应用噬菌体展示随机12肽库筛选诺如病毒抗原模拟表位

目的:利用Ph.D.-12噬菌体展示肽库筛选诺如病毒(NoV)的抗原模拟表位。方法:包被与GⅡ.4、GⅡ.6、GⅡ.17型NoV具有高特异性及中和能力较强的单链可变片段抗体(scFv),用Ph.D.-12噬菌体展示肽库进行3轮生物淘选。ELISA鉴定淘选所得噬菌体与scFv的结合活性及其与NoV P蛋白的竞争作用;阳性克隆测序后进行生物信息学分析,合成多肽鉴定其抗原性。结果:发现1段与GⅡ.6 VP1区同源性较高的氨基酸序列“MG-D-W”,综合分析提示其可能为GⅡ.6 NoV的抗原模拟表位,且合成的包含“MG-D-W”的多肽可竞争抑制P蛋白与人类组织血型抗原(HBGAs)受体的结合。结论:“MG-DW”是与NoV单链抗体高亲和力的肽段,可能模拟了GⅡ.6 NoV与scFv结合的抗原表位。

胞内随机序列多肽库的构建

根据达尔文的进化论思想发展起来的分子进化工程(Molecular Evolution Engineering),不仅有助于生命科学基础研究的发展,还有可能成为药物筛选的新手段.多肽进化是分子进化的一个重要组成部分,利用合成的随机序列寡核苷酸片段表达形成的多肽库(Random Peptide Library)包含一定长度多肽的所有可能的氨基酸排列顺序,通过一定模式的筛选,可定向筛选出有生物活性的肽段,用作药物或酶抑制剂.

利用噬菌体肽库筛选小肽免疫抑制剂

利用MT-2细胞系特异性表达白细胞介素2受体α(IL-2Rα)在细胞表面,作为靶蛋白在噬菌体六肽库中筛选,经过4轮筛选得到能特异性结合IL-2Rα的配体,挑选出与IL-2Rα亲和性高的21个噬菌体克隆,经过DNA测序,得到3组肽序列,其中2组序列分别与白细胞介素2(IL-2)的N端17-24(LLLDLQMI)序列和C端114-121(IVEFLNRW)序列相似,另外一组与IL-2Rβ和γ有共同的保守序列(WSXWS)相似.因此推测这些筛选到的序列可能模拟IL-2与受体α相互作用的位点和IL-2Rβ,γ与α结合的位点.根据筛选结果,进一步合成了一个九肽AIVEFLNRW,以ConA诱导的淋巴细胞转化实验为模型,观察到这个肽在终浓度≥31.3μg/mL时抑制效果明显.

酵母双杂交随机肽库的设计及构建

构建一个含16个氨基酸的酵母双杂交随机肽库,设计合成编码16肽的随机DNA片段,PCR扩增随机DNA片段,经限制性内切酶BamHI和EcoRI酶切后克隆入酵母表达质粒pGADT7GH,构建酵母双杂交随机肽库质粒pGADT7GH-RP并检验其库容。结果表明,扩增获得编码16肽的随机DNA片段,并成功将随机DNA片段克隆入酵母表达质粒pGADT7GH,与GAL4AD形成融合蛋白,其库容为1.28×107。从而成功地构建了酵母双杂交随机肽库。

肽库在抗原表位研究中的应用

肽库分为化学合成肽库和噬菌体显示肽库，在生物学诸多方面有广泛应用。在免疫学领域已用于研究抗原抗体反应，确定各类抗原表位序列，推测自身免疫病抗原性质，预测抗原表位三维结构等方面。

从噬菌体十二肽库中筛选MMP-2抑制剂的研究

为了筛选抑制MMP 2 (基质金属蛋白酶 2 )的小分子多肽 ,以纯化MMP 2为目标蛋白 ,经 3轮筛选 ,并通过ELISA分析 ,从噬菌体展示 12肽库中获得 6个阳性克隆 ;经DNA测序并推导小肽序列 ,分析序列保守性 ,找到一个保守序列模式“HWKF” ,经明胶酶谱活性检测具有该序列的噬菌体克隆能明显抑制MMP 2水解明胶活性 ,该研究为肿瘤的生物治疗和临床应用提供了一定的帮助。

噬菌体展示肽库技术淘选蚕丝纤维蛋白连结短肽的实验研究

采用噬菌体随机肽库展示技术研究与蚕丝纤维蛋白连结的功能性短肽的淘选方法.实验结果显示,淘选的与蚕丝纤维蛋白连结的功能性短肽都包含有一个相同的氨基酸残基序列QSWS.噬菌体与蚕丝蛋白的连结试验和合成肽与蚕丝蛋白的连结试验都证实了QSWS序列与蚕丝蛋白连结的重要性.随着对淘选方法进一步改进和优化,这些功能性短肽将有助于对蚕丝进行功能化改造,可拓宽蚕丝在生物材料领域中的应用.

