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基于改进EfficientNetV2的脑胶质瘤IDH1突变状态预测方法 被引量:2
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作者 徐华畅 许倩 +3 位作者 赵钰琳 梁峰宁 徐凯 朱红 《山东大学学报(理学版)》 CAS CSCD 北大核心 2023年第7期60-66,共7页
提出了一种基于改进EfficientNetV2的脑胶质瘤IDH1突变状态预测方法。首先使用k-means聚类算法为无标签的脑胶质瘤MRI数据标注伪标签,并使用Vision Transformer网络对伪标签进行修正,实现脑胶质瘤数据扩增;其次将坐标注意力机制加入Effi... 提出了一种基于改进EfficientNetV2的脑胶质瘤IDH1突变状态预测方法。首先使用k-means聚类算法为无标签的脑胶质瘤MRI数据标注伪标签,并使用Vision Transformer网络对伪标签进行修正,实现脑胶质瘤数据扩增;其次将坐标注意力机制加入EfficientNetV2模型,同时使用果蝇优化算法为模型训练过程中的伪标签数据赋予最优的权重;最后对脑胶质瘤IDH1突变状态进行分类,达到了96.32%的预测准确率。实验结果表明,本文方法能够在术前无创的情况下准确地预测脑胶质瘤IDH1突变状态。 展开更多
关键词 EfficientNetV2 胶质瘤idh1 K-MEANS聚类 伪标签 果蝇优化算法
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基于CnViT的胶质瘤IDH1突变状态智能预测方法 被引量:1
2
作者 徐芊芊 许倩 +3 位作者 徐华畅 赵钰琳 徐凯 朱红 《山东大学学报(工学版)》 CAS CSCD 北大核心 2023年第2期127-134,共8页
为了提高胶质瘤影像数据利用率,实现胶质瘤-异柠檬酸脱氢酶1(isocitrate dehydrogenase1,IDH1)突变状态术前无创预测,提出一种基于影像组学与粗糙集属性约简算法的伪标签标注算法,为无标签胶质瘤影像做伪标签标注;提出一种基于卷积神经... 为了提高胶质瘤影像数据利用率,实现胶质瘤-异柠檬酸脱氢酶1(isocitrate dehydrogenase1,IDH1)突变状态术前无创预测,提出一种基于影像组学与粗糙集属性约简算法的伪标签标注算法,为无标签胶质瘤影像做伪标签标注;提出一种基于卷积神经网络和Vision Transformer的分类模型,并在模型中加入基于胶质瘤位置信息的先验知识,用于胶质瘤IDH1突变状态预测。伪标签标注算法实现了胶质瘤影像数据扩增,基于卷积神经网络和Vision Transformer的分类模型在胶质瘤IDH1突变状态预测中的准确率为93.27%。试验结果表明,提出的方法能够有效提高胶质瘤影像利用率和胶质瘤IDH1突变状态智能诊断准确率,可实现术前无创预测,从而辅助医生诊断和制定治疗方案。 展开更多
关键词 胶质瘤idh1 影像组学 伪标签 VISION TRANSFORMER 先验知识
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IDH1突变型胶质母细胞瘤临床病理分析 被引量:1
3
作者 曾英 钟鹏 +4 位作者 朱祥风 林俐 杜娟 肖华亮 郭乔楠 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第7期734-743,共10页
目的探讨IDH1突变型胶质母细胞瘤(glioblastoma IDH1-mutant,GBM IDH1-mut)的临床病理学特征。方法收集2014-2018年陆军军医大学大坪医院病理科10例GBM IDH1-mut患者临床及影像学资料,观察其病理学形态及免疫表型,检测其分子改变,并复... 目的探讨IDH1突变型胶质母细胞瘤(glioblastoma IDH1-mutant,GBM IDH1-mut)的临床病理学特征。方法收集2014-2018年陆军军医大学大坪医院病理科10例GBM IDH1-mut患者临床及影像学资料,观察其病理学形态及免疫表型,检测其分子改变,并复习相关文献,探讨GBM IDH1-mut的临床病理特征及分子机制。结果GBM IDH1-mut患者10例,其中男性6例,女性4例;年龄28~63岁;7例累及额叶,以头昏、头痛为主要症状,5例有胶质瘤病史。显微镜下观察GBM IDH1-mut共同形态学特征为细胞密集,细胞呈圆形、梭形、多角形,细胞异型明显,核分裂象易见,微血管增生、坏死。微血管增生以肾小球样微血管增生为主,坏死表现为栅栏状坏死和凝固性缺血性坏死,根据累及范围分为大片和局灶。8例GBM IDH1-mut周围见WHOⅡ/Ⅲ胶质瘤成分。免疫组化结果:GFAP、Nestin、IDH1呈阳性表达,Olig-2可见不同程度表达(9/10),P53呈弥漫阳性表达(9/10);ATRX均不表达;Ki-67标记指数为10%~80%,而肿瘤细胞NeuN、NF、CD68、Syn、CD34均为阴性,CD34血管内皮细胞阳性。分子病理结果:10例均见IDH1R132H突变,9例MGMT启动子发生甲基化,1p/19q未缺失(0/4),未检测到TERT突变和BRAFV600E突变(0/3)。结论GBM IDH1-mut少见,坏死局限和微血管增生不显著提示预后较好,坏死广泛和微血管显著增生提示预后较差。 展开更多
