基于TCGA数据库数据NME基因家族生物学功能、在肝癌诊断和预后预测中的应用分析

目的基于TCGA数据库数据分析肿瘤转移相关(NME)基因家族(NME 1、2、3、4、5、6、7)生物学功能、相关信号通路,并探讨NME基因家族成员对肝癌的诊断、预测预后效能及其与肝癌患者预后的关系。方法从TCGA数据库获取NME基因家族在肝癌组织和癌旁组织中的表达水平和肝癌患者临床病理资料。对NME基因进行基因本体论(GO)及KEGG代谢通路分析。比较肝癌组织与癌旁组织中NME基因的表达。应用ROC评价NME基因对肝癌的诊断效能。采用单因素生存分析、Log-rank检验和多因素COX生存分析法分析NME基因家族与肝癌患者预后的关系。结果NME基因主要参与调节核苷二磷酸激酶活性、细胞凋亡、发育等生物学过程,主要涉及新陈代谢、抗生素合成、嘌呤和嘧啶代谢途径等相关通路。肝癌组织中NME1、NME2、NME3、NME6、NME7水平均高于癌旁组织(t分别为8.927、7.044、5.267、8.370、4.349,P均<0.0001),肝癌组织中NME5水平低于癌旁组织(t=4.306,P<0.0001),肝癌组织及癌旁组织中NME4水平比较,t=1.403,P=0.1613。除NME4外,其他NME基因家族对肝癌的诊断效能良好,曲线下面积(AUC)分别为0.8872、0.8262、0.7459、0.7457、0.8715、0.7255。吸烟等危险因素、TMN分期、肿瘤浸润情况和是否治疗新发肿瘤影响肝癌患者的生存时间,P均<0.01;NME6和NME7与肝癌患者的预后相关,P均<0.05;NME5、NME6、NME7低表达组肝癌患者的总生存时间高于高表达组(P均<0.05)。结论NME基因家族主要参与调节核苷二磷酸激酶活性、细胞凋亡和细胞发育等生物过程,影响细胞新陈代谢和嘌呤、嘧啶代谢等相关通路。除NME4外,其他NME基因家族对肝癌的诊断效能良好。NME5、NME6、NME7基因水平与肝癌患者的预后相关,可预测预后。

B细胞特异性莫洛尼鼠白血病病毒整合位点1的生物学功能及肿瘤相关性的研究进展

B细胞特异性莫洛尼鼠白血病病毒整合位点1(BMI1)是第一个被发现的多梳基因家族(PcG)成员,BMI1在乳腺癌、结直肠癌和食管鳞状细胞癌等多种人类恶性肿瘤中表达异常升高,参与细胞增殖、凋亡、侵袭、迁移的调控,与患者的临床特征、化疗耐药性和不良预后密切相关。BMI1基因与干细胞的自我更新和一系列恶性肿瘤的发生、发展及预后密切相关,可能是一个重要的肿瘤治疗靶点,因而日益被重视。本文就BMI1的结构、功能及其在肿瘤细胞中生物学作用的研究进展进行综述。

宫颈癌中转移相关基因MTA1高表达的临床意义及其协同表达基因的生物信息学分析

目的分析转移相关基因MTA1高表达与宫颈癌临床转移的相关性,并筛选MTA1协同表达基因网络中的潜在干预靶点基因。方法应用SPSS软件分析TCGA-CESC数据集中MTA1与宫颈癌转移和病理分级的相关性,应用edge R软件分析该数据集中MTA1高表达组与低表达组的全转录组差异表达基因,应用DAVID平台对这些差异表达基因进行聚类分析,应用STRING在线平台和Cytospace软件对这些基因进行互作网络分析,筛选关键的网络节点基因。结果TCGA-CESC宫颈癌数据库中MTA1表达水平与肿瘤临床转移和病理分级呈显著正相关(P<0.01),在不同MTA1表达水平的宫颈癌转录组中存在显著且较一致的差异表达基因集,这些基因主要聚集在癌症通路、干细胞通路、细胞转移、细胞分化等方面,与肿瘤的恶性生物学行为显著相关。基因筛选显示,宫颈癌中与MTA1协同表达的Agt、Acta1、Fpr2、Pmch和RGS18等基因是差异表达基因集中最重要的节点基因,这些基因聚集在GPCR相关通路。结论 MTA1高表达与宫颈癌转移显著相关,且与肿瘤细胞的干细胞通路、趋化因子受体通路、细胞转移、细胞分化等基因调控网络活化相关。MTA1的协同表达基因网络中的节点基因可能参与了宫颈癌的转移调控,并最有可能成为宫颈癌治疗的分子靶点。

