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北京、上海严重急性呼吸道感染儿童中肠道病毒D68的检出与基因特征分析
被引量:
13
1
作者
王延群
赵彦杰
+6 位作者
沈军
谢正德
李亚敏
刘高山
楼永良
陆柔剑
谭文杰
《病毒学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第4期445-452,共8页
为了解肠病毒D68(EV-D68)在北京、上海地区严重急性呼吸道感染(SARI)儿童中的流行情况和分子特征。本研究采集2008~2010年北京儿童医院SARI儿童呼吸道样品259份,2013~2014年上海复旦大学附属儿科医院SARI儿童呼吸道样品441份,采...
为了解肠病毒D68(EV-D68)在北京、上海地区严重急性呼吸道感染(SARI)儿童中的流行情况和分子特征。本研究采集2008~2010年北京儿童医院SARI儿童呼吸道样品259份,2013~2014年上海复旦大学附属儿科医院SARI儿童呼吸道样品441份,采用套式RT-PCR结合测序方法检测筛选EV-D68阳性样品,设计EV-D68全基因组通用引物,对EV-D68阳性样品进行全基因组扩增,收集NCBI核酸数据库中目前所有的EV-D68全基因组序列进行序列分析,比较EV-D68中国和美国流行株的差异。结果发现:北京地区检测EV-D68阳性样品1例,阳性率为0.4%,上海地区检测EV-D68阳性样品4例,阳性率为0.9%。结合目前中国已上传的所有EV-D68相关序列,分析表明:目前中国地区流行的EV-D68主要属于Clade A2或Clade B2亚型,不同于美国的Clade A1、Clade B1、Clade B4和Clade B5亚型,另外EV-D68部分基因进化分析时出现树形结构冲突现象;上述结果表明目前EVD68在北京、上海地区的SARI儿童群体中的感染率较低(5/700;〈1%);中国与美国流行的EV-D68毒株属于不同的分支,差异较大,部分序列分析表明EV-D68病毒可能存在组内重组现象。
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关键词
肠病毒d68型
严重急性呼吸道感染
流行
基因组
测序
原文传递
题名
北京、上海严重急性呼吸道感染儿童中肠道病毒D68的检出与基因特征分析
被引量:
13
1
作者
王延群
赵彦杰
沈军
谢正德
李亚敏
刘高山
楼永良
陆柔剑
谭文杰
机构
中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所应急技术中心
温州医科大学医学病毒学研究所
复旦大学附属儿科医院
首都医科大学北京儿童医院
出处
《病毒学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第4期445-452,共8页
基金
十二五国家传染病重大专项(2013ZX1004101
2013ZX1004601
2014ZX1004001)
文摘
为了解肠病毒D68(EV-D68)在北京、上海地区严重急性呼吸道感染(SARI)儿童中的流行情况和分子特征。本研究采集2008~2010年北京儿童医院SARI儿童呼吸道样品259份,2013~2014年上海复旦大学附属儿科医院SARI儿童呼吸道样品441份,采用套式RT-PCR结合测序方法检测筛选EV-D68阳性样品,设计EV-D68全基因组通用引物,对EV-D68阳性样品进行全基因组扩增,收集NCBI核酸数据库中目前所有的EV-D68全基因组序列进行序列分析,比较EV-D68中国和美国流行株的差异。结果发现:北京地区检测EV-D68阳性样品1例,阳性率为0.4%,上海地区检测EV-D68阳性样品4例,阳性率为0.9%。结合目前中国已上传的所有EV-D68相关序列,分析表明:目前中国地区流行的EV-D68主要属于Clade A2或Clade B2亚型,不同于美国的Clade A1、Clade B1、Clade B4和Clade B5亚型,另外EV-D68部分基因进化分析时出现树形结构冲突现象;上述结果表明目前EVD68在北京、上海地区的SARI儿童群体中的感染率较低(5/700;〈1%);中国与美国流行的EV-D68毒株属于不同的分支,差异较大,部分序列分析表明EV-D68病毒可能存在组内重组现象。
关键词
肠病毒d68型
严重急性呼吸道感染
流行
基因组
测序
Keywords
Enterovirus type
d
68
Severe acute respiratory infections
prevalence
genome
sequencing
分类号
R373.1 [医药卫生—病原生物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
北京、上海严重急性呼吸道感染儿童中肠道病毒D68的检出与基因特征分析
王延群
赵彦杰
沈军
谢正德
李亚敏
刘高山
楼永良
陆柔剑
谭文杰
《病毒学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016
13
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