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16SrDNA克隆文库方法分析两纯系鸡回肠及盲肠黏膜细菌的组成
被引量:
3
1
作者
容庭
张洁
+4 位作者
王刚
刘志昌
李书宏
林海丹
陈庄
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第8期1218-1227,共10页
以1日龄纯系的优质肉鸡A系(♂,A组)和惠阳胡须鸡(♂,B组)为试验动物,研究比较两纯系鸡28日龄回肠与盲肠黏膜菌群的组成及多样性。于第28日龄分别从2组中采集鸡2个肠段并提取黏膜细菌基因组DNA,应用16S rDNA基因序列技术,建立2个肠段黏...
以1日龄纯系的优质肉鸡A系(♂,A组)和惠阳胡须鸡(♂,B组)为试验动物,研究比较两纯系鸡28日龄回肠与盲肠黏膜菌群的组成及多样性。于第28日龄分别从2组中采集鸡2个肠段并提取黏膜细菌基因组DNA,应用16S rDNA基因序列技术,建立2个肠段黏膜细菌16S rDNA V3区的随机克隆文库。回肠文库分析发现,A组文库有86个序列共产生6个OTUs()perational taxonomic units),其已知序列主要属于肠球菌属、乳杆菌属、粪球菌属及梭菌属类序列,而B组文库有97个序列共产生2个OTUs,主要属于梭菌类序列;盲肠文库分析发现,A组文库有93个序列共产生44个OTUs,其优势菌群是未分类瘤胃球菌属(18.28%)、粪球菌属(13.98%)、拟杆菌属(10.75%)、Blautia(10.75%)及未分类毛螺菌属(7.53%);B组文库有97个序列共产生42个OTUs,其优势菌群是普拉梭杆菌属(17.53%)、粪球菌属(11.34%)、拟杆菌属(9.28%)及未分类瘤胃球菌属(8.25%);2组盲肠文库中其他菌属的数量存在较大差异,且未发现与大肠杆菌相关的序列。优质肉鸡A系和惠阳胡须鸡28日龄回肠与盲肠黏膜细菌的组成差异明显,尤其是瘤胃球菌属与产丁酸菌的组成比例,这种差异可能是宿主遗传的影响所致。
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关键词
优质肉鸡A系
惠阳胡须鸡
肠道黏膜微生物丛
16S
rDNA克隆文库
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题名
16SrDNA克隆文库方法分析两纯系鸡回肠及盲肠黏膜细菌的组成
被引量:
3
1
作者
容庭
张洁
王刚
刘志昌
李书宏
林海丹
陈庄
机构
广东省农业科学院动物科学研究所畜禽育种国家重点实验室广东省动物育种与营养公共实验室广东省畜禽育种与营养研究重点实验室
广东省兽药与饲料监察总所
广东省农业科学院
出处
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第8期1218-1227,共10页
基金
广东省农业科技攻关引导项目(2009B020307001)
文摘
以1日龄纯系的优质肉鸡A系(♂,A组)和惠阳胡须鸡(♂,B组)为试验动物,研究比较两纯系鸡28日龄回肠与盲肠黏膜菌群的组成及多样性。于第28日龄分别从2组中采集鸡2个肠段并提取黏膜细菌基因组DNA,应用16S rDNA基因序列技术,建立2个肠段黏膜细菌16S rDNA V3区的随机克隆文库。回肠文库分析发现,A组文库有86个序列共产生6个OTUs()perational taxonomic units),其已知序列主要属于肠球菌属、乳杆菌属、粪球菌属及梭菌属类序列,而B组文库有97个序列共产生2个OTUs,主要属于梭菌类序列;盲肠文库分析发现,A组文库有93个序列共产生44个OTUs,其优势菌群是未分类瘤胃球菌属(18.28%)、粪球菌属(13.98%)、拟杆菌属(10.75%)、Blautia(10.75%)及未分类毛螺菌属(7.53%);B组文库有97个序列共产生42个OTUs,其优势菌群是普拉梭杆菌属(17.53%)、粪球菌属(11.34%)、拟杆菌属(9.28%)及未分类瘤胃球菌属(8.25%);2组盲肠文库中其他菌属的数量存在较大差异,且未发现与大肠杆菌相关的序列。优质肉鸡A系和惠阳胡须鸡28日龄回肠与盲肠黏膜细菌的组成差异明显,尤其是瘤胃球菌属与产丁酸菌的组成比例,这种差异可能是宿主遗传的影响所致。
关键词
优质肉鸡A系
惠阳胡须鸡
肠道黏膜微生物丛
16S
rDNA克隆文库
Keywords
high quality chicken line A
Huiyang Beard chicken
intestinal mucosa-associated microbiota
16S rDNA clone library
分类号
S831.2 [农业科学—畜牧学]
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题名
作者
出处
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1
16SrDNA克隆文库方法分析两纯系鸡回肠及盲肠黏膜细菌的组成
容庭
张洁
王刚
刘志昌
李书宏
林海丹
陈庄
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014
3
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引证文献
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