肿瘤转移相关基因1与P-糖蛋白在化疗后骨肉瘤组织中的表达及意义

本文通过研究骨肉瘤化疗后肿瘤转移相关基因1（MTA1）和耐药表型P-糖蛋白（P-gp）在骨肉瘤中的表达,探讨骨肉瘤侵袭转移和耐药之间的关系,希望能够为骨肉瘤的术后治疗及评价预后提供一定的分子生物学依据。

Bcl-2家族基因及其相关蛋白与头颈部肿瘤

随着分子生物学的发展和应用,对肿瘤病因的研究不仅仅局限于细胞增埴方面,细胞凋亡在肿瘤发生发展中也起相当重要的作用。细胞凋亡(apop-tosis)即程序性细胞死亡(programmed cell death,PCD),是细胞自主死亡的一种形式,它对维持机体内环境的稳定具有非常重要的作用。

分化相关基因NDRG1在消化系统肿瘤中的研究进展

N-myc下游调节基因1（N-myc downstream regulated gene 1,NDRG1）是近年来发现的一种分化相关基因,多种生理或病理因素的刺激可诱导NDRG1的表达,但其确切的生物学功能尚不完全清楚。

四跨膜蛋白超家族与肿瘤侵袭和转移

四跨膜蛋白超家族包括20个家族成员,以4个高度保守的跨膜结构为特征的蛋白家族。四跨膜蛋白通过与细胞表面多种跨膜蛋白形成复合物,而广泛参与调控细胞生长、黏附、迁移和信号转导等生物学功能,且高表达的四跨膜蛋白CD151、TM4SF5与肝癌、胃癌及乳腺癌的侵袭和转移有关。

非小细胞肺癌中转移相关基因-1的表达及其临床意义

侵袭性和转移性是肿瘤细胞的重要的生物学特征,也是恶性肿瘤的重要标志。但目前对肿瘤转移机制的研究仍不理想。转移相关基因（metastasis-associated gene,MTA）-1在多种肿瘤细胞系（如乳腺癌、食管癌、喉癌及卵巢癌）中参与肿瘤细胞的侵袭和转移,是近年来研究比较深入的肿瘤浸润转移相关基因。目前,肺癌的发病率在在我国呈上升趋势,深入研究肺癌发生、进展的机制对于开发药物、指导和改善临床治疗有着重大意义。本研究拟应用免疫组织化学sP法，对非小细胞肺癌组织中MTA1蛋白表达进行对比，以探讨其与肺癌侵袭转移的相关关系。

一种新的肿瘤转移抑制基因TMSG—l的研究现状(英文)

TMSG-1 is a newly discovered tumor metastasis suppressor gene,which plays important roles in promoting apoptosis and inhibiting invasion and metastasis of tumor cells.The inhibitory function of TMSG-1 in tumor cells may be related to vacuolar H+-ATPase and ceramide,but the underlying mechanism remains unknown.Studies on TMSG-1 are limited worldwide,and only a research group in Shanghai and our group have recently studied on it.As a new research field,the function of TMSG-1 remains to be explored.This review discusses the discovery of TMSG-1,structure of its encoded protein,its roles and possible mechanism in inhibiting tumor invasion and metastasis.

PTTG基因的结构、功能及其与肿瘤的关系

肿瘤是威胁人类健康的主要疾病之一，现在公认肿瘤是一种基因病，癌基因和抑癌基因扮演着极其重要的角色。自从1997年Pei等用差异显示PCR等分子生物学技术分离出原癌基因垂体瘤转化基因（Pituitary tumor-transforrning gene，PTTG）以来，已深入研究了其生物学功能，如促进细胞转化、血管形成、肿瘤转移等。本文就PTTG基因的结构、生物学功能及其与肿瘤的关系作一综述。

S100A9蛋白生物学特性及其相关研究

1965年,Moore从牛脑中分离到一个神经系统特有组分,由于这种组分在中性条件下能很好的溶解于100%饱和硫酸铵中,因此命名为S100[1]。在S100蛋白家族中有代表意义的钙卫蛋白(S100A8/A9)最初是作为由中性粒细胞表达和分泌的一种免疫蛋白而被发现,后来发现它是急慢性炎症中重要的促炎介质。最近,在人类多种原发和浸润性肿瘤中都检测到S100A8和S100A9的高表达,它们的表达及其在炎症和肿瘤中潜在的类细胞因子的功能提示其在炎症相关性肿瘤的发生中起着至关重要的作用。