从噬菌体展示随机肽库中筛选豌豆凝集素的结合肽

目的:从噬菌体展示随机肽库中筛选能与豌豆凝集素(PSA)特异结合的短肽。方法:①用豌豆凝集素(PSA)作为靶蛋白,对噬菌体展示的随机六肽库进行亲和筛选;②α-甲基-D-甘露糖苷对筛选出的噬菌体和PSA结合的影响实验(点印迹法);③选择性地合成了3条6肽ARMWSF、RYDYSY、LRLRQL,用不同浓度的6肽对PSA、ConA与HRP的结合进行竞争抑制实验。结果:经过三轮筛选后,这些噬菌体展示肽有明显的富集,从第三轮挑选的22个克隆的插入氨基酸序列可分为三大类;点印迹结果表明,这些噬菌体展示肽能与PSA特异结合,而α-甲基-D-甘露糖苷不同程度地抑制这种结合;LRLRQL不溶于水,ARMWSF和RYDYSY对PSA和HRP的结合有抑制,而对ConA和HRP的结合没有明显抑制。结论:人工合成的2条6肽和PSA的结合部位与α-甲基-D-甘露糖苷和PSA结合的部位并非相同。

用噬菌体展示六肽库筛选与G-CSF具有结合活性的小分子多肽

目的筛选与人重组G-CSF分子有结合活性的小分子多肽。方法将靶分子G-CSF固定在塑料平皿上,对随机噬菌体六肽库进行3轮筛选。经孵育、洗脱、扩大培养和ELISA分析,随机挑取出第3轮得到的4个阳性克隆测序,然后进行同源性比较。结果找到1个保守性肽段序列模式“SXXRVX”,此模式在人和小鼠的受体中都未见到其同源序列。结论此小肽可与G-CSF结合,故在一定程度上有可能抑制G-CSF与受体的结合,为临床治疗炎症反应和研究G-CSF与受体相互作用的机制提供了一定的帮助。

组合肽库技术及其应用研究

肽库技术是近年发展起来的一种新技术,它可以在很短的时间内合成一个庞大的肽库,为研究大分子结构、分子识别、新型疫苗设计、药物设计和某些难以制备的诊断试剂提供了一个非常有用的工具,肽库具有许多优越性,本文将介绍几种肽库合成方法和应用.

用噬菌体肽库筛选SjC-TPI的模拟抗原表位

目的 筛选日本血吸虫中国大陆株磷酸丙糖异构酶 (SjC TPI)分子的模拟抗原表位 ,研究其免疫学特性。方法 用纯化的抗重组SjC TPI抗体 (IgG)筛选 12肽库 ,获取SjC TPI的模拟抗原表位 ,并研究其抗原特性。结果 获得SjC TPI分子的两个模拟抗原表位M1和M2 ,Westernblotting分析结果表明由这两个模拟抗原表位免疫小鼠产生的免疫血清能识别SjC TPI分子和含此两抗原表位的噬菌体外壳蛋白。DNA测序结果显示这两个模拟抗原表位的氨基酸序列与SjC TPI无同源性。结论 本研究获得的模拟抗原表位M1及M2为SjC TPI的空间构型抗原的模拟表位 。

