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基于网络药理学探讨三七对骨愈合的作用机制
被引量:
3
1
作者
吴文正
郑晓辉
+3 位作者
高怡加
欧阳崇志
黄敏玲
杨锐敏
《广州中医药大学学报》
CAS
2020年第8期1561-1567,共7页
【目的】基于网络药理学方法探讨三七对骨愈合的作用机制。【方法】通过中药系统药理学技术平台(TCMSP)获取三七的主要化学成分及其对应的作用靶点;借助人类基因数据库(GeneCards)获取骨愈合相关靶标基因,与三七作用靶点取交集后获得三...
【目的】基于网络药理学方法探讨三七对骨愈合的作用机制。【方法】通过中药系统药理学技术平台(TCMSP)获取三七的主要化学成分及其对应的作用靶点;借助人类基因数据库(GeneCards)获取骨愈合相关靶标基因,与三七作用靶点取交集后获得三七—骨愈合的交集靶点。通过Cytoscape 3.7.1软件构建中药调控网络并进行可视化展示;通过STRING在线数据库构建蛋白相互作用(PPI)网络。利用DAVID数据库进行交集基因的基因本体论(GO)功能富集分析及基于京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。【结果】三七作用于骨愈合的化学成分有7个,相关靶点70个,关键有效成分4个,关键靶点68个。GO分析结果显示,三七—骨愈合的交集基因的生物功能主要涉及对雌二醇的反应、RNA聚合酶II启动子转录的正调控、DNA模板转录的正调控等生物过程,细胞质基质、细胞外间隙、核质等细胞组成;酶结合、相同的蛋白结合、转录因子结合等分子功能。KEGG通路富集结果显示,三七—骨愈合的交集基因的通路主要包括人类疾病通路(如肿瘤疾病通路、乙型肝炎等)、环境信息处理通路[如磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B(PI3K-Akt)信号通路、缺氧诱导因子1(HIF-1)信号通路等]、有机系统通路(如甲状腺激素信号通路、催乳激素信号通路等)、细胞过程通路(如细胞局部粘附、p53信号通路等)。【结论】三七调节骨愈合的作用机制呈多成分、多靶点、多通路特点,主要通过肿瘤疾病通路、PI3K-Akt信号通路、甲状腺激素信号通路、细胞局部粘附等多方面的途径发挥调节骨愈合的作用。
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关键词
三七
骨愈合
网络药理学
肿瘤疾病通路
PI3K-AKT信号
通路
甲状腺激素信号
通路
细胞粘附
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职称材料
题名
基于网络药理学探讨三七对骨愈合的作用机制
被引量:
3
1
作者
吴文正
郑晓辉
高怡加
欧阳崇志
黄敏玲
杨锐敏
机构
广州中医药大学第一临床医学院
广州中医药大学第一附属医院
出处
《广州中医药大学学报》
CAS
2020年第8期1561-1567,共7页
基金
广东省自然科学基金资助项目(编号:2018A030313369)
广东省中医药局科研项目(编号:20181084)。
文摘
【目的】基于网络药理学方法探讨三七对骨愈合的作用机制。【方法】通过中药系统药理学技术平台(TCMSP)获取三七的主要化学成分及其对应的作用靶点;借助人类基因数据库(GeneCards)获取骨愈合相关靶标基因,与三七作用靶点取交集后获得三七—骨愈合的交集靶点。通过Cytoscape 3.7.1软件构建中药调控网络并进行可视化展示;通过STRING在线数据库构建蛋白相互作用(PPI)网络。利用DAVID数据库进行交集基因的基因本体论(GO)功能富集分析及基于京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。【结果】三七作用于骨愈合的化学成分有7个,相关靶点70个,关键有效成分4个,关键靶点68个。GO分析结果显示,三七—骨愈合的交集基因的生物功能主要涉及对雌二醇的反应、RNA聚合酶II启动子转录的正调控、DNA模板转录的正调控等生物过程,细胞质基质、细胞外间隙、核质等细胞组成;酶结合、相同的蛋白结合、转录因子结合等分子功能。KEGG通路富集结果显示,三七—骨愈合的交集基因的通路主要包括人类疾病通路(如肿瘤疾病通路、乙型肝炎等)、环境信息处理通路[如磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B(PI3K-Akt)信号通路、缺氧诱导因子1(HIF-1)信号通路等]、有机系统通路(如甲状腺激素信号通路、催乳激素信号通路等)、细胞过程通路(如细胞局部粘附、p53信号通路等)。【结论】三七调节骨愈合的作用机制呈多成分、多靶点、多通路特点,主要通过肿瘤疾病通路、PI3K-Akt信号通路、甲状腺激素信号通路、细胞局部粘附等多方面的途径发挥调节骨愈合的作用。
关键词
三七
骨愈合
网络药理学
肿瘤疾病通路
PI3K-AKT信号
通路
甲状腺激素信号
通路
细胞粘附
Keywords
Radix Notoginseng
bone healing
network pharmacology
pathways in cancer
PI3K-Akt signaling pathway
thyroid hormone signaling pathway
cell adhesion
分类号
R285.5 [医药卫生—中药学]
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作者
出处
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被引量
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1
基于网络药理学探讨三七对骨愈合的作用机制
吴文正
郑晓辉
高怡加
欧阳崇志
黄敏玲
杨锐敏
《广州中医药大学学报》
CAS
2020
3
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职称材料
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参考文献
引证文献
统计分析
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