MTSS1与恶性肿瘤相关性研究进展

侵袭转移是恶性肿瘤重要的生物学特性，肿瘤转移是在一系列相关基因及分子改变调控下发生黏附、降解及运动，从而使肿瘤细胞浸润周围组织。浸润血管，在转移部位形成新的转移灶。已知细胞骨架蛋白可维持细胞形态、运动、黏附、有丝分裂过程，其中肌动蛋白的聚合及解聚可调节肿瘤细胞的形态及运动等，从而在恶性肿瘤转移中扮演重要角色。

细胞黏附分子-1和淋巴细胞功能相关抗原在口腔鳞癌中的表达及其临床意义

口腔鳞癌（OSCC）是颌面部常见的恶性肿瘤,在全身系统常见恶性肿瘤中居第6位[1].近年来,OSCC患者术后生活质量有所提高,但5年生存率并没有显著改善[1,2].浸润和转移是影响恶性肿瘤患者预后的主要因素.研究证实,肿瘤细胞与宿主微环境中众多间质细胞的密切联系推动了肿瘤的浸润和转移,黏附因子在其中发挥重要作用.细胞黏附分子1 （ICAM-1）是免疫球蛋白超家族中的一种跨膜糖蛋白,它通过介导免疫细胞与肿瘤细胞之间的黏附与信号转导在多种恶性肿瘤中发挥重要作用[3,4].整合素αL和β2是ICAM-1的受体,它也被称为淋巴细胞功能相关抗原（LFA-1）,是整合素家族重要成员之一,特异表达于白细胞,可通过增加细胞迁移和黏附能力,促进多种恶性肿瘤的浸润和转移[5].但ICAM-1与LFA-1的表达与口腔鳞癌的发生及进展是否相关目前鲜见报道.

结肠癌转移相关基因-1通过调控肝细胞生长因子-酪氨酸激酶受体信号通路对体外胃癌细胞株MGC-803生物学功能的影响

目的 观察结肠癌转移相关基因-1（MACC-1）表达对体外胃癌细胞株MGC-803的增殖凋亡和生物学功能的影响.方法 培养胃癌MGC-803细胞,将传代的细胞分为以下3组：A组：MACC-1-短发卡RNA （shRNA）和PSV2neo3共转染组,B组：shNC和PSV2neo共转染组,C组：未转染组,A组为实验组,B、C两组为阳性对照组和阴性对照组.通过Western blot和实时定量聚合酶链反应（Real-time PCR）检测MACC-1蛋白和mRNA在3组细胞中的表达水平,并检测3组MGC-803细胞中酪氨酸激酶受体（c-Met）、E-钙黏蛋白（E-cadherin）和N-钙黏蛋白（N-cadherin）和mRNA水平表达变化,并通过流式细胞法和划痕实验观察比较转染MACC-1-shRNA的MGC-803细胞的的迁移能力和增殖凋亡情况.结果 （1）Westem blot和Real-time PCR检测结果显示：与B、C组比较,MACC-1-shRNA组MACC-1蛋白及mRNA表达均显著下调（P＜0.01）,c-Met蛋白及其mRNA的表达显著下调（P＜0.01）.（2）Western blot和Real-time PCR检测结果显示：与B、C组比较,A组上皮标志物E-cadherin蛋白和及mRNA表达显著上调（P＜0.01）,c-Met蛋白及其mRNA,间质细胞标志物N-cadherin蛋白及mRNA的表达显著下调（P＜0.01）,B、C两组间E-cadherin和N-cadherin蛋白及mRNA表达的差异无统计学意义（P＞0.01）.（3）划痕实验检测细胞迁移：结果表明,A组划痕间距较宽,愈合被抑制,MGC-803细胞迁移能力低于B、C细胞（P＜0.01）,B、C两组细胞的划痕间距差异无统计学意义（P＞0.01）.（4）流式细胞仪分析细胞凋亡：A、B和C组细胞的凋亡率分别为（21.06＆#177;1.12）％、（2.18＆#177;0.14）％和（2.04＆#177;0.11）％,A组细胞的凋亡率较C组明显增加（P＜0.01）,B、C两组细胞凋亡的差异无统计学意义.结论 MACC-1基因转染对体外胃癌细胞株MGC-803细胞具有促进增殖和抑制凋亡作用,其可能是通过调控肝细胞生长因子（HGF）/c-Met信号转导通路来发挥作用.