噬菌体展示肽库筛选赭曲霉毒素A模拟表位的研究

目的从噬菌体随机肽库中筛选模拟赭曲霉毒素A表位的噬菌体粒子,并以其替代毒素建立免疫学检测方法。方法以抗赭曲霉毒素A的单克隆抗体为配基,免疫亲和筛选以融合蛋白形式表达在丝状噬菌体M13外壳蛋白Ⅲ上的随机七肽库,以ELISA方法鉴定阳性克隆,同时进行DNA测序确定插入七肽的氨基酸序列。结果经过4轮淘选,共筛选到11株能与该抗体特异性结合的阳性克隆,且该结合能被赭曲霉毒素A阻断,模拟表位的共有序列为IRPMVXX,X为任意氨基酸。以其中的P2号克隆建立了竞争ELISA检测方法,线性范围为200～8000pgml,检测下限为150pgml。结论噬菌体展示技术可成功筛选到赭曲霉毒素A模拟表位,筛选到的噬菌体粒子可作为毒素的替代品建立免疫学分析方法。

HCV核心蛋白噬菌体随机展示肽库的构建

目的 :为了探讨噬菌体展示技术在筛选和鉴定病毒抗原表位研究中的应用前景。 方法 :利用随机引物 PCR法以HCV核心基因为模板合成随机 DNA片段 ,再经特定引物二次扩增后获得高丰度的 HCV核心蛋白随机 DNA片段 ,将该片段插入噬菌粒载体 p CANTAB5 X的 Xba 位点 ,转化大肠杆菌 TG1,辅助噬菌体拯救 ,建立噬菌体随机肽展示文库。结果 :所构建的随机文库含 1.2 3× 10 5个不同克隆 ,库容噬菌体滴度为 2× 10 1 2 TU/ m l(转导单位 / ml) ,PCR法检测插入阳性为 2 8.1% ,核酸杂交证实 40 %的克隆为 HCV核心基因阳性克隆。 结论 :所建的随机文库有足够大的库容和较好的多样性 ,可以满足HCV C抗原表位的筛选。

利用15肽随机肽库确定抗TNF单抗表位的研究

利用抗ＴＮＦ的Ｔ５单抗作为筛选配基，对经ＤＮＡ碱基组成分析证明具有良好随机性的１５肽库进行亲和筛选．经过三轮筛选后，以硝酸纤维素膜斑点印迹法观察到良好的富集效果．由第三轮挑选出的３１个克隆进行ＤＮＡ测序，结果推出的优势克隆的短肽为ＣＹＲＲＰＡＧＧＬＰＧＩＣＳＡ等，竞争性ＥＬＩＳＡ实验证明带有以上短肽的噬菌体与ＴＮＦ能竞争性地与Ｔ５单抗结合．

用噬菌体随机肽库鉴定日本血吸虫22.6kDa抗原分子的表位

目的 筛选和鉴定日本血吸虫 (中国大陆株 ) 2 2 .6kDa抗原 (Sj2 2 .6)的表位。 方法 用纯化的抗Sj2 2 .6的多克隆抗体IgG对噬菌体十二肽库进行 5轮免疫学筛选 ,挑取克隆 ;采用Westernblotting免疫识别 ,将获得的阳性克隆免疫小鼠 ,并采用dot ELISA筛选能刺激小鼠产生较高滴度抗Sj2 2 .6抗体的阳性克隆 ;测定核苷酸序列 ,分析其表位与Sj2 2 .6抗原的同源性。 结果 经 5轮免疫学筛选后挑取的 1 4个克隆 ,用Westernblotting方法均能被抗Sj2 2 .6抗体识别。经动物免疫初步实验筛选 ,共获得 6个免疫原性较强的阳性克隆 ,测序结果获得 4种不同表位 ,其中 1种表位与Sj2 2 .6抗原具有较高的同源性 ,其余 3种表位与其无一级结构的同源性。 结论 获得的 4种日本血吸虫中国大陆株抗原表位 ,1种可能为结构表位 。

从HCV核心蛋白噬菌体随机展示肽库中筛选抗原表位

目的探讨病毒抗原序列研究的新方法。方法应用噬菌体展示技术，筛选ＨＣＶ核心蛋白的抗原序列。用抗－ＨＣＶ核心抗体单独阳性的血清，对巳构建的ＨＣＶ核心蛋白噬菌体随机展示肽库进行４轮筛选，检测筛选阳性的克隆数、插入阳性率和杂交阳性率来评价筛选的效果。测定和分析７个杂交阳性克隆的ＤＮＡ序列。结果所测定的７个序列中，６个为ＨＣＶ核心蛋白序列，其中５个被正确地展示于噬菌体表面，１个可能被正确展示，这些序列均含有重要的ＨＣＶ核心抗原表位。另１个为大肠杆菌ｎｒｆａ基因。结论噬菌体展示技术完全可应用于病毒蛋白抗原序列的筛选，并具有简便、快速、准确的优点。