关键词 idh1突变型胶质母细胞 免疫组化 临床病理特征
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P53和ATRX蛋白在IDH1突变型与野生型胶质母细胞瘤表达的 相关性及生物学意义 被引量:1
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作者 潘斌才 梁颖雯 +4 位作者 王春华 黄桂芳 徐伟玲 黄嘉裕 伏慧 《临床与病理杂志》 2017年第10期2050-2056,共7页
目的:探讨P53和ATRX蛋白在IDH1突变型与野生型胶质母细胞瘤的表达相关性及生物学意义。方法:收集广东同江医院病理科行手术切除胶质母细胞瘤后组织蜡块标本共62例(其中经免疫组织化学检测IDH1突变型胶质母细胞瘤12例,IDH1野生型胶质母... 目的:探讨P53和ATRX蛋白在IDH1突变型与野生型胶质母细胞瘤的表达相关性及生物学意义。方法:收集广东同江医院病理科行手术切除胶质母细胞瘤后组织蜡块标本共62例(其中经免疫组织化学检测IDH1突变型胶质母细胞瘤12例,IDH1野生型胶质母细胞瘤50例),检测P53和ATRX蛋白在这两种不同基因分型胶质母细胞瘤中的表达情况及相关性,并分析其与预后的关系。结果:P53蛋白在IDH1突变型与野生型胶质母细胞瘤的表达率分别为75.00%(9/12)和30.00%(15/50),ATRX蛋白的表达率分别为16.67%(2/12)及94.00%(47/50),P53和ATRX蛋白在IDH1两种基因分型的胶质母细胞瘤的表达差异均有统计学意义(均P<0.01)。P53及ATRX的表达呈负相关(r=-0.404,P<0.01)。Cox多元回归分析结果显示IDH1基因分型、年龄及性别是影响胶质母细胞瘤(glioblastoma,GBM)生存期的危险因素(P<0.01)。结论:大部分的IDH1野生型的GBM的患者缺乏P53基因及ATRX基因的突变。IDH1野生型GBM是显著影响GBM生存期的危险因素,可以作为临床对成年GBM患者预后判断的重要指标之一。 展开更多
关键词 idh1突变型胶质母细胞 idh1野生型胶质母细胞 P53 ATRX 预后
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磁共振在评估胶质母细胞瘤IDH1突变状态中的价值 被引量:2
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作者 李苗苗 叶春涛 +1 位作者 嵇鸣 林光武 《影像诊断与介入放射学》 2017年第6期471-475,共5页
目的分析对比胶质母细胞瘤IDH1野生型和IDH1突变型的MRI影像学特征。方法选取资料完整并经手术病理证实的60例胶质母细胞瘤患者的MRI影像资料,其中IDH1野生型21例,IDH1突变型39例,除4例IDH1突变型未行DWI检查外,所有病例均行T_1WI、T_2W... 目的分析对比胶质母细胞瘤IDH1野生型和IDH1突变型的MRI影像学特征。方法选取资料完整并经手术病理证实的60例胶质母细胞瘤患者的MRI影像资料,其中IDH1野生型21例,IDH1突变型39例,除4例IDH1突变型未行DWI检查外,所有病例均行T_1WI、T_2WI、FLAIR及DWI等常规序列扫描,并行T_1WI增强扫描。观察肿瘤发病年龄、性别、部位、最大面积、最大囊变坏死面积、囊变坏死面积比、平均表观扩散系数(ADC)等指标并行统计分析。结果IDH1野生型好发于左侧额叶,IDH1突变型最好发于右侧额叶,两组间有统计学意义;IDH1野生型最大面积、最大囊变坏死面积均高于IDH1突变型,两组间有统计学意义;IDH1野生型发病年龄较突变型年轻;两组间发病性别、囊变坏死面积比无统计学意义;IDH1野生型ADC值(0.894±0.102)×10^(-3 )mm^2/s,IDH1突变型ADC值(0.907±0.036)×10^(-3 )mm^2/s,两组间差异无统计学意义。结论MRI可初步评估胶质母细胞瘤的IDH1突变状态,从而指导临床治疗方案的精确设计和预后评估。 展开更多
关键词 idh1 胶质母细胞 表观扩散系数 磁共振成像
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