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利用CRISPR/Cas9系统制备斑马鱼cbsb敲除模型
被引量:
1
1
作者
陈福海
蒋林
+4 位作者
曹建斌
蒋伟青
项略
顾珊烨
刘犇
《浙江医学》
CAS
2024年第4期377-383,共7页
目的 采用成簇的规律性间隔的短回文重复序列(CRISPR)/Cas9系统对斑马鱼胱硫醚-β-合成酶b基因(cbsb)进行编辑,并制备稳定的斑马鱼cbsb敲除品系。方法 使用ClustalX软件分析斑马鱼cbsb编码蛋白(Cbsb)的保守结构域,利用生物信息学选取向...
目的 采用成簇的规律性间隔的短回文重复序列(CRISPR)/Cas9系统对斑马鱼胱硫醚-β-合成酶b基因(cbsb)进行编辑,并制备稳定的斑马鱼cbsb敲除品系。方法 使用ClustalX软件分析斑马鱼cbsb编码蛋白(Cbsb)的保守结构域,利用生物信息学选取向导RNA(gRNA)靶点,体外合成并纯化gRNA和密码子优化的Cas9 mRNA,在刚受精的斑马鱼胚胎(1-cell期)中显微注射混合的gRNA和Cas9 mRNA,提取受精后3 d的斑马鱼幼鱼基因组,通过PCR扩增并测序分析靶点的切割效率,通过基因组扩增和测序筛选并获得cbsb敲除的稳定品系。结果 斑马鱼Cbsb与人、小鼠胱硫醚-β-合成酶(CBS)高度同源。在斑马鱼Cbsb保守结构域的编码序列处设计4个靶点,其中4#靶点具有高效的切割效率,利用该靶点制备并筛选获得多个cbsb敲除斑马鱼,选取-3+13 bps和-228 bps移码突变的两种品系,进一步筛选获得稳定的cbsb敲除品系。结论 利用CRISPR/Cas9系统成功制备了两种斑马鱼cbsb敲除的稳定品系,为进一步在斑马鱼活体中研究Cbsb的功能奠定了基础。
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关键词
胱硫醚
-β-
合成酶
b
硫化氢
基因敲除
斑马鱼
成簇的规律性间隔的短回文重复序列/Cas9
下载PDF
职称材料
青年缺血性脑卒中与MTHFRC677T、CBS844ins68基因多态性的关系
被引量:
4
2
作者
方乐
王田蔚
+1 位作者
邵延坤
杨宏
《吉林大学学报(医学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第2期310-313,共4页
目的:研究人MTHFR、CBS基因多态性与青年缺血性脑卒中的遗传关联性。方法:采用限制性内切酶片段长度多态性方法(PCR-RFLP),对98例脑卒中患者(病例组)和116例健康人(对照组)MTHFRC677T及CBS844ins68多态性位点进行检测。结果:病例组MTHF...
目的:研究人MTHFR、CBS基因多态性与青年缺血性脑卒中的遗传关联性。方法:采用限制性内切酶片段长度多态性方法(PCR-RFLP),对98例脑卒中患者(病例组)和116例健康人(对照组)MTHFRC677T及CBS844ins68多态性位点进行检测。结果:病例组MTHFR基因T、C等位基因频率分别为54.09%和45.91%,对照组为37.93%和62.07%,两组比较差异有显著性(P<0.05)。TT型携带者与CC型携带者罹患脑卒中比较相对危险度为2.83,T等位基因携带者与C等位基因携带者罹患脑卒中比较相对危险度为1.93。CBS844ins68多态性位点在病例组与对照组之间D/I 2种等位基因及基因型分布频率差异无显著性(P>0.05)。Logistic回归分析显示MTHFRC677T是青年缺血性脑卒中的一个独立危险因子,且吸烟及高血压也与之有关联(P<0.01)。结论:汉族人群MTHFR C677T位点多态性与青年缺血性脑卒中有相关性,MTHFR基因可能是青年缺血性脑卒中的一个易感基因。CBS844ins68多态性位点与青年缺血性脑卒中无关联。
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关键词
亚甲基四氢叶酸还原酶
胱硫醚b合成酶
脑血管意外
多态现象(遗传学)
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职称材料
题名
利用CRISPR/Cas9系统制备斑马鱼cbsb敲除模型
被引量:
1
1
作者
陈福海
蒋林
曹建斌
蒋伟青
项略
顾珊烨
刘犇
机构
浙江大学医学院附属第一医院泌尿外科
浙江省台州医院超声科
浙江省台州医院麻醉科
上海交通大学附属第六人民医院神经内科
温州医科大学附属眼视光医院基础研究中心
出处
《浙江医学》
CAS
2024年第4期377-383,共7页
基金
浙江省医药卫生科技计划项目(2022RC293)。
文摘
