肠膜明串珠菌种共有4个亚种,其中肠膜明串珠菌肠膜亚种被我国卫生部与美国食品药品监督管理局列为可食用菌种之一。而16S r RNA基因,无法确定肠膜明串珠菌菌株的亚种地位。实验利用16S^23S核糖体间隔序列与3种种特异性基因,并根据肠膜...肠膜明串珠菌种共有4个亚种,其中肠膜明串珠菌肠膜亚种被我国卫生部与美国食品药品监督管理局列为可食用菌种之一。而16S r RNA基因,无法确定肠膜明串珠菌菌株的亚种地位。实验利用16S^23S核糖体间隔序列与3种种特异性基因,并根据肠膜明串珠菌已有的引物进行分析,确定肠膜明串珠菌BD1710归属肠膜明串珠菌肠膜亚种。展开更多
比较16S r RNA基因、dna A、rpoB部分基因序列对Leuconostoc mesenteroides(Leu.mesenteroides)及其近缘种的分辨力,为肠膜明串珠菌提供快速准确的鉴定方法。以分离自自然发酵乳制品中的8株Leu.mesenteroides为研究对象,以其看家基因d...比较16S r RNA基因、dna A、rpoB部分基因序列对Leuconostoc mesenteroides(Leu.mesenteroides)及其近缘种的分辨力,为肠膜明串珠菌提供快速准确的鉴定方法。以分离自自然发酵乳制品中的8株Leu.mesenteroides为研究对象,以其看家基因dnaA、rpoB部分基因序列作为分子标记,结合Gene Bank数据库中的近缘种及亚种的相应序列构建系统发育树,并与16S r RNA基因的系统发育树进行比较。研究发现,基于Leu.mesenteroides及其近缘种的dna A和rpo B部分基因序列构建的系统发育树的拓扑结构与16S r RNA基因基本一致,但分辨率高于16S r RNA基因;种间的dna A和rpo B部分基因序列相似性分别为81.7~84.8%和85.5、87.4%,而种间16S r RNA基因相似性为98.1%~99.5%。相较于16S r RNA基因,dna A和rpo B基因更容易鉴定肠膜明串珠菌及其近缘种,其中rpo B可明晰区分试验菌株与肠膜明串珠菌亚种间的系统发育关系,因此rpo B基因可作为16S r RNA基因的辅助工具用于Leu.mesenteroides及其近缘种的快速鉴定。展开更多
文摘肠膜明串珠菌种共有4个亚种,其中肠膜明串珠菌肠膜亚种被我国卫生部与美国食品药品监督管理局列为可食用菌种之一。而16S r RNA基因,无法确定肠膜明串珠菌菌株的亚种地位。实验利用16S^23S核糖体间隔序列与3种种特异性基因,并根据肠膜明串珠菌已有的引物进行分析,确定肠膜明串珠菌BD1710归属肠膜明串珠菌肠膜亚种。
文摘比较16S r RNA基因、dna A、rpoB部分基因序列对Leuconostoc mesenteroides(Leu.mesenteroides)及其近缘种的分辨力,为肠膜明串珠菌提供快速准确的鉴定方法。以分离自自然发酵乳制品中的8株Leu.mesenteroides为研究对象,以其看家基因dnaA、rpoB部分基因序列作为分子标记,结合Gene Bank数据库中的近缘种及亚种的相应序列构建系统发育树,并与16S r RNA基因的系统发育树进行比较。研究发现,基于Leu.mesenteroides及其近缘种的dna A和rpo B部分基因序列构建的系统发育树的拓扑结构与16S r RNA基因基本一致,但分辨率高于16S r RNA基因;种间的dna A和rpo B部分基因序列相似性分别为81.7~84.8%和85.5、87.4%,而种间16S r RNA基因相似性为98.1%~99.5%。相较于16S r RNA基因,dna A和rpo B基因更容易鉴定肠膜明串珠菌及其近缘种,其中rpo B可明晰区分试验菌株与肠膜明串珠菌亚种间的系统发育关系,因此rpo B基因可作为16S r RNA基因的辅助工具用于Leu.mesenteroides及其近缘种的快速鉴定。