多肽：N-乙酰氨基半乳糖转移酶-2与共刺激分子B7-H3相互作用的结构信息学初步探讨

目的 研究多肽：N-乙酰氨基半乳糖转移酶-2（ppGalNAc-T2）与共刺激分子B7-H3的相互关系.方法 通过同源模拟,得到共刺激分子B7-H3两种不同剪接体（2IgB7-H3,4IgB7-H3）的分子结构,寻找PDB数据库中的ppGalNAc-T2的蛋白质晶体结构,利用软件GRAMM（http：//vakser.bioinformatics.ku.edu/main/resources_gramm.php）,与同源模拟得到的两种不同剪接体的B7-H3分子结构相结合,寻找两者之间是否存在直接结合的可能.结果 成功地模拟了共刺激分子B7-H3两种剪接体的分子结构,发现ppGalNA-T2与共刺激分子B7-H3有相互结合的可能性.结论 结构生物信息学的研究发现ppGalNAc-T2分子与B7-H3具有潜在相互作用位点,ppGalNAc-T2可能参与B7-H3蛋白质的O-糖链合成反应,并且很有可能是通过直接接触来催化控制B7-H3分子的O-糖链合成.

PPIB蛋白对结肠癌成瘤的影响和低氧机制

目的:研究肽酰脯氨基顺反异构酶B(peptidyl-prolyl cis-trans isomerase,PPIB)蛋白对结肠癌细胞成瘤的影响,探讨结肠癌低氧发病的机制。方法:应用RNAi技术,构建下调PPIB蛋白表达的稳转结肠癌细胞株,移植到BALB/c裸鼠皮下,检测PPIB蛋白下调组与对照组的成瘤差异。TUNEL法检测两组移植瘤的细胞凋亡水平。低氧培养结肠癌细胞株,Western印迹法检测PPIB的表达水平与低氧诱导因子1α(hypoxia-inducible factor-1α,HIF-1α)的关系。结果:下调PPIB蛋白表达后,在裸鼠皮下成瘤的能力显著减弱。SW480-si PPIB下调组的移植瘤体积显著小于SW480-NC对照组(P<0.01)。TUNEL检测显示下调组的癌细胞凋亡比例显著高于对照组(P<0.001)。在低氧环境下培养后,结肠癌细胞的PPIB蛋白表达水平随着低氧条件下HIF-1α的上调而升高(P<0.05)。结论:PPIB蛋白在结肠癌中因为低氧环境而表达升高,且在升高后通过抑制癌细胞的凋亡而发挥促进结肠癌形成和进展的作用,是一个极具临床应用价值的防治结肠癌的分子靶点。

LncRNA SNHG3/miR-339-5p/PPIB轴对结直肠癌细胞恶性生物学行为的影响

目的探讨长链非编码RNA(LncRNA)小核仁RNA宿主基因(SNHG)3/miR-339-5p/肽酰脯氨基顺反异构酶(PPI)B轴对结直肠癌(CRC)细胞恶性生物学行为的影响。方法以SW620细胞为实验对象,分为:SW620组(未处理的SW620细胞)、si-NC组、si-SNHG3组、si-SNHG3+NC inhibitor组、si-SNHG3+miR-339-5p inhibitor组、si-SNHG3+pcDNA组、si-SNHG3+pcDNA PPIB组。荧光原位杂交实验和双荧光素酶报告基因检测LncRNA SNHG3、miR-339-5p、PPIB三者的靶向关系;实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)检测LncRNA SNHG3、miR-339-5p、PPIB表达;CCK-8检测SW620细胞活性;Tran-swell试验检测SW620细胞迁移、侵袭;Western印迹检测E-钙黏蛋白(cadherin)、波形蛋白(vimentin)、锌指转录因子(Snail)表达。结果与NC组相比,CRC组LncRNA SNHG3、PPIB相对表达量显著升高,miR-339-5p相对表达量显著下降(P<0.05);与NCM460组相比,SW620组LncRNA SNHG3、PPIB相对表达量显著上升,miR-339-5p相对表达量显著下降(P<0.05);LncRNA SNHG3与miR-339-5p存在靶向关系,miR-339-5p与PPIB存在靶向关系;下调LncRNA SNHG3显著降低SW620细胞增殖、迁移、侵袭能力及vimentin、Snail蛋白表达,显著升高E-cadherin蛋白表达(P<0.05),而下调miR-339-5p和上调PPIB均显著升高了SW620细胞增殖、迁移、侵袭能力及vimentin、Snail蛋白表达,显著降低E-cadherin蛋白表达(P<0.05)。结论敲低Ln-cRNA SNHG3可能通过调节miR-339-5p/PPIB轴调控CRC细胞增殖、侵袭等恶性生物学行为。