利用随机肽库鉴定猪瘟病毒E2蛋白抗原表位

利用噬菌体随机12肽库对抗猪瘟病毒(classical swine fever virus CSFV)糖蛋白E2特异的单抗A11进行表位鉴定,经过4轮筛选后,随机挑取10个噬菌体克隆作竞争ELISA检测.结果表明,10个克隆中除4号克隆外,其余9个均能抑制原核表达的E2蛋白和A11单抗之间的抗原抗体反应,抑制率在35%～64%;DNA测序表明,所有产生竞争抑制作用的8个噬菌体克隆的12肽序列均含有XXWRXXXL核心序列,而没有抑制作用的克隆则不含该核心序列;Western-blot试验证明,所挑阳性克隆均能被单抗A11识别.多序列比较发现,该核心序列与猪瘟病毒E蛋白的28～35位氨基酸TTWKEYSH有一定的同源性,人工合成的含有部分核心序列氨基酸的多肽可以与单抗A11反应,表明单抗A11所针对的抗原表位位于CSFV E2蛋白的28～35位氨基酸.

应用噬菌体随机肽库研究蛋白质抗原表位的进展

蛋白质抗原表位分析在抗原的结构与功能、抗原抗体反应、以及疫苗等新型生物制剂的研究中具有重要意义。近年来 ,随着噬菌体随机肽库研究技术的发展 ,人们逐渐将该技术应用于蛋白质抗原表位研究中。结果表明 :噬菌体随机肽库技术比传统的蛋白质抗原表位分析技术有着较明显的优点。这种新的蛋白质抗原表位分析技术弥补了传统分析技术的不足 ,在蛋白质抗原表位分析中具有广阔的应用前景。

猪瘟病毒E2基因噬菌体展示多肽库的构建及表位鉴定

本研究通过建立CSFV噬菌体展示多肽库,并对其进行生物淘选,以期获得E2蛋白上新的抗原表位。选择CSFV石门株(SM)和疫苗株(HCLV)为代表株,采用噬菌体展示技术,以T7select415-1b为载体,分别构建了CSFV SM株和HCLV株E2基因噬菌体展示多肽库(SM-E2库和HCLV-E2库)。通过生物淘选和噬菌体原位杂交技术,采用7株猪瘟单克隆抗体和1株猪瘟高免血清分别对构建的SM-E2库和HCLV-E2库进行抗原表位筛选。结果共筛选到了5条与E2蛋白高度同源的序列,在E2蛋白上的同源区域分别为TAVSPTTLR、YYEP、TTWKEYSH、GGQ(V)VK和PDGLPHY。结果表明,TAVSPTTLR、YYEP和TTWKEYSH序列与目前已知E2蛋白表位一致,说明它们是E2蛋白上的优势表位;GGQ(V)VK和PDGLPHY序列与预测表位一致,推测是E2蛋白上潜在的抗原表位。

随机肽库筛选赭曲霉毒素A模拟表位及其应用

目的从噬菌体随机肽库中筛选模拟赭曲霉毒素A表位的噬菌体粒子,并以其替代毒素建立免疫学检测方法.方法以抗赭曲霉毒素A的单克隆抗体为配基,免疫亲和筛选以融合蛋白形式表达在丝状噬菌体M13外壳蛋白Ⅲ上的随机七肽库,以ELISA方法鉴定阳性克隆,同时进行DNA测序确定插入七肽的氨基酸序列.结果经过4轮淘选,共筛选到11株能与该抗体特异性结合的阳性克隆,且该结合能被赭曲霉毒素A阴断,模拟表位的共有序列为:异亮氨酸-精氨酸-脯氨酸-蛋氨酸-缬氨酸-X-X,X为任意氨基酸.以其中阻亲和力最强的克隆(P 2)建立了竞争ELISA检测方法,线性范围为200～8 000pg/ml,检测下限为150 pg/ml.结论噬菌体展示技术可成功筛选到赭曲霉毒素A模拟表位,筛选到的噬菌体粒子可作为毒素的替代品建立免疫学分析方法.