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一种新型肿瘤组织起源分子标志物的建立与评价
1
作者
王奇峰
徐清华
+3 位作者
陈金影
钱琛晖
刘晓健
杜祥
《中国癌症杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第10期801-812,共12页
背景与目的:原发灶不明恶性肿瘤是一类转移性肿瘤的统称,在诊断时无法找到原发位点,约占所有恶性肿瘤的5%~10%。明确肿瘤的组织起源对于患者的诊断和治疗具有重要意义。方法:整合Array Express和Gene Expression Omnibus数据库中肿瘤...
背景与目的:原发灶不明恶性肿瘤是一类转移性肿瘤的统称,在诊断时无法找到原发位点,约占所有恶性肿瘤的5%~10%。明确肿瘤的组织起源对于患者的诊断和治疗具有重要意义。方法:整合Array Express和Gene Expression Omnibus数据库中肿瘤类型明确的样本数据,构建涵盖22种常见肿瘤类型、5 800例样本的基因表达谱数据库;通过支持向量机递归特征消除算法筛选组织特异性基因,建立肿瘤分类模型;采用实时定量聚合酶链反应(real-time quantitative polymerase chain reaction,RTQ-PCR)检测石蜡包埋肿瘤组织中基因的表达水平,并将基因分型结果与病理诊断结果进行比较。结果:基于肿瘤基因表达谱大数据,筛选出96个组织特异性基因,其中包含常见的肿瘤相关基因,如钙黏蛋白1(cadherin 1,CDH1)、激肽释放酶相关酶3(kallikreinrelated peptidase 3,KLK3)和表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)等。在206例石蜡包埋组织样本中,182例的基因分型结果与病理诊断结果一致,准确率达到88.4%(95%CI:83.2%~92.4%)。结论:96基因RTQ-PCR检测对22种常见肿瘤类型具有较好的分类性能,可作为临床和病理诊断的辅助工具。
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关键词
原发灶不明恶性
肿瘤
肿瘤组织起源
基因表达谱
实时定量聚合酶链反应
免疫组化
下载PDF
职称材料
I级神经上皮组织起源肿瘤的特征及分子遗传学研究进展
被引量:
2
2
作者
于士柱
王虔
《中国神经肿瘤杂志》
2008年第2期79-84,共6页
本文简要介绍了中枢神经系统(CNS)WHOI级神经上皮组织起源肿瘤的种类及发病率、年龄和性别分布、好发部位、生物学行为和预后等一般特征。同时简要介绍了该组肿瘤常见的分子遗传学异常表现和研究进展,旨在加深对该组肿瘤上述特征和分子...
本文简要介绍了中枢神经系统(CNS)WHOI级神经上皮组织起源肿瘤的种类及发病率、年龄和性别分布、好发部位、生物学行为和预后等一般特征。同时简要介绍了该组肿瘤常见的分子遗传学异常表现和研究进展,旨在加深对该组肿瘤上述特征和分子遗传学异常改变的认识。
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关键词
神经上皮
组织
起源
肿瘤
一般特征
分子遗传学
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职称材料
题名
一种新型肿瘤组织起源分子标志物的建立与评价
1
作者
王奇峰
徐清华
陈金影
钱琛晖
刘晓健
杜祥
机构
复旦大学附属肿瘤医院病理科
杭州可帮基因科技有限公司
复旦大学附属肿瘤医院化疗科
出处
《中国癌症杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第10期801-812,共12页
文摘
背景与目的:原发灶不明恶性肿瘤是一类转移性肿瘤的统称,在诊断时无法找到原发位点,约占所有恶性肿瘤的5%~10%。明确肿瘤的组织起源对于患者的诊断和治疗具有重要意义。方法:整合Array Express和Gene Expression Omnibus数据库中肿瘤类型明确的样本数据,构建涵盖22种常见肿瘤类型、5 800例样本的基因表达谱数据库;通过支持向量机递归特征消除算法筛选组织特异性基因,建立肿瘤分类模型;采用实时定量聚合酶链反应(real-time quantitative polymerase chain reaction,RTQ-PCR)检测石蜡包埋肿瘤组织中基因的表达水平,并将基因分型结果与病理诊断结果进行比较。结果:基于肿瘤基因表达谱大数据,筛选出96个组织特异性基因,其中包含常见的肿瘤相关基因,如钙黏蛋白1(cadherin 1,CDH1)、激肽释放酶相关酶3(kallikreinrelated peptidase 3,KLK3)和表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)等。在206例石蜡包埋组织样本中,182例的基因分型结果与病理诊断结果一致,准确率达到88.4%(95%CI:83.2%~92.4%)。结论:96基因RTQ-PCR检测对22种常见肿瘤类型具有较好的分类性能,可作为临床和病理诊断的辅助工具。
关键词
原发灶不明恶性
肿瘤
肿瘤组织起源
基因表达谱
实时定量聚合酶链反应
免疫组化
Keywords
Cancer of unknown primary
Tumor tissue origin
Gene expression profiling
Real-time quantitativepolymerase chain reaction
Immunohistochemistry
分类号
R730.21 [医药卫生—肿瘤]
下载PDF
职称材料
题名
I级神经上皮组织起源肿瘤的特征及分子遗传学研究进展
被引量:
2
2
作者
于士柱
王虔
机构
天津医科大学总医院
出处
《中国神经肿瘤杂志》
2008年第2期79-84,共6页
基金
天津市科技攻关计划重点科技攻关专项项目(项目批准号:06YFSZSF01100)
文摘
本文简要介绍了中枢神经系统(CNS)WHOI级神经上皮组织起源肿瘤的种类及发病率、年龄和性别分布、好发部位、生物学行为和预后等一般特征。同时简要介绍了该组肿瘤常见的分子遗传学异常表现和研究进展,旨在加深对该组肿瘤上述特征和分子遗传学异常改变的认识。
关键词
神经上皮
组织
起源
肿瘤
一般特征
分子遗传学
Keywords
Tumors of neuroepithelial tissue
Features
Molecular genetics
分类号
R739.41 [医药卫生—肿瘤]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
一种新型肿瘤组织起源分子标志物的建立与评价
王奇峰
徐清华
陈金影
钱琛晖
刘晓健
杜祥
《中国癌症杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2016
0
下载PDF
职称材料
2
I级神经上皮组织起源肿瘤的特征及分子遗传学研究进展
于士柱
王虔
《中国神经肿瘤杂志》
2008
2
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职称材料
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