基于普通转录组和孟德尔随机分析探讨肾透明细胞癌中PANoptosis相关基因的诊断价值

肾透明细胞癌(KIRC)是一种常见的泌尿生殖系统恶性肿瘤,但其早期发现和诊断相当困难。泛凋亡(PANoptosis)强调细胞焦亡、细胞凋亡和坏死之间的作用和协调。本研究的目的是通过孟德尔随机分析方法(MR),确定PANoptosis相关基因(PRG)在KIRC中的作用,并揭示其因果关系。通过对3446个差异表达基因(DEGs)和347个PRGs进行交叉分析,我们发现66个差异表达的PANoptosis相关基因(DE-PRGs)存在表达量性状位点(eQTL)。分别进行双样本单变量和多变量MR分析后发现,PRF1 (P = 0.030,OR 95% 置信区间[CI] = 1.599 [1.047~2.441])、TNFRSF10B (P = 0. 008, OR 95% CI = 1.238 [1.058~1.447])、PDGFRB (P = 0.012, OR 95% CI = 0.546 [0.340~0.876])基因与KIRC疾病有关,以上3个标记基因同时存在时,PDGFRB基因是一个直接因素。此外,基于生物信息学分析,建立了具有良好诊断价值的KIRC模型。最后,通过数据分析和实时荧光定量PCR (RT-qPCR)验证标记基因的表达。