最高,优杆菌属和乳酸菌属细菌增多。大蒜多糖可以促进肠道中优杆菌属和乳酸菌属生长,调节急性酒精性肝损伤伴有的肠道菌群失调。 展开更多
关键词 大蒜多糖 急性酒精性肝损伤 道菌群 杆菌基因重复共有序列基因扩增 聚合链式反应-变性梯度凝胶电泳
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产碳青霉烯酶产气肠杆菌的ERIC-PCR图谱分析 被引量:5
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作者 刘瑛 费奇力 +3 位作者 陈峰 陶晓勤 刁文晶 沈立松 《中华医院感染学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2011年第11期2176-2178,共3页
目的了解医院临床产碳青霉烯酶产气肠杆菌感染流行情况,为医院感染控制提供帮助。方法对医院检验科微生物实验室在2009年6月-2010年3月临床分离出的16株产碳青霉烯酶产气肠杆菌及1株非产碳青霉烯酶产气肠杆菌,用肠杆菌基因间重复一致序... 目的了解医院临床产碳青霉烯酶产气肠杆菌感染流行情况,为医院感染控制提供帮助。方法对医院检验科微生物实验室在2009年6月-2010年3月临床分离出的16株产碳青霉烯酶产气肠杆菌及1株非产碳青霉烯酶产气肠杆菌,用肠杆菌基因间重复一致序列聚合酶链反应(ERIC-PCR)进行基因分型。结果 17株菌株分为两个克隆型,其中16株产碳青霉烯酶产气肠杆菌为同一型,而另1株非产酶菌株为另一型。结论医院存在产碳青霉烯酶产气肠杆菌克隆传播现象,医护人员应予以高度关注,并及时采取有效措施。 展开更多
关键词 碳青霉烯 产气杆菌 杆菌基因重复一致序列聚合反应
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大肠埃希菌耐药谱型、基因型和生物膜表型关系研究 被引量:7
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作者 陈朝喜 朱恒乾 +1 位作者 廖晓萍 刘雅红 《动物医学进展》 CSCD 北大核心 2011年第4期59-62,共4页
以ATCC25922为研究对象,采用改良结晶紫染色,快速银染法和扫描电镜技术对其生物被膜进行定量和定性研究,建立大肠埃希菌生物被膜体外模型,利用优化的模型条件对249株临床分离株进行验证。采用琼脂平板计数法绘制大肠埃希菌浮游菌和被膜... 以ATCC25922为研究对象,采用改良结晶紫染色,快速银染法和扫描电镜技术对其生物被膜进行定量和定性研究,建立大肠埃希菌生物被膜体外模型,利用优化的模型条件对249株临床分离株进行验证。采用琼脂平板计数法绘制大肠埃希菌浮游菌和被膜菌生长曲线,比较其生长特性的异同。对不同成膜能力的大肠埃希菌临床分离株进行色氨酸定量试验,分析不同培养条件对生物被膜菌胞外基质分泌量的影响。快速银染法和扫描电镜定性研究结果表明,大肠埃希菌形成生物被膜后,形成一种浮游细菌和生物被膜细菌共同分布于同一生存空间内的特殊生理结构;不同稀释度的接种量对细菌生物被膜生物量的变化影响不显著(P>0.05)。249株大肠埃希菌分为强成膜能力、中等成膜能力、弱成膜能力和无成膜能力4个表型,分别占3.21%、18.88%、51.81%、26.10%。 展开更多
关键词 耐药谱型 生物被膜表型 基因型 杆菌基因重复一致序列聚合反应
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呼吸重症监护病房2008~2011年鲍曼不动杆菌的耐药性变迁及同源性分析 被引量:5
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作者 谭湘淑 韩新鹏 葛淑华 《西安交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2013年第3期371-374,共4页
目的监测呼吸重症监护室(RICU)临床分离的非重复性鲍曼不动杆菌的耐药性变迁趋势及基因同源性状况。方法收集RICU 2008年~2011年临床分离的非重复性鲍曼不动杆菌,采用K-B(Kirby-Bauer)法进行药敏试验,并应用ERIC-PCR进行基因同源性分... 目的监测呼吸重症监护室(RICU)临床分离的非重复性鲍曼不动杆菌的耐药性变迁趋势及基因同源性状况。方法收集RICU 2008年~2011年临床分离的非重复性鲍曼不动杆菌,采用K-B(Kirby-Bauer)法进行药敏试验,并应用ERIC-PCR进行基因同源性分析。结果①2008年~2011年RICU共分离非重复性鲍曼不动杆菌232株,其中标本来源以痰液为主,占89.66%;②除米诺环素外,对常见抗生素的耐药率均有增加的趋势;对碳青霉烯类抗生素的耐药率已高达85%以上;③所收集的菌株可分为的5个克隆型,其中A型45株,B型61株,C型79株,D型32株,E型15株。结论 RICU检出的鲍曼不动杆菌对抗生素耐药率较高,且具有基因同源性,提示有耐药基因的水平转移。 展开更多
关键词 呼吸ICU 鲍曼不动杆菌 耐药率 杆菌科基因重复序列聚合反应
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75株碳青霉烯类耐药铜绿假单胞菌ERIC-PCR菌种分型及其主要耐药机制研究 被引量:10
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作者 张勇 刘爱胜 文艳 《检验医学》 CAS 2014年第7期755-759,共5页
目的探讨碳青霉烯类耐药的铜绿假单胞菌同源性及其主要耐药机制。方法收集临床标本946份,分离出碳青霉烯类耐药的铜绿假单胞菌,采用琼脂稀释法进行体外药物敏感性试验;采用肠杆菌基因间重复一致序列为引物的聚合酶链反应(ERIC-PCR)进行... 目的探讨碳青霉烯类耐药的铜绿假单胞菌同源性及其主要耐药机制。方法收集临床标本946份,分离出碳青霉烯类耐药的铜绿假单胞菌,采用琼脂稀释法进行体外药物敏感性试验;采用肠杆菌基因间重复一致序列为引物的聚合酶链反应(ERIC-PCR)进行耐药菌株同源性分析;筛选其金属β-内酰胺酶并测定主动外排系统表型来分析碳青霉烯类耐药的铜绿假单胞菌的耐药性。结果共检测出75株碳青霉烯类耐药的铜绿假单胞菌;ERIC-PCR同源性分析显示75株菌株共分为8个型别,其中A型占34.7%(26株)、B型占22.7%(17株);75株碳青霉烯类耐药的铜绿假单胞菌中有13株为产酶株,产酶率为17.3%;外排泵抑制剂MC207110可以使34株美罗培南耐药株的最低抑菌浓度(MIC)较单药时下降4倍或以上,占63.0%。结论本院分离的耐碳青霉烯类铜绿假单胞菌主要有两种类型,产生碳青霉烯水解酶和外排泵机制是碳青霉烯类耐药铜绿假单胞菌耐药的重要机制。 展开更多
关键词 铜绿假单胞菌 碳青霉烯类耐药 杆菌基因重复一致序列为引物的聚合反应 β-内酰胺 主动外排
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