目的 采用成簇的规律性间隔的短回文重复序列(CRISPR)/Cas9系统对斑马鱼胱硫醚-β-合成酶b基因(cbsb)进行编辑,并制备稳定的斑马鱼cbsb敲除品系。方法 使用ClustalX软件分析斑马鱼cbsb编码蛋白(Cbsb)的保守结构域,利用生物信息学选取向导RNA(gRNA)靶点,体外合成并纯化gRNA和密码子优化的Cas9 mRNA,在刚受精的斑马鱼胚胎(1-cell期)中显微注射混合的gRNA和Cas9 mRNA,提取受精后3 d的斑马鱼幼鱼基因组,通过PCR扩增并测序分析靶点的切割效率,通过基因组扩增和测序筛选并获得cbsb敲除的稳定品系。结果 斑马鱼Cbsb与人、小鼠胱硫醚-β-合成酶(CBS)高度同源。在斑马鱼Cbsb保守结构域的编码序列处设计4个靶点,其中4#靶点具有高效的切割效率,利用该靶点制备并筛选获得多个cbsb敲除斑马鱼,选取-3+13 bps和-228 bps移码突变的两种品系,进一步筛选获得稳定的cbsb敲除品系。结论 利用CRISPR/Cas9系统成功制备了两种斑马鱼cbsb敲除的稳定品系,为进一步在斑马鱼活体中研究Cbsb的功能奠定了基础。
关键词
胱硫醚
-β-
合成酶
b
硫化氢
基因敲除
斑马鱼
成簇的规律性间隔的短回文重复序列/Cas9
Keywords
Cystathionine
b
eta-synthase
b
Hydrogen sulfide
Gene knockout
Ze
b
rafish
Clustered regularly inter-spersed short palindromic repeats(CRISPR)/Cas9
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
R-332 [医药卫生]
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职称材料
题名
青年缺血性脑卒中与MTHFRC677T、CBS844ins68基因多态性的关系
被引量:
4
2
作者
方乐
王田蔚
邵延坤
杨宏
机构
吉林大学中日联谊医院神经内科
吉林大学中日联谊医院放射线科
出处
《吉林大学学报(医学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第2期310-313,共4页
基金
卫生部科技专项基金资助课题(卫科教规划发<2000>84号)
文摘
目的:研究人MTHFR、CBS基因多态性与青年缺血性脑卒中的遗传关联性。方法:采用限制性内切酶片段长度多态性方法(PCR-RFLP),对98例脑卒中患者(病例组)和116例健康人(对照组)MTHFRC677T及CBS844ins68多态性位点进行检测。结果:病例组MTHFR基因T、C等位基因频率分别为54.09%和45.91%,对照组为37.93%和62.07%,两组比较差异有显著性(P<0.05)。TT型携带者与CC型携带者罹患脑卒中比较相对危险度为2.83,T等位基因携带者与C等位基因携带者罹患脑卒中比较相对危险度为1.93。CBS844ins68多态性位点在病例组与对照组之间D/I 2种等位基因及基因型分布频率差异无显著性(P>0.05)。Logistic回归分析显示MTHFRC677T是青年缺血性脑卒中的一个独立危险因子,且吸烟及高血压也与之有关联(P<0.01)。结论:汉族人群MTHFR C677T位点多态性与青年缺血性脑卒中有相关性,MTHFR基因可能是青年缺血性脑卒中的一个易感基因。CBS844ins68多态性位点与青年缺血性脑卒中无关联。
关键词
亚甲基四氢叶酸还原酶
胱硫醚b合成酶
脑血管意外
多态现象(遗传学)
Keywords
5, 10-methylenetetrahydrofolate reductase
cystathionine
b
eta-synthase
cere
b
rovascular acident
polymorphism (genetics)
分类号
R743.3 [医药卫生—神经病学与精神病学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
利用CRISPR/Cas9系统制备斑马鱼cbsb敲除模型
陈福海
蒋林
曹建斌
蒋伟青
项略
顾珊烨
刘犇
《浙江医学》
CAS
2024
1
下载PDF
职称材料
2
青年缺血性脑卒中与MTHFRC677T、CBS844ins68基因多态性的关系
方乐
王田蔚
邵延坤
杨宏
《吉林大学学报(医学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2007
4
下载PDF
职称材料
已选